東海大学

東海大学
教員氏名椎名隆（しいなたかし）
取得学位博士（畜産学）
現在の身分（役職名）准教授
専門分野免疫遺伝学、ゲノム医科学
現在の研究課題主要組織適合遺伝子複合体の機能解析
所属学会日本組織適合性学会（評議員）、日本分子生物学会、日本再生医
療学会、日本進化学会
教員紹介
領域（医学部組織）
分子生命科学
専門分野キーワード
研究内容
ヒト白血球抗原（HLA）は、免疫の場における自己あるいは病原体由来の非自己ペプチドを結合し、こ
れを T 細胞に提示することにより抗原特異的免疫応答を誘導するとともに、NK 細胞のリガンドとして
各種免疫細胞を制御する働きを担っている。この HLA 分子をコードする HLA ゲノム領域は、自己免
疫疾患、がん、骨髄移植に伴う移植片対宿主病（graft versus host disease; GVHD）などの疾患の発
症に関与し、またウイルス感染症における防御と重症化、及び薬剤感受性を規定するなど、興味ある
臨床知見が山積している。この領域はヒトゲノムにて比類なき多型性に富み、HLA 遺伝子は遺伝子
全領域に渡り高度な多型性を有することから、他の一般的な遺伝子とは異なり、遺伝子全領域の機
能を HLA アリルごとに知ることのできる、初めての、また唯一無ニの絶好な系である。これまでに我々
は、HLA ゲノム領域 3.8 Mb のゲノム塩基配列を決定したこと（図）、次世代シークエンサーを用いた
HLA タイピング法を開発したことなど、数多くの HLA 研究を推進させるための重要な成果を報告して
いる。現在、最新技術を駆使した HLA 遺伝子における多型解析、遺伝子発現解析、並びに多型・変
異部位における機能解析を実施しており、非コード領域の機能の解明、転写開始点などの遺伝子発
現に重要な役割を担う部位の同定、mRNA の安定性、及びスプライシングに必須な部位の同定を通じ
て HLA 遺伝子内の各部位の機能を明確にすることを目指す。
第６番染⾊色体
テロメア側
ZDHHC20P1
HCG4P11
HLA-F
HLA-F-AS1
RPL23AP1
MICE
HCG9P5
IFITM4P
3.8-1.5
HCG4
HLA-V
短
腕
部
LOC554223
動
原
体
ク
ラ
ス
Ⅰ
領領
域
HCG4P9
HLA-P
RPL7AP7
MICG
HCG4P8
HLA-G
HCGVIII-2
MICF
3.8-1.4
HCG4P7
HLA-H
HLA-T
DDX39BP1
⻑⾧長
腕
部
MCCD1P1
3.8-1.3
HCG4B
HLA-K
HLA-U
HCG4P5
HLA-A
HCG4P4
HLA-W
MICD
HCG9
DDX39BP2
MCCD1P2
ZNRD1-AS1
HCG4P3
HLA-J
HCG8
ETF1P1
ZNRD1
PPP1R11
RNF39
TRIM31
TRIM40
TRIM10
TRIM15
TRIM26
PAIP1P1
HCG17
TRIM26BP
HLA-L
HCG18
TRIM39
ク
ラ
ス
Ⅰ
領領
域
RPP21
HLA-N
UBQLN1P1
MICC
TMPOP1
SUCLA2P1
RANP1
HLA-E
GNL1
PRR3
ABCF1
MIR877
PPP1R10
MRPS18B
ATAT1
PTMAP1
C6orf136
DHX16
PPP1R18
NRM
RPL7AP
MDC1
TUBB
FLOT1
IER3
LINC00243
DDR1
MIR4640
GTF2H4
VARS2
SFTA2
DPCR1
LOC100422429
LOC100420530
MUC21
MUC22
HCG22
C6orf15
CDSN
PSORS1C1
PSORS1C2
POLR2LP
CCHCR1
TCF19
POU5F1
PSORS1C3
HCG27
LOC100996357
HLA-C
USP8P1
RPL3P2
WASF5P
HLA-B
DHFRP2
FGFR3P1
ZDHHC20P2
HLA-S
MICA
HLA-X
HCP5
HCG26
MICB
CYP21A2
TNXB
ATF6B
FKBPL
PRRT1
PPIAP9
RPL15P4
MCCD1
ATP6V1G2
DDX39B
SNORD117
SNORD84
ATP6V1G2
NFKBIL1
TRIM39-RPP21
Extended クラスⅡ領領域
LOC100507547
PPT2
PPT2-EGFL8
EGFL8
AGPAT1
RNF5
AGER
PBX2
GPSM3
NOTCH4
C6orf10
LOC100287329
ク
ラ
ス
Ⅲ
領領
域
LTA
TNF
LTB
LST1
NCR3
UQCRHP1
AIF1
PRRC2A
SNORA38
BAG6
APOM
C6orf47
GPANK1
CSNK2B
LY6G5B
LY6G5C
ABHD16A
MIR4646
LY6G6F
LY6G6E
LY6G6D
LY6G6C
C6orf25
DDAH2
CLIC1
MSH5-SAPCD1
MSH5
SAPCD1
VWA7
VARS
LSM2
HSPA1L
HSPA1A
HSPA1B
C6orf48
SNORD48
SNORD52
NEU1
SLC44A4
EHMT2
ZBTB12
C2
CFB
NELFE
MIR1236
SKIV2L
DOM3Z
STK19
C4A
CYP21A1P
TNXA
STK19P
C4B
HNRNPA1P2
ク
ラ
ス
Ⅱ
領領
域
HCG23
BTNL2
HLA-DRA
HLA-DRB9
HLA-DRB5
HLA-DRB6
HLA-DRB1
HLA-DQA1
HLA-DQB1
MTCO3P1
HLA-DQA2
MIR3135B
HLA-DQB2
HLA-DOB
TAP2
PSMB8
LOC100507463
TAP1
PSMB9
PPP1R2P1
LOC100294145
HLA-Z
HLA-DMB
HLA-DMA
BRD2
HLA-DOA
HLA-DPA1
HLA-DPB1
RPL32P1
HLA-DPA2
COL11A2P
HLA-DPB2
HLA-DPA3
Extended クラスⅡ領領域
セントロメア側
左上からクラスⅠ、クラスⅢ、クラスⅡ領域の順で記載した。白色、灰色、縦縞および黒色のボックス
は、発現遺伝子、遺伝子候補、非タンパク質コード遺伝子および偽遺伝子をそれぞれ示す。HLA 遺伝
子は太文字で記した。クラスⅢ領域には、発現遺伝子が密に位置するのに対して、クラスⅠ領域やク
ラスⅡ領域、とりわけ HLA 遺伝子近傍には、偽遺伝子が密に位置する。これは HLA 遺伝子の重複や
偽遺伝子化を繰り返しながら形成されてきたことを示唆する。
主要論文
1. Shiina T, Tamiya G, Oka A, Takishima N, Yamagata T, Kikkawa E, Iwata K, Tomizawa M, Okuaki N,
Kuwano Y, Watanabe K, Fukuzumi Y, Itakura S, Sugawara C, Ono A, Yamazaki M, Tashiro H, Ando A,
Ikemura T, Soeda E, Kimura M, Bahram S, Inoko H. Molecular dynamics of MHC genesis unraveled by
sequencing analysis of the 1,796,938 bp HLA class I region. Proc Natl Acad Sci USA 96:
13282-13287, 1999.
2. The MHC sequencing consortium (Aguado B, Bahram S, Beck S, Campbell RD, Forbes S, Geraghty
D, Guillaudeux T, Hood L, Horton R, Inoko H, Janer M, Jasoni C, Madan A, Milne S, Neville M, Oka A,
Qin S, Ribas-Despuig G, Rogers J, Rowen L, Shiina T, Spies T, Tamiya G, Tashiro H, Trowsdale J, Vu
Q, Williams L, Yamazaki M). Complete structure and gene map of a human major histocompatibility
complex (MHC). Nature 401: 921-923, 1999.
3. Abi-Rached L, Gilles A, Shiina T, Pontaotti P, Inoko H. Evidence of en Bloc duplication in vertebrate
genomes. Nature Genet. 31: 100-105, 2002.
4. Shiina T, Ota M, Shimizu S, Katsuyama Y, Hashimoto N, Takasu M, Anzai T, Kulski JK, Kikkawa E,
Naruse T, Kimura N, Yanagiya K, Watanabe A, Hosomichi K, Kohara S, Iwamoto C, Umehara Y, Meyer
A, Wanner V, Sano K, Macquin C, Ikeo K, Tokunaga K, Gojobori T, Inoko H, Bahram S. Rapid
evolution of MHC class I genes in primates generates new disease alleles in man via hitchhiking
diversity. Genetics 173: 1555-1570, 2006.
5. Shiina T, Suzuki S, Ozaki Y, Taira H, Kikkawa E, Shigenari A, Oka A, Umemura T, Joshita S, Takahashi
O, Hayashi Y, Paumen M, Katsuyama Y, Mitsunaga S, Ota M, Kulski JK, Inoko H. Super high resolution
for single molecule-sequence-based typing of classical HLA loci at the 8-digit level using next
generation sequencers. Tissue Antigens 80: 305-316, 2012.
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