東海大学 教 員 氏 名 椎名 隆(しいな たかし) 取 得 学 位 博士 (畜産学) 現在の身分(役職名) 准教授 専 門 分 野 免疫遺伝学、ゲノム医科学 現在の研究課題 主要組織適合遺伝子複合体の機能解析 所 属 学 会 日本組織適合性学会(評議員)、日本分子生物学会、日本再生医 療学会、日本進化学会 教員紹介 領域(医学部組織) 分子生命科学 専門分野キーワード 研究内容 ヒト白血球抗原(HLA)は、免疫の場における自己あるいは病原体由来の非自己ペプチドを結合し、こ れを T 細胞に提示することにより抗原特異的免疫応答を誘導するとともに、NK 細胞のリガンドとして 各種免疫細胞を制御する働きを担っている。この HLA 分子をコードする HLA ゲノム領域は、自己免 疫疾患、がん、骨髄移植に伴う移植片対宿主病(graft versus host disease; GVHD)などの疾患の発 症に関与し、またウイルス感染症における防御と重症化、及び薬剤感受性を規定するなど、興味ある 臨床知見が山積している。この領域はヒトゲノムにて比類なき多型性に富み、HLA 遺伝子は遺伝子 全領域に渡り高度な多型性を有することから、他の一般的な遺伝子とは異なり、遺伝子全領域の機 能を HLA アリルごとに知ることのできる、初めての、また唯一無ニの絶好な系である。これまでに我々 は、HLA ゲノム領域 3.8 Mb のゲノム塩基配列を決定したこと(図)、次世代シークエンサーを用いた HLA タイピング法を開発したことなど、数多くの HLA 研究を推進させるための重要な成果を報告して いる。現在、最新技術を駆使した HLA 遺伝子における多型解析、遺伝子発現解析、並びに多型・変 異部位における機能解析を実施しており、非コード領域の機能の解明、転写開始点などの遺伝子発 現に重要な役割を担う部位の同定、mRNA の安定性、及びスプライシングに必須な部位の同定を通じ て HLA 遺伝子内の各部位の機能を明確にすることを目指す。 第6番染⾊色体 テロメア側 ZDHHC20P1 HCG4P11 HLA-F HLA-F-AS1 RPL23AP1 MICE HCG9P5 IFITM4P 3.8-1.5 HCG4 HLA-V 短 腕 部 LOC554223 動 原 体 ク ラ ス Ⅰ 領領 域 HCG4P9 HLA-P RPL7AP7 MICG HCG4P8 HLA-G HCGVIII-2 MICF 3.8-1.4 HCG4P7 HLA-H HLA-T DDX39BP1 ⻑⾧長 腕 部 MCCD1P1 3.8-1.3 HCG4B HLA-K HLA-U HCG4P5 HLA-A HCG4P4 HLA-W MICD HCG9 DDX39BP2 MCCD1P2 ZNRD1-AS1 HCG4P3 HLA-J HCG8 ETF1P1 ZNRD1 PPP1R11 RNF39 TRIM31 TRIM40 TRIM10 TRIM15 TRIM26 PAIP1P1 HCG17 TRIM26BP HLA-L HCG18 TRIM39 ク ラ ス Ⅰ 領領 域 RPP21 HLA-N UBQLN1P1 MICC TMPOP1 SUCLA2P1 RANP1 HLA-E GNL1 PRR3 ABCF1 MIR877 PPP1R10 MRPS18B ATAT1 PTMAP1 C6orf136 DHX16 PPP1R18 NRM RPL7AP MDC1 TUBB FLOT1 IER3 LINC00243 DDR1 MIR4640 GTF2H4 VARS2 SFTA2 DPCR1 LOC100422429 LOC100420530 MUC21 MUC22 HCG22 C6orf15 CDSN PSORS1C1 PSORS1C2 POLR2LP CCHCR1 TCF19 POU5F1 PSORS1C3 HCG27 LOC100996357 HLA-C USP8P1 RPL3P2 WASF5P HLA-B DHFRP2 FGFR3P1 ZDHHC20P2 HLA-S MICA HLA-X HCP5 HCG26 MICB CYP21A2 TNXB ATF6B FKBPL PRRT1 PPIAP9 RPL15P4 MCCD1 ATP6V1G2 DDX39B SNORD117 SNORD84 ATP6V1G2 NFKBIL1 TRIM39-RPP21 Extended クラスⅡ領領域 LOC100507547 PPT2 PPT2-EGFL8 EGFL8 AGPAT1 RNF5 AGER PBX2 GPSM3 NOTCH4 C6orf10 LOC100287329 ク ラ ス Ⅲ 領領 域 LTA TNF LTB LST1 NCR3 UQCRHP1 AIF1 PRRC2A SNORA38 BAG6 APOM C6orf47 GPANK1 CSNK2B LY6G5B LY6G5C ABHD16A MIR4646 LY6G6F LY6G6E LY6G6D LY6G6C C6orf25 DDAH2 CLIC1 MSH5-SAPCD1 MSH5 SAPCD1 VWA7 VARS LSM2 HSPA1L HSPA1A HSPA1B C6orf48 SNORD48 SNORD52 NEU1 SLC44A4 EHMT2 ZBTB12 C2 CFB NELFE MIR1236 SKIV2L DOM3Z STK19 C4A CYP21A1P TNXA STK19P C4B HNRNPA1P2 ク ラ ス Ⅱ 領領 域 HCG23 BTNL2 HLA-DRA HLA-DRB9 HLA-DRB5 HLA-DRB6 HLA-DRB1 HLA-DQA1 HLA-DQB1 MTCO3P1 HLA-DQA2 MIR3135B HLA-DQB2 HLA-DOB TAP2 PSMB8 LOC100507463 TAP1 PSMB9 PPP1R2P1 LOC100294145 HLA-Z HLA-DMB HLA-DMA BRD2 HLA-DOA HLA-DPA1 HLA-DPB1 RPL32P1 HLA-DPA2 COL11A2P HLA-DPB2 HLA-DPA3 Extended クラスⅡ領領域 セントロメア側 左上からクラスⅠ、クラスⅢ、クラスⅡ領域の順で記載した。白色、灰色、縦縞および黒色のボックス は、発現遺伝子、遺伝子候補、非タンパク質コード遺伝子および偽遺伝子をそれぞれ示す。HLA 遺伝 子は太文字で記した。クラスⅢ領域には、発現遺伝子が密に位置するのに対して、クラスⅠ領域やク ラスⅡ領域、とりわけ HLA 遺伝子近傍には、偽遺伝子が密に位置する。これは HLA 遺伝子の重複や 偽遺伝子化を繰り返しながら形成されてきたことを示唆する。 主要論文 1. Shiina T, Tamiya G, Oka A, Takishima N, Yamagata T, Kikkawa E, Iwata K, Tomizawa M, Okuaki N, Kuwano Y, Watanabe K, Fukuzumi Y, Itakura S, Sugawara C, Ono A, Yamazaki M, Tashiro H, Ando A, Ikemura T, Soeda E, Kimura M, Bahram S, Inoko H. Molecular dynamics of MHC genesis unraveled by sequencing analysis of the 1,796,938 bp HLA class I region. Proc Natl Acad Sci USA 96: 13282-13287, 1999. 2. The MHC sequencing consortium (Aguado B, Bahram S, Beck S, Campbell RD, Forbes S, Geraghty D, Guillaudeux T, Hood L, Horton R, Inoko H, Janer M, Jasoni C, Madan A, Milne S, Neville M, Oka A, Qin S, Ribas-Despuig G, Rogers J, Rowen L, Shiina T, Spies T, Tamiya G, Tashiro H, Trowsdale J, Vu Q, Williams L, Yamazaki M). Complete structure and gene map of a human major histocompatibility complex (MHC). Nature 401: 921-923, 1999. 3. Abi-Rached L, Gilles A, Shiina T, Pontaotti P, Inoko H. Evidence of en Bloc duplication in vertebrate genomes. Nature Genet. 31: 100-105, 2002. 4. Shiina T, Ota M, Shimizu S, Katsuyama Y, Hashimoto N, Takasu M, Anzai T, Kulski JK, Kikkawa E, Naruse T, Kimura N, Yanagiya K, Watanabe A, Hosomichi K, Kohara S, Iwamoto C, Umehara Y, Meyer A, Wanner V, Sano K, Macquin C, Ikeo K, Tokunaga K, Gojobori T, Inoko H, Bahram S. Rapid evolution of MHC class I genes in primates generates new disease alleles in man via hitchhiking diversity. Genetics 173: 1555-1570, 2006. 5. Shiina T, Suzuki S, Ozaki Y, Taira H, Kikkawa E, Shigenari A, Oka A, Umemura T, Joshita S, Takahashi O, Hayashi Y, Paumen M, Katsuyama Y, Mitsunaga S, Ota M, Kulski JK, Inoko H. Super high resolution for single molecule-sequence-based typing of classical HLA loci at the 8-digit level using next generation sequencers. Tissue Antigens 80: 305-316, 2012. Copyright (C) 2015 東海大学大学院医学研究科. All Rights Reserved.
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