De bepaling van pyrazinamide resistentie

Diagnostiek in tuberculose
pyrazinamide
Sami Simons
Radboud UMC, afdeling longgeneeskunde
Pyrazinamide
• Een stukje geschiedenis….
• Hoe werkt pyrazinamide eigenlijk?
• Het bepalen van pyrazinamide resistentie
Disclosure Statement for Conflicts of Interest
I have no conflicts of interest to disclose
Pyrazinamide
Een stukje geschiedenis
De ontdekking van pyrazinamide
• 1936,
synthese van pyrazinamide
• 1945,
vitamine B3 actief tegen
tuberculose
• 1952,
Pyrazinamide meest potente
nicotinamide analoog in vivo
muismodel
• 1952,
meteen getest in patiënten……
Zhang 2003;7:6
De ontdekking van pyrazinamide
• Walsh McDermott (1909-1981)
• Als arts-in-opleiding pulmonale
tuberculose (1935)
• Lobectomie en thorocoplastiek
vanwege bronchopleurale fistel
(1950)
Zhang 2003;7:6
De ontdekking van pyrazinamide
• De eerste ontdekking:
• Alleen actief in zuur milieu
• De tweede ontdekking
• Steriel na behandeling. Groei
enkele dagen erna
• basis voor huidige idee over
dormant bacilli
• Pyrazinamide actief tegen deze
dormant bacilli
Zhang 2003;7:6
Mijlpalen
• Pyrazinamide aan de wieg van RCTs
• PZA,R, of thioacetazon bij S+H behandeling
• Meer sputumconversie op maand 2
• Pyrazinamide aan de wieg van DOTS
• Z of R: duur TB behandeling van 12 naar 9 maanden
• Z en R: behandeling van 12 naar 6 maanden
• Pyrazinamide aan de wieg van toekomstige (MDR)TB behandelingen
• Synergistisch met Bedaquiline en fluorochinolonen
• Verkorting TB behandeling naar 4 maanden (PAMZ trials)?
Hoe werkt pyrazinamide?
De centrale rol van pyrazinamidase
Klassieke theorie: nonspecifiek
• Pyrazinamide als prodrug
• Omzetting door pyrazinamidase
enzym
• Passieve diffussie (of actief
transport?) cel uit
• In zuur milieu als ongeladen HPOA
cel weer in
• Acidificatie van de cel
Zhang 2003;7:6
Nieuwe inzichten: trans-translatie
• Onder stress (pH, hypoxie?)
….stop mRNA translatie
• Koppeling tmRNA waardoor
hervatten translatie
• Hiervoor ribosomaal proteine S1
noodzakelijk (rpsA)
• POA bindt aan rpsA hierdoor geen
trans-translatie meer mogelijk
• Depletie ribosomen, ophoping
defecte eiwitten
Shi 2011:333;1630
Nieuwste inzichten; CoA
• Whole genome sequencing van
pyrazinamide resistente stammen
• Mutaties in panD
• panD betrokken bij synthese Coenzym-A
• CoA betrokken oxidatie FFA en
pyruvaat in citroenzuur cyclus
• Rol panD en pyrazinamide?
Zhang 2013;2:e34
Pyrazinamide resistentie
Valkuilen in de diagnostiek
Resistentiebepaling van pyrazinamide
• Storende factoren in het bepalen van pyrazinamideresistentie
• Fenotypische resistentiebepalingen
• Moleculaire resistentiebepalingen
• Voor de praktijk:
stroomdiagrammen voor bepalen van pyrazinamideresistentie
Resistentiebepaling van pyrazinamide
• Storende factoren in het bepalen van pyrazinamideresistentie
• Fenotypische resistentiebepalingen
• Moleculaire resistentiebepalingen
• Voor de praktijk:
stroomdiagrammen voor bepalen van pyrazinamideresistentie
Pyrazinamide
• Pyrazinamide pas actief na conversie door pyrazinamidase
• Activiteit pyrazinamide/pyrazinamidase afhankelijk van:
1.
pH medium
2.
Inoculumgrootte
3.
Bovine serum albumine (BSA)
4.
Groeifase M. tuberculosis?
Pyrazinamide
• Pyrazinamide pas actief na conversie door pyrazinamidase
• Activiteit pyrazinamide/pyrazinamidase afhankelijk van:
1.
pH medium
2.
Inoculumgrootte
3.
Bovine serum albumine (BSA)
4.
Groeifase M. tuberculosis?
Effect van pH
• Het probleem in diagnostiek is:
• Bij hoge pH pyrazinamidase niet
actief
• Bij lage pH geen groei M.
tuberculose
• Kritische concentratie (pH 5.5) = 50
μg/ml (= MIC90)
Zhang 2003;7:6
Effect van pH
• MIC afhankelijk van pH medium
• Henderson-Hasselbach vergelijking
pH = pKa + log[A-]/[HA]
• Theorie:
Bij PZA bepaalt fractie HA activiteit
• Hogere pH, lagere HA fractie: dus
hogere MIC
• Op pH 6.0, theoretische MIC 156
μg/ml
Zhang 2003;7:6
Pyrazinamide
• Pyrazinamide pas actief na conversie door pyrazinamidase
• Activiteit pyrazinamide/pyrazinamidase afhankelijk van:
1.
pH medium
2.
Inoculumgrootte
3.
Bovine serum albumine (BSA)
4.
Groeifase M. tuberculosis?
inoculumgrootte
• Inoculumgrootte > 107 neutraliseert
pH medium
>> pyrazinamidase inactief
• Achtergrond:
NH3 als bijproduct van omzetting
pyrazinamide
Zhang 2003;7:6
Pyrazinamide
• Pyrazinamide pas actief na conversie door pyrazinamidase
• Activiteit pyrazinamide/pyrazinamidase afhankelijk van:
1.
pH medium
2.
Inoculumgrootte
3.
Bovine serum albumine (BSA)
4.
Groeifase M. tuberculosis?
Andere storende factoren
• BSA
• supplement in kweekmedia
(0.5%, 7H9 medium)
• 0.5%-2.0% BSA verhoogt MIC
pyrazinamide
• Werkingsmechanisme:
• Verhoging pH
• Binding aan POA• Groeifase M. tuberculosis?
• Hogere kill 3 maanden ouder
bacterie dan 4 dagen oude
bacterie
Zhang 2003;7:6
Resistentiebepaling van pyrazinamide
• Storende factoren in het bepalen van pyrazinamideresistentie
• Fenotypische resistentiebepalingen
• Moleculaire resistentiebepalingen
• Voor de praktijk:
stroomdiagrammen voor bepalen van pyrazinamideresistentie
Fenotypische resistentiebepaling
• Testen pyrazinamide gevoeligheid
in MGIT 960 systeem (pH 6.0)
• CC = 100 μg/ml (fabrikant)
• Sensitiviteit: 91-100%
Specificiteit: 87-100%
• zuur milieu: 4% geen groei
• Wild type MIC distributie in MGIT
960 systeem
Simons 2011; 17:2863 & Werngren
2012;56:1253
Fenotypische resistentiebepaling
• MGIT 960 geeft hogere kans op
vals-resistente uitslagen
• 42-68% vals-resistent bij 1ste MGIT
uitslag
• Oorzaken:
1. Groter inoculum (0.5 ml)
2.
Lagere kritische concentratie
Simons 2012;50:428
Resistentiebepaling van pyrazinamide
• Storende factoren in het bepalen van pyrazinamideresistentie
• Fenotypische resistentiebepalingen
• Moleculaire resistentiebepalingen
• Voor de praktijk:
stroomdiagrammen voor bepalen van pyrazinamideresistentie
Moleculaire testen
• Pyrazinamidase enzym centraal in werking pyrazinamide
• Het pncA gen codeert voor pyrazinamidase
• Morlock (1997)
mutaties in het pncA gen geven pyrazinamide resistentie
• Epidemiologische studies:
70%-98% van de pyrazinamide resistente M TB isolaten hebben een mutatie
in het pncA gen
Zhang 2003;7:6
Moleculaire testen
• Mutaties in pncA zijn voorspellend voor optreden pyrazinamide resistentie
• Geen hotspotregio, mutaties verspreid over het gen (558 bp)
Chang 2011;55:4499
Moleculaire testen
• Gebruik moleculaire testen afhankelijk van pyrazinamide prevalentie
• Laag prevalentie:
uitsluiten pyrazinamide resistentie
• Hoog prevalentie:
aantonen pyrazinamide
Chang 2011;55:4499
Resistentiebepaling van pyrazinamide
• Storende factoren in het bepalen van pyrazinamideresistentie
• Fenotypische resistentiebepalingen
• Moleculaire resistentiebepalingen
• Voor de praktijk:
stroomdiagrammen voor bepalen van pyrazinamideresistentie
Diagnostiek algoritme
• Diagnostiek afhankelijk van prevalentie pyrazinamide en MDR-TB
• Laag-prevalentie landen:
• Screening met fenotypische testen
• Hoe om te gaan met valspositieve MGIT uitslagen?
• Hoog-prevalentie landen:
• Screening met moleculaire testen
• Hoe moleculaire (snel)testen in te zetten?
Algoritme in laagprevalentie landen
• Prevalentie pyrazinamide
resistentie in NL: 1%
• Screening via MGIT 960 geeft veel
valspositieven
• Is het mogelijk deze te identificeren
via mutaties in pncA?
• 1,650 isolaten uit NL
screening via MGIT
pncA analyse indien resistent
Simons 2012;50:428
Algoritme in laagprevalentie landen
• pncA mutaties zijn voorspellend
voor resistente isolaten na 1ste
MGIT
• Voorstel: pncA analyse bij 1ste
resistente PZA MGIT
• Andere opties:
• Herhalen fenotypisch
• Alleen pncA analyse
• Verminderd inoculum
• Hogere kritische concentratie
Simons 2012;50:428
Algoritme in hoogprevalentie landen
• Screening door middel van rpoB mutatie analyse
• pncA om resistentie aan te tonen
• Kan via rpoB en pncA analyse snel pyrazinamide resistente MDR-TB worden
aangetoond?
Diagnostiek in van PZA-R MDR-TB
• 83 patienten met MTB met rpoB
mutatie
• Prospectief
• pncA mutaties analyse
• PZA MGIT kit tweemaal
• Resultaten R en H uit database
gehaald
• Voorspelt pncA mutatie voor PZA-R
MDR-TB?
Simons 2014 in press
Diagnostiek van PZA-R MDR-TB
• 33 pncA mutaties
• 30 PZA resistente MDR TB
• 3 valspositief
• 1 gemist (geen pncA mutatie)
• pncA mutaties goed voorspeller
PZA-R MDR-TB
• Voorstel: pncA mutatie analyse
uitvoeren bij elk rpoB+ MTB patiënt
Simons 2014 in press
Pyrazinamide
• Een stukje geschiedenis….
• Hoe werkt pyrazinamide eigenlijk?
• Het bepalen van pyrazinamide resistentie