ファスマックDNAシーケンス解析 - greiner bio-one

バイオ研究支援事業部
ファスマックDNAシーケンス解析
ファスマックのDNAシーケンス解析は、
高品質なデータを迅速にお届けすることが特長です。お客様のお仕事の一部を弊社が
承ることにより、
お客様により速く、
より良い成果を得ていただくことが、
弊社の役割と考えています。データのアセンブルや比較、
シーケンサーによる泳動のみのサービスまで、
解析数も1本から96穴プレートまで、
どのようなご要望にもお応えいたします。
概要
解
析
機
器
Applied Biosystems 3130xl ジェネティックアナライザ
Applied Biosystems 3730xl DNAアナライザ
解
析
試
薬
BigDye Terminator V3.1
ランタイム/解読base数/ 1hr / 600-700base / 800base
＊ 2hr / 700-800base / 1000base
ご提供データb a s e 数
解
析
コ
ー
ス
ノーマル、
ワンパス、Premix、
レンタル
解析データ形式
波形データ
（ab.1）
、配列データ
（txt）
納
E-mail、郵送
品
方
法
＊解読base数/ご提供データbase数…ノーマル解析以外では、
解析データの前後をカットせずに全てお届けしております
（「ご提供データbase数」）
。
「解読base数」
は
「ご提供データbase数」
のうち、
信頼の持てるデータ長
（base数）
です。
サービスの流れ
Premix 1
ご依頼コース
ノーマル
ワンパス
Premix 2
レンタル
早く、安く解析したい
シーケンサーの
泳動だけ
お願いしたい。
シングル
データアセンブルも
お願いしたい
こんな
お客様に
お勧め
全長解析
(Primer walking
してほしい）
既知配列、
解析データ
間の比較をしてほしい
ファスマックの
スタンダード
早く解析結果が欲しい
テンプレートＤＮＡとプラ
イマーを別々にご用意
いただくことで、様々な
ご要望に対応できます。
良好な結果が得られな
い場合に、再解析を
保証してほしい。
プライマー設計、
合成
からお願いしたい
シングルＬｉ
ｔｅ
8連
プレート
1サンプル単位 8サンプル単位 96サンプル単位
お客様で実施
STEP1
テンプレートDNAの純度・濃度確認
（電気泳動チェック）
シーケンス反応に使用するDNA量の決定
シーケンス反応テンプレートＤＮＡシーケンスプライマー+酵素ミックス(BigDye Terminator v3.1)
STEP3
シーケンス反応産物の精製 BigDye XTerminatorを使用
STEP4
シーケンスサーにて泳動（ラン）・Premix2→1hrラン(解読base600−700b)
STEP5
3130xl、3730xl
・その他解析コース→2hrラン(解読base700−800b)
データＱＣ
全データを専門スタッフがチェック
＜データ不良の場合＞
・条件を変更しての再泳動(STEP4に戻る)
(例）
シーケンサーのインジェクション効率を上げる、下げる、
サンプルを希釈するなど…
STEP7
・波形データ、
配列データ、
contigチャート他
納品
納品
STEP8
お客様で実施
データアセンブル
マニュアルによる
contigデータ作成、
比較データ作成
Primer walking 等
・波形データ
（.ab1)
・配列データ(txt)
お客様で実施
再反応
シーケンス反応条件を変更して再解析を実施します。(STEP2に戻る)
(例）
GC-richが疑われる場合に高次構造に特化した試薬を使用するなど…
お客様で実施
＜再泳動で改善されない場合＞
STEP6
お客様で実施
STEP2
サービスの詳細
Premix 1
ご依頼コース
ノーマル
ワンパス
解読base数
700-800b
700-800b
700-800b
納期
3日
（最短2日）
2日
(最短1日)
1日
¥6,500/run
¥3,000/run
スポット
料金
※
キット
ご提供サンプル
シングル
8連
シングルLite
レンタル
プレート
600-700b
1日
700-800b
2日
（最短1日）
2日
（最短1日） 2日
（注1）
¥5,440 ¥38,400
¥2,000/run ¥950/run
（¥680/run）
（¥400/run）
¥6,500
（30run Kit） ¥3,000/run（30run Kit）
¥2,000/run
¥6,000
（100run Kit） ¥2,500/run（100run Kit）
テンプレートDNAとプライマーを別容器にてご提供
いただきます。
（ユニバーサルプライマーは弊社で準備いたします）
Premix 2
¥1,000/run
¥1,000/run
ご相談
テンプレートDNAとプライマーを混合したサンプル
をご提供いただきます。
シーケンス反応・
精製済みサンプ
ルをご提供いた
だきます。
※料金について／都度清算型の
「スポッ
ト」
と、
プリペイド型の
「キッ
ト」
がございます。
キッ
トご購入の方には、
ご注文セッ
ト
（ご依頼用サンプルチューブ、
ラベル、
配送用伝票）
を差し上
げております。
またキッ
トご利用の場合、
販売元
（株）
グライナー・ジャパンより、
ご購入数に応じたギフトがございます。詳しくは、
DNAシーケンス解析キッ
ト購入申込書をご確認ください。
（注１）
「急がないのでもっと価格を抑えたい」場合には、
「ゆとり」
プラン
（¥33,600/4営業日）
がございます。
ご依頼時に「ゆとり希望」
とご記載下さい。
オプション内容
料金
ご依頼コース
ノーマル
ワンパス
Premix
レンタル
プライマー設計・合成
¥3,000/本
○
○
―
―
PCR産物精製
¥5,000/サンプル
○
○
―
―
データアセンブル（マニュアル）
¥3,000/データ
無料
○
○
○
CD-Rデータ納品
¥2,000/ご依頼
○
○
○
○
波形データ印刷
¥2,000/ご依頼
無料
○
○
○
Blast検索
¥1,000/データ
○
○
○
○
サンプル、プライマー返却
¥2,000/ご依頼
○
○
―
―
※プレート単位でのデータアセンブル、1hrランから2hrランへのアップグレードなどのご要望にも応じます。お気軽にご相談ください。
ご依頼方法
解析サンプルの準備
●ノーマル
●ワンパス
・プラスミドDNA
市販のプラスミド精製キットにて調製し、電気泳動により純度・濃度チェックを行ってください。
可能であれば、電気泳動写真を添付してください。送付量は100ng/ulで20ul程度お願いします。
・ PCR産物
プライマー、dNTPの除去、
エキストラバンドがある場合には電気泳動切り出し精製を行ってください。
・解析プライマー
ユニバーサルプライマーは弊社で用意しております。
オリジナルの場合はサンプルとは別容器にて10uMで10ul以上ご提供ください。
※1.5mlチューブなどの破損しにくい容器でご提供ください。
カスタム合成も承ります。
●Premix
以下の通り、
テンプレートDNAと解析プライマーを混合後、14ulに調製してください。
300-600ng
Plasmid
PCR産物
プライマー
100-200bp
2-6ng
200-500bp
6-20ng
500-1000bp
10-40ng
1000-2000bp
20-80ng
＞2000bp
40-100ng
6.4pmol
●レンタル
BigDye Terminator V3.1 Cycle Sequencing Kit
（AB社）
にて反応、精製、乾燥後、遮光し、
クール便にてご送付下さい。反応試薬はBigDye Terminator V1.1も対応可能です。
ご依頼の流れ
1 ご注文書（オーダーシート）への入力とメールでの送信をお願いします。
入力後、
ファスマック
（ [email protected] ）
へ送信してください。
また、
オーダーシートは、
サンプル送付用に1枚印刷してください。
※ご注文書は下記よりダウンロードできます。
http://www.greiner-bio-one.co.jp/products/DNA/dna_sequencing.html
2 シーケンスキットをご利用の方はキット購入手続きをお願いします。
DNAシーケンス解析キット購入申込書へご入力、
ファスマック
（ [email protected] ）
へ送信して下さい。
FAX
（グライナー・ジャパン
（FAX：03-3505-8879）
）
も受け付けております。
3 サンプル、オーダーシート
（印刷物）の送付をお願いいたします。
〈送り先〉
〒243-0021 神奈川県厚木市岡田3088 ケーオービル4階
株式会社ファスマックバイオ研究支援事業部
シーケンス担当
Tel:046-222-6962
4 ファスマックにサンプル到着
オーダーシートとサンプルを確認後、
お客様にE-mailで受注のご連絡をいたします。
「解析受注のご連絡」
5 ファスマックでご希望内容に応じたシーケンス解析を行います。
6 「解析受注のご連絡」でお伝えした納期までに、E-mailで結果をお届けいたします。
【注意事項】
※サンプルは、
冷凍便、
冷蔵便、
保冷剤同封の普通便、
いずれかでお送りください。
※サンプル送料は、
4サンプル以上、
Premix8連、
プレートについて着払いで承ります。
※サンプル送付用の印刷済み宅配伝票をご提供しております。
ご希望の際はお申し付けください。
※解析データ、
プロジェクト内容について、
秘密厳守いたします。秘密保持契約、
年間契約にも応じますので、
お問い合わせください。
※反応系の特性上、
プライマーの3'末端から数10baseは正確なデータが得られません。
※PCR産物は、
増幅長が100bp以下の場合、
結果を得ることができない場合があります。
※シーケンス反応のアニーリング温度は50℃で行っております。
プライマーのTm値にご注意ください。
※本サービスは研究目的にのみ利用できます。診断目的にはご利用いただけませんのでご了承ください。
※本サービスは、配列の解読を保証するものではございません。弊社では万全の体制で解析を行っておりますが、
お預かりしたサンプルの状態、特殊な配列
（連続配列、繰り
返し配列、
GC-richなど）
の場合には解析が困難となる場合がございます
※サンプルはP1レベルまでとさせていただきます。 ※血液や組織、
ウイルス等の受け入れは行っておりません。
121029
解析元
販売元株式会社ファスマック
株式会社グライナー・ジャパン
〒243-0021 神奈川県厚木市岡田3088 ケーオービル4階
〒107-0052 東京都港区赤坂 2-17-44 福吉坂ビル
株式会社ファスマックバイオ研究支援事業部
株式会社グライナー・ジャパン
シーケンス担当
TEL：03-3505-8875(代表)
TEL：046-281-9902
FAX：03-3505-8879
Email ご注文用…[email protected]
http://www.greiner-bio-one.co.jp/
Email お問い合わせ用…[email protected]

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