Retour devoir2, UCSC Genome Browser et SeattleSeq SNPAnnotation BIN1002 Jean-François Théroux Robert-Cedergren Centre Université de Montréal 24 février 2014 Devoir 2 ● Vous pouvez copier ma version du code à partir de : – ~dbin1002/Solution/devoir2_vJF.pl UCSC Genome Browser ● http://genome.ucsc.edu/ UCSC Genome Browser ● http://genome.ucsc.edu/ UCSC Genome Browser UCSC Genome Browser ● Tutoriels : – https://genome.ucsc.edu/training/ashg2009/index.html – https://genome.ucsc.edu/training/ashg2009/adv.html – Note : Puisque le tutoriel date de 2009, certaines options ont changé de nom et certains menus ont disparus. SeattleSeq SNP Annotation ● Outils que nous allons utiliser lors du devoir 3 ● http://snp.gs.washington.edu/SeattleSeqAnnotation129/ SeattleSeq SNP Annotation ● Outils que nous allons utiliser lors du devoir 3 ● http://snp.gs.washington.edu/SeattleSeqAnnotation129/ SeattleSeq SNP Annotation ● Outils que nous allons utiliser lors du devoir 3 – Nous allons annoter les SNPs présents chez des individus. SeattleSeq SNP Annotation ● Outils que nous allons utiliser lors du devoir 3 – Nous allons annoter les SNPs présents chez des individus. – Explication du format de sortie de l'annotateur SeattleSeq SNP Annotation
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