Pseudomonas in Dresden entdeckt

Pseudomonas in Dresden entdeckt
Im Zuge einer studentischen Abschlussarbeit sind im Dresdner Stadtgebiet
Rosskastanien hinsichtlich Phytopathogenen untersucht und ein aktuelles Verfahren
zum Nachweis der neuen Pseudomonas-Krankheit erprobt worden. Dabei erfolgte der
Erstnachweis von Pseudomonas syringae pv. aesculi an Rosskastanien, wie Hubertus
Frölich, Kristin Morgenstern, Doris Krabel, und Prof. Andreas Roloff in ihrem Beitrag in
der BaumZeitung 1/2016 darstellen. Die ergänzende Literaturliste zu dem Artikel sowie
eine detaillierte Beschreibung des PCR-Ansatzes und des Cycler-Programms finden
Sie hier.
Polymerasekettenreaktion
Zum Nachweis von P. syringae pv. aesculi wurde das Primerpaar G5/G6 (SCHMIDT et al.
2009) verwendet, was einen für P. syringae pv. aesculi typischen Bereich des Gyrase
B-Gens vervielfältigt. Die Amplifikation erfolgte in einem 25 µl Reaktionsansatz mit dem
TopTaq Mastermix der Firma Qiagen GmbH (Hilden, Deutschland). Eine detaillierte
Beschreibung des PCR-Ansatzes und des Cycler-Programms sind in Tabelle 1 und 2
dargestellt.
Tab. 1: Angaben zum PCR-Ansatz
PCR-Ansatz
Menge in µl
H2O
9,5
TopTAQ MM (Polymerase)
12,5
MgCl2
1,0
Primer G5
0,5
Primer G6
0,5
Template DNA (aus Extraktion)
1,0
Tab. 2: Angaben über das PCR-Programm
Denaturierung
94 °C
3 min
94 °C
30 sek
Annealing
Elongation
Zyklenzahl
1
67 °C
30 sek
72 °C
1 min
35
72 °C
10 min
1
∞
10 °C
Ergänzung zu Beitrag „Pseudomonas in Dresden entdeckt“ in BaumZeitung 1/2016 von:Hubertus Frölich,
Kristin Morgenstern, Doris Krabel und Prof. Andreas Roloff
Literatur
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Beiträge Tharandt, Beiheft 18: im Druck
DUJESIEFKEN, D.; SCHMIDT, O.; KEHR, R.; STOBBE, H.; MORETH, U.; SCHRÖDER, T. (2008):
Pseudomonas-Rindenkrankheit der Rosskastanie – Erstnachweis des Bakteriums
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DUJESIEFKEN, D.; 12. Ausgabe, S. 153-164, Haymarket Media GmbH & Co. KG, Braunschweig
FISCHER, G. (2014): Umgang mit kranken Rosskastanien. In: Taspo BaumZeitung. 4/2014, S.
19-22, Haymarket Media GmbH & Co. KG, Braunschweig
FRÖLICH, H. (2016): „Untersuchung/ Beurteilung von Stressfaktoren an Rosskastanien als
mögliche Prädisposition für neuartige Schaderreger im Dresdner Stadtgebiet auf Grundlage von
Vitalitätsuntersuchungen“, TU Dresden, Fakultät Umweltwissenschaften, Institut Forstbotanik,
Dresden, Masterarbeit
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Untersuchungsergebnisse und Hinweise für die Praxis. In: Jahrbuch der Baumpflege 2013.
Hrsg. DUJESIEFKEN, D.; 17. Ausgabe, S. 229-237, Haymarket Media GmbH & Co. KG,
Braunschweig
KEHR, R.; MÖHLENHOFF, P.; PETERSEN, K. (2010): Pseudomonas-Rindenkrankheit der
Rosskastanie – Anleitung zur Probennahme für den Schnellnachweis. In: Jahrbuch der
Baumpflege 2010. Hrsg: DUJESIEFKEN, D.; 14. Ausgabe, S. 306-310, Haymarket Media GmbH &
Co. KG, Braunschweig
KRÜGER, T. (2010): Hinweise zum Datensatz der mittleren Oberflächentemperaturen in Dresden.
Leibnitz-Institut für ökologische Raumentwicklung, Dresden. Herausgegeben auf Anfrage
ROLOFF, A. (2001): Baumkronen. Verständnis und praktische Bedeutung eines komplexen
Naturphänomens. Ulmer Verlag, Stuttgart
ROLOFF, A. (2015): Aktuelles zur Vitalitätsbeurteilung von Stadtbäumen anhand der
Kronenstruktur - Erfahrungen und Konsequenzen. In: Jahrbuch der Baumpflege 2015. Hrsg:
DUJESIEFKEN, D.; 19. Ausgabe, S. 125-130. Haymarket Media, Braunschweig
SCHMIDT, O.; MORETH, U.; DUJESIEFKEN, D.; STOBBE, H.; GAISER, O. (2009): Fast molecular
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SCHMIDT, O.; DUJESIEFKEN, D.; STOBBE, H. (2014): Infektionsversuche an Rosskastanien mit
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Eugen Ulmer KG, Stuttgart
STOBBE, H.; SCHMIDT, O.; MORETH, U.; KEHR, R.; DUJESIEFKEN, D. (2008): Pseudomonas:
Derzeitige Verbreitung. In: AFZ-Der Wald, S. 176-177, 4/2008
Ergänzung zu Beitrag „Pseudomonas in Dresden entdeckt“ in BaumZeitung 1/2016 von:Hubertus Frölich,
Kristin Morgenstern, Doris Krabel und Prof. Andreas Roloff