まずは登録しよう My NCBIの登録

日本大学歯学部図書館
PubMed Manual
Contents
PubMed とは
まずは登録しよう
手軽に使ってみる
My NCBI
Search from Top page
特定の文献を素早く探す Single Citation Matcher
テーマから探す Advanced Search
本文を読みたい
学部内から読む/学外から読む
検索結果を絞り込みたい フィールド指定 Limits
キーワードを探したい,知りたい Mesh Database
雑誌名を調べたい,雑誌を探したい Journal in NCBI Database
これぞ,という論文をもとに探したい Related Citation
P1
P2
P5
P6
P7
P9
P12
P15
P17
P18
エビデンスレベルの高い文献を素早く探す
Clinical Queries
P19
検索の手順
Search Procedure
P20
検索記録、文献の保管と管理 Saving and Managing Bibliographies P21
主要画面説明
P22
検索フィールドとタグ一覧,入力方法
資料種類,参考文献
P24
P25
PubMedとは?
"PubMed"とは世界で最も利用されている,生命科学に関する書誌情報データベース
"Medline"の無料検索システムのことです。
アメリカ国立医学図書館(NLM: National Library of Medicine)の一部門である国立生物工
学情報センター(NCBI:National Center for Biotechnology Information)が提供しています。
1946 年以降に登録された約 2300 万件の文献,約 5600 誌の学術雑誌の書誌情報(文献
の情報)が検索できます(2014 年現在。近年は 1 年間に約 70 万件ずつ増加)。90%以上
が英語論文です。
インターネット登場以前は,図書館に論文を調べるための専門の雑誌(索引誌)があり,
医学の分野では,1879 年に創刊された”Index Medicus"が中心的存在でした。この索引誌
のオンライン版が"Medline"です。Medline は様々なプラットフォームから利用できます。Ovid
SP, EBSCO host, J Dream Ⅲからも学内から利用可能です。
1997 年から Medline を誰でも無料で検索できるように提供されたのが,PubMed です。
PubMed を利用すれば,Medline 登録前の文献や Medline 以外の NLM データベースなどにも
アクセスでき,世界の生命科学文献情報を随時検索できるメリットがあります。また,協力
出版社の原著フルテキストジャーナルとも有料・無料でリンクしており,日本大学歯学部も
しくは他学部の契約状況により全文へのアクセスができるものがあります。近年は NCBI が
提供する PubMed Central という全文フリーアクセスのデジタルアーカイブが収録論文数を
拡大しています。
PubMed のデータは,出版社から雑誌発行とほぼ同時に送られてくる生のデータを基に,索
引付けや各種番号付与等が行われます。この作業が終わるまでは,MeSH 用語は付与されま
せんので MeSH を使う検索はできません。検索結果は新しいものから順に表示されるので,
最初の方のデータにはよく[as supplied by publisher]の表示がでることがあります。データ
の状態は順次変化していきます。
順番
データの状態
画面表示
1
雑誌出版社から提供されたばかりのレコード
[PubMed-as supplied by publisher]
2
データ整備作業中,MeSH の付与,書誌事項確認
[PubMed-in process]
3
Medline データとして登録
[PubMed-indexed forMEDLINE]
他
Medline データとして登録しないレコード
[PubMed]
PubMed は頻繁に改定を行うので,最新情報は以下を参照
New and Noteworthy http://www.ncbi.nlm.nih.gov/feed/rss.cgi?ChanKey=PubMedNews
(PubMed top page より)
MEDLINE/PubMed Resources Guide
http://www.nlm.nih.gov/bsd/pmresources.html
-1-
まずは登録しよう
My NCBI
PubMed にはインターネットが接続されている環境があればどこからでも無料でアクセスでき
ます。ネット上の住所 URL は http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/です。利用する場合,学部
内のネットワーク内から歯学部図書館のホームページを経由してアクセスすると,大学内の所蔵
へナビゲートするアイコン(SFX)が利用できるので便利です。
(歯学部図書館 URL=http://www2.dent.nihon-u.ac.jp/library/index.html)
頻繁に利用する場合は登録するこ
とをお勧めします。登録は無料で
す。Pub Med
トップ画面右上の
Sign In をクリック。
→My NCBI の画面へ
Register for an account をクリック。
必要事項を入力後,R
Register をクリック。
電子メールアドレスを入力(オプション)すると,
N LM(PubMed の運営機関)から確認のメールが来ます。
-2-
登録しておけば,①検索結果の長期保存
②検索式を記録,更新情報の受け取り(保存した検索
式の結果を定期的,自動的に受け取ることができる)など便利な機能が使えます。
(注意)PubMed は無料の書誌検索エンジンなので,使用や秘密保持に関する契約はありません,自己責任で利用し
てください。
①検索結果の長期保存
検索結果の一覧から保存したい文献にチェックをつける→Send to
メニューから Collection を選択し,A
Add to Collection をクリック
My NCBI にサインインをしていないときは,Username/Password
の画面が表示されるので入力する。
Create new collection を選び Collection 名を付けて Save をクリッ
ク。既存のコレクションに入れる場合は Append to an existing
collection を選ぶ。
一時的な保存は Send to から Clipboard を使う(8 時間保存可能)。
もしくは,検索結果から論文のタイトルをクリック→論文の抄録画
面右上 Save items 欄の Favorite から保存することもできる。
-3-
②よく使う検索式を記録,更新情報の受け取り
検 索 を 実 行 後 , 検 索 ボ ッ ク ス 下 の Save
search をクリック。
検索式の名前をつけて Save をクリック→
詳細設定画面に変わる。
保存した検索式を自動実行して電子メー
ルへ結果を送信させる設定ができる。
My NCBI 画面の右上 Help から詳細な説明が
得られる。
自分の好みに合わせたカスタマイズが可能。
例えば Filter your results(絞り込み)機能を
設定しておくとかなり便利。Free Full Text
や Review など、任意に設定できる。
-4-
手軽に使ってみる
Search from Top page
PubMed による検索の基本は,思いつくキーワードを検索ボックスに入力することです。複数入
力するときはスペースで区切って(AND 検索~P11 参照)入力します。
例えば、検索ボックスに探したい文献の著
者名を入力して Search をクリック
{著者名検索~ラストネーム(姓)をフル
で,ファーストネームとミドルネームはイ
ニシャルで入力。2002 年以降出版の文献
はフルネームで検索できる}
。
すると,その著者名を含む文献が新しいものから
順に表示される。右の表示結果は 156 件のうち
の 50 件。Display Setting をクリックして表示形
式を詳細表示などに変えることもできる。
156 件では多すぎるので,接着を表すキー
ワード(adhesive OR bonding)をスペース
で区切って追加。24 件になった。
(OR 検
索についてはP12 を参照)
絞り込みの方法はいろいろあり、自分で考えて
試してみることが重要。安易に絞り込むと欲し
い文献が漏れることもあるので注意が必要。
-5-
特定の文献を素早く探す
Single Citation Matcher
文献の書誌情報から論文を探す場合,PubMed では Single Citation Matcher を使うと素早く探せ
ます。まず,書誌情報を見て刊行年,巻号,開始ページ数を記録します。
Van Meerbeek B, Peumans M, Verschueren M, Gladys S, Braem M, Lambrechts P. Clinical status
of ten dentin adhesive systems. J Dent Res 1994; 73: 1690-1702.
ここでは,1994.73.1690 という数字をメモ。
PubMed ト ッ プ ペ ー ジ か ら Single Citation
Matcher をクリック。
刊行年、巻号,開始ページ数を入れ,Search をクリ
ック
この「数字による検索方法」は、入力された条
件に合った文献がすべて検索されるが,大抵は
一桁以内の文献数で検出される。
該当するものが見つからないときは手元の情報が間違っている可能性があるので,
入力条件を減らす変える等,工夫してみる(PubMed 未収録の可能性も念頭に置く)
。
-6-
テーマから探す
Advanced Search
研究テーマのキーワードなどから探す場合,検索式と検索件数を表示させ,それをもとにかけ合
わせていく方法が効率的です。
トップ画面から Advanced をクリック→Advanced Search Builder の検
索ボックスにキーワードを入力し,Add to history をクリック。
画面下部 History に検索式と検索件数が表示される。この作業を繰り返してゆく.
History の項目に検索式(キーワード)をひとつずつ入れ終えたら,
それらをかけあわせてみる。Add をクリックすると Builder に番号
が追加されて,自動的に♯1AND ♯2 などの検索式が作られていく。
Builder 左のプルダウンを使っ
て AND, OR, NOT(AND, OR 等に
ついてはP12 を参照)を指定
して検索をする。
-7-
#1~#3 を掛け合わせて,#4 にまとめた。検索件数をクリックすると結果表示画面になる。
なぜ,この Advanced Search が効率的かというと,①検索件数が掌握できる②それをもとに検
索の戦略を立てることができる③検索結果に納得できない場合,コトバの組み合わせを変えるな
どのやり直しができることがあげられます。検索を的確に行うことにつながります。
単一のクエリーボックスに複数のコトバを入れる方法(P4)は,検索行為が偶然性に左右され
がちです。予備検索やちょっとした検索では手軽で有用ですが,腰をすえて網羅的に調査をした
い場合は,Advanced Search を利用するほうがより良い結果を得られます。
網羅的に検索をしたい場合には,その概念を表す複数のコトバ(同義語)について OR 検索を用
いて検索をする必要があります。そのようなときにこの Advanced Search を使った「ひとつず
つ検索」が有効な手段となります。
例)
「抗菌物質」について考えられる物質名を OR でつなぐ
唾液“saliva”と掛け合わせ(AND 検索)をすることにより「唾液抗菌物質」に
関する文献を検索。
初めは難しく面倒くさく感じられますが
慣れると検索が楽になります。
-8-
本文を読みたい
学部内から読む
PubMed で検索した文献の本文を読みたい場合は、文献の詳細表示から、画面右上の Full text
links を利用します。
① 出版社のアイコン
クリックをすると出版社のサイトへ
飛ぶ。このアイコンは PubMed と協
力関係にある出版社がつけているア
イコンなので、日本大学歯学部で見
られるとは限らない。
本文アクセスの途中で ID/PW を求
められるもしくは価格の表示が出
るようであれば,本学部契約外の
ジャーナルである可能性が高い。
② SFX(日本大学が用意しているリンクリゾルバ)
出版社アイコンで本文にアクセスで
きなかった場合は SFX アイコンをク
リック。SFX とは電子ジャーナルへ
のリンクや日本大学の所蔵を横断的
に検索するシステム。
学部内のネットワークからであれ
ば SFX アイコンが表示される。ここ
から調べるのが最も確実な方法。
SFX をクリックして上から調べていく。
フルテキスト(電子ジャーナルでの本
文)がない場合は、日本大学蔵書目録横
断検索システムをクリック。
。
-9-
日本大学各学部の検索結果一覧が表示
されるので、この中から歯学部を探す。
図の例では、電子、冊子とも所蔵がある
ことがわかる。
「アイテムを読み込み」を
クリックすると歯学部 OPAC へ飛ぶ。探
している文献の所蔵状況を確認して、電
。
子体をダウンロードもしくは冊子体を書
棚へ探しに行く。
電子ジャーナルの場合は、
「e journal」アイ
コンをクリックして出版社サイトへ飛ぶ。
雑誌の所蔵は、欠けている巻号、受入をしていな
い年次、倉庫所蔵などがあるので注意をする。
当館に所蔵がない場合、他学部を含む外部へ複写の依頼をすることになる。複写の依頼は図
書館カウンターで直接申込をするか,図書館ホームページ「メールできいてみる」からメー
ルで申込ができる。
学外から読む
雑誌によっては「学認」を利用して学外からのアク
セスが可能な電子ジャーナルがあります。
図書館ウェブサイトトップページの電子
リソースから「日本大学オンラインジャー
ナル」へアクセス。
- 10 -
「学認」マークがあるデータベースは学外閲覧が可能です。
学外の端末から,PubMed の文献を辿って電子ジャーナルのサイトへアクセスした場合,サイト
により表示方法は異なりますが,ID/Password を求める表示がでます。
Athens/Institution log in という表示があればクリックして以下の画面のように log in をします。
NU-MAIL の ID/PW を入力してアクセスができます。
ID/PW は各自でしっかりと管理し他人に知ら
せないようにしてください。不正利用があった
場合には大学全体で利用の差し止めになるこ
とがあります。
- 11 -
検索結果を絞り込みたい
フィールド指定 Limits
データベースの検索でキーワードを組み合わせるには,論理演算子を使います。論理演算子には,
AND(論理積),OR(論理和), NOT(論理差)の 3 種類があります。
検索ボックスにキーワードを入れ,スペ
ースを空けて違うキーワードを入れる
と自動的に AND 検索になる。
PubMed は,自動用語マッピングとい
Search details で実際にどのような検索
う機能により,入力されたキーワード
をしたかをチェック。See more をクリッ
を自動的に解析し漏れのない検索結
クすると,詳細な検索式が表示される。
果になるように設計されている。
漏れのない=検索件数が多い
というのが PubMed の特徴である。
一般的に検索のコツは,まずヒットさ
せて絞り込むことだが、PubMed の場合
はどう絞り込むかがポイントになる。
★フィールドを指定して絞り込む
フィールドとは字句どおり,検索する場所を意味します。通常は All Fields
に設定されていますが,検索フィールドを指定することにより効果的な絞
込みができます。最も正確な情報,あるいは核となりうる事項をもとに絞
込みをします。
クエリーボックス左のプルダウンメ
Advanced Search 画面へ
ニューから項目が選べる。
- 12 -
例えば Date-Publication を選択する
と,新たに年代指定のボックスが現
れ期間を指定することができる。他
にも、「論文タイトルと抄録から」
「雑誌タイトル」などいろいろな活
用が考えられる。
★その他の方法
タグを直接入力してフィールド指定
Dr.Crick が 1993 年に出版した DNA についての論文を探す場合。
→dna[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
AND はスペースでも OK。タグの内容と種類
については P22 参照。詳細は PubMed トップページから PubMed Help へ行き
Search Field Descriptions and Tags の項目を参照。
キーワードをダブルクォーテーションで囲む
長い熟語を字句どうり調べたいときや自動マッピング機能を働かせたくないとき。
→ “alpha methyl p tyrosine”
その特定の語句のみの検索になる。
前方一致検索 *トランケーションを使う
探したい語が曖昧で,自動マッピング機能を働かせたくないとき。
→ acute hepatitis c*
キーワードの最後にアスタリスク(*)をつけると,その後
にはどんな文字が続いてもすべて検索するという意味になる。
Search Details の編集
前ページで紹介した Search Details
のボックス内を直接修正して検索。
OR でつないでいる部分,語句の揺
れを補完している項目,[All Fields]
または[Mesh Terms]の部分を消去
することなどで絞り込みができる。
★Filter を使う
検索結果の左側に絞込みを行うための各
種フィルターが表示されます。
全文へのリンク,抄録の有無,雑誌の出版
年,言語,年齢,などで絞込みができます。
この機能は解除するまで有効なので注意
が必要。フィルターをかけている場合は
Result の下に表示が出ます。設定を解除し
たいときは,clear all をクリックします。
- 13 -
!このフィルター設定は,記憶させることができます。
P2 の My NCBI 画面で登録を済ませ
る。Sign in してから検索画面を表
示させる。結果表示右側の
Managed Filters をクリック。
初期設定は Free Full Text(無料の電
子ジャーナル文献), Review(レビ
ュー文献)のフィルター設定。My
NCBI では,15種類までのフィル
ターを個人設定することができる
Select category で 4 種類のカテゴリーの
いずれかを選択→下に詳細設定画面が
でるので,反映させたいフィルター項目
にチェック→Your PubMed filter list に貯
めていくことができる。
Create custom filter をクリック→複
数のフィルターを組み合わせた独自
の設定を作り保存できる。
自分好みのフィルター設定をしてお
けば,検索結果が自動的にフィルタ
リングされ,グループが形成される。
検索結果右側のフィル
ター表示件数を見なが
ら,検索式を評価,検
討,また各グループの
結果を表示させること
ができる。
- 14 -
キーワードを探したい,知りたい
MeSH Database
MeSH とは索引語として使うために開発された医学用語集です。1 論文あたりに中心的テー
マとして 2~3 語,その他 10~20 語の MeSH が付与されています。例えば「癌」という言
葉は cancer, neoplasm, tumor などいくつかの用語で表現されますが,MeSH により neoplasms
に統一されています。PubMed では,入力された用語を自動的に MeSH に変換する仕組みが
あり,MeSH を意識しなくてもそれなりに検索はできます。しかし,MeSH の仕組みや個々
の意味を理解しているとさらに効果的な検索ができ,検索結果を評価することもできます。
また,キーワードが定まらない場合などにも,MeSH Database を用いることにより,その
研究テーマにおける広い意味の用語や特定の狭い意味の用語,関連する用語などを明らか
にすることができます。
トップページから MeSH Database をクリック,またはクエリーボック
ス左のプルダウンメニューから MeSH を選択して検索をする。
右 の 例 で は , dopamine に つ い て
MeSH で調べた結果 85 件表示され
た。表示された MeSH 用語をクリッ
クすると次ページの画面になる
もし適切な MeSH 用語がなければ,
同義語や違うスペルで再検索する
論文の abstract 表示画面
か,自由語検索(MeSH を想定しな
いオールフィールド検索)を行っ
て,Search detail の検索式に表示さ
れた MeSH を調べる,あるいは,検
クリックするとこの論文の MeSH 語
索された文献の MeSH 用語を確認す
などが表示される
るといった方法も有効。
- 15 -
MeSH Database 内”dopamine”についての詳細表示
選択した MeSH 用語についての説明
Subheadings とは、治療(therapy)や診断
(diagnosis)のように MeSH 用語と組み合
わせることのできるキーワードのこと。
選択した MeSH が major topic として索引さ
選んだ MeSH と組み合わせることにが
れた文献だけを検索したいときにチェック
できる Subheadings が表示されるので必
要なものにチェックを入れる。
選択した MeSH の下位語を含め
ないで検索するときにチェック
たいときにチェック
画面下方には階層構造が表示されている。よ
り広い概念(上位語)から狭い概念(下位語)
へ並べてられている。この図を見て上位語に
下位語に変更する。
この MeSH Database 画面をもとに MeSH 用語とい
う視点から PubMed で検索ができる。下図では
Subheadings の secretion にチェックを入れ,Add to
search builder をクリック→ボックス内に検索式が
入力。他の MeSH 用語を加えながら複数の MeSH
を組み合わせた式も可能。
検索式ができたら search
PubMed で検索実行
MeSH は毎年改定作業が行われており、新設語や削除語、変更語が存在する。新しく発見された疾患や治療法などには
対応が遅れることがある。また全ての概念に MeSH が存在するとは限らない。
- 16 -
雑誌名を調べたい,雑誌を探したい Journals in NCBI Database
雑誌名が不確かな場合,略称から正式名を知りたい場合,電子化の有無を知りたい場
合,関心のある領域の雑誌を探したい場合などには Journals in NCBI Databases が便利
です。
トップページの Journals in NCBI
Database をクリック
ボックスに調べたい雑誌名またはキーワードを入
力。わかっている部分だけでも入力すれば,その語
句やテーマを含む雑誌名がリスト表示される
雑誌の情報画面。付与された MeSH を見
ることにより雑誌の内容についてある程
度の掌握ができる。雑誌評価の引用情報
をもとにした位置づけを知りたい場合
は、図書館HPの電子リソースから
Journal Citation Reports を使う。
収録されている雑誌にも MeSh 語が
付与されているため、図例のように
アスタリスクを使った前方一致検
索で、ぺリオ関連雑誌を検出できる
Electronic Links の URL が表示されていれ
ば,電子版にアクセスすることもできる。
本文閲覧の可否は雑誌による。
- 17 -
これぞ,という論文をもとに探したい
Related Citation
探しているテーマにぴったりの文献が手元にあるときは,それを手がかりに関連のある文
献を検索したり,MeSH 用語を特定して検索に活かしたりすることができます。
文献のリスト表示の場合は一番下の
Related citations を ク リ ッ ク 。 Related
citations は,MeSH,タイトル,抄録中の
キーワードを自動的に分析して,関連性
の高い文献へリンクする機能
文献の Abstract 形式の画面では,右上に
Related citations in PubMed という項目があ
り,関連性の高い順に 5 件の文献が表示。
See all をクリック→関連文献リスト表示へ
Cited by PubMed Central articles は PubMed
Central に収録された全文の参考文献を手が
かりにして,この文献を引用している他の文
献を表示。
画面下方の Publication Types, MeSH Terms, Substance の+ボタンをクリック→それぞ
れのデータが表示→論文の内容を素早く把握できる。特に論文に付与された MeSH を用
いて検索を再試行することは求めている文献に到達するための近道となる。
★Web of Science を使う
引用関係をもとに関連文献を探す場合には文献検索データベース Wed of Science が適
しています。
図書館 HP の電子リソースから Web of Science にアクセ
ス→PubMed 画面から該当論文のタイトルをコピーして
Web of Science の検索ボックスに貼り付けると簡単に該
当論文が表示される(Web of Science 収録誌のみ)
この論文が引用した 177 件の論文と,引用
された 49 件の論文の詳細を簡単に調べる
ことができる
- 18 -
エビデンスレベルの高い文献を素早く探す Clinical Queries
根拠に基づいた医療~Evidence-Based Medicine を実践する上で,EBM の手法に耐えう
る研究デザインによる文献情報の検索は中核となる大切なステップとなります。
Clinical Queries は,研究デザインやシステマティックレビューに特化した検索クエリ
ーがあらかじめ用意された検索画面です。網羅的な文献の収集には向きませんが,関
連文献の調査などを目的とした予備検索に活用することができます。
PubMed トップページからアクセス
クエリーボックスに調べたい疾患などの
キーワードを入力
Clinical Study Categories では「病因」
「診
断」「治療」「予後」「Clinical prediction
guides」を選択できる。図の例では「歯周
病と喫煙について」「病因(因果関係)」
の側面から検索をした。
Scope の項目で検索件数を調節できる。
Narrow→ノイズを減らすことができるが
漏れも生じる。Broad→漏れを少なく検索
するがノイズも増える。
システマティックレビューとは,あるテ
ーマに関する複数のランダム化比較試験
のデータを評価した結果をまとめた論
文。最もエビデンスレベルが高い研究デ
ザインとされる。
Systematic Reviews の画面では,システマ
ティックレビューに関連する文献(臨床
試験のレビューやガイドライン等)を広
く検索する。
- 19 -
検索の手順
Search Procedure
検索を、偶然性に左右されない的確で確実なものにするためには、戦略を立てることが大
切です。また、検索の過程でメモを取る・文献情報の保管場所を決めておくことなども、
継続性のある情報探索にとって重要なこととなります。
Question
・専門家に訊く
臨床/研究
・ガイドラインを参照
・EBM 資源を使う
PubMed で(とり
あえず)検索
既知の情報
図は「Agoritsas T.(2012) Sensitivity and predictive
試行錯誤
value of 15 PubMed search strategies to answer
MeSH 用語を利用
clinical questions rated against full systematic
reviews.(PMID:22693047)」より加工して引用
検索語の決定
論理演算子
(AND OR )の利用
検索戦略 =
PICO※による概念分け
P-Patient,Population
I-Intervention,Exposure
C-Controls,Comparators
AND
Outcomes
AND
Filters
AND
検索後の戦略
Limits :言語・研究デザイン・出版時期
AND
用意されたフィルター機能
Clinical Queries
-Type Narrow/Broad
-Category :Therapy,Diagnosis,etc.
・ Related Articles in
PubMed
・他のデータベースの
利用-Web of Science,
Google Scholar 等で引
用情報を辿る
※PICO とは、目の前の患者から生じる疑問や問題を、わかりやすい形に整理するための方
法論です。文献検索の際に臨床上の疑問を整理するために使いますが、「検索したい概念に
分けてからコトバを選んでいく」という過程が大切であり、P=主体 I=介入 C=比較 O
=結果 という概念を便宜的に使います。必ずしも P.I.C.O.全てを抽出する必要はなく、ま
た臨床研究以外にもこの「概念分け」を意識した検索は有効です。
- 20 -
検索記録、文献の保管と管理
Saving and Managing Bibliographies
★検索記録の保存(P3 も参照のこと)
PubMed で検索した記録は、自動的に蓄積されていきます。PubMed Advanced Search Builder
画面から検索記録をエクセル形式で保存することができます。My NCBI に未登録でもこの操
作はできるので、急ぎのときには使えます。
★文献管理
文献管理は2種類あります。
「書誌事項の管理」と「書誌事項を含めた論文本体の管理」で
す。PubMed の My NCBI では、書誌事項の管理が簡単にできます(P3 参照)
。
書誌事項を含めた論文本体の管理については以下のツールがお勧めです。
★ENDNOTE オンライン(http://endnote.com/)
マニュアル→ http://ip-science.thomsonreuters.jp/media/support/enw/enw_qrc_jp.pdf
★Mendeley (http://www.mendeley.com/)
マニュアル→
http://www2.dent.nihon-u.ac.jp/library/manualpage/mendeley.pdf
日本大学所属の学生、教職員は Google 提供の NU-AppsG を利用することができ
ます。
電子ジャーナル文献等の保存は、紙への印刷や USB/PC に保存するより、Google ドライブ
への保存が便利です。
例えば、図書館の検索用PCでダウンロードした文献を印刷せず、Google ドライブにアク
セスをして保存をするという習慣をつけると文献を効率的に管理できます。iPad などにも
Google ドライブアプリを入れておけるので、本文アクセスができれば iPad で文献保存もで
きます。
文献を Web 上に置いておけば、ネット環境があるところならどこからでもアクセスができ
て便利です。
- 21 -
検索実行
主要画面説明
検索の途中でマークをクリ
ックするとト ッ プペー ジ
Enter キ ー
でも OK
PubMed の主要な画面の説明です。
My NCBI へのリンク
へ戻る
検索ボックス
詳細検索
Pubmed 以外のデー
Help マ ニ ュ ア ル 画 面 へ 。
タベース選択
Pubmed のマニュアルは分かり
やすく有用
・クイックマニュアル
・動画でのマニュアル
・Pubmed モバイル
・詳細なマニュアル
・Mesh データベース
・特定論文検索
・最新情報など
・Journal データベース
・PMID を特定する検索
・臨床試験情報
・臨床医学領域における検索
・E-Utilities(インターフ
・特定のトピックに絞った検索
ェイスを使用せずデータ
を取り込む)
・リンクアウト
Pubmed 以外の NLM の各種データベースへのリンク
検索結果の表示
検索結果に関連したフ
表示形式の変更
ィルターを表示
検索件数(新しい順に表示)
雑誌名,出版年月,巻号,ページ
論題
著者名
データ整備作業中
PMID は pubmed 固有の番号
この番号のみで文献を hit させ
ることができる
詳しい検索経過を表示,この検索式を直
- 22 -
接編集して再検索することができる
検索結果の表示(抄録付き)
電子体へのリンク
雑誌名,年,月,巻,号,ページ
保存先を選ぶ
学内所蔵,電子体の利用
に関する情報
本文の言語が英語以外の場合,論
関連文献(MeSH,タイトル,抄
題が[ ]で囲まれ,収録ページ数の
録中のキーワードによる)
後に言語種類が表示される
PubMed central 中の関連文献(こ
の論文を引用しているもの)
PMID, レコードの状態
MeSH などを表示
様々な情報源やサービスへのリンク
My NCBI 画面
My NCBI をカスタマイズ,検索結果
を自分好みにアレンジできる
ここから検索ができる
保存した検索式を表示
どの項目も Manage~をクリックして
空欄のまま Search を押すと pubmed トップ画面へ
編集できる
文献単位でのリストを作成する。PubMed 以
外の文献情報も手入力で作成できる
検索結果の長期保存
最近実行した検索行動を表示
よく使用する絞り込み条件を
15種類まで設定できる
- 23 -
検索フィールドとタグの種類,入力方法
検索フィールド(P11 参照)とは詳細検索画面検索ボックス左にあるプルダウンメニューから
選べる検索対象となる項目です。タグは検索ボックスに入力したキーワードの後ろに直接[ ]で
囲んで示す検索対象で,検索フィールド指定と同義です。以下は主なフィールドと検索項目のタ
グ一覧,入力方法です。
[大文字小文字の区別はなし。ハイフン(-)はスペースに,アポストロフィー(‘),ウムラウト
(
“)
,アクサンテギュ(‘)は省略。ギリシャ文字は読みの英語綴りで。]
Affiliation[ad] : 第一著者の所属機関,住所,電子メールアドレス
例) nihon univ[ad]
著者名だけでは識別できないときに使うと便利
Article Identifier[aid] : 文献番号。[doi]タグを使って,DOI 番号で検索することもできる。
Author[au] : 著者名。ラストネーム(姓)とイニシャル(名)をスペースを挟んで記入。
自動的に前方一致で検索される。完全一致は”
例) yamada t[au]
baker a[au]
”で囲むか@を後ろにつける。
baker a@[au]
“o’brien j”[au]
Full Author Name[fau] : 著者のフルネーム。2002 年以降の文献については検索可能。
Journal[ta] : 掲載雑誌の略誌名,正式名,ISSN 番号
例) new england journal of medicine[ta] 正式名称は of 必要,the は不要
N engl j med[ta] 省略形。0135-2256[ta]
ISSN はハイフン必要。
Issue[ip] : 文献が掲載された雑誌の号数
Language[la] : 文献が記述された言語
例)
jpn[la]
MeSH Terms[mh] : MeSH 用語(P14 参照)NLM が作成する医学分野の統制語彙集。特定の狭
い語から一般的な広い語までの階層構造を持ち,サブヘディングとの組み合わせで
用いることも可能。
例)
neoplasms/diet therapy[mh]
MeSH Subheadings[sh] : サブヘディングは文献の主題をより的確に表すために通常は MeSH と
組み合わせて用いられるが,タグで別に検索することで広い検索ができる。
例)
therapy[sh]
MeSH Major Topic[majr] : 文献の主要トピックを表す MeSH 用語。文献には通常3~4個付与さ
れている。
PMID[uid] : pubmed のID番号。タグを付けなくても,この番号を直接入力すると該当文献が
検索される。検索ボックスにスペースで区切って入力すると,OR検索になる。
Publication Date[dp] : 出版年。期間を指定して入力したいときは:で挟む。
例)
1996:1998[dp]
1998/01:1998/04[dp]
Publication Type[pt] : 文献の資料種類。例) review[pt]
clinical trial[pt] 次ページ参照
Title[ti] : 文献のタイトルに含まれる言葉や数字。
Title/Abstract[tiab] : 文献のタイトルや抄録に含まれる言葉や数字。
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Publication Types
主な資料種類
タグは[pt]
Randomized Controlled Trial
Practice Guideline 診療ガイドライン
ランダム化比較試験
Guideline ガイドライン
Controlled Clinical Trial
Review レビュー論文
比較臨床試験
In Vitro インビトロ
Multicenter Study 多施設共同研究
Journal
Case Reports 症例報告
Technical Report テクニカルレポート
Congresses 会議録
Government Publications 政府出版物
Article
雑
誌
論
文
Editorial エディトリアル
この Manual は簡易版です
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PubMed Manual (改定第3版)2014
日本大学歯学部図書館発行
参考文献・マニュアル
・ PubMed Help(PubMed Top Page より)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/
・ 岩下愛・山下ユミ共著(2013)「図解 PubMed の使い方 インターネットで医学文
献を探す」 第 6 版 紀伊國屋書店
・ 縣
俊彦編著(2005)
「上手な情報検索のための PubMed 活用マニュアル」改訂第
2 版 南江堂
・東京慈恵会医科大学学術情報センター(2012) PubMed の使い方・基礎&応用
http://www.jikei.ac.jp/academic/micer/pubmed1.pdf
・東京大学医学図書館(2014)PubMed の使い方
http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf
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