2015 年度シラバス (Syllabus 2015) システム生物学特論 (Systems

2015 年度シラバス (Syllabus 2015)
システム生物学特論 (Systems Biology)
===== Japanese Version =====
１．授業科目と単位：システム生物学特論
(ｘ)講義 ( )演習 ( )実習 0.5 単位
２．履修対象者：(ｘ)D1,(ｘ) D2, (ｘ)D3, (ｘ)D4, (ｘ)D5:
(ｘ)生命科学研究科, (ｘ)総研大の全研究科, その他（
）
３．授業担当教員：
担当教員との連絡（e-mail、電話、FAX、研究室）：
（科目責任者）
有田正規（[email protected],
電話 055-981-9449, 国立遺伝学研究所 W401）
小田祥久（[email protected],
電話 055-981-6800, 国立遺伝学研究所 C217）
島本勇太（[email protected], 電話 055-981-6784, 国立遺伝学研究所 A211）
授業内容の質問は e-mail か e-mail で調整した時間の面談を歓迎。
４．授業実施期日時間：（対面講義）月曜日 10:50-12:30
５．授業実施場所：（対面講義）国立遺伝学研究所図書館 2F セミナー室（B202）
６．履修条件、受講方法：
分子細胞生物学 I またはそれに対応する知識を持っていることが望ましいが必須ではない。
７．授業内容の概要：
生命をシステムとして捉えるための概念や方法論についてとりあげる。生体高分子の集団として
の細胞、細胞の集団としての個体が、集団として調和して機能するしくみについて、その解析手法
とともに概説する。
８．授業の達成目標：
１）システム生物学の歴史的背景、めざすところを理解する。
２）システム生物学で用いられる手法、問題点を理解する。
３）システム生物学が生命の理解に貢献し得る可能性と課題を理解する。
９．授業計画：（対面講義）
日程
内容
第１回
6 月 15 日有田正規：
システム生物学のめざすところと様々なアプローチ
第２回
6 月 22 日小田祥久：
多細胞によるパターン形成、パターンの数理モデル
第３回
7月 6日
細胞ダイナミクスの物理的モデリング、イメージング解析
第４回
7 月 13 日有田正規：
島本勇太：
生命をシステムとして捉える：全ゲノムモデリング
講義は英語で行われる。
10．使用参考書、参考文献：
初回の講義で紹介する
11．単位修得要件と成績評価基準：
講義への出席は必須とする。達成目標１～３のうち１点以上について調査あるいは見解をレポー
トにて期限までに提出した受講者のうち、要点を理解していると判定されたものに単位を認定する。
成績は A,B 及び C を合格、D を不合格として評価する。
12．その他のコメント：
===== English Version =====
１．Course Title, style, and credit: Systems Biology
(x)lecture, ( ) Discussions ( )practice 0.5 credit
２．Appropriate grade level and Eligible Departments: (x)1, (x)2, (x)3, (x)4, (x)5:
(x)School of Life Science， (x) All Departments， ( ) Other ( )
３．Lecturer(s):
Contact information (e-mail address, Tel and Fax numbers, and the office):
Masanori Arita （[email protected],
TEL 055-981-9449, NIG W401）
Yoshihisa Oda （[email protected],
TEL 055-981-6800, NIG C217）
Yuta Shimamoto （[email protected], TEL 055-981-6784, NIG A211）
You are advised to contact lecturers first by e-mail.
４．Time: (oral) 10:50-12:30 on Monday
５．Place:
2F seminar room (B202) of the library in National Institute of Genetics
６．Prerequisites and Styles：
Desirable to have knowledge of the course Molecular and Cellular Biology I, but not essential.
７．Contents:
The basic concepts and methodologies to understand life as a system. The lecture overviews the
mechanisms of how a cell functions as a system of macromolecules, and how an organism
functions as a system of cells, emphasizing on methods used for the studies.
８．Course objectives:
1) To understand the historical background and the aim of systems biology
2) To understand the methods and their problems used in systems biology
3) To understand the prospects and problems of systems biology for the understanding of life.
９．Schedule: (Oral)
Date [lecturers if omnibus] Topic
1. June 15: Masanori Arita:
Overview of systems biology and its approaches
2. June 22: Yoshihisa Oda:
Pattern formation by multicellular bodies, its mathematical
background
3. July 6:
Yuta Shimamoto: Mathematical modeling of cellular dynamics, imaging analysis
4. July 13: Masanori Arita:
Understanding life as a system: whole genome models
10．Lecture materials and readings: To be introduced in the first lecture.
11．Grades:
Attendance at lectures. The grades (A, B, C, or D) will be determined by the quality of your report,
which must be submitted to the lecturer by a given deadline. The subject(s) must be one of the
three important aspects that are presented in the above Course Objectives.
12．Notes：

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