PTLV-1の起源と進化 氏名:307102 塚田幸絵 所属:熱帯医学研究所 国際保健学分野 担当教員:江口克之、山本太郎 目的 STLV-1とヒトのHTLV-1の感染自然史を比較する ための第一歩として、ニホンザルに感染して いるSTLV-1株のPTLV-1内の系統学的位置づ けの解明 背景 PTLV-1について 霊長類T細胞白血病ウイルス1型(PTLV-1)はアフリカ、ア ジアに分布する真猿類のサル、類人猿、ヒトのT細胞 に感染するレトロウイルス。 サル、類人猿を自然宿主とするウイルスはサルT細胞白 血病ウイルス1型(STLV-1) ヒトを宿主とするウイルスは成人T細胞白血病ウイルス (HTLV-1) と便宜的に分類されている。 PTLV-1の遺伝子構造 5’-LTR-ψ-gag-pol-env-LTR-3' LTR(反復配列) ψ (RNA ゲノムが粒子内に取り込まれるのに 必要なパッケージングシグナル) STLV-1とHTLV-1はenv、pX、LTRの各遺伝子領域でほぼ 90%の相同性を示すほど非常に近縁である。 HTLV-1陽性者→ATL(白血病) →HAM/TSP(神経疾患) 西南日本は中央・西アフリカ、ニューギニア・メ ラネシア、カリブと並び世界的に見てもHTLV-1 陽性率の高い地域である。 最近の分子系統学的研究では・・・ ①STLV-1にはいくつかの明瞭な系統群が存在し、 それぞれの系統群は、その流行地において、 種の壁を越えて感染していること、 ②HTLV-1はアフリカにおいて、サルや類人猿を 自然宿主とするSTLV-1がヒトに偶発的に感染 する過程で多系統的に進化してきたこと を示している。 ⇒PTLV-1の系統分化において、水平感染が重 要な役割を果たしている! 他にも・・・ • ニホンザル(Macaca fuscata)ではSTLV-1陽性率 が群によっては50%を超える • 青年期以降の水平感染が頻繁に起こっている ことが示唆されている。 このことは、HTLV-1の主要な感染経路が授乳を介 した母子感染で、陽性率も数%程度であることと 異なっている。 サルの中で高い陽性率を示す種・地域個体群の 大部分はマカク属に属している ⇒STLV-1はもともとマカクのウイルスであった? つ・ま・り ニホンザルのSTLV-1とヒト のHTLV-1の感染自然史を 比較する ⇒ ウイルスがヒトへ宿主転換 し、ヒト社会へ適応していく プロセスを解明 対象と方法 • 本研究では、進化速度が比較的遅いと考えられているpol領 域の一部を解析対象とした。 1. 福井県内で捕獲されたSTLV-1陽性ニホンザル6個体 の末梢血からDNAを抽出。 2. それらのDNAについて、pol領域の一部1703塩基を PCR法によって増幅。 3. Exosap処理したPCR 産物はサイクルシークエンス反 応に供し、塩基配列を読み取る。 4. 得られた配列をDNA Baserを用いて照合することに より、1200~1500塩基長の配列を決定。 5.決定された配列をGenBankに登録されているPTLV-1 株の配列とともに、最尤法により系統解析した。 結果 AF139170 95 J02029 HTLV1China 84 AY563954 HTLV1 100 99 D13784 STLV01 22 100 AF074966 89 toyama1 87 toyama4 100 98 toyama226 L02534 Z46900 ニホンザルのSTLV-1はHTLV-1の グループに属している。 100 69 99 100 HTLV4 HTLV04 99 HTLV002 HTLV2 STLV02 100 STLV2 STLV03 STLV3 100 HTLV3Pyl 89 99 HTLV3Lobak 79 STLV1 AY590142 0.1 AF139170(HTLV-1 95 from HTLV-1 /2 seroindeterminate patient) J02029(HTLV-1 proviral DNA) HTLV1China 84 AY563954 (HTLV-1 two Blazilian isolate) HTLV1 100 99 D13784(HTLV-1 proviral Caribbian orizin) STLV01 22 100 AF074966)STLV-1 isolate natural infected Tantalus Monkey Tan90 from 89 87 Central Africa toyama1 toyama4 100 toyama226 L02534(HTLV-1 melanesian varient (mel5) proviral DNA) Z46900(STLV-1 from exons(TE4) naturally infected celebes macaques (Macaca tankeana)) 0.02 Toyama1と異なる塩基個数の割合 toyama1(1502基)との比較(%) 14 Z46900 L02534 toyama4 toyama226 AF074966 D13784 AY563954 HTLV1China J02029 AF139170 12 10 8 6 4 2 0 HTLV-1よりSTLV-1との違いのほうが大きい AF139170(HTLV-1 95 from HTLV-1 /2 seroindeterminate patient) J02029(HTLV-1 proviral DNA) HTLV1China 84 AY563954 (HTLV-1 two Blazilian isolate) HTLV1 100 99 D13784(HTLV-1 proviral Caribbian orizin) STLV01 22 87 100 約45万年前 AF074966)STLV-1 isolate natural infected Tantalus Monkey Tan90 from 89 Central Africa toyama1 toyama4 100 約5万年前 toyama226 L02534(HTLV-1 melanesian varient (mel5) proviral DNA) Z46900(STLV-1 from exons(TE4) naturally infected celebes macaques (Macaca tankeana)) 0.02 この系統樹はアミノ酸配列の突然変異が一定速度で発生す るという背景のもと 成り立っており、距離は時間に比例する こととなる。 ディスカッション サルとヒトの宿主の違いにより、 ウィルスの進化速度が違うのではないか • Gene bank に保存されているデータ数が少な いため結論を出すことはできないが、 原猿類と真猿類の進化においても進化速度の 違いが挙げられているので、この説は有力で はないかと思われる。 今後はサルの集団中における水平感染の進化 速度への影響を検討していく必要性があると 思う。 謝辞 • この研究をするにあたり、研究する機会を頂 いた山本太郎先生、何から何まで御助言を 頂いた江口克之先生に深く御礼申し上げま す。 打ち上げ楽しみです!! 96 U19949(HTLV-1 ATL-YS a prematurelly terminaited px open reading from Ⅱ) J02029(HTLV-1 proviral DNA) AB513134(HTLV-1 proviral DNA) L03562(from rabbit cell lines with diverse in VIVO effect) 0 AF259264(HTLV-1 isolate WHP from China) AB273635(HTLV-1 Eukarystic synthetic constract) L03561(from rabbit cell lines with diverse in VIVO effect) 73 93 77 72 AF139170(HTLV-1 from HTLV-1 /2 seroindeterminate patient) L36905(HTLV-1 proviral in post-transfusional spastic paraparesis from uncultured blood cell) AF042071(HTLV-1 stain RKI3-Ger from Germony) 88 M86840(HTLV-1 tropical spatic paraparesisをもつ人から) AY563953(HTLV-1 strain BRRP438 two Blazilian isolate) 99 77 AY563954(HTLV-1 two Blazilian isolate) D13784(HTLV-1 proviral Caribbian orizin) 99 AF033817(HTLV-1 ) AF074966(STLV-1 isolate natural infected Tantalus Monkey Tan90 from Central Africa) toyama226 85 toyama227 toyama4 100 toyama7 87 toyama92 87 toyama3 toyama1 0.02
© Copyright 2024 ExpyDoc