Wissenschaftliche Mitarbeiterin/Wissenschaftlicher Mitarbeiter in der

STELLENAUSSCHREIBUNG
Das Bundesinstitut für Risikobewertung (BfR) ist das nationale Institut, das auf der Grundlage international anerkannter wissenschaftlicher Bewertungskriterien Gutachten und Stellungnahmen zu Fragen der Lebensmittel-, Futtermittel- und Chemikaliensicherheit und des
gesundheitlichen Verbraucherschutzes erstellt. In diesen Bereichen berät es die Bundesregierung sowie andere Institutionen und Interessengruppen. Das BfR betreibt eigene Forschung zu Themen, die in engem Zusammenhang mit seinen Bewertungsaufgaben stehen.
Es ist eine rechtsfähige Anstalt im Geschäftsbereich des Bundesministeriums für Ernährung
und Landwirtschaft (BMEL).
In der Abteilung Biologische Sicherheit des BfR ist in der Fachgruppe „Molekulare Mikrobiologie und Genomanalyse“ ab sofort unbefristet folgende Stelle zu besetzen:
Wissenschaftliche/r Mitarbeiterin / Mitarbeiter
- Entgeltgruppe 14 TVöD Kennziffer: 1473/2016
Teilzeitbeschäftigung ist möglich.
Aufgaben:
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Eigenverantwortlicher Aufbau und Verifizierung von Abläufen zur Gesamtgenomsequenztypisierung von bakteriellen Erregern, insbesondere Enteritiserreger
Entwicklung von automatisierten Datenanalysepipelines für Genomsequenzen bakterieller Erreger (Assemblierung, Mapping, Annotieren, Alignments, wgMLST, vergleichende
Analysen) unter Berücksichtigung verschiedener Next-Generation Sequenzierungstechnologien
Entwicklung und Einrichtung von Softwaretools für die Identifizierung von spezifischen
Erregersequenzen, z.B. hinsichtlich ihrer Virulenz, Resistenz und Phylogenie
Aufbau und Verwaltung einer Genomsequenzdatenbank und Auswertung von Genomsequenzdaten
Qualitative und quantitative Auswertung von Metagenomsequenzen
Interne und externe Beratung von Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern hinsichtlich der Genomdatenauswertung sowie Durchführung von Anwenderworkshops
Beteiligung an und Einwerbung von Drittmittelprojekten, sowie aktiver wissenschaftlicher
Austausch mit nationalen und internationalen Kooperationspartnern
Abfassen von wissenschaftlichen Publikationen und Präsentation wissenschaftlicher
Ergebnisse
Betreuung von Praktikantinnen/Praktikanten, Studentinnen/Studenten, Doktorandinnen/Doktoranden
Anforderungen:
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Abgeschlossenes Hochschulstudium der Bioinformatik, Biologie, Biochemie oder einer
vergleichbaren Fachrichtung, Promotion erforderlich
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Bundesinstitut für Risikobewertung
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Mehrjährige Erfahrung auf dem Gebiet der Gesamtgenomsequenzdatenanalyse von
Bakterien und ihrer bioinformatischen Auswertung erforderlich
Fundierte Kenntnisse mit sequenzbasierten molekularbiologischen Typisierungsmethoden zur Untersuchung bakterieller Evolution (z.B. MLST) notwendig
Fundierte Kenntnisse von NGS-Datenanalyseprogrammen wie BioNumerics und CLCbio
Genomics Workbench
Fundierte bioinformatische Kenntnisse von open-source Programmen für vergleichende
Genomanalysen (Mapping, Alignments, Variant Calling) und phylogenetische Analysen
wie BEAST, Blast, ClustalW, R, Mega, SeqAn, Galaxy sowie für die Visualisierung genomischer Daten unabdingbar
Gute Kenntnisse im Umgang mit Genomdatenbanksystemen
Beherrschung von Unix bzw. Linux und Skriptsprachen wie Python, Biopython, Shell
erforderlich; Kenntnisse anderer Programmiersprachen von Vorteil
Einschlägige Publikationen auf dem Gebiet der bakteriellen Genomsequenzvergleiche
Erfahrung in Gremienarbeit auf nationaler und internationaler Ebene wünschenswert
Ausgeprägte Kommunikationsfähigkeit und Erfahrungen in der Anleitung von Praktikantinnen/Praktikanten, Studentinnen/Studenten, Doktorandinnen/Doktoranden und Hospitantinnen/Hospitanten
Sehr gute Kenntnisse der englischen Sprache in Wort und Schrift erforderlich
Gute EDV-Kenntnisse sowie eine gewissenhafte Arbeitsweise, Flexibilität, Teamfähigkeit
und Belastbarkeit sowie die Bereitschaft zu Dienstreisen werden vorausgesetzt
Der Dienstort ist Berlin.
Nähere Auskünfte erteilen Herr PD Dr. Burkhard Malorny (Tel.: 030 18412 - 2237) und Herr
PD Dr. Karsten Nöckler (Tel.: 030 18412- 2053).
Das BfR begrüßt Bewerbungen von Menschen aller Nationalitäten.
Als innovative wissenschaftliche Einrichtung bietet das BfR familienfreundliche Arbeitsbedingungen. Dafür wurde das BfR mit dem Zertifikat
„audit berufundfamilie®“ ausgezeichnet. Das BfR gewährleistet die berufliche Gleichstellung von Frauen und Männern. An der Bewerbung von
Frauen besteht daher ein besonderes Interesse.
Schwerbehinderte Menschen werden bei gleicher Eignung besonders
berücksichtigt; von ihnen wird nur ein Mindestmaß an körperlicher Eignung verlangt.
Bewerbungsverfahren
Fühlen Sie sich angesprochen?
Dann bewerben Sie sich bitte bis zum 25. Mai 2016 über unser Online-System:
online bewerben
Für Fragen im Zusammenhang mit dem Bewerbungsverfahren steht Ihnen Frau Walter (Tel.:
030 18412-4808) gerne zur Verfügung.
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Bundesinstitut für Risikobewertung
Sofern Sie sich nicht online bewerben können, verweisen wir auf den Weg der postalischen
Bewerbung unter Angabe der jeweiligen Kennziffer (Bundesinstitut für Risikobewertung,
Personalreferat - 11.17 -, Max-Dohrn-Str. 8-10, 10589 Berlin).
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