電磁プラズマ粒子シミュレーション pCANS

電磁プラズマ粒子シミュレーション
pCANS
松本洋介
千葉大学理学研究科
２０１4年８月5日
宇宙磁気流体・プラズマシミュレーション
サマースクール＠千葉大学
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内容
イントロダクション
電磁プラズマ粒子シミュレーション（３章）
pCANSの紹介（１，２，４、５章）
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イントロダクション
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プラズマシミュレーション手法
近似レベル（≒計算量の逆数）
MHD
Hall MHD
(hybrid)
Two fluid
Vlasov / Particle-in-Cell (PIC)
取り扱える現象のスケール
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プラズマ分散関係（横波・並行伝搬）
ω=ck
R
L
R (whistler)
ω=V A k
MHD
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MHD vs. PIC
MHD
流体的な大規模構造
構造形成（宇宙ジェット、星
形成、銀河団）
ダイナモ（地球、太陽）
恒星風、フレア
有限体積（差分）法
数値スキームにバリエーショ
ン（Roe’s、HLLD、CIP、
etc.）
計算コスト小
並列化効率大
PIC
MHDスケールから電子スケー
ルまで記述できる、無衝突プ
ラズマ第一原理シミュレー
ション手法
粒子加速（無衝突衝撃波、磁
気リコネクション）
粒子輸送（KH不安定、乱流）
磁場生成（Weibel不安定）
粒子法
アルゴリズムはほぼ完成
計算コスト大
並列化に工夫が必要
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基礎方程式
Vlasov-Maxwell方程式系
∂ fs
qs
v
+v⋅∇ f s +
E+ ×B ⋅∇ v f s=0
∂t
ms
c
(
)
s=ion, electron
∂E
=c ∇× B−4 π J
∂t
∂B
=−c ∇ × E
∂t
∇⋅B=0
∇⋅E=4 π ρe
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Vlasov方程式の数値解法
∂fs
qs
v
+v⋅∇ f s +
E+ ×B ⋅∇ v f s =0
実空間の移流（移動）
∂t
ms
c
∂fs
qs
v
速度空間の移流（加速）
+v⋅∇ f s +
E+ ×B ⋅∇ v f s=0
∂t
ms
c
y
(
(
粒子法
)
)
v
流体法
v
v
v
x
x
位相空間をグッリドで定義して、fsを直
分布関数fsを粒子によって表現
接解く手法
アルゴリズムが単純、安定
最大６次元線形移流問題
非熱的成分の運動を記述するのに、膨大
非熱的成分まで記述可能
な粒子数が必要
高効率なベクトル化・並列化が容易 8/36
超並列計算機での効率的な計算が困難
電磁プラズマ粒子シミュレーション
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粒子の運動、加速
粒子と電磁場
d xp up
=γ
p
dt
d up q
up
=
E+
×B
dt
m
c γp
up
J =∑ p q p γ
p
(
)
E, B, J
Maxwell equation
∂B
=−c ∇ × E
∂t
∂E
=c ∇ ×B−4 π J
∂t
流体スケールからデバイ長まで自己
無撞着に解くことができる。
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全体の流れ
t +Δ t /2
1.
2.
3.
4.
up
t −Δ t
−u p
Δt
/2
(
t
qp
u
t
p
t
=
E + t ×B
mp
c γp
)
t
t
t +Δ /2
x t+Δ
−
x
u
p
p
= tp+Δ/ 2
Δt
γp
J
t+Δ t / 2
N
=∑ p
t /2
u t+Δ
p
qp γ
p
B t+Δ t − Bt
=−c ∇ × E t+Δ t /2
Δt
E t+Δ t − E t
=+c ∇ × B t+Δ t /2+4 π J t+Δ t / 2
Δt
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11/36
粒子の加速・移動
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Buneman-Boris 法
(
t /2
t −Δ t
t
q
u t+Δ
−u
/
2
u
p
p
p
t
p
t
=
E + t ×B
Δt
mp
c γp
t
ここで、
qp E
−
t −Δ/ 2
u p =u p +
mp
t
qp E
+
t +Δ/ 2
u p =u p −
mp
Δt
2
Δt
2
)
を導入して、上式に代入。
qp
u +p −u −p
+
−
t
=
u p −u p )×B
(
Δt
2 γp mp c
+
p
−
p
∣u ∣=∣u ∣
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13/36
∗
p
−
p
−
p
+
p
−
p
∗
p
u =u +u ×t
u =u +u ×s
qp B Δt
2t
s=
t=
2
mp γpc 2
1+t
まとめると、、、
電場による加速
u
t −Δ t / 2
p
u
−
p
磁場による回転
電場による加速
u
+
p
u
t +Δ t / 2
p
位置の更新
x
t +Δ t
p
t
p
=x +
u
t +Δ t / 2
p
t+Δ t /2
γ
Δt
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Particle-in-Cell法
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グリッド点に対する粒子の影響度合い
xp-Xi
Xi+1-xp
x
q/2
Xi-1
q/2
xp
Xi
Xi+1
(
x p− X i
J i =∑ p q p v p 1−
Δx
J i +1=∑ p q p v p
(
x p− X i
Δx
)
一次の形状関数
)
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逆もまた然り
xp-Xi
Xi+1-xp
x
F/2
F/2
Xi
Xi-1
(
xp
) (
Xi+1
x p− X i
x p− X i
F p = F i 1−
+ F i+1
Δx
Δx
)
電流計算の時と同じ形状関数
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17/36
電磁場の数値解法
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グリッド点への電磁場の配置
Yeeグリッド
空間二次精度で差分化
レギュラー格子に対して、数値分散が軽減
磁場の発散なし条件（divB=0）を満たす
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電磁場の陰的解法
B
E
t +Δ t
t +Δ t
t
−B
t +Δ t
t
=−c ∇ ×( θ E
+(1−θ) E )
Δt
t
−E
t +Δ t
t
t +Δ/ 2
=c ∇×( θ B
+(1−θ) B )−4 π J
Δt
from PIC
右辺に未来の情報を含む。この種の陰解法という。一方、過
去の情報から求める方法を陽解法という。
電場と磁場は同じ時間ステップに定義される（↔FDTD法）
θ=0.5のとき、クランク・ニコルソン法。θ=1.0で、後進オ
イラー法
陰解法は陽解法に比べて数値的に安定。
逆行列を求める必要があり、計算コストは大だが、粒子計算
ではPIC法が全計算コストの大部分を占めるため、電磁場の陰
解法化に伴う計算コストの増大は軽微
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t
δ B=−θ c Δ t ∇×δ E−c Δ t ∇× E
t
t +Δ t / 2
δ E=θ c Δ t ∇×δ B+c Δ t ∇ ×B −4 π Δ t J
δ B= Bt +Δ t −B t
(
δ B=B t +Δ t − Bt
4π
t+Δ t /2
( I −( θ c Δ t ) ∇ ) δ B=θ(c Δ) ∇ B + c ∇ ×J
−c Δ t ∇× E t
2
2
2
2
t
)
既知量
A x=b
Conjugate gradient method
(共役勾配法)
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束縛条件
∇⋅B=0
∇⋅E=4 π ρe
∇⋅B=0
Yeeグリッド上に定義された磁場はd/dt (divB)=0を
丸め誤差の範囲で満たすので、初期条件で満たせば
その後の計算中も丸め誤差の範囲で満たす
誘導方程式のYeeグリッド上での差分化
E
t+Δ t / 2
z ,i+1/2, j+1/ 2
t+Δ/ 2
z , i+1/ 2, j−1/ 2
−E
B
=B
−
Δt
Δy
t+Δ t /2
t+Δ/ 2
E
−E
t
t
z , i+1 /2, j+1/2
z , i−1 /2, j+1/2
B ty+Δ
=B
+
Δt
, i , j+1/2
y ,i , j+1/2
Δx
t +Δ t
x , i+1 /2, j
t
x , i+1/ 2, j
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差分化した ∇⋅B=0
B x , i+1/ 2, j −B x , i−1/ 2, j B y , i , j+1/ 2−B y , i , j−1/2
∇⋅B=
+
=0
Δx
Δy
差分化した誘導方程式を上式に代入すると、電場の項が打ち
消し合って、
t
t+Δ t
t +Δ t
t+Δ t
B tx+Δ
−
B
B
−B
, i+1 /2, j
x , i−1/2, j
y , i , j+1/2
y ,i , j−1 /2
+
=
Δx
Δy
t
t
t
t
B x , i+1 /2, j − B x , i−1/2, j B y , i , j+1/2 −B y ,i , j−1 /2
+
Δx
Δy
時間ステップ前後で、差分化したdivBは維持される
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∇⋅E=4 πρe
電荷保存法
ρeとJを独立にPIC法で計算すると、必ずしも電荷保存則
を満たさないため、（静）電場に誤差が生じる。
∂ ρe
+∇⋅J =0
∂t
粒子の位置（形状関数）の時間変化からセル境界におけ
る電荷流束（qv）を求める。
Density Decomposition法（Esirkepov, CPC, 2001）の採用
同じアルゴリズムで任意の次数の形状関数に適用可能
分岐処理（if文）がない
精度が良い
２０１4年８月5日
宇宙磁気流体・プラズマシミュレーション
サマースクール＠千葉大学
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様々な形状関数
計算コストが一番低いのはNGP（0次）だが、コストと
精度のバランスがとれたCIC（1次）法が広く使われる。
2次のスプラインの方法により、形状関数によるノイズ
を大きく減らせる。相対論的流れの現象を取り扱うのに
必要とされる。
Density decomposition法を採用したことにより、０－２
次まで拡張が可能に
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パラメタの決め方
Dtの決め方
電磁場は陰的解法で解いているので、光モードによ
るCFL条件はない。通常は、電子プラズマ振動を解
ける程度に設定する。典型的には、
ω pe Δ t<0.1
Dxの決め方
通常はデバイ長程度に設定する。
Δx
∼1
λD
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pCANSの紹介
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CANS
Coordinated Astronomical Numerical Software
磁気流体（MHD）シミュレーションコードパッ
ケージ
太陽や星、星間空間などにおける宇宙の流体現
象を対象としたシミュレーションを簡単に実行
可能
数値スキームの選択が可能
多くの物理課題が整備
Fortran77
IDLによる可視化
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pCANS
PICシミュレーションコードパッケージ
CANSと同じようなディレクトリ構成
CANS経験者であればすぐに使えるはず。。。
１，２次元コード
物理課題の整備（weibel, mrx, shock, KH, etc.)
Fortran90
MPI並列化（PCからスパコンまでポータブル）
IDLによる可視化
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世界におけるPICコード
公開／非公開
フリー／商用
並列化
開発元
TRISTAN-MP
公開
フリー
◯
Princeton/USA
OSIRIS
非公開
フリー
◯
UCLA/USA
VSim
非公開
商用
◯
Tech-X corp./USA
KEMPO
非公開
フリー
◯
京都大学
CELESTE3D
公開
フリー
◯
LANL/USA
pCANS
公開
フリー
◯
千葉大学
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宇宙磁気流体・プラズマシミュレーション
サマースクール＠千葉大学
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pCANSドキュメント
http://www.astro.phys.s.chiba-u.ac.jp/pcans
*padユーザーのためには、電子図書形式（epub）
も配布します（非公式）
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開発メンバー
松本洋介（千葉大）- 統括、KH不安定、無衝突衝撃波
天野孝伸（東大） - 情報技術参与、無衝突衝撃波、二流
体不安定
加藤恒彦（広島大） - Weibel不安定、無衝突衝撃波
銭谷誠司（NAOJ） - 磁気リコネクション
高橋博之（NAOJ） - 磁気リコネクション
三好由純（名大） - 電子温度異方性不安定
簑島敬（JAMSTEC）- 電子温度異方性不安定、IDL
星野真弘（東大）- アドバイザー
松元亮治（千葉大） - アドバイザー
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領域分割によるMPI並列化
粒子分割法
領域分割法
E, B
実装が容易
通信はreductionのみ
キャッシュに乗りにくい
電磁場は各プロセスで共有
超並列（>100）計算では、並
列化効率が悪い
E, B
超並列（>100）計算でもス
ケーリングが良い
キャッシュに乗りやすい
コーディングが面倒（領域間
の粒子の受け渡し）
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負荷バランスの崩れに注意
２次元コードの並列化効率
(weak scaling)
512並列まで、「そこそこ」スケール
PCからスパコンまでポータブル
実行効率は5-7％程度
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pCANS物理課題
１次元課題
線形波動
無衝突衝撃波
２流体不安定
温度異方性不安定
２次元課題
数値チェレンコフ不安定
Weibel不安定
36/36
36/36
２次元課題
磁気リコネクション
37/36
37/36
２次元課題
無衝突衝撃波
KH不安定
M/m=16
M/m=64
M/m=256
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