生物統計学・第12回 エクセルを使いこなす ワークシート操作、ワークシート関数、マクロ、VBA 2013年12月25日 生命環境科学域 応用生命科学類 尾形 善之 本日の予定 ★ノートパソコン組 ♦ 実習 ★スクリーン組 ♦ 実演 本日の内容 ★座学 ♦ チェックポイントがあります ★ノートパソコン組 ♦ 予め課題を見せるので、挑戦してください ♦ 何かあればTAに尋ねてください ★スクリーン組 ♦ これまでの統計解析のうち、エクセルで実行でき るものを実演します ♦ 最後に課題を出します 外れ値 ★グラブスの検定 ♦ 目的 • データセット中でひとつだけ離れた値を外す • 纏めて省くとき – クラスタリング、主成分分析 ♦ 手順 • 離れていると予想される値の𝑍値を計算 • グラブスの表で𝑝値を得る グラブスの検定 A B 1 35 31 2 26 27 3 41 8 平均 34 22 SD 6 10 長さ 60 42 26 − 34 = 1.333 6 8 − 22 = 1.400 10 どちらも1%の危険率で有意に外れる 実験数 5% 1% 3 1.153 1.155 チェックポイント・I 1. データセットからひとつだけ外れたデー タを外す手順は? 2. データセットからふたつ以上の外れた データを外す方法は? 2種類のエラーの話 声 が 大 き い ウ ェ 教 ッ ト 授 リ ー ダ ー シ ッ プ 犬 ア 声 嫌 ロ ハ が い か 四 十 代 か ず さ D N A 研 究 所 馬 好 き 教 員 植 物 コ ン ピ ュ ー タ 微 生 物 バ イ オ イ ン フ ォ マ テ ィ ク ス S N ジ 生 S ブ 物 嫌 リ 統 い 好 計 き 学 … な り 大 き い … … 視 力 若 さ 酒 に ト 呑 マ ま ト れ る 眼 鏡 青木先生が王様だったら… 正解! 偽陽性 False Positive 偽陰性 False Negative 5 5 = 9 + 5 14 5 5 = 7 + 5 12 Recall Precision 私が王様だったら… 正解! 偽陽性 False Positive 偽陰性 False Negative 5 5 = 9 + 5 14 5 5 = 7 + 5 12 Precision Recall 2種類のエラー ★PrecisionとRecallは対になっている ★王様(理論値)がいる場合 ♦ PrecisionとRecallは意味がある ★王様(理論値)がいない場合 ♦ PrecisionとRecallは向きによって異なる ♦ ふたつの指標を合わせると相関指標になる ♦ F-measure(ふたつの指標の調和平均) 5 5 = 9 + 5 14 5 5 = 7 + 5 12 5+5 10 5 𝐹= = = 14 + 12 26 13 生物統計学と2種類のエラー ★ある病気の検査方法の信頼度は? 実際に 陽性 実際に 陰性 検査で 陽性 検査で 陰性 True Positive False Negative 8 0 False Positive True Negative 12 80 20 80 8 𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛 = = 40% 20 8 𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙 = = 100% 8 8 92 生物統計学と2種類のエラー 偽陽性 偽陰性 検査で陽性 検査で陰性 精密検査で陰性 実は陽性 ほっとひと息 これは困る 情報学と2種類のエラー ★あるブラウザの検出の信頼度は? 目的の ページ 関係ない ページ ブラウザで ヒット ブラウザで ノーヒット 8 0 8 992 999,000 999,992 1000 999,000 8 𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛 = = 0.8% 1000 8 𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙 = = 100% 8 情報学と2種類のエラー ★あるブラウザの検出の信頼度は? 目的の ページ 関係ない ページ ブラウザで ヒット ブラウザで ノーヒット 3 5 8 7 999,985 999,992 10 999,990 3 𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛 = = 30% 10 3 𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙 = = 37.5% 8 2種類のエラーの纏め ★偽陽性 False Positive ♦ 検査で陽性だが実際は陰性 • 「第一種の過誤(誤り)」「あわてんぼうのエラー」 ★偽陰性 False Negative ♦ 検査で陰性だが実際は陽性 • 「第二種の過誤(誤り)」「うっかりもののエラー」 ★意識しないとどちらかのエラーを忘れがち チェックポイント・II 3. 偽陽性とは? 4. 偽陰性とは? 今日の自習のポイント ★今日は特にありません! アンケート・III ★次回からは解析環境の話です 5. いま学校や自宅でエクセルが使える 環境かどうか教えてください。 6. この講義にノートパソコンを持ってこら れるかどうか教えてください。 本日の課題 ★下の検査結果について以下の問いに答えなさ い。 ♦ PrecisionとRecallを計算し、この検査方法の信頼度について 考察しなさい。検査で陽性 検査で陰性 実際に 陽性 True Positive False Negative 7 1 実際に 陰性 False Positive True Negative 3 89 10 90 8 92
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