物質科学実験 CIII タンパク質の取り扱い

海洋生命・分子工学基礎実験
タンパク質の取扱い
(4)
細胞分子工学研究室担当
4. SDS-ポリアクリルアミド
ゲルの調製
おまけ
(kDa)
120
90
48
36
28
20
• アフィニティークロマトグラフィーの結果の例
まずは・・・
• ゲル板を組み立てる。
– 当日実演します。
– メモの用意を!
使う溶液
1. A 液 (30% アクリルアミド水溶液)
2. B 液 (Lower Gel Buffer)
3. C 液 (Upper Gel Buffer)
4. D 液 (10% 過硫酸アンモニウム
ammonium peroxodisulfate = APS)
5. E 液 (10% テトラメチルエチレンジアミン
tetramethylethylenediamine
= TEMED)
分離ゲル
(separation gel = running gel)
• 以下の溶液を混ぜる(12.5% アクリルアミド)。
– A 液: 3.47 ml (3470 ml)
– B 液: 2.08 ml (2080 ml)
– 蒸留水: 2.78 ml (2780 ml)
• ここまで混ぜたところで脱気
– D 液: 28.5 ml
– E 液: 85 ml
• D 液と E 液を加えたらすばやく混ぜてゲル板
に流し込む。
分離ゲル
(separation gel = running gel)
• ガラス板に流し込んだら,上に静かに水飽和
1-ブタノールを載せる。
• 1-ブタノールはアクリルアミド水溶液とは混ざ
らない。ゲルの上の端が平らになるように 30
分ほど静置してゲルを固める。
• 固まったら,1-ブタノールを捨て,水道水→蒸
留水で洗う。
• 残った水をろ紙で拭き取る。
濃縮ゲル
(stacking gel)
• 以下の溶液を混ぜる。
– A 液: 375 ml
– C 液: 625 ml
– 蒸留水: 1.5 ml (1500 ml)
• ここまで混ぜたところで脱気
– D 液: 7.5 ml
– E 液: 50 ml
• D 液と E 液を加えたらすばやく混ぜてゲル板
に流し込む。
濃縮ゲル
(stacking gel)
• 気泡を閉じ込めないように,サンプルコウムを
差し込む。
• 30 分間ほど静置し,ゲルを固める。
• 固まったら,サンプルコウムとシールガスケッ
トを取り外し,水でぬらしたキムワイプと一緒
に,ラップで包んで冷蔵保存する(数週間は
保存可能)。
サンプルの調製
• SDS-サンプルバッファー
– 10% (w/v) グリセリン
– 5% (v/v) 2-メルカプトエタノール
– 2.3% (w/v) SDS
– 62.5 mM Tris-HCl (pH 6.8)
• 当日は,上記のサンプルバッファーの 2 倍濃
縮ストック溶液を使用します(次のスライド)。
サンプルの調製
• 2x SDS-サンプルバッファーの実際の作り方
(以下のものを混ぜて 10 ml とする)
– 50% グリセリンを 4 ml
– 2-メルカプトエタノールを 1 ml
– SDS の粉を 0.46 g
– 0.5 M Tris-HCl (pH 6.8) を 2.5 ml
– 蒸留水を 2.5 ml
– 最後に少量のブロモフェノールブルーの粉を溶か
し,適度に青い色をつける。
サンプルの調製
• アフィニティークロマトグラフィーで分画した 3
つの試料 (A, B, C) を 50 ml ずつ,別の
チューブに取り分け,それぞれに 50 ml の 2x
SDS サンプルバッファーを加える。
• このとき,フタの周りにサンプルバッファーを
つけないように注意!
• 80℃ 程度で 5 分加熱して,タンパク質に
SDS を結合させる (泳動の直前に行なう)。
電気泳動の準備
• 下槽に泳動バッファーを
入れる (泡立てない)
• 泳動槽にゲルを取り付
ける
• 上槽に泳動バッファーを
注ぎ込む
• ケーブルを接続する
(赤は赤と,黒は黒と)
電気泳動用の電源
• 電圧 (voltage) の調節
• 電流 (current) の調節
• OUTPUT の ON/OFF
• READ と SET
• メインスイッチ
• ケーブルの接続
電気泳動用の電源の操作
• OUTPUT が OFF であ
ることを確かめる
• 念のため,VOLTAGE と
CURRENT のツマミを
最小にしておく
• READ/SET は READ
にしておく
• それからメインスイッチを
ON
電気泳動用の電源の操作
• READ/SET を SET に
する
• 今回の SDS-PAGE は
定電流で…
• CURRENT ツマミを回し
て 40 mA にする
(ゲル 1 枚あたり 20 mA)
• VOLTAGE ツマミを回し
て 300〜500 V 程度に
する
(数字が表示される)
電気泳動用の電源の操作
• READ/SET を READ に
する
(数字が 000 になる)
• OUTPUT を ON にする
• 電気が流れると,泳動槽
の電極から泡が出る
(確認しよう)
電気泳動用の電源の操作
• CURRENT が 40 にな
ったところで,「CC」 の赤
ランプが点灯
• 「CV」 のランプは消灯
– これが定電流 (Constant
Current) という意味
電気泳動用の電源の操作
• 泳動の後半,ゲル中の
電解質が減る
• 抵抗が増して電圧が上
がる
• 最初に SET した電圧を
上回ると,自動的に定電
圧運転に替わる
– 「CC」 ランプが消灯
– 「CV」 ランプが点灯
• その場合,VOLTAGE
の SET 値を大きくする