診療録データの臨床研究利用 のための仕組み データ抽出システム 大阪大学医学部附属病院 医療情報部 村田 泰三 システム全体像 既存システム XMLパース 電子カルテ サーバ GW 1 各科臨床研究用システム 1 value 1 record データ ウェアハウス データ抽出 GW 2 1 case 1 record 各プロジェクト別 臨床研究用 データベース データ 閲覧・集計 データ登録 操作用PC 操作用PC 1 value 1 record 患者ID データウェア ハウス 臨床研究用 DB Date Template 1001 10/12 血圧 \収縮期血圧 root 収縮期血圧 120 1001 10/12 血圧 \拡張期血圧 root 拡張期血圧 60 1001 10/12 血圧 \血圧測定部位 root 血圧測定部位 右上腕 1001 10/12 血圧 ¥左右差チェック root 左右差チェック あり 1001 10/12 血圧 \左右差チェック\あり 左右差 チェック 血圧測定部位2 左上腕 患者ID Date xPath 収縮期血圧 親項目 親値 あり 項目 拡張期血圧 血圧測定部位 測定体位 値 左右差チェック 1001 10/12 120 60 右上腕 座位 あり 1002 10/12 134 64 左上腕 座位 なし 1001 10/14 124 68 右上腕 座位 あり ・・・ ・・・ ・・・ ・・・ ・・・ ・・・ ・・・ 1 case 1 record 抽出可能なデータ 文書で入力されたテン プレート情報 経過記録で入力され たテンプレート情報 抽出可能な項目 赤枠で囲まれたテンプ レート入力された箇所の み抽出設定可能。 各科臨床研究用DBで必要な設定 項目の設定 抽出対象患者の設定 閲覧および抽出のアクセス権限の設定 項目の設定 アトム(項目)群を作成 項目のグループ化を行う。 別のテンプレートで入力された同じ意味の項目 をひとつの項目として設定。 アトム(項目) T001 A001 血圧 T002 A100 血圧 アトム(項目)群 A001 血圧 T001 A001 血圧 T002 A100 血圧 項目の設定 アトム(項目)群の名称をチェックする 項目名称は、DBのフィールド名となるので、重 複した名称は、許されない。 グループ化? アトム(項目)群 A010 大きさ T001 A010 大きさ ・・・ ・・・ ・・・・ ・・・ →意味が異なる A010 大きさ →腫瘍の大きさ A020 大きさ →病変の大きさ 所見 腫瘍 ・・・ ・・・ 重複 ・・・ A020 大きさ T001 A020 大きさ 大きさ 病変 大きさ ・・・ 項目出力制限 複数選択可のテンプレートの対応 (checkbox) 1項目選択の場合 2項目選択の場合 カンマで区切る 心雑音 心雑音 汎収縮期雑音,収縮期雑音 汎収縮期雑音 フィールドを増やす 心雑音01 心雑音02 汎収縮期雑音 収縮期雑音 項目出力制限 心雑音 なし 収縮期雑音 収縮早期雑音 収縮中期雑音 収縮後期雑音 汎収縮期雑音 拡張期雑音 12項目 拡張早期雑音 拡張中期雑音 拡張後期雑音 前収縮期雑音 連続性雑音 ブランコ雑音 最強点 伝達方向 ピッチ 性状 変化 最強点 伝達方向 ピッチ 性状 変化 5項目 複数選択項 目の下位層 すべてに同じ 項目がある。 ・ フィールドを増やした場合 異常所見のすべての項目 のフィールドを用意する必 要がある。 12×5=60項目 すべての項目を抽出する必 要性は低い。 一度に選択される項目数は 、2~3項目程度 ・ ・ 最強点 伝達方向 ピッチ 性状 変化 項目ごとにフィールドの生成数の 制限を設定可能にした。 必要な項目を設定 テンプレートの中には、抽出設定に必要のない項 目は除き、必要な項目を設定する 各項目の単位 タイトルとして表記されている項目 データ入力されること のないコントロール Suffix Insert Title ラベル 必要な項目および表示順を設定 抽出対象患者の設定 同じ文書の抽出したい対象患者が異なるケースが考えら れる。 自科だけを抽出 内視鏡レポート 消化器外科と消化器内科を分けて 抽出 全科は必要ないが、複数科のデータを抽出 循環器内科と心臓血管外科が入力したデータのみ 抽出 治験患者だけを抽出 …etc 対象患者は、匿名化する必要がある場合 匿名化→患者IDの置換え、患者氏名の非表示 閲覧および抽出のアクセス権限の設定 どの文書を閲覧・抽出するか どのテンプレートを閲覧・抽出するか どのグループが閲覧するか どのユーザが閲覧するか 閲覧できる端末を限定 各科臨床研究用DBの利用方法 院内HPから設定依頼書を医療情報部長宛 に提出 依頼書から抽出設定の相談を行う 必要な項目を選択し、抽出設定作業 設定時間 1文書につき、約0.5~2時間 →構造および改訂回数によって、変動 診療情報管理士1名(医療情報技師資格有)
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