Application note – Dream Spray for AB Sciex MS 弊社従来品nano XYZ InterfaceとDream Spray for AB Sciex MSの比較を実施した。 <LC-MSMS Analysis> MS; 4000QTRAP(AB Sciex) AS; HTS-xt PAL (CTC Analytics) LC; UltiMate 3000 (Thermo Fisher Scientific) Solvent A; 0.1% Formic acid / water Solvent B; 0.1% Formic acid / acetonitrile Column; Zaplous αPep C18 0.1mmID x 150mm, 3um 120A Trap; L-trap micro 0.3mmIDx5mm, C18 5um 12nm (CERI) Flow rate; 500nl/min Gradient rate; 5-35%B in 120 min Sample; E.coli digest 500ng (Waters) 効果① バックグラウンドの低減 +EMS: 53.470 min from Sample 1 (TuneSampleID) of MT20141001083235.wiff (Nanospray) Max. 1.2e7 cps. Reference 675.8 1.24e7 1.20e7 1.15e7 1.10e7 BPT: 1.2e7 1.05e7 1.00e7 9.50e6 9.00e6 663.5 1/55 8.50e6 In te n s ity , c p s 8.00e6 7.50e6 429.3 7.00e6 459.4 6.50e6 6.00e6 5.50e6 5.00e6 403.3 4.50e6 4.00e6 419.4 503.3 3.50e6 411.4 3.00e6 493.4 2.50e6 441.4 475.4 2.00e6 445.3 547.4 1.50e6 461.5 607.5 529.7 1.00e6 482.6 642.7 5.00e5 562.6 0.00 400 500 600 741.2 684.2 815.3 744.2 673.4 708.5 832.3 889.0 943.0 1028.3 838.2878.0 761.3 700 800 900 1000 1115.0 1126.9 1100 m/z, Da 1238.6 1292.0 1200 1359.3 1300 1461.0 1537.4 1400 1770.2 1585.51635.4 1500 1600 1700 +EMS: 17.993 min from Sample 1 (TuneSampleID) of MT20141003080749.wiff (Nanospray) 1800 Max. 2.2e5 cps. 610.6 2.2e5 Dream Spray 2.1e5 2.0e5 1.9e5 1.8e5 BPT: 2.2e5 1.7e5 1.6e5 1.5e5 In te n s ity , c p s 1.4e5 1.3e5 1.2e5 Dream Spray付属のチャコールフィルターが 大気中のシロキサン等を除去することで バックグラウンドが大幅に低下!! 1.1e5 454.5 1.0e5 9.0e4 8.0e4 7.0e4 415.4 422.0 443.4 6.0e4 5.0e4 468.0 4.0e4 404.8 479.3 593.5 499.0571.3 684.1 563.2 580.5 640.1 773.0 721.1 3.0e4 650.2 673.4 531.4 2.0e4 690.2 1381.4 885.8 903.8 738.2 1000.7 1061.0 0.0 400 500 600 700 1216.0 1095.4 1303.91426.2 1004.2 800 1618.6 1287.7 934.6975.9 869.4 1.0e4 900 1089.9 1000 1131.9 1100 m/z, Da 1470.2 1488.2 1624.0 1701.2 1733.4 1762.5 1309.0 1200 1300 1400 1500 1600 1700 ※分析装置の設置環境により効果は異なります。 1800 効果② イオン強度の上昇 Base Peak Chrom. of +EMS: Exp 1, from Sample 1 (E.coli_T3_MSMS_08) of E.coli_MSMS.wiff mass range 400.00 - 1800.00 Da (Nanospray) Max. 1.1e7 cps. 1.9e7 Reference 1.8e7 1.7e7 1.6e7 BPT: 1.1e7 1.5e7 1.4e7 In te n s ity , c p s 1.3e7 1.2e7 1.1e7 64.92 55.69 1.0e7 59.54 9.0e6 8.0e6 67.58 52.72 1.8倍 7.0e6 25.08 6.0e6 17.93 5.0e6 14.95 38.09 30.91 43.65 25.79 71.37 45.78 50.11 4.0e6 3.0e6 15.55 1.66 20.71 76.62 10.58 85.57 2.0e6 95.54 112.59113.64 106.36 1.0e6 0.0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 70 75 80 Time, min Base Peak Chrom. of +EMS: Exp 1, from Sample 1 (E.coli_DS_MSMS_05) of E.coli_MSMS.wiff mass range 400.00 - 1800.00 Da (Nanospray) 85 90 95 100 105 110 115 Max. 2.0e7 cps. 64.56 2.0e7 1.9e7 Dream Spray 23.70 1.8e7 14.62 1.7e7 20.59 1.6e7 37.11 1.5e7 1.4e7 55.49 1.3e7 In te n s ity , c p s BPT: 2.0e7 91.37 67.47 25.62 18.03 96.72 31.66 1.2e7 59.35 52.21 28.50 1.1e7 Dream Sprayがスプレーの拡散を防ぎ イオンの取り込み量が増えるので イオン強度の上昇が見込めます。 13.47 1.0e7 38.74 9.0e6 32.45 47.67 8.0e6 71.27 39.39 99.36 12.84 7.0e6 104.35 83.41 80.27 6.0e6 112.92 5.0e6 75.58 85.55 4.0e6 3.0e6 105.63 ※分析装置の設置環境により効果は異なります。 2.0e6 1.0e6 0.0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 Time, min 65 70 75 80 85 90 95 100 105 110 115 効果③ 同定数の増加 Software; MASCOT 2.4.1 (Matrix Science) Search engine; Mascot, Scaffold Database; SwissProt_201408.fasta Taxonomy; E. coli Modification; Fix – Carbamidomethyl (Cys) , Variable – Oxidation (Met) Filter; Peptide mass tolerance = ±2 Da, Fragment mass tolerance = ±1.5 Da Protein Groups Peptides PSMs Reference 126 211 218 Dream Spray 160 444 463 *Protein Groups; 同定タンパク質グループ数、Peptides; 同定ペプチド数、PSMs; 同定に使用したスペクトル数 エーエムアール株式会社 〒152-0031 東京都目黒区中根2-13-18 TEL:03-5731-2281 FAX:03-5731-2283
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