海洋生命・分子工学基礎実験 タンパク質の取扱い (4) 細胞分子工学研究室担当 5.SDS-ポリアクリルアミド ゲルの調製 まずは・・・ • ゲル板を組み立てる o 当日実演します o メモの用意を! 使う溶液 1. A 液 (30% アクリルアミド水溶液) 2. B 液 (Lower Gel Buffer) 3. C 液 (Upper Gel Buffer) 4. D 液 (10% 過硫酸アンモニウム ammonium peroxodisulfate = APS) 5. E 液 (10% テトラメチルエチレンジアミン tetramethylethylenediamine = TEMED) 分離ゲル (separation gel = running gel) • 以下の溶液を混ぜる(12.5% アクリルアミド) o A 液: 3.47 mL (3470 mL) o B 液: 2.08 mL (2080 mL) o 蒸留水: 2.78 mL (2780 mL) • ここまで混ぜたら脱気 o D 液: 28.5 mL o E 液: 85 mL • D 液と E 液を加えたらすばやく混ぜてゲル板に流し込む 分離ゲル (separation gel = running gel) • ガラス板に流し込んだら,上に静かに水飽和 1-ブタノー ルを載せる • 1-ブタノールはアクリルアミド水溶液とは混ざらない • ゲルの上の端が平らになるように約 30 分静置してゲル を固める • 固まったらブタノールを捨て,水道水→蒸留水で洗う • 残った水をろ紙で拭き取る 濃縮ゲル (stacking gel) • • • 以下の溶液を混ぜる • A 液: 375 mL • C 液: 625 mL • 蒸留水: 1.5 mL (1500 mL) ここまで混ぜたところで脱気 • D 液: 7.5 mL • E 液: 50 mL D 液と E 液を加えたらすばやく混ぜてゲル板に流し込む 濃縮ゲル (stacking gel) • 気泡を閉じ込めないように,サンプルコウムを差し込む • 30 分間ほど静置し,ゲルを固める • 固まったら,サンプルコウムとシールガスケットを取り外し, 水でぬらしたキムワイプと一緒に,ラップで包んで冷蔵保存 する(数週間は保存可能) サンプルの調製 • SDS サンプルバッファー o 10% (w/v) グリセリン o 5% (v/v) 2-メルカプトエタノール o 2.3% (w/v) SDS o 62.5 mM Tris-HCl (pH 6.8) • 当日は上記のサンプルバッファーの 2 倍濃縮ストック溶液を 使用します(次のスライド) 2x SDS サンプルバッファー のつくり方 • 以下のものを混ぜて 10 mL とする o 50% グリセリンを 4 mL o 2-メルカプトエタノールを 1 mL o SDS の粉を 0.46 g o 0.5 M Tris-HCl (pH 6.8) を 2.5 mL o 蒸留水を 2.5 mL o 少量のブロモフェノールブルーの粉を溶かす
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