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糖鎖受託解析サービス
(住友ベークライトが日本国内で実施)
糖鎖精製ラベル化キットBlotGlyco®を用いた糖鎖測定・解析を受託します。糖タンパク質、血液、細胞、
生体組織、電気泳動バンドなど様々な生体由来試料の糖鎖解析に対応します。
各サービスの特長
LC-MS
・LCによる定量情報とESI-MSによる構造情報が同時に得られます。
・BlotGlyco®を用いて莢雑物を除去することで糖鎖由来のピークが検出されやすくなります。
≪ データレポートの一例 ≫
LCクロマトグラム
ESI-MSクロマトグラム
peak
obsd m/z
calcd m/z
ion species
5
790.29
790.30
[M-2H]2-
(HexNAc)2 (Deoxyhexose)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
7
891.82
891.84
[M-2H]2-
(HexNAc)3 (Deoxyhexose)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
10
871.31
871.33
[M-2H]2-
(Hex)1 (HexNAc)2 (Deoxyhexose)1 + (Man)3(GlcNAc)2
11
871.31
871.33
[M-2H]2-
(Hex)1 (HexNAc)2 (Deoxyhexose)1 + (Man)3(GlcNAc)2
12
972.85
972.86
[M-2H]2-
(Hex)1 (HexNAc)3 (Deoxyhexose)1 + (Man)3(GlcNAc)2
16
952.33
952.35
[M-2H]2-
(Hex)2 (HexNAc)2 (Deoxyhexose)1 + (Man)3(GlcNAc)2
17
1053.37
1053.38
[M-2H]2-
(Hex)1 (HexNAc)3 (NeuGc)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
23
1016.85
1016.87
[M-2H]2-
(HexNAc)2 (Deoxyhexose)2 (NeuGc)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
1016.87
[M-2H]2-
(Hex)1 (HexNAc)2 (Deoxyhexose)1 (NeuAc)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
1097.90
[M-2H]2-
(Hex)1 (HexNAc)2 (Deoxyhexose)2 (NeuGc)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
1097.90
[M-2H]2-
(Hex)2 (HexNAc)2 (Deoxyhexose)1 (NeuAc)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
1199.44
[M-2H]2-
(Hex)1 (HexNAc)3 (Deoxyhexose)2 (NeuGc)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
1199.44
[M-2H]2-
(Hex)2 (HexNAc)3 (Deoxyhexose)1 (NeuAc)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
27
28
10.0
12.5
15.0
17.5
20.0
22.5
25.0
27.5
30.0
32.5
35.0
37.5
40.0
42.5
45.0
Estimated glycan composition ('GlycoMod' database)
1097.88
1199.42
47.5
MALDI-TOF MS
・糖鎖の構造情報(定性)を比較的低コストで迅速に解析可能です。
・多数のサンプルを用いた糖鎖パターン変化の解析に適しています。
2314.398
≪ データレポートの一例 ≫
m/z
2500
4962.053
4901.685
4535.072
4500
4596.069
4229.691
4170.071
4000
4290.673
3926.368
3864.959
3500
3985.953
3500.432
3619.846
3254.353
3315.456
3353.499
3048.156
3000
3560.344
3193.943
2828.779
2888.544
2949.696
2742.494
2842.841
2727.329
2579.533
2682.817
2476.516
2335.749
2000
2417.584
2276.155
2071.714
2377.430
2218.269
1989.641
1893.960
1624.430
1665.332
1827.474
2523.367
2152.174
1487.259
m/z
実測値(ラベル化糖鎖)
S/N ratio
Intensity
8.4
3292.63
1665.332
4.9
1827.474
19.5
1893.96
1.9
1989.641
2071.714
2152.174
2218.269
GlycoModで糖鎖組成を推定
Area
Estimated glycan compositions (by GlycoMod)
8454
(Hex)3 (HexNAc)2 (Deoxyhexose)1
1195.41
3902
(Hex)2 + (Man)3(GlcNAc) 2
5171.55
16732
(Hex)3 + (Man)3(GlcNAc) 2
480.16
1832
(HexNAc)2 (Deoxyhexose)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
16
3871.99
15430
(Hex)4 + (Man)3(GlcNAc) 2
2.2
450.08
3196
(Hex)2 (HexNAc)2 + (Man)3(GlcNAc) 2
33.8
8002.21
38915
(Hex)5 + (Man)3(GlcNAc) 2
10.6
2227.31
13929
(Hex)2 (HexNAc)2 (Deoxyhexose)1 + (Man)3(GlcNAc)2
2276.155
1.5
292.88
4243
(Hex)2 (HexNAc)3 + (Man)3(GlcNAc) 2
2314.398
35.6
7383.21
52381
(Hex)6 + (Man)3(GlcNAc) 2
2335.749
2.6
449.04
3459
(Hex)3 (HexNAc)1 (NeuAc)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
2377.43
6.2
1085.91
8831
(Hex)2 (HexNAc)2 (NeuAc)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
2417.584
1.9
290.02
3220
(Hex)1 (HexNAc)3 (NeuAc)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
2476.516
1.6
329.1
3752
(Hex)7 + (Man)3(GlcNAc) 2
2523.367
17.4
6034.37
36231
(Hex)2 (HexNAc)2 (Deoxyhexose)1 (NeuAc)1 + (Man)3(GlcNAc) 2
O型糖鎖解析
・一般のラボでは実施困難な「ヒドラジン分解法」もしくは独自の手法を用いてO型糖鎖を遊離し解析を行います。
測定・解析サービスご利用の流れ
お客様にて
「測定サービス」ご利用の場合:
BlotGlyco®を用いた糖鎖精製を行って下さい
*BlotGlyco®キットを別途ご購入頂く必要があります
住友ベークライト㈱にて
・LC-MSまたはMALDI-TOF MS測定
・データ解析(糖鎖組成推定)
「解析サービス」ご利用の場合:
未処理のサンプルをご提供下さい
-1-
結果のご報告
・速報(2 - 4週間)
・報告書納品(1ヶ月)
糖鎖受託解析サービス
(米国Vaupell社で実施)
GlycanMap® Xpress, GlycanMap® 糖鎖解析サービス
MALDI-TOF MSによる完全自動糖鎖解析プラットフォームGlycanMap®を用いて、迅速かつ高い再現性で糖鎖の
定量と構造推定を行います。米国 EZOSE Sciences, Inc. が提供していたサービスを住友ベークライト㈱が継承しま
した。解析作業は住友ベークライト㈱のグループ会社である Vaupell Inc.(米国 New Hampshire)にて実施します。
GlycanMap® Xpress サービス
多数のサンプルについて短期間に糖鎖解析を行いたい場合に最適なサービスです。
用途例: 糖鎖バイオマーカー探索研究、バイオ医薬品候補のスクリーニング
≪特長≫
定量性 : 既知量の内部標準に基づいた定量値としてプロファイリング結果を報告します。
迅速性 : 全自動化した分析システムにより、多検体のオーバーナイトアッセイが可能です。
再現性 : 高い精度で糖鎖の構造推定と定量が可能であり、良好な再現性を確保しています。
汎用性 : 分子量1,100 ~ 4,100 の糖鎖が測定可能です。中性糖に加えシアリル糖鎖、リン酸基を含む
酸性糖鎖の同時測定が可能です。また、硫酸化糖鎖の測定も可能です。
レポート:含有量 0.5% 以上の糖鎖について分子量、組成式、推定構造、濃度を提示します。
≪測定・解析データの一例 ≫
N -linked Glycans Detected in Etanercept
N-glycan profile of cetuximab
ISTD
m/z
1300
1500
1700
1900
2100
2300
2500
2700
2900
3100
Composition
(Hex HexNAc Fuc
Neu5Ac Neu5Gc)
Proposed
Structure
Conc.
(pmol/mg)
1362.53
52000
881
1444.59
34000
313
7131
1590.65
34100
1606.65
44000
243
1752.72
44100
5561
1768.72
54000
1230
1914.77
54100
2545
2057.82
44110
1158
2073.83
54010
6017
2219.90
54110
7967
2378.92
54020
1336
2524.98
54120
3044
3300
GlycanMap® サービス
GlycanMap® Xpress よりも豊富なデータをご提供します(含有量0.1%以上の糖鎖をレポート)
用途例:バイオ医薬品候補の糖鎖の詳細解析、糖鎖プロファイル比較
≪特長≫
分子量4,100以上の高分子量糖鎖の測定・解析が可能です。
O型糖鎖の測定にも対応します。O型糖鎖の切り出しには独自の方法を利用します。
サンプルの輸送に関して
GlycanMap® Xpress, GlycanMap® 糖鎖解析サービスは、米国 Vaupell 社(Hudson, New Hampshire)にて実施します。サンプル
は住友ベークライト㈱神戸研究所にお送り頂き、住友ベークライト㈱がVaupell社に送付します。お客様から住友ベークライト㈱、
および、住友ベークライト㈱からVaupell社までの輸送費(約10万円)はお客様の負担とさせて頂きます。
サンプルの輸送には万全を期しますが、万一サンプルが変性、破損、紛失等で解析に適さない状態になっても住友ベークライ
ト㈱は責任を負いかねます。再現できないサンプルや貴重なサンプルは、お客様自身でVaupell社に送付頂くようお願い致します。
-2-
糖鎖受託解析サービス
仕様・価格
糖鎖受託解析サービス ご注文情報
糖鎖受託測定・解析サービス (住友ベークライト㈱が日本国内で実施)
品
番
サービス名
内容
参考価格 (税別)
BS-X4901
糖鎖 MALDI-TOF MS 測定サービス
BlotGlyco®を使用して精製・ラベル化された糖鎖の状態で引き
受けMS測定。
50,000円
BS-X4905
糖鎖 MALDI-TOF MS/MS 測定サービス
MALDI-TOF MS測定に引き続き、1ピークのMS/MS測定。
30,000円
BS-X4907
糖鎖MALDI-TOF MS解析サービス
未処理のサンプルの前処理、糖鎖精製・ラベル化、MALDITOF MS測定を実施。
250,000円
BS-X4913
糖鎖 LC-MS測定サービス
BlotGlyco®を使用して精製・ラベル化された糖鎖の状態で引き
受けLC-MS測定を実施。LCの主要10ピークについてMS解析。
80,000円
BS-X4914
糖鎖LC-MS解析サービス
未処理サンプルの前処理、糖鎖精製・ラベル化、LC-MS測定を
実施。LCの主要10ピークについてMS解析。
298,000円
BS-X4916
O型糖鎖MALDI解析サービス
未処理サンプルのヒドラジン分解、糖鎖精製・ラベル化、
MALDI-TOF MS測定を実施。
349,000円
BS-X4917
O型糖鎖MALDI解析サービス
(2サンプル~)
未処理サンプルのヒドラジン分解、糖鎖精製・ラベル化、
MALDI-TOF MS測定を実施。2サンプル以上を同時にご依頼頂
いた場合、本品番を適用。
BS-X4920
糖鎖LC-MS追加データ処理サービス
BS-X4924
O型糖鎖LC-MS解析サービス
298,000円
(1サンプルあたりの価格)
LC-MSデータにつき、追加10ピークのMS解析を実施。
50,000円
未処理サンプルのヒドラジン分解、糖鎖精製・ラベル化、LCMS測定を実施。LCの主要10ピークについてMS解析。
398,000円
※サンプルの輸送費(お客様~住友ベークライト㈱・神戸研究所)はお客様にご負担いただきます。
GlycanMap® Xpress, GlycanMap® 糖鎖解析サービス (住友ベークライト㈱のグループ会社Vaupell社が米国で実施)
品
番
サービス名
内容
参考価格 (税別)
BS-49201
GlycanMap Xpress (single assay)
含有量0.5%以上の主要成分についてMS解析を実施。
短納期(Vaupell社にサンプル到着後2週間以内)にデータを提供。
最低受注数量:2サンプル
60,000円
BS-49202
GlycanMap Xpress (duplicate assay)
含有量0.5%以上の主要成分について、N=2でMS解析を実施。
短納期(Vaupell社にサンプル到着後2週間以内)にデータを提供。
110,000円
BS-49203
GlycanMap (N-glycan)
含有量0.1%以上の成分についてMS解析を実施。
高分子量(4,100Da~)の糖鎖解析にも対応。
290,000円
BS-49204
GlycanMap (O-glycan)
弊社独自の前処理法によるO型糖鎖の切り出し、糖鎖解析を実施
高分子量(4,100Da~)の糖鎖解析にも対応。
含有量0.1%以上の成分についてMS解析を実施。
330,000円
BS-49200
サンプル輸送サービス
お客様のサンプルを日本(住友ベークライト・神戸研究所)から米
国Vaupell社に送付するサービスです。1回に送付するサンプル数
に制限はありません。
140,000円
※BS-49200 「サンプル輸送サービス」の価格は、燃料費の変動等により変更する可能性があります。
-3-