PubMed の使い方（入門編） PubMed とは？アメリカ国立医学図書館（ NLM ）内の NCBI( 国立生物科学情報センター :National Center for Biotechnology Information）が作成しているデータベースです。統合検索システム Entrez の一部としてインターネットで無料公開されています。世界の主要医学系雑誌に掲載された文献情報（雑誌名,巻号,ページ,タイトル,著者名,抄録）を検索することができます。 PubMed へのアクセス学内・学外問わず、どこからでも利用できます。筑波大学内または専用ＵＲＬから利用すると、が、表示され、OPAC（蔵書検索）や電子ジャーナルへのアクセス、文献複写申込などが、容易になります。 ●筑波大学専用 URL http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?otool=ijputslib ●筑波大学附属図書館 HP「資料案内」→「データベースリスト」から PubMed へのリンクをクリックしてご利用ください。 PubMed の画面の見方 ①検索ボックス ②使い方 1 ・マニュアル・FAQ ・チュートリアル etc… ③ツール・特定論文の検索 2 3 4 ・書誌一括検索・特定トピック検索 ④情報資源・MeSH ・Jornal ・臨床試験 1/7 etc… etc… PubMed の基本の検索 ■STEP1：キーワード検索 1 3 ① 検索ボックスにキーワードを入力 ② 自動マッピング機能が働き、MeSH 用語（索引語）や雑誌名などが表示されま 2 す。 ③ [Search]ボタンをクリック ■STEP2：検索結果の絞り込み：Filter ① 検索画面の左側にある Filter エリアで、絞り込み検索選択中の条件には 1 2 がつきます ② デフォルト以外の項目は、 [Show additional filters]で表示・文献のタイプ・フルテキストの有無・出版時期・ヒトまたは動物・言語・性別・対象年齢 PubMed からのリンクで絞り込まれます。筑波大学で契約している EJ 等は反映されません。・テーマ ③ 絞り込んだ条件は、検索結果上部に表示されます。 ※絞り込んだ条件は、[Clear all]をクリック 3 するまで有効 ■STEP3：様々な検索ルール例題 1 Point 小児喘息（child asthma）の薬物治療（drug therapy）に関する文献を探すスペースで AND 検索大文字・小文字どちらでも検索できます。１種類だけでなく関連する用語で何度か検索してみましょう。 ※ひとつのフレーズとして検索したい場合は、検索例： “child asthma” “drug therapy” 2/7 例題２ The American Journal of Medicine に掲載された Lehman J M 氏の論文を探す Point 正式雑誌名 or 略誌名で検索正式名または MEDLINE の略誌名、ISSN を入力します。大文字・小文字の区別はありません。 ISSN は「‐（ハイフン）」を省略せずに入力します。 ※ ISSN： International Standard Serial Number 国際標準逐次刊行物番号個々の刊行物に与えられる固有の識別番号。 ISSN 0028-0836（Nature の ISSN） Point Last Name はフルで、First Name と Middle Name はイニシャルで検索 2002 年以降出版の文献には、フルネームで検索できる論文もあります。 ※特殊な著者名の入力 St.Clair M → St Clair M (ピリオドは省略) Smith AB 3d , Smith AB III → Smith AB 3rd Vaart JM van der → van der Vaart JM ※ O’brien J＠ → O’brien J のみ検索。O’brien JM, O’brien JD 等は検索しない検索例： The American Journal of Medicine Lehman J M 例題３腎不全（Kidney Failure）に関する論文のうち慢性（chronic）を除く。 Point 論理演算子を使う AND（論理和）、OR（論理積）、NOT（論理差）が使えます。必ず大文字で入力します。ただし、AND は省略することができます。 [OR] 慢性腎不全か尿毒症 [AND] C 型肝炎の薬物治療 A:慢性腎不全 A : C 型肝炎 B: 尿毒症 B: 薬物治療 A AND 検索例： “Kidney B Failure” A OR B NOT [NOT]高齢者以外での褥瘡 A:褥瘡 B:高齢者 A NOT B chronic 例題４論文タイトルに「breast cancer」が入っている文献を探す Point 検索フィールドを指定する雑誌名、タイトル、著者名など、検索するフィールドを明示的に指定したい場合は、そのフィールドをあらわすタグを単語の後ろに[ ]で付け加えます。検索例： breast cancer[TI] PubMed のレコードには、データのフィールドを表すタグがそれぞれ付与されています。このタグを使い、フィールドを指定して検索することができます。また、各文献には MeSH という統制された主題のキーワードが付加されており、これが特徴となっています。 3/7 TI : タイトル AB : 抄録 DP : 出版年 AU : 著者名 TA: 掲載誌名 MH : MeSH 用語 etc. その他の入力のルール Point 前方一致検索(Truncation) 単数形と複数形を一緒に検索するなど、語尾変化のある単語をまとめて検索したいときなどには、キーワードの最後にアスタリスク(＊)を付けて検索します。 PubMed では、前方一致検索のみが可能なので、アスタリスクは常に最後に付けます。1 文字に「＊」を付けて検索することはできません。前方一致検索をした場合には、自動マッピング機能は解除されます。 Point ストップワード ”a” “the” “of” “can” “that”等のような頻出する単語は検索では無視されます。このような単語をストップワードといいます。ストップワードを含む複数の単語をフレーズとして入力したい場合は、” ”（ダブルクォーテーション）で括ります。以下の URL で PubMed のストップワードを一覧できます。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/table/pubmedhelp.T43 Point 特殊文字の入力方法＊ギリシャ文字 ⇒英綴りで入力（（例）α ⇒ alpha）＊ハイフン ⇒ スペースに置き換え＊アポストロフィ、”! ? ％“ などの記号 ⇒ 省略＊ウムラウト、アクサン＊分子式 ((例) H2O , ⇒ 省略 39 degrees C.) ２は通常の２とし、39 度Ｃは 39 degree C ■STEP4：詳細検索(Advanced search) ① 検索ボックス下の[advanced]をクリック 1 ② Filter が設定されていたら解除 ③ [Journal]を選択し、American Journal of Medicine 2 と入力 ④ [Data-Publication] を選択し、日付を 2006 to present と入力 3 ⑤ History から最初のキーワード検索 (Search 4 allergic)の Add をクリック ⑥ 検索式が入ったのを確認し、クリック 6 →指定した条件の検索結果が表示 5 ※設定した条件は検索結果画面に表示される「Clear all」をクリックするまで有効になります。 4/7 ■STEP4：検索結果一覧の表示形式を変更 ① デフォルトの表示は、「Summary」「20 1 2 件/1 ページ」「日付(最新)順」 ② [Display Setting]をクリック 3 ③ フォーマット、1 ページあたりの件数、並べ替え順を選択し、[Apply] ④ 検索結果を出力したい場合は、保存/ メールしたい文献にチェックをつけ、 4 [Send to]をクリックし、保存形式を選択 Point 検索結果一覧の見方掲載誌名出版年月；巻（号）：ページ本文が英語以外の論文は、PubMed 上では翻訳されて［］でくくられています。 [Epub ahead of print]とは、オンラインのみで刊行された論文です。冊子に先行してオンラインに掲載される場合（後に冊子にも掲載）と、オンラインのみで刊行されるものがあります。 5/7 ■STEP5：検索結果から論文を入手する ① 書誌情報掲載誌名, 年, 巻(号), ページ論文名著者 ② 抄録 ③ PMID ④ 出版元へのリンク出版社の EJ へアクセスしますが、筑波大学で契約しているかどうかは反映されていません。 ⑤ 関連文献へのリンク ⑥ Tulips Linker 全文を (1) 電子 Point 入手できるかどうかは、[Tulips Linker]で一発解決。ジャーナルが読めるかどうか → (2)筑波大学の図書館で所蔵しているか → (3)学外の図書館で所蔵しているか、の順に調べると効率的です。 ① フルテキストへのリンク ② 附属図書館 OPAC を検索 ③ 他大学の所蔵を検索 ④ 国会図書館の所蔵を検索 ⑤ 図書館の電子ジャーナルリストを検索 ⑥ 文献複写申込（事前申請要・有料） ※本学に所蔵がないものについて、他の機関から複写物を取り寄せることができます。（雑誌のみ） 6/7 参考文献・PubMed Quick Start Guide （http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/#pubmedhelp.PubMed_Quick_Start）・東京大学医学図書館 PubMed の使い方 http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf ・東京慈恵会医科大学 PubMed の使い方 http://www.jikei.ac.jp/academic/micer/pubmed1.pdf ・図解 PubMed の使い方 : インターネットで医学文献を探す(第 5 版) 第 5 版, 2012 （⇒本学所蔵：医学 490.7-A12） 7/7 岩下愛, 山下ユミ共著