創薬化学のための新しいデータベース reaxys.com Reaxys Medicinal Chemistry（リアクシス・メディシナルケミストリー）は、医薬品候補化合物に関連した生物活性 データ、薬理作用、ADME特性等、最新の質の高い実測データを抽出しまとめたデータベースです。候補化合物の選択 プロセスの効率化と生産性を向上させ、新薬創生のための化合物デザインやターゲットへの最適化に携わるメディシナル ケミストの研究の効率化に寄与します。 収録データ 特許由来のデータ 約90,000件の英文特許から抽出したファクトデータ - WIPO（世界知的所有権機関） : 1978年以降のデータを収録 - USPTO（米国特許商標庁） : 1971年以降のデータを収録 - EPO（ヨーロッパ特許庁） : 1979年のデータより収録 特許分類はA61K（医薬用,歯科用又は化粧用製剤）が中心 学術文献由来のデータ 約5,000誌の雑誌タイトル（文献数約230,000）より1980年以降のデータを収録 薬物ターゲット情報 9,000以上の薬物ターゲット 生物活性データ 約2,540万データポイント 約520万件の化合物（生物活性データを有するもの） ※Reaxysと統合することにより、合計約2,500万化合物の情報を参照可能です。 （生物活性データの報告がない化合物も含まれます。） 化合物 ※2014年10月現在 ユーザーインターフェース／検索モード 生物活性情報からの検索で使用可能な主な項目 ① 生物活性情報からの検索 ② 化合物情報からの検索 ● バイオアッセイの種類（in vitroの薬効、動物モデ ル、薬物動態アッセイ、毒性等） ● ターゲット名・サブユニット名 ● 薬効・ターゲットに対する作用 ● 動態・毒性の各種パラメーター ● 細胞株名・動物種名 ● 臨床試験の開発段階 ● 薬剤投与経路・投与量 ③ 文献検索 など ④ Advanced Search ① Medicinal Chemistry（生物活性情報からの検索） ③ Literature（文献検索） ［Medicinal Chemistry］を選択すると、ターゲット、薬効、動 文献検索を行いたい場合は［Literature］を選択します。著者名、 物種、アッセイ名、細胞、組織、動物モデル、各種パラメーターといっ や特許番号、出版年といった各種書誌情報に基づく検索が可能で たバイオアクティビティ関連項目の検索フィールドが表示されます。 す。 また、これらの検索項目を構造式と組み合わせて検索することも可 能です。 ② Substances, Names, Formulas （化合物情報からの検索） ［Substances, Names, Formulas］を選択すると、構造式の 描画画面および化合物データの入力フィールドが表示され、化合 物情報に基づく検索を行うことができます。構造式エディタを使用 した入力の他に、化学名やInChi-Key といった同定情報から構 造を呼び出すことも可能です。 ④ Advanced Search ［Advanced］を選択すると、化合物情報やアッセイデータ、書 誌情報等の詳細を自由に組み合わせた検索が可能です。検索条 件として構造式を描画することもできます。 reaxys.com 独自指標「pX値」を用いたデータの標準化 Reaxys Medicinal Chemistry では、様々な生物活性データを標準化し相互に比較可能にする独自の指標「pX」を採用 しています。文献情報から得られる各種アッセイデータは、その濃度単位がまちまちであり、統合的に評価することは非常に 難しいのが現状です。pX値を使用することにより、様々なアッセイデータを直観的に把握・相互比較することが可能となります。 パラメーターの単位をモル濃度に統一（化合物の分子量や生体重、組織重、 体積から換算） 2-a）値の逆対数が親和性に比例するパラメーター pIC50, pEC50, pED50, pID50, pLC50, pLD50, pKi, pKd, pKb, pD2, pD′ 2, pA2 ⇒ pX = parameter value Total Radioligand Binding 1）単位の統一 Total 50% NS 2-b）値が親和性に比例するパラメーター IC50, EC50, ED50, ID50, LC50, LD50, Ki, Kd, Kb, Ka, Ke ⇒ pX = -log10 (parameter value) log (IC50) log [Unlabeled Drug] 2-c）%inhibition ① 化合物の濃度（C）がわからない場合（濃度が範囲として得られる場合も含む） ⇒ pXの算出なし ※化合物の濃度を大きくすれば阻害率が100%に達す ると仮定する ※濃度と阻害率の関係はヒル係数1の曲線に従うと仮 定する ② 化合物の濃度（C）がわかっている場合 ⇒ %inhibition > 25 のとき pX= -log10 (IC50) IC50 = ⇒ %inhibition < 25 のとき pX= 1 Heatmapによる検索結果の可視化 「化合物とターゲット」 「化合物と細胞株」 等々、様々な相互関係を可視化 様々な生物活性データを標準化し相互に比較可能に する独自の指標「pX」を採用 直観的にデータを直観的に把握可能 「pX=9」であればnanomolarレベルの親和性 例） 豊富なフィルタリング機能 100 X [C] − [C] % inhibition reaxys.com 生物活性データ／ターゲット情報の表示 生物活性データを確認 ターゲットの情報も ワンクリックで表示 ADME特性やin vivoのデータもわかりやすくまとめて表示 その他の機能・特長 ● Reaxysとの統合インターフェース ● APIおよびデータフラットファイルのご提供 Reaxysをご 利 用の 場 合、同 一プラットフォーム上でReaxys In-houseの統合検索システム等から本製品のデータへアクセスし Medicinal Chemistryをお使いいただけます。 反応検索や物性値検索と生物活性データの取得をシームレスに行 たい、あるいは特定のクライテリアに沿った形でデータを一括処理 したいといったご要望がある際にはご相談ください。 データフラットファイルは、全化合物の構造式を収録したSDファイ うことが可能となります。 ※電子ジャーナルのフルテキストへのリンクや「Analysis View」、Report機 能といったReaxysの有用な機能も本製品でそのままご利用可能です。 ルおよび全生物活性データを収録したXMLファイル（Open PHACTS準拠）で構成されます。 ● 検索結果のアウトプット 生物活性データをExcel、XML、SDフォーマットでアウトプット可 能です。 トライアルを随時受付中です お問い合わせ先 エルゼビア・ジャパン株式会社 日本語ホームページ（製品情報） http://www.elsevier.com/jp/reaxys-medicinal-chemistry Research Solutions TEL: 03-5561- 5035 E-mail: [email protected] © 2014 Reed Elsevier Properties SA. All rights reserved. Authorized use only. Reaxys® and the Reaxys® trademark are owned and protected by Reed Elsevier Properties SA and used under license. 2014.10
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