温度勾配ゲル電気泳動装置 温度勾配ゲル電気泳動装置 マイクロTG 171 ●電気泳動用パワーサプライ➡P.169 ●実験データ➡P.172 ●垂直式と平行式の両用 (特型は平行式専用) 平行式TGGE 泳動例 ミキサー ローテーター スターラー おもな用途 ●平行式による多型解析、垂直式のアプリケーション 垂直式TGGE 泳動例 ±0.1℃(*1) 温度調節精度 70℃(直線性維持温度勾配40℃) 最大温度勾配 安全器/安全機能 230×346×231Hmm 本体外形寸法 AC100V・6A(電気泳動用パワーサプライは除く) 電源 別途必需品 (*3) ゲルカセット、ゲルキャスター、電気泳動用パワーサプライ 本体価格 ¥1,078,000 ■別売部品 品名 マルチスロット ロングスロット 備考 価格 平行式用、8ウェル、約2.5µl/ウェル、泳動距離約20mm、100個入 ¥10,000 ¥10,000 垂直式用、1ウェル、約8µl/ウェル、泳動距離約20mm、100個入 ゲルカセット (ロングスロット) ゲルキャスター (18枚作製用、特注品) ●外形寸法は突起部を含みません。 ●写真の容器は付属しません。 ●表示価格は消費税を含みません。 品名 ゲルキャスター 備考 価格 ゲルカセット内にアクリルアミドゲルを作るために必須、3枚作製用 ¥28,000 ●ゲルキャスター (18枚作製用) は特注品です。価格はお問い合わせください。 [オフライン総合カタログ2016-2017] 学術と産業に貢献します 巻末資料 索引 ●ゲルキャスター 恒温水循環装置 ゲルカセット (マルチスロット) ●ゲルカセット(低蛍光性の樹脂製、蛍光ラベルサンプルはそのまま検出可能です) [チラー] ゲルキャスター (3枚作製用) 酸素センサー 電気培養装置 電気泳動関連 (*1) ゲルに対する温度精度は、同一ゲル内が±0.2℃程度、ゲル間が±0.5℃程度です。なお、 本製品の使用環境温度範囲は+10℃~+30℃です。空調された室内でご使用ください。ただし バッ エアコン等の吹き出し口付近のように直接風が当たるような場所は避けてください。 (*2) ファーウィック (泳動バッファー保持体) は、蒸留水ですすいで数回の再使用が可能です。消耗時 (*3)169ページ掲載のAE-8155等を別途ご用意 のため、100個入¥10,000で販売しています。 いください。 凍結乾燥機 ゲルホルダー:平行式TGGE用×3、垂直式TGGE用×3 伝熱シート×4、カバーフィルム×10 バッファーウィック×100(*2) 標準付属品 マイクロTG-2(特注品) フタを閉時のみ電気泳動可能、温調器の各種エラー表示 遠心式濃縮機 低温トラップ 3枚 最大ゲル架数 ハイブリダイゼーション +10℃〜+80℃ 使用温度範囲 インキュベーター マイクロゲル (平行式用) は100~300bpの 断片の多型解析には十分ですが、微生物 の群集構造解析には泳動距離と温度勾配 の解像度が不足気味です。ゲルをミニゲル し サイズまで拡大 (172ページ参照) た平行式専用の特型の製作 も受けたまわっておりますの で、詳細はお問い合わせくだ さい。 恒温庫 マイクロTG 型名 投込み式冷却器 のご紹介 ■特型 (マイクロTG-2) ゲルホルダー (泳動槽) 恒温水槽 振とう恒温槽 や手間がかかるという欠点がありました。 マイクロTGは超小型のゲルフォーマットと コンパクトな温度コントロール装置を用い ることで、TGGEを格段に便利な手法にし ました。従来のTGGE装置では必要だった 循環装置は、マイクロTGでは不要です。 ゲルカセット (マイクロゲル) アルミブロック恒温槽 をかけて行う電気泳動法で、同じ大きさ のDNAでもその配列の違いにより分離す ることができる技 術で す。TGGEには、 温度勾配を泳動方向に対して垂直にかける と平行にかける 「平行式 「垂直式TGGE」 TGGE」があります。 DNA解析において非常に情報量の多い 手法であるTGGEですが、従来では時間 ミニ恒温槽 TGGE(Temperature-Gradient Gel Electrophoresis)は ゲ ル に 温 度 の 勾 配 ■マイクロTGについて ビーズ破砕機 超音波破砕機 ●平行式による微生物群集構造解析 [特型が向く] ■温度勾配ゲル電気泳動:TGGEについて 振とう機 ●マイクロゲル3枚同時泳動 (特型はミニゲル2枚) バイオ医薬品開発 ●25mm角のマイクロゲルでTGGE、最短で泳動20分 細胞培養 おもな特長 恒温振とう培養機 化によりさらに簡便化しました。温度調節機能内蔵で循環装置は不要です。 ODモニター DGGEよりもゲル作成の簡便さと再現性の点で優れるTGGEを、ゲルの小型 172 温度勾配ゲル電気泳動装置 (参考資料) マイクロTGの実験データ 恒温振とう培養機 ODモニター ■分離能 検証 例 マイクロTGの分離能検証例:16S rDNAの部分断片の分離 (CGクランプ法+TGGE) 細胞培養 バイオ医薬品開発 GCクランプ付きプライマーを用いてPCRで個別に増幅した16S rDNAの部分断片(断片長は同じ)を混合して、TGGEで分離を試みました。結 果、 「長さが同じでも配列が異なれば分離できる」 というTGGEの基本的な作用を確認することができました。 通常の電気泳動 垂直式TGGE 平行式TGGE ❶:サンプルB 振とう機 ❷:PCR後にサンプルAとBを混合 ❸:サンプルA ❹と❺:その他のサンプル ミキサー ローテーター スターラー Ⓐ ❶❷❸❹❺ Ⓑ マイクロTG-2(特注品) の検証例:DGGEマーカーの分離 ビーズ破砕機 超音波破砕機 アルミブロック恒温槽 ミニ恒温槽 マイクロTG-2(特注品) 用のゲルは、標準タイプのマイクロTG用マイクロゲルと比較して、泳動距離が約5倍になっています (比較写真参照、分 かりやすくするためにゲル部に色をつけています) 。装置本体内の熱源の幅も変更し、拡大版ゲルの上下両端がそれぞれの設定温度になるよう に熱源を配置しています。この拡大版ゲルを用いて、DGGEで分離すると10本のバンドが現れる市販のDGGEマーカーの分離を試みました。結 果、拡大版ゲルは市販のDGGE装置のゲルと比較したらかなり小さいものの、明確な9本のバンド (1、3~10) と1本のやや薄いバンド (2) を確認 することができ、一定のパフォーマンスが得られることを確認できました。 ゲルの大きさ比較 投込み式冷却器 恒温水槽 振とう恒温槽 ハイブリダイゼーション インキュベーター 恒温庫 マイクロTG マイクロTG-2 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 [泳動条件] ・泳動サンプル:DGGE Marker III 3µ( l 10 fragments,、ニッポンジーン) ・ゲル:6%アクリルアミドゲル (アクリルアミド:ビス19:1、6.5M尿素、TBE) ・泳動用バッファー:5×TBE ・温度勾配:48℃ー 63℃ ・電圧:最初の30分を50V、その後100Vで2時間45分 ・泳動後、ゲルをSYBR Goldで染色しバンドを検出 遠心式濃縮機 低温トラップ 凍結乾燥機 マイクロTG アプリケーション例① マイクロTG アプリケーション例② テ ン プ レ ー トDNAセ ッ トras Mutant Set c-Ki-ras codon 61 (TaKaRa) を用いて同一コドン内で一塩基のみ異なる8種類のDNA 断片 (157bp、GCクランプ付き)を作製し、Heteroduplex Analysis を行ったところ、各種の一塩基置換を移動度の差として検出すること ができました。各レーンの上2本のバンドがヘテロ二重鎖、3本目以降 のバンドはホモ二重鎖です。 GP法とはランダムPCR法と垂直式TGGE法から成る、遺伝子型による 1) 生物種の予備的同定法です 。ゲノムDNAを鋳型にしてランダムPCR で得た断片のTGGEバンドパターンは生物種固有のものとなることが 分かっています。GP法における種の同定は、そのパターンから8つの特 徴点を抽出して類似性に関するスコアを算出することで行われます。ス コアが1に近づくほど、GP法の上では種が近いことを意味します。 ポイントミューテーションの検出 (ヘテロ二重鎖法+TGGE) 図1.通常の電気泳動 図2.平行式TGGE ゲノムプロフィリング (GP) 法 酸素センサー 電気培養装置 電気泳動関連 乳酸菌の一種の GPパターン 病原性酵母の一種の GPパターン 恒温水循環装置 [チラー] 1)Nishigaki, K., Naimuddin, M., Hamano, K.:J.Biochem. , 128, 107-112(2000) 巻末資料 索引 学術と産業に貢献します [オフライン総合カタログ2016-2017] ●外形寸法は突起部を含みません。 ●写真の容器は付属しません。 ●表示価格は消費税を含みません。
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