LH遺伝子変異検出キット

Wako 遺伝子変異検出キットシリーズ A3二つ折り 〈表・裏面〉
KRAS遺伝子の点変異検出実験
簡便・迅速・正確・安価に遺伝子変異を検出!!
実験条件に示すサンプルとその他コントロールDNAを用いて、KRAS遺伝子のコドン12および13のグリシンにおけ
る点変異を検出しました。
遺伝子変異検出キットシリーズ
LH Gene Mutation
Detection Kit series
D
N
A
マ
野
ー
生
型 カー
コ
G1 ント
2D
ロ
ー
サ コン ル
DN
ト
ン
ロ
プ
A
ー
ル
ル
サ
1( D
ン
プ
野 NA
サ ル 2 生型
ン
)
プ (G
サ ル 3 12
S
ン
)
プ (G
サ ル 4 12
D
ン
)
プ (G
サ ル 5 12
V
ン
)
プ (G
サ ル 6 12
A
ン
)
プ (G
ル
1
7( 2C
)
G
1
3
D
)
【結果】
● 変異型サンプル
(サンプル 2-7)のバンドシフトを高感度で検出!! ● G12D以外の変異も同じLH Probeで検出!!
抗がん剤セツキシマブは、
KRAS遺伝子
に変異のない野生型患者に効果が高いこ
とが臨床試験で明らかになっており、厚生
労働省は2010年3月23日付に発出した通知で、
KRAS
遺伝子変異の有無を考慮して投与することを追記するよ
400→
野生型
G12D
300→
G12S, G12V,
G12A, G12C,
G13D
250→
対象遺伝子(BRAF、EGFR、KRAS)
における点変異、挿入変異、欠損変異を簡便、迅速、正確、安価に検出できます。
Loop Hybrid Mobility Shift Assay(LH-MSA法)を基本原理とし、変異遺伝子領域にハイブリダイズする
Loop Hybrid Probe(LH Probe)の二次構造変化をポリアクリルアミドゲル電気泳動で検出します。
LH-MSA法は、高価なリアルタイムPCR装置及び特異的プローブなどの特別な設備・機器を必要としません。
う指導しました。
大腸がん患者の約30%にKRAS遺伝子変異があり、
KRAS遺伝子に変異がある大腸がん患者のゲノムDNA
は中メチル化状態であることから、
メチル化の蓄積と遺伝
子変異の研究が数多く報告されています。
<実験条件>
● サンプル 1-7:ヒ
ト大腸がん組織凍結切片由来ゲノムDNA
● 電気泳動ゲル:SuperSepTMAce, 10%, 17well
(推奨品)
〔定電流、
20mA〕
● 泳動時間:70分
(目安)
● 染色:Gel RedTM 核酸ゲル染色液
(x10000)
水溶液 KRAS遺伝子 PCR増幅産物 : 165 bp
200→
175→
■特長
● リアルタイムPCR法に比べて非常に安価!!
■キット構成(96サンプル用:16サンプル×6回用)
1.
2.
3.
4.
10×Buffer
dNTPs
DNA Polymerase
Forward Primer *1
102μL×1本
102μL×1本
12μL×1本
51μL×1本
5.
6.
7.
8.
Reverse Primer *1
LH Probe
Wild Type Control DNA
各Control DNA *2
180μL×1本
96μL×1本
6μL×1本
6μL×1本
■検出原理
9. Loading Buffer *3
10. DNA Marker
288μL×1本
9μL×1本
特殊な設備・機器が不要!!
操作が簡便、作業時間・手間が低減!!
● 1プローブで稀な変異も検出可能!!
● 非常に高感度!!
●
プライマー
●
LHプローブ
ステップ①
PCR増幅反応
容量
希望納入価格(円)
SuperSepTMAce, 10%, 17well
10枚
14,000
196-14981
SuperSepTMAce, 12.5%, 17well
519-20301
517-53333
GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000x in Water
GelGreenTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000x in Water
10枚
0.5mL
14,000
23,200
0.5mL
28,000
201-18601
316-90101
058-07681
10×Tris-Glycine Buffer
Distilled Water, Deionized, Sterile
EasySeparator
1L
100mL
1セット
7,200
4,000
295-52401
DNA Isolator PS Kit
EtBr Destroyer Bag
100テスト
20個
25,000
303-89321
25,400
冷暗所
300-89331
EtBr Destroyer Sprayer
200mL×2
13,000
冷暗所
…−20℃保存
…特定毒物
…化審法 第一種特定化学物質
…毒物
Reagent
…劇物
…毒薬
…劇薬
…危険物
…化学兵器禁止法 第一種指定物質
…向精神薬
LH Probe
5’
3’
-
-3’
-5’
-3’
-5’
野生型
Genomic DNA
-3’
-5’
PCR
点変異
94℃, 2 min
68℃, 5 min
5’
3’
-
-3’
-5’
PCR 増幅産物
(Target gene)
PAGE, Detection
ステップ③
LH-MSA by PAGE
5’
3’
-
…カルタヘナ法
覚せい剤取締法…「覚せい剤原料研究者又は取扱者」の免許を取得して、
ご購入に際しては、
譲受証及び譲渡証による受け渡しが必要となります。
国民保護法…生物・毒素兵器の製造、
使用防止のため、
「毒素等」
を試験研究用に使用することを確認する証を頂戴しております。
ダイオキシン類…特に法的な規制はございませんが、
取扱いに際し特に厳重を要するため、
「ダイオキシン類」
を試験研究用に使用することを確認する証を頂戴しております。
上記以外の法律及び最新情報は、siyaku.com(http://www.siyaku.com/)をご参照ください。
-3’
-5’
ポリアクリルアミド電気泳動
Tissue
ステップ②
LH反応
…特定麻薬向精神薬原料
…化学兵器禁止法 第二種指定物質
Cells
5’
3’
-
52,000
5’
3’
-
LH反応
稀な変異
PCR Mixture
…−80℃保存 表示が無い場合は室温保存です。
…化審法 第二種特定化学物質
WT : 野生型
5’
3’
-
192-14961
…2∼10℃保存
BRAF(V600E変異あり)
②:稀な変異
■関連製品
品名
-5’
PCR
①:点変異
DNA Polymerase
コードNo.
-3’
3’
-
DNAポリメラーゼ
■操作概要
*1 Exon21 L858R用は、Forward Primer 180μL、Reverse Primer 51μL
*2 BRAF V600E : V600E コントロール DNA、EGFR Exon19 : 欠損型コントロール DNA、
EGFR Exon20 : 挿入型コントロール DNA
EGFR Exon21: L858R コントロール DNA、KRAS Mutations : G12D コントロール DNA
*3 内容は6X濃度です。また、青色とオレンジ色の色素が入っています。
5’
-
ゲノムDNA
マ
ー
カ
ー
コン
トロ
ー
ル
DN
コン
A(
トロ
W
T)
ー
ル
DN
サ
A(
ン
プ
①
ル
)
1(
サ
W
ン
T
)
プ
ル
2(
サ
①
ン
)
プ
ル
3(
②
)
500→
DN
A
(bp)
Contribute to the future of science
-3’
-5’
染色結果
(イメージ図)
■ラインアップ
● 本文に記載されております試薬は、試験、研究の目的のみに使用されるもので、
「医療品」、
「食品」、
「生活用品」などとして使用できません。
● 希望納入価格には消費税等が含まれておりません。 ● 記載希望納入価格は2015 年 05 月現在の価格です。
● 最新情報は、siyaku.com( http://www.siyaku.com/ )をご参照下さい。
本キットは、研究用試薬です。試験、研究の目的のみに使用されるもので、
「 体外診断用医薬品」、
「食品」、
「生活用品」など
として使用できません。
コードNo.
299-76101
291-76301
容量
希望納入価格
(円)
LH遺伝子変異検出キット(BRAF V600E用)
LH遺伝子変異検出キット(EGFR Exon19 Deletion用)
品名
1キット(16サンプル×6回用)
65,000
1キット(16サンプル×6回用)
65,000
293-76501
LH遺伝子変異検出キット(EGFR Exon20 Insertion用)
1キット(16サンプル×6回用)
65,000
295-76701
LH遺伝子変異検出キット(EGFR Exon21 L858R用)
1キット(16サンプル×6回用)
65,000
297-76901
LH遺伝子変異検出キット(KRAS Mutations at Codons 12 and 13用)
1キット(16サンプル×6回用)
65,000
次の科学のチカラでありたい。
15503開01Tp
Wako 遺伝子変異検出キットシリーズ A3二つ折り 〈中面〉
■実験例 ‒ 電気泳動
ヒト大腸がん組織の凍結切片またはヒト肺がん組織ホルムアミド・パラフィン包埋切片より抽出したゲノムDNAとその他
コントロールDNAを用いて、対象遺伝子(BRAF、
EGFR、
KRAS)における遺伝子変異を検出しました。
本実験データは、神奈川県立がんセンター臨床研究所 がん分子病態学部 松隈章一先生より提供していただきました。
EGFR遺伝子のExon20挿入変異検出実験
実験条件に示すサンプルとその他コントロールDNAを用いて、EGFR遺伝子Exon20における挿入変異を検出しま
した。
【結果】
● 最も品質が悪いとされるFFPE切片から抽出したゲノムDNAでも変異型サンプルのバンドシフトを高感度で検出!!
D
N
A
(bp)
抗がん剤ゼルボラフは、
BRAF遺伝
す。2011年8月、米国食品医薬品局
(FDA)により、
れています。
400→
D594G
野生型
V600E
300→
大腸がんの約10%にBRAF遺伝子があり、
BRAF
高メチル化状態であることから、
メチル化の蓄積と遺
<実験条件>
● サンプル 1-7:ヒ
ト大腸がん組織凍結切片由来ゲノムDNA
● 電気泳動ゲル:SuperSepTMAce, 10%, 17well
(推奨品)
〔定電流、
20mA〕
● 泳動時間:70分
(目安)
● 染色:Gel RedTM 核酸ゲル染色液
(x10000)
水溶液 BRAF遺伝子 PCR増幅産物 : 157 bp
200→
175→
150→
Factor Receptor;EGFR)
のチロシンキナーゼの働きを阻害する作用を
標的治療薬として2002年7月に世界に先駆
A
野
N
(bp)
持ち、非小細胞肺癌
(NSCLC)に対する分子
けて日本で承認されました。しかし本薬剤に
よる間質性肺炎の発生が副作用として大きな
問題となっています。ゲフィチニブにおいては、
500→
EGFRのチロシンキナーゼ活性部位に遺伝子
400→
変異があれば効果があることが確認されてお
遺伝子に変異がある大腸がん患者のゲノムDNAは
伝子変異の研究が数多く報告されています。
250→
受容体(Epidermal Growth
BRAF V600E遺伝子変異があり、切除不能または
転移性メラノーマである場合の治療薬として承認さ
500→
ゲフィチニブは上皮成長因子
マ
子に変異のある患者に効果が高いこ
とが臨床試験で明らかになっていま
D
マ
ー
野
カ
生
ー
型
コ
ン
V6
ト
00
ロ
ー
E
ル
コ
サ
ント
D
ン
N
ロ
プ
A
ー
ル
ル
サ
1(
D
ン
NA
野
プ
生
ル
サ
2( 型)
ン
野
プ
生
ル
型
C
3
O
(
)
LO
野
生
-2
型
サ
0
)
5(
ン
プ
V
ル
6
4( 00
サ
ン
E)
V6
プ
ル
0
5( 0E
サ
ン
V6 )
プ
ル
0
6( 0E
サ
)
ン
V
プ
60
ル
7( 0E
)
D
59
4G
)
【結果】
● BRAF V600E変異細胞株
(COLO 205)
と同じ位置に変異型サンプル
(サンプル 4∼6)
のバンドを高感度で検出!!
● D594G
(サンプル 7)
という稀な変異も同じLH Probeで検出!!
ー
カ
ー
型
コ
挿
ン
ト
入
ロ
型
ー
コ
ル
サ
ン
ト
ン
D
ロ
プ
N
ー
ル
A
ル
サ
1(
ン
D
プ
野
N
ル
A
生
サ
2( 型
ン
)
プ
挿
ル
入
サ
型
3
ン
(
)
プ
挿
ル
入
サ
4( 型
ン
)
プ
挿
ル
入
サ
5( 型
ン
)
プ
挿
ル
入
サ
6( 型
ン
)
プ
挿
ル
入
7( 型
)
挿
入
型
)
実験条件に示すサンプルとその他コントロールDNAを用いて、BRAF遺伝子コドン600における点変異を検出しま
した。
生
BRAF遺伝子の点変異検出実験
り、
その検査が重要となっています。
NSCLCの 約5% のEGFR遺伝子Exon20
300→
に挿入変異があると報告されています。
挿入型
250→
<実験条件>
サンプル 1-7:ヒト肺がん組織ホルムアミド・パラフィン包埋切片由来ゲノムDNA
● 電気泳動ゲル:SuperSepTMAce, 10%, 17well
(推奨品)
〔定電流、20mA〕
● 泳動時間:70分
(目安)
● 染色:Gel RedTM 核酸ゲル染色液
(x10000)
水溶液
EGFR遺伝子Exon20 PCR増幅産物: 189 bp
●
200→
175→
図: 点変異検出実験電気泳動結果
図: 挿入変異検出実験電気泳動結果
EGFR遺伝子のExon19欠損変異検出実験
EGFR遺伝子のExon21点変異検出実験
実験条件に示すサンプルとその他コントロールDNAを用いて、EGFR遺伝子Exon19のコドン746から750におけ
る欠損変異を検出しました。
実験条件に示すサンプルとその他コントロールDNAを用いて、EGFR遺伝子Exon21のL858R点変異を検出しま
した。
D
N
A
(bp)
ゲフィチニブは上皮成長因子受容
体(Epidermal Growth Factor
(bp)
N
ナーゼの働きを阻害する作用を持ち、
非小細胞肺癌
(NSCLC)に対する分子標的治療薬として2002
A
Receptor;EGFR)の チ ロ シ ン キ
マ
ー
野
カ
生
ー
型
コ
ン
L8
ト
58
ロ
ー
R
ル
コ
ント
サ
D
ン
N
ロ
プ
A
ー
ル
ル
1(
D
サ
N
ン
A
野
プ
生
ル
型
2(
サ
)
ン
L8
プ
ル
5
8
3(
サ
R
ン
)
L8
プ
ル
5
8
4(
R
)
L8
5
8
R
)
【結果】
● 最も品質が悪いとされるFFPE切片から抽出したゲノムDNAでも変異型サンプルのバンドシフトを高感度で検出!!
D
マ
ー
野
カ
生
ー
型
コ
ン
欠
ト
損
ロ
型
ー
コ
ル
ン
サ
ト
D
ン
ロ
N
プ
A
ー
ル
ル
サ
1(
D
ン
N
野
プ
A
生
ル
サ
2( 型)
ン
欠
プ
損
ル
サ
3( 型)
ン
欠
プ
損
ル
サ
4( 型)
ン
欠
プ
損
ル
サ
5( 型)
ン
欠
プ
損
ル
サ
6( 型)
ン
欠
プ
損
ル
サ
7( 型)
ン
欠
プ
損
ル
8( 型)
挿
入
型
)
【結果】
● 最も品質が悪いとされるFFPE切片*1から抽出したゲノムDNAでも変異型サンプルのバンドシフトを高感度で検出!!
● 挿入変異
(サンプル 8)
という稀な変異も同じLH Probeで検出!!
*1 FFPE : ホルマリン固定・パラフィン包埋
挿入型
年7月に世界に先駆けて日本で承認されました。
し
400→
欠損型
て大きな問題となっています。ゲフィチニブにおい
ては、
EGFRのチロシンキナーゼ活性部位に遺伝子
変異があれば効果があることが確認されており、そ
の検査が重要となっています。
ン746-750を中心とする部位に欠損変異がある
250→
と報告されています。
<実験条件>
● サンプル 1-8:ヒ
ト肺がん組織ホルムアミド・パラフィン包埋切片由来ゲノムDNA
● 電気泳動ゲル:SuperSepTMAce, 10%, 17well
(推奨品)
〔定電流、
20mA〕
● 泳動時間:70分
(目安)
● 染色:Gel RedTM 核酸ゲル染色液
(x10000)
水溶液 EGFR遺伝子Exon19 PCR増幅産物 : 146 bp
200→
175→
150→
125→
図: 欠損変異検出実験電気泳動結果
細胞肺癌
(NSCLC)
に対する分子標的治療薬として2002年7
間質性肺炎の発生が副作用として大きな問題となっています。ゲ
L858R
500→
野生型
400→
フィチニブにおいては、
EGFRのチロシンキナーゼ活性部位に遺
伝子変異があれば効果があることが確認されており、
その検査が
重要となっています。
NSCLCの20∼25%のEGFR遺伝子Exon21コドン858に
おいてロイシンからアルギニンへの点変異があると報告されて
NSCLCの20∼25%のEGFR遺伝子Exon19コド
300→
Growth Factor Receptor;EGFR)の チ ロシ
ンキナーゼの働きを阻害する作用を持ち、非小
月に世界に先駆けて日本で承認されました。
しかし本薬剤による
かし本薬剤による間質性肺炎の発生が副作用とし
500→
ゲフィチニブは上皮成長因子受容体(Epidermal
います。
300→
250→
<実験条件>
サンプル 1-4:ヒト肺がん組織ホルムアミド・パラフィン包埋切片由来ゲノムDNA
● 電気泳動ゲル:SuperSepTMAce, 10%, 17well
(推奨品)
〔定電流、20mA〕
● 泳動時間:70分
(目安)
● 染色:Gel RedTM 核酸ゲル染色液
(x10000)
水溶液
EGFR遺伝子Exon21 PCR増幅産物: 184 bp
●
200→
175→
図: 点変異検出実験電気泳動結果