メタボローム受託解析 - かずさDNA研究所

メタボローム受託解析
選択フローチャート
興味ある化合物は?
一次代謝物
二次代謝物
化合物の極性は?
化合物の極性は?
高(中)極性
低極性
中(高)極性
低極性
糖、アミノ酸
有機酸など
脂肪酸など
二次代謝物
など
脂質類
GC-MS
基本解析
GC-MS
脂肪酸解析
弊所受託メニュー共通の特徴
過不足のない最適な情報量
◆各種データベース検索により得られた
検出ピークと既知化合物との照合を
直感的にご理解いただける形で
ご提供いたします。
◆一般的な受託サービスでは
データベースヒットのないピーク情報
は破棄されますが、弊所では余すこと
なく情報提供いたしますので、
未知化合物の探索にも最適です。
求めるデータは?
詳細な
(MS/MS)
データで
解析を
LC-MS
基本解析
LC-MS
脂質解析
シンプルな
データで
試料間比較
など
LC-MS
差分解析
メタボローム受託解析
メニュースペック表
◆特性比較
メニュー名
データ解析に使用する
主なソフトウェア
特徴
考慮すべき点
・PowerGet
中極性化合物(芳香族配糖体、テルペノイド誘導体、
アミノ酸誘導体など)を対象に、化合物推定のための
豊富な精密質量分析情報(MS/MS情報を含む)の付与
および多変量解析を行います。
未知化合物であっても組成式予測が可能。
複数のデータベースとの
照合結果、MS/MS情報、
標品実測データとの照合結果
を含む
LC-MS
差分解析
・SIEVE
中極性化合物(芳香族配糖体、テルペノイド誘導体、
アミノ酸誘導体など)を対象に、化合物推定のための
精密質量分析情報の付与および試料間の差分検出、
多変量解析を行います。
未知化合物であっても組成式予測が可能。
MS/MS情報は考慮されない
LC-MS
脂質解析
・Lipid Search
・SIEVE
低極性化合物(脂質)を対象に、
化合物推定のための精密質量分析情報の付与および
脂質候補のスコア付けを行います。
未知化合物であっても構造推定が可能。
ソフトウェア閲覧操作の詳細は
開発企業である
三井情報株式会社がサポート
GC-MS
基本解析
・GC/MS代謝成分
TMS化データベース
・Analyzer Pro
・FragmentAlign
高極性成分(糖、アミノ酸、有機酸など)を対象に、
428種の代謝成分データベースとの照合による
同定および全検出ピークを用いた多変量解析を行います。
代謝成分データベースに
ヒットしない化合物ピークに
ついては情報が少ない
GC-MS
脂肪酸解析
・GC/MS代謝成分
ME化データベース
・Analyzer Pro
・FragmentAlign
低極性成分(脂肪酸)を対象に、
50種の代謝成分データベースとの照合による同定および
全検出ピークを用いた多変量解析を行います。
代謝成分データベースに
ヒットしない化合物ピークに
ついては情報が少ない
LC-MS
基本解析
◆分析対象比較
分析対象
化合物極性
定性
定量
メニュー名
既知化合物
未知化合物
高極性
中極性
低極性
DB検索
相対
絶対
(半定量)
LC-MS
基本解析
○
◎
△
○
×
○
○
△**
LC-MS
差分解析
△
○
△
○
×
○
○
△**
LC-MS
脂質解析
○
○
×
×
◎
○
○
△**
GC-MS
基本解析
◎
×
○
×*
×
○
○
△**
GC-MS
脂肪酸解析
◎
×
×
×*
○
○
○
△**
*化合物の種類により検出される可能性あり
**標品測定を別途行う必要あり
お問い合わせ先
公益財団法人 かずさDNA研究所 バイオ産業技術支援センター
E-mail: [email protected] Tel: 0438-52-3947
http://www.biosupport.kazusa.or.jp/index.html
メタボローム受託解析
目的に応じた
3種のメニュー
基本
解析
中(高)極性 二次代謝物などの
詳細(MS/MS)なデータ解析
未知化合物であっても組成式予測可能
差分
解析
中(高)極性 二次代謝物などを
シンプルなデータで多試料間比較
未知化合物であっても組成式予測可能
脂質
解析
脂質分子を網羅的に解析
未知化合物であっても構造推定が可能
LTQ-Orbitrap-XL
最高分解能100,000、質量誤差5ppm以内を誇る分析装置
(Thermo Fisher Scientific社製)による精密質量データをもとに、各解析を実施。
基本解析
分析試料
差分解析
脂質解析
中極性化合物
中極性化合物
(芳香族配糖体・テルペノイド
誘導体・アミノ酸誘導体など)
(芳香族配糖体・テルペノイド
誘導体・アミノ酸誘導体など)
低極性化合物
(脂質)
SIEVE
解析ソフトウェア
Power Get
(弊所独自開発)
SIEVE
(Thermo Fisher
Scientific社製)
(Thermo Fisher
Scientific社製)
Lipid Search
(三井情報株式会社(MKI)製)
化合物推定のための
情報
統計解析結果
価格 /1試料 ※
精密質量データ
推定組成式リスト
データベース検索結果
MSMSフラグメント情報
弊所標品実測データ
との照合結果
精密質量データ
推定組成式リスト
データベース検索結果
精密質量データ
推定組成式リスト
データベース検索結果
脂質構造データベース
検索結果
SIEVE:主成分分析結果
主成分分析結果
主成分分析結果
Lipid Search:
t 検定結果
t 検定結果
(各群とQC群の差分の検出 各群代表サンプルの脂質
(2群間の差分の集計結果)
結果)
分子を網羅的に検索同定
¥230,000~
¥161,000~
¥311,000~
※試料数が多くなると単価は下ります。 また、試料調製料別途かかります。 各解析納期:分析開始から1ケ月
「PowerGet」では
MSMS情報を考慮した高精度なピークピッキングとアライメントを行い
検出された全化合物ピーク情報と共に 分子量・分子式(アノテーション)・DB検索
結果・MSMS情報・弊所の代謝物標品測定データ(293種)との照合結果など
豊富な情報をExcelファイルにてご報告いたします。
結果は組成式・化合物名から検索が可能です。
「PowerGet」
(弊所独自開発)
また、主成分分析結果や t 検定結果などの統計解析よりサンプル群に特徴的
な成分を見出したり、注目サンプルの特徴づけを行うことが可能です。
これらは条件の変更可能なExcelファイルにてご報告いたします。
化合物推定にお役立ていただけます。
「SIEVE」
を用いて解析することにより低価格化を実現しました。
「シンプルなデータで多数試料間の比較解析をされたい」
「1試料のみの予備的な測定をされたい」場合にも適したメニューです。
サンプルと共にQC試料を測定し、検出された全化合物ピークについて精密質
量データから組成式演算、代謝物DB検索を行い、各サンプル群とQC群との差
分(有意差(p-value)、ピーク面積値の変化率)を算出いたします。
全化合物ピーク情報、差分検出結果及び主成分分析結果の何れも
「SIEVE」
(Thermo Fisher
Scientific社製)
Excelファイルにてご報告いたします。
SIEVEを使い、解析結果を閲覧いただくことができます。
アカウント登録(無料)後1ヶ月間は再解析も可能です。
「Lipid Search」は
生体内脂質を対象とした大量の質量分析データを一括同定・定量するハイスル
―プット質量同定システムです。
グループ特異的同定手法(スペクトルから脂質構造を推定し、脂質DBを用いて
最適脂質候補を推定)および網羅的手法(LC-MSにより網羅的に抽出されたス
ペクトル群を脂質DBの理論構造、理論開列パターンと照合し高精度同定アルゴ
リズムにより最適な脂質分子候補を推定)の2手法を用いて網羅的に検索、同
Search 定します。(注:同定には標品との照合が必要です)
(三井情報株式会社
(MKI)製)
既知・未知脂質合わせて100万種以上の推定が可能。未知の脂質についても構
造の推定が可能。
解析結果はソフトウエアと共に納品され、納品後MKI社のサポートを受けること
ができます。(SIEVEによる解析データも付加されます)
【脂肪酸】C4:0~C31:0に着目の場合
脂肪酸解析メニューをお勧めします
お問い合わせ先
GC-MS解析へ
公益財団法人 かずさDNA研究所 バイオ産業技術支援センター
E-mail: [email protected] Tel: 0438-52-3947
http://www.biosupport.kazusa.or.jp/index.html
メタボローム受託解析
基本
解析
脂肪酸
解析
高極性成分対象
糖・アミノ酸・有機酸など
低極性成分対象
(脂肪酸 C4:0~C31:0など)
分析装置は、 GCMS-QP2010Ultra
10,000u/sec以上の高速Scan測定と高感度測定を可能とし、高い定量性を有する
島津製ガスクロマトグラフ四重極型質量分析装置を使用。
代謝成分データベースとの照合による同定および全検出ピークを用いた多変量解析。
分析Rawファイル、Wordファイル報告書、解析結果はExcelファイルにてご報告いたします。
対象試料
ターゲット
解析
基本解析
脂肪酸解析
高(中)極性 (糖・アミノ酸・有機酸など)
低極性(脂肪酸など)
「代謝物TMS化データベース」…428種
(shimadzu社製)
「代謝物ME化データベース」…50種
(shimadzu社製)
解析
ソフトウェア
ノンターゲット
解析
「Analyzer Pro」 (Spectral Works社製)
「Fragment Align」 (弊所独自開発)
化合物推定のための情報
MSスペクトル照合
統計解析結果
多変量解析による主成分分析結果
価格
¥483,000 / 9試料
¥720,000 / 18試料
※試料数が9,18以外の場合は別途お問い合わせください
各解析納期:分析開始から1ケ月
お問い合わせ先
公益財団法人 かずさDNA研究所 バイオ産業技術支援センター
E-mail: [email protected] Tel: 0438-52-3947
http://www.biosupport.kazusa.or.jp/index.html
メタボローム受託解析
サンプル群間で共通の特徴を持つ成分を過不足なくグルーピング
サンプル群間の代謝物量の変動を相関係数で表現
→任意の閾値以上の代謝物間を結んでモジュール化
相関係数
金平糖アルゴリズム
統計学の指標:相関係数に加え
幾何学の理論を取り入れた独自の指標を導入
ネットワーク
F値
モジュールへの寄与が
安定であるか
要素特異率
特異的なつながりであるか
False Positive Out解析
生体現象を
↓
忠実に可視化
ネットワークF値を下げる成分を
モジュールから外す
偽陽性を低減した解析が可能に
False Negative In解析
注目モジュールとのつながりが多く、
他のモジュールとのつながりが少ない
要素を組み込む
↓
偽陰性を低減した解析が可能に
準備するのは、これひとつだけ。
全検出ピーク×サンプル群のピーク強度テーブルのみです。
弊所のLC-MS・GC-MS受託解析データであれば、そのままご利用頂けます。
お客様ご自身で取得したデータであっても問題なく使用できます。
必要な機能は、すべてこの中に。
代謝物間の関係性を紐解く演算機能だけでなく、その関係性を
視覚的に表現するネットワーク描画機能も搭載しています。
ConfeitoGUIplusさえあれば、学会・論文・報告書...
あらゆる場面で効果的なプレゼンテーションが可能です。
本ソフトウェアは、年間ライセンスでの販売となります。
ライセンス料、デモ版の頒布に関しましては、別途お問い合わせください。
お問い合わせ先
公益財団法人 かずさDNA研究所 バイオ産業技術支援センター
E-mail: [email protected] Tel: 0438-52-3947
http://www.biosupport.kazusa.or.jp/index.html