多剤耐性菌感染症克服を意図した 多剤排出ポンプ

多剤耐性菌感染症克服を意図した
多剤排出ポンプ阻害剤
大阪大学 産業科学研究所
教授 山口 明人
大阪大学 産業科学研究所
教授 加藤 修雄
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従来技術とその問題点
従来技術:抗菌薬による細菌感染症の治療
問題点
・多剤排出ポンプの過剰産生に起因する
グラム陰性多剤耐性菌感染症が発生
臨床投与できる有効な治療薬が存在しない
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研究の背景
グラム陰性菌多剤耐性の背景には多剤排出ポンプの高発現がある
グラム陰性菌主要多剤排出ポンプ
の模式図
・多剤排出ポンプはすべての細菌が持っている細菌
の生体防御機構。
・多剤耐性菌では多剤排出ポンプの発現が亢進して
いる。
・多剤耐性菌の広い耐性スペクトルは多剤排出ポン
プの高発現によるものである。
多剤耐性緑膿菌臨床分離株(MDRP)における多剤排出ポンプの高発現
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排出ポンプの構造決定
世界初の多剤排出ポンプ構造決定により、構造に基づく
阻害剤のデザインが可能になった
私たちは、2002年に世界で初めて大腸菌の多剤排出ポ
ンプAcrBの構造を決定したのを皮切りに、2006年には初
めて薬物結合構造を決定し、2011年には複数の多剤結
合ポケットの存在を証明、さらに2013年には大腸菌と緑
膿菌の多剤排出ポンプの阻害剤結合構造を決定した。
2006年Nature誌に報告した
多剤排出ポンプAcrBの薬物 2002年Nature誌の表紙を飾った
結合構造
初の多剤排出ポンプ構造決定
2006年薬物結合構造決定
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排出機構
多剤排出ポンプは、ホモ3量体が機能的回転輸送機構で
薬物を排出する細胞膜の掃除機だった。
drug
binding monomer
access
monomer
distal pocket
proximal pocket
②
extrusion
drug
H+
drug
periplasm
③
①
Central Cavity
proton relay site
ion pair triplet
inner
membrane
access
binding
Arg971
H+
cytoplasm
3つの入り口に1つの出口、2つの結合ポケット、
プロトンリレーサイトを持つホモ3量体ポンプ
機能的回転輸送機構の模式図
3つのモノマーが待機→結合→排出と順に構造
変化する
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多剤認識機構
多剤結合を可能にしていたのはマルチサイト結合だった
extrusion
monomer
access
monomer
小分子量薬物
PN2 MINO(青)
DOX(橙)
PN1
PC1
PC2
open
cleft
binding
monomer
大分子量薬物
RIF(マゼンタ)
EM(黄)
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阻害剤結合部位の決定
既知の狭域阻害剤ABI-PPとの結合構造を決定した
Nature 2013
ABI-PP: AcrB, MexBを阻害す
るが、MexYを阻害しない。
extrusion
90°
binding
access
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ABI-PPがMexYを阻害できない理由
AcrB/∆acrB
MexY/∆acrB∆tolC
MexB/∆acrB∆tolC
EM 2µg/ml
AcrB
MexY
MexB
F178
V139
F178
V139
W177
I138
crystal structure
homology model
crystal structure
AcrB, MexBでは阻害剤結合ピットのフェニルアラニン178がABI-PPのピリドピリミジン環とπ-π結合を形成しているが、
MexYの対応する部位はトリプトファン177で占められており、その大きなインドール側鎖が結合ピットに張り出してABIPPの結合を立体的に障害しているということが、構造解析によって解明された。
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広域阻害剤の設計と合成
MexYのTrp177側鎖を迂回して結合できる新規Hx化合
物の合成に成功
Hxはエリスロマイシンとの併用で、
はエリスロマイシンとの併用で、MexB,
MexYどちら
どちら
はエリスロマイシンとの併用で、
の過剰発現株の生育も阻害する
MexY
Hx濃度
W177
Hx
Hx濃度
PP
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新技術の特徴・従来技術との比較
・グラム陰性菌多剤排出ポンプの広域阻害剤を開発。
・多剤耐性緑膿菌を始めとするグラム陰性多剤耐性菌に対する
従来型抗菌薬の抗菌活性を復活させる。
・これまでグラム陰性細菌には適応のなかったマクロライド薬な
どの抗菌薬の使用も可能になる。→グラム陰性菌には耐性が
広まっていないことが期待できる。
・阻害剤自体には抗菌力がないので、阻害剤への耐性菌の出
現可能性は低いと期待できる。
・単剤投与が原則の従来の抗菌薬治療に対し、ポンプ阻害剤
併用投与という新しい治療形態により、耐性菌の出現を抑え、
抗菌薬使用量を劇的に低減できる。
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想定される用途
• 既知抗菌薬との併用により、多剤耐性緑膿菌
(MDRP)、多剤耐性アシネトバクター(MDRA)などの
治療薬。
• CRE, BLPAR, BLNARなど、多剤排出ポンプ過剰産
生以外の多剤耐性菌に対しても、多剤排出ポンプ阻
害効果により有効になる抗菌剤が期待できる。
• 阻害剤配合抗菌薬という形で、これまでグラム陰性
感染菌には無効であった抗菌薬を治療に生かせる。
• 耐性菌以外の感受性菌に対しても、阻害薬を併用す
ることで抗菌薬の投与量を大幅に低減できる。
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実用化に向けた課題
Hxをリード化合物としてさらに阻害能の向上し
た化合物を設計・合成すると共に、臨床開発に
向けてデータを積み重ねていく
現在:大腸菌、緑膿菌、サルモネラ菌に対する
各種抗菌薬との組み合わせによる抗菌力
のデータが得られた段階。
今後:臨床的に重要な他の菌種に対するデータ
を集めると共に、細胞毒性、薬物動態など
のin vivoの検証を行う。
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企業への期待
・多剤耐性菌に対する有効な抗菌薬を開発する
意欲を持つ企業と共同研究することで、私たち
の開発した多剤排出ポンプ広域阻害剤を臨床薬
として育てたい。
・新たな化合物の合成、ポンプの結合構造決
定、対象細菌の遺伝子操作や抗菌力測定は大
学で分担できるので、企業には培養細胞や動物
を用いた細胞毒性や薬物動態等の検証をお願
いしたい。
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本技術に関する知的財産権
• 発明の名称 :多剤排出ポンプ阻害剤
• 出願番号 :特願2015-238703
• 出願人
:国立研究開発法人科学技
術振興機構
• 発明者
:山口明人、加藤修雄、
井上雄太、山崎聖司
樋口雄介、櫻井啓介
中島良介、西野邦彦
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お問い合わせ先
【ライセンスについて】
科学技術振興機構
知的財産戦略センター 下岡 正志
TEL
03-5214 - 8486
e-mail
[email protected]
【技術内容について】
大阪大学 産業科学研究所
教授 山口 明人
TEL
06-6879 - 8418
e-mail
akihito@sanken.osaka-u.ac.jp
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