こちら - Life Technologies

ABS-2746_Mailer_v4.qxd 05.9.26 3:33 PM ページ1
Product Bulletin TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assays
表3
製品規格
P/N
Size
Status
Concentration
Volume Delivered
Reaction Size*
Reactions
4362691
Small
Inventoried
20X
187.5 µL
5 µL
25 µL
750
150
*反応ボリュームは、使用する反応ブロックにより異なります。384-ウェルブロックでは5 µl、96-ウェルブロックでは25 µlで反応を行います。
表4
他のTaqMan®
Assay Type
SNP Genotyping
AssaysとTaqMan®
Drug Metabolism Genotyping Assaysとの比較
Status
Size
Number of 5-µL Reactions*
Performance Validated with 180 DNA Samples
Number of Assays
Drug Metabolism
Inventoried
Small
750
Yes
>2,000
Validated
Inventoried
Small
750
Yes
~160,000
Coding
Inventoried
Small
750
No
~30,000
Made-to-order
Small
750
No
>2 million
Pre-Designed
Custom
Made-to-order
Small
Medium
Large
Applied Biosystems 7900HT Fast
Applied Biosystems 7500 リアルタイ
Applied Biosystems 7300 リアルタイ
リアルタイムPCRシステム − 究極の
ムPCR システム − 拡張性必要とす
ム PCR システム − 基礎分野の研究
パフォーマンスと柔軟性
るユーザーのための多機能モデル
者のための経済性に優れたスタンダー
• ユーザーご自身で交換できるサンプ
• 先進的な5色対応の光学検出系の採
ドモデル
ルブロックには、384-ウェル、96-ウェ
用により、広範囲の色素に対応でき、
• 4色対応の検出系で、主要なすべて
ル、TaqMan® Low Density Array、
また励起波長はフィルター毎に変更
のアプリケーションに対応します。
Fast 96-ウェルの4種があります（オプ
されており、長波長（赤色）色素に
ション）
。
対する感度を改善しています。
• 寿命の長い488 nmアルゴンイオン
• Relative Quantitation Softwareの機
レーザーと、500 - 660nm波長域の全
能により、最大10枚のプレートの遺
波長での検出を組み合わせることで、
伝子発現データを、1度に解析する
優れた色素識別能を発揮します。
ことが可能です。
No
がシンプルでわかりやすく、多機能
ソフトウェアを採用しています。
• 精密な光学系とCCDカメラにより、
精度、再現性、信頼性ともに高い結
極めて簡単な設定で自動化を実現し
コードしています。
ロールシステムにより、優れた再現
性と一貫した高品質のデータを提供
エンタープライズ版ソフトウェアにより数
• SNPs、insertion/deletion、複数塩
基におよぶ多型（MNPs）など幅広
します。
い変異が検出可能です。
百から数千のプレートを同時に解析す
ることが可能です。
（21 CFR part 11に
• 常時在庫しているinventoried assay
準拠。オプション。
）
特長と優位性
• ターゲットとなる多型が存在する
遺伝子は220種以上におよび、薬物
果を提供します。
• 特許取得済みのサンプル温度コント
N/A
*384-ウェルサンプルブロック使用
• 実験のセットアップ、データの処理
代謝酵素や薬物輸送タンパク質を
• オートメーションアクセサリーにより、
ます。
1,000
3,000
12,000
基礎研究および臨床研究のためのTaqMan®
Drug Metabolism Genotyping Assays
で、パフォーマンスは検証済みで
す。
特長
優位性
Ordering Information
220種以上の薬物代謝遺伝子の調節因子やコーディング領域の
内部に存在する有用な多型2,000以上がターゲットです。※注1
特定薬物の代謝速度に関係する多型や、これまでタイピングが困
難とされていた多型の研究が可能。
商品名
各アッセイは任意に選択して、注文することができます。
研究の目的に応じて自由にアッセイを選択することができ、
アッセイを制限されることはありません。
TaqMan Drug Metabolism Genotyping Assays
®
TaqMan®ケミストリにより、1つのプラットフォームで、
SNPs、in/dels、MNPsなど各種多型に対応可能です。
各アッセイは、dme.appliedbiosystems.comから注文できます。
アッセイコレクションは既存のリアルタイムPCRプラットフォーム
を用いて検出できるよう開発が行われています。
新規のアッセイもこれまでと全く同じ実験条件で（90秒のエク
ステンションタイムと50回のサイクル数が必要となりますが、
他の条件は全て同じです。）シームレスな統合が可能です。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
必要なアッセイを選択するための時間とエネルギーは必要ありま
せん。
配列相同性による問題の克服および特異的な多型検出のために、
高度なバイオインフォマティクス技術が用いられています。
厳密なWet Validationにより、信頼性の高いターゲットSNPs
のデータを提供します。
Applera シーケンシングプロジェクトで得られた新規の
SNPターゲット変異が含まれています。
他の手法では入手が困難な情報が簡単にアクセスでき、研究に重
要なSNPsをいち早く調査することが可能です。
※注1 2005年8月末現在、1,560Assays。順次追加する予定です
商品番号
small scale
4362691
本製品には、プロトコル、Assey Information File (AIF)、DME Assay Index、トラブルシューティングガイドの入ったCDが付属されています。
各種多型が検出可能です。
個々の多型と一般的なアレル名との関連づけ、またゲノム上の
物理的な位置を得るため、高度なバイオインフォマティクス技術が
用いられています。
サイズ
• 4人種で合計180人のDNAサンプル
についてデータを検証済みです。
• 公開されているallele nomenclatureサイトを参照しています。
イントロダクション
NOTICE TO PURCHASER: LIMITED LICENSE:
The purchase price of TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assays, P/N 4362691 includes a limited, non-transferable license under U.S. Patents Nos. 5,538,848, 5,876,930, 6,030,787
and 6,258,569, and corresponding claims in patents outside the U.S., owned by the Applera Corporation (“Applera”), and U.S. Patent No. 5,804,375 (claims 1-12 only), owned by Roche
Molecular Systems, Inc. and corresponding claims outside the U.S. owned by F. Hoffmann-La Roche Ltd. (collectively, “Roche”), to use only this portion of probe solely to perform the
purchaser’s own internal research and development activities. This product may also be used to perform 5' nuclease assays under service licenses from Applera. No rights are granted
under any other patent or patent claim, expressly, by implication, or by estoppel, including U.S. Patents Nos. 5,210,015 or 5,487,972, covering the 5' nuclease process, owned by Roche,
or corresponding claims in patents outside the United States. Further information on purchasing licenses for these patented processes may be obtained by contacting the Director of
Licensing, Applied Biosystems, 850 Lincoln Centre Drive, Foster City, California 94404, USA.
Notice to Purchaser:
TaqMan® probes are covered by U.S. Patent 5,723,591, and foreign counterparts and patents pending owned by Applera Corporation, and are covered by U.S. Patents 5,801,155 and
6,084,102 and foreign counterparts licensed to Applied Biosystems.
2 2 0 種を超す薬物代謝酵素遺伝子
（DMEs）および薬物輸送タンパク質遺
伝子上に存在する、2000種以上
（※注1）
のユニークな多型を検出するTaqMan®
Drug Metabolism Genotyping Assays
が発売になりました。これらの遺伝子
多型は、患者体内の薬物代謝速度に
関係することがあり、薬効や副作用
研究用にのみ使用できます。診断目的およびその手続き上での使用は出来ません。
Applied Biosystems is a registered trademark and AB (Design), Applera and myScience are trademarks of Applera Corporation or its subsidiaries in the US and/or certain other countries.
の発生に影響を与える可能性があり
ます。これまで、こうした遺伝子多
TaqMan is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc.
記載の社名および製品名は、弊社または各社の商標または登録商標です。
型を効果的に同定するための技術や
© 2005 Applied Biosystems Japan Ltd,. All Rights reserved.
製品が少なかったため、遺伝子の複
Printed in JAPAN, GTA001-A0509OB
雑な性質についての研究には制限が
お問い合せ先
本社：
アプライドバイオシステムズジャパン株式会社
〒104-0032 東京都中央区八丁堀4-5-4
セイは、全て表現型に現れる可能性
がある多型、すなわち調節領域や
FAX. 03（5566）6501
コーディング領域、スプライシング
大阪：
に関連した部位の多型のみをター
TEL. 06（6389）1201 FAX. 06（6389）1206
www.appliedbiosystems.co.jp
ありました。本製品に含まれるアッ
TEL. 03（5566）6100 〒564-0052 大阪府吹田市広芝町10-28
www.appliedbiosystems.co.jp
取扱店：
TaqMan® Drug Metabolism Genotyping
薬物代謝に関わる遺伝子
Assaysの開発には、高度なバイオイ
薬物代謝酵素をコードする遺伝子は、
ンフォマティクス技術、厳密な
医薬品（もしくは化学物質）に対す
ウェットバリデーションの手法が用
る反応性に影響を与えるため、医薬
いられています。アッセイはallele
品開発や臨床研究において重要な
nomenclatureサイトを含む、幾つか
ターゲットとなります。主要な遺伝
のパブリックSNPデータベースをも
子は以下の通りです。
とに設計されており、4人種から得ら
れた180人のDNAサンプルからパ
フォーマンスを確認してます。またこ
れらのTaqMan® DME (drug metabolism enzyme) assaysは、アプライドバイオ
システムズのTaqMan® SNP Genotyping
Assaysやリアルタイム PCR システムと共
• CYP2D6: 57種あるチトクローム
P450ファミリーの遺伝子の1つであ
り、抗不整脈剤、抗うつ剤、抗精
神病薬、ßブロッカーや鎮痛剤など
の20-25%がこの酵素により代謝さ
れるとされています。
に使用することが可能です。
ゲットにしています。
※注１ 9月12日現在、1560アッセイ。順次追加予定です。
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表1
DME Assay Index
Assay ID
Gene
Symbol
C____559715_20
UGT1A4
C___2307598_20
C__30634116_20
C__27861809_10
C__25625805_10
UGT1A1
Gene Symbol Alias
Allele Nomenclature
Polymorphism
UDPGT|UGT1D|UGT1*
4|HUG-BR2
UGT1A1*6,c.211G>A
A/G
GNT1|UGT1|UDPGT|UGT1
A|UGT1*1|HUG-BR1
UGT1A1*27,c.686C>A
CYP2C19
CYP2C9
MIM:191740
T154A
A/G
CYP2C19*3,c.636G>A
Phenotype
Q229P
T/C
CPCJ|CYP2C|CYP
2C|P450C2C|P450IIC19
NCBI SNP
Reference
MIM:606429
A/C
TPMT
Amino Acid
Change
*212W
rs1800460
PharmGKB:PA124
|MIM:124020
R144C
CPC9|CYP2C|CYP2C10|P450I
IC9|P450 MP-4|P450 PB-1
CYP2C9*2A,c.430C>T|CYP2C9*2A,g.
3608C>T|CYP2C9*2B,c.430C>T|CYP
2C9*2B,g.3608C>T|CYP2C9*2C,c.43
0C>T|CYP2C9*2C,g.3608C>T
C/T
CYP3A4*7,c.167
g.6004G>A
C/T
D56G
PharmGKB:PA130
|MIM:124010
A/G
E308G|E308G
MIM:136132
C__30634213_10
CYP3A4
HLP|CP34|CYP3A|NF25|CYP3
A3|P450C3|P450PCN1|CP33
C___2220257_30
FMO3
FMOII|MGC34400|dJ127D3.1
C__27529541_20
N A T 1
A
C__25599886_40
NR1I2
ARq|PAR2|BXR|PAR|PRR|PXR|
SAR|SXR|ONR1|PAR1
A
C
1
G>A|CYP3A4*7,
NAT1*17,g.190C>T
C
/
C/T
T
hCV
SNP Type
Gene Name
hCV559715
Intron
UDP
glycosyltransferase
1 family, polypeptide A4
NM_007120
Mis-sense
Mutation
UDP
glycosyltransferase
1 family, polypeptide A1
NM_000463
Mis-sense
Mutation
thiopurine
transferase
NM_000367
Nonsense
Mutation
cytochrome P450, family 2,
subfamily C, polypeptide 19
hCV2307598
MIM:187680
rs4986893
MIM:601130|Phar
mGKB:PA126
rs1799853
rs16947
R 6 4 W
MIM:108345
P66S|P27S|P2
7S
PharmGKB:PA378
|MIM:603065
NCBI Gene
Reference
hCV30634116
hCV27861809
S-methyl-
Cytogenetic
Band
TGACGCCTCGTTGTACATCAGAGAC[A/G]
GAGCATTTTACACCTTGAAGACGTA
228389777
35
2q,2q37,2q3
TTTCTGTGCGACGTGGTTTATTCCC[A/C]
GTATGCAACCCTTGCCTCAGAATTC
228390252
TCACCTGGATTAATGGCAACTAATG[T/C]
TCCTCTATCCCAAATCATGTCAAAT
19377237
ACATCAGGATTGTAAGCACCCCCTG[A/G]
ATCCAGGTAAGGCCAAGTTTTTTGC
90280519
Context Sequence
NM_000769
0
0.2
0.11
Homo sapiens
中にも含まれています。
35
2q,2q37,2q3
35
6p22,6p2,6p
35
10q24,10q,10q2
2
6
10
0
0.03
0
0
0
0.01
0
0.14
0
0.03
0
0.03
Homo sapiens
Homo sapiens
0
0
Homo sapiens
NM_006894|
NM_001002294
AAGCCTAACGTGAAGGAATTCACAG[A/G]
GACCTCGGCCATTTTGAGGATGGG
144193147
35
1q,1q23,1q2
1
0.15
0.01
0.23
0.19
Homo sapiens
N-acetyltransferase 1 (arylamine N-acetyltransferase)
NM_000662
TTTTGATCAAGTTGTGAGAAGAAAT[C/T]
GGGGTGGATGGTGTCTCCAGGTCAA
17045677
3
nuclear receptor subfamily 1,
group I, member 2
NM_022002|NM_0
03889|NM_033013
GGACACAGAGTCTGTTCCTGGAAAG[C/T]
CCAGTGTCAACGCAGATGAGGAAGT
117935283
35
hCV27529541
Mis-sense
Mutation
hCV25599886
Mis-sense
Mutation
35
10q24,10q,10q2
10
0.17
0.02
0
0
Homo sapiens
表2
5
8p22,8p2,8p
8
0
0
0
0
Homo sapiens
3q13.1,3q13,3q
1,3q
3
0
0.08
0
0
Homo sapiens
DMEコレクションに含まれるアッセイとそれに付随する情報の例。アレル名とrs#については存在するもののみ記載。dme.appliedbiosystems.comより、ファイルをダウンロードすることが可能です。
• NAT1とNAT2（N-アセチルトラ
1. アッセイコンポーネントとDNAテンプレート
ンスフェラーゼ）: この遺伝子から
Forward primer
できる酵素は、最も重要な結核の薬
F
Q
5'
ガン性物質を代謝します。
MGB
Probe
Q
Reverse primer
A
G
であるイソニアジドやさまざまな発
• MDR1（ABCB1, P-糖タンパク質
V
MGB
Probe
[C/T]
3'
5'
LEGEND
Reverse primer
V
薬物輸送に関わる遺伝子の代表で
MGB
Probe
F
Q
MGB
Probe
Q
A
G
Forward primer
す。これらの遺伝子は細胞膜を介し
た代謝産物の輸送に関わっています。
[C/T]
3'
ここに挙げたもの以外の遺伝子の例に
全なリストは dme.appliedbiosys-
F
Forward primer
実験が可能であり、アッセイのパフォー
す。
マンスを各々に最適化する必要はありま
Q
G
MGB
Q
C
Match
のを一部改良し、90秒のエクステンショ
ンタイム、50サイクルで反応します。その
他すべての装置条件は、アプライドバイ
FAM™ dye
高い再現性と容易な操作性を兼ね備え
オシステムズのTaqMan® Genotyping
Quencher
たTaqMan
® によるアレル識別技術を
Minor Groove
Binder
採用しています。それぞれのアッセイ
す。反応手順の統一と簡便化するため
AmpliTaq Gold®
DNA Polymerase
には、多型を検出するための2種類の
に、全てのTaqMan® Genotyping Assays
アレル特異的なプローブと一対のプラ
にDrug Metabolism Assayと共通のサー
Probe
Primer
イマーが含まれています。プローブと
マルサイクリング条件を用いることも可能
Template
プライマーはともにゲノム中で特有の
です。
VIC® dye
F
Q
MGB
Probe
TaqMan® Genotyping Assay
Technologyの採用
A
V
Extended Primer
tems.comで入手可能です。
多型の同定とマッピング
ル名やdbSNPのrs＃が記載されていま
TaqMan® Genotyping Assaysでは、
V
MGB
5'
3. シグナルの発生
ついては表 2に示しています。また完
全アッセイは、すべて同じ反応条件での
せん。アッセイの反応条件は、従来のも
2. 熱変性したDNAテンプレートとアニールするアッセイコンポーネント
1）: 多剤耐性遺伝子の一つであり、
DME Assay Index ファイルには、アレ
3'
[G/A]
DNA template
図 1 1. TaqMan® Genotyping Assay の4つのコンポーネントとターゲットDNAテンプレート（SNP
を括弧内に示しています）。2. 熱変性したDNAテンプレートとアニールする各コンポーネント。3. シグナ
ルの発生によるアレルの検出。
これらのDMEコレクションの多型には
一塩基多型（ S N P s ）、挿入や欠失
Assaysで採用されているものと同じで
® ケミストリーを用いた
検証済みの優れたパフォーマンス
ジェノタイピング技術の高い特異性を
各々のアッセイについて、まずAfrican
実現します。そしてその特異性の高さ
American
が、偽遺伝子を含む非常に相同性の高
DNAサンプル（3 ng）
を使用し、2反復
45人、Caucasian45人の
（ i n / d e l s ）、複数塩基にわたる多型
報、更にはアプライドバイオシステムズ
連部位に存在する多型のみをセットとし
い遺伝子ファミリー中に存在するター
のテストを行います。ここで良好な結果
（MNPs）があります。そのデータソース
独自のSNPデータベースが含まれます。
て選出しました。allele nomenclature
ゲットにおいても特異的に検出できま
が得られたアッセイは、さらに各45人ず
は３種類で、dbSNP、HGMD、allele
まず初めに220遺伝子の全ての多型を
サイトは、DMEにある多型と、一般的
す。すべてのアッセイデザインにおい
つのChineseおよびJapaneseのDNAサ
nomenclatureサイト等のデータベース、
抽出し、その中から調節因子やコー
なアレル名と整合性をとるために利用
て、BLASTプログラムによるゲノム
ンプルを用いたテストを行っています。
しました。無料でダウンロード可能な
全体との相同性チェックが行われ、ゲ
すべてのテストにおいて再現性、シグナ
ノム中で特有のデザインであることを
ル強度、確実なジェノタイプの判定がで
医薬品業界における共同研究による情
ディング領域、もしくはスプライシング関
確認しています。
www.appliedbiosystems.co.jp
www.appliedbiosystems.co.jp
きるかどうか評価しています。
製品としての柔軟性
各アッセイは１本単位、もしくはセッ
にこのシステムは次世代のソフトウェ
プローブ（ VIC もしくは 6-
ア技術を採用することにより、高い利
FAMTMでラベル）、2種類の遺伝子特異
便性を実現します。もちろん、このリ
的なプライマーを含むシングルチュー
アルタイム PCR システムは、パフォー
ブで供給されます。各アッセイは20×
マンス、品質、信頼性を兼ね備えた、
濃度に調整されており、5-µLの反応系
アプライドバイオシステムズの実績に
で750反応が可能です（表 3）
。
支えられた製品です。
®
遺伝子リスト（サンプル）
Official Gene
Symbol
Alias
Entrez Gene ID
Gene Description
ABCB1
ABC20; CD243; CLCS; GP170; MDR1; P-gp; PGY1
5243
ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
ABCC1
ABC29; ABCC; GS-X; MRP; MRP1
4363
ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 1
ABCC2
ABC30; CMOAT; DJS; MRP2; cMRP
1244
ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 2
ADH1A
ADH1
124
alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide
ADH5
ADH-3; ADHX; FDH
128
alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide
1312
catechol-O-methyltransferase
COMT
CYP1A1
AHH; AHRR; CP11; CYP1; P1-450; P450-C; P450DX
1543
cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 1
CYP1A2
CP12; P3-450; P450(PA)
1544
cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 2
全てのアッセイでも、研究に合わせて
CYP1B1
CP1B; GLC3A
1545
cytochrome P450, family 1, subfamily B, polypeptide 1
選択することができます。各アッセイ
CYP2A6
CPA6; CYP2A; CYP2A3; P450C2A; P450PB
1548
cytochrome P450, family 2, subfamily A, polypeptide 6
はアプライドバイオシステムズのウェ
CYP2B6
CPB6; CYP2B; CYPIIB6; IIB1; P450
1555
cytochrome P450, family 2, subfamily B, polypeptide 6
ブサイト、dme.appliedbiosys-
CYP2C19
CPCJ; CYP 2C; CYP2C; P450C2C; P450IIC19
1557
cytochrome P450, family 2, subfamily C, polypeptide 19
tems.com のページからmyScienceSM
CYP2C9
CPC9; CYP2C; CYP2C10; P450 MP-4; P450 PB-1; P450IIC9
1559
cytochrome P450, family 2, subfamily C, polypeptide 9
CYP2D6
CPD6; CYP2D; CYP2D@; CYP2DL1; P450-DB1; P450C2D
1565
cytochrome P450, family 2, subfamily D, polypeptide 6
DPYD
DHP; DPD
1806
dihydropyrimidine dehydrogenase
FMO3
FMOII; MGC34400; dJ127D3.1
2328
flavin containing monooxygenase 3
2952
glutathione S-transferase theta 1
トで注文することができます。1遺伝
子上の１アッセイでも、複数遺伝子の
を通じて注文できます。
DME Assay Indexファイル
配列を持つようにデザインされてお
り、TaqMan
り使いやすいものにしています。さら
MGB
Homo sapiens
0
mono-
のTaqMan SNP Genotyping Asays同
様、2種類のアレル特異的なTaqMan
®
0
flavin containing
oxygenase 3
ションであり、リアルタイムPCRをよ
0
7
Mis-sense
Mutation
なニーズに対応できる強力なソリュー
います。アプライドバイオシステムズ
2
7q22,7q2,7q
hCV2220257
注後速やかに発送できる体制を整えて
Species
ウンロードでき、製品に添付されるCDの
35
cytochrome P450, family 3,
subfamily A, polypeptide 4
タイムPCRシステムは、研究者の多様
Chromosome
94109937
Mis-sense
Mutation
アプライドバイオシステムズのリアル
アッセイは、製造後ストックされ、受
Minor Allele
Frequency
Chinese
ACATTCCATGTCAAACATACAAAAG[C/T]
CCTGGGAGGAGAAACAAAATAATAT
hCV30634213
製品を迅速に供給するためにすべての
dme.appliedbiosystems.comからダ
Minor Allele
Frequency
Japanese
NM_017460
NM_000771
強力なリアルタイムPCR システム
Minor Allele
Frequency
African
American
90442165
cytochrome P450, family 2,
subfamily C, polypeptide 9
迅速なデリバリーと使いやすいフォーマット
バイオシステムズのウェブサイトの
Minor Allele
Frequency
Caucasian
GATGGGGAAGAGGAGCATTGAGGAC[C/T]
GTGTTCAAGAGGAAGCCCGCTGCCT
Mis-sense
Mutation
hCV25625805
Location on
NCBI Assembly
NCBI
Assembly
Build
DME Assay Index ファイルはアプライド
全てのアッセイの詳細情報は、DME
GSTT1
Assay Index ファイルに入っています。
NAT1
AAC1
9
N-acetyltransferase 1 (arylamine N-acetyltransferase)
クスト配列（多型および前後 2 5 b p ）、
NAT2
AAC2
10
N-acetyltransferase 2 (arylamine N-acetyltransferase)
NCBIアセンブリ上の位置、dbSNP rs
SLC15A2
PEPT2
6565
solute carrier family 15 (H+/peptide transporter), member 2
#や、また存在する一般的なアレル名が
UGT1A1
GNT1; HUG-BR1; UDPGT; UGT1; UGT1*1; UGT1A
54658
UDP glycosyltransferase 1 family, polypeptide A1
リストアップされています。さらに、遺
UGT1A6
GNT1; HLUGP; HLUGP1; MGC29860; UDPGT; UGT1; UGT1*6; UGT1F
54578
UDP glycosyltransferase 1 family, polypeptide A6
このファイルには、各アッセイのコンテ
伝子名（およびaliases）、SNPタイプ、ア
ミノ酸置換、ウェットバリデーションより
こちらには220種の薬物代謝酵素および薬物輸送タンパク質遺伝子のうちの一部を示しています。完全なリストは dme.appliedbiosystems.comにアクセスし
てご覧ください。
得られた4人種各45人でのマイナーアレ
ル頻度の情報も記載されています。
www.appliedbiosystems.co.jp
ABS-2746_Mailer_v4.qxd 05.9.26 3:33 PM ページ2
表1
DME Assay Index
Assay ID
Gene
Symbol
C____559715_20
UGT1A4
C___2307598_20
C__30634116_20
C__27861809_10
C__25625805_10
UGT1A1
Gene Symbol Alias
Allele Nomenclature
Polymorphism
UDPGT|UGT1D|UGT1*
4|HUG-BR2
UGT1A1*6,c.211G>A
A/G
GNT1|UGT1|UDPGT|UGT1
A|UGT1*1|HUG-BR1
UGT1A1*27,c.686C>A
CYP2C19
CYP2C9
MIM:191740
T154A
A/G
CYP2C19*3,c.636G>A
Phenotype
Q229P
T/C
CPCJ|CYP2C|CYP
2C|P450C2C|P450IIC19
NCBI SNP
Reference
MIM:606429
A/C
TPMT
Amino Acid
Change
*212W
rs1800460
PharmGKB:PA124
|MIM:124020
R144C
CPC9|CYP2C|CYP2C10|P450I
IC9|P450 MP-4|P450 PB-1
CYP2C9*2A,c.430C>T|CYP2C9*2A,g.
3608C>T|CYP2C9*2B,c.430C>T|CYP
2C9*2B,g.3608C>T|CYP2C9*2C,c.43
0C>T|CYP2C9*2C,g.3608C>T
C/T
CYP3A4*7,c.167
g.6004G>A
C/T
D56G
PharmGKB:PA130
|MIM:124010
A/G
E308G|E308G
MIM:136132
C__30634213_10
CYP3A4
HLP|CP34|CYP3A|NF25|CYP3
A3|P450C3|P450PCN1|CP33
C___2220257_30
FMO3
FMOII|MGC34400|dJ127D3.1
C__27529541_20
N A T 1
A
C__25599886_40
NR1I2
ARq|PAR2|BXR|PAR|PRR|PXR|
SAR|SXR|ONR1|PAR1
A
C
1
G>A|CYP3A4*7,
NAT1*17,g.190C>T
C
/
C/T
T
hCV
SNP Type
Gene Name
hCV559715
Intron
UDP
glycosyltransferase
1 family, polypeptide A4
NM_007120
Mis-sense
Mutation
UDP
glycosyltransferase
1 family, polypeptide A1
NM_000463
Mis-sense
Mutation
thiopurine
transferase
NM_000367
Nonsense
Mutation
cytochrome P450, family 2,
subfamily C, polypeptide 19
hCV2307598
MIM:187680
rs4986893
MIM:601130|Phar
mGKB:PA126
rs1799853
rs16947
R 6 4 W
MIM:108345
P66S|P27S|P2
7S
PharmGKB:PA378
|MIM:603065
NCBI Gene
Reference
hCV30634116
hCV27861809
S-methyl-
Cytogenetic
Band
TGACGCCTCGTTGTACATCAGAGAC[A/G]
GAGCATTTTACACCTTGAAGACGTA
228389777
35
2q,2q37,2q3
TTTCTGTGCGACGTGGTTTATTCCC[A/C]
GTATGCAACCCTTGCCTCAGAATTC
228390252
TCACCTGGATTAATGGCAACTAATG[T/C]
TCCTCTATCCCAAATCATGTCAAAT
19377237
ACATCAGGATTGTAAGCACCCCCTG[A/G]
ATCCAGGTAAGGCCAAGTTTTTTGC
90280519
Context Sequence
NM_000769
0
0.2
0.11
Homo sapiens
中にも含まれています。
35
2q,2q37,2q3
35
6p22,6p2,6p
35
10q24,10q,10q2
2
6
10
0
0.03
0
0
0
0.01
0
0.14
0
0.03
0
0.03
Homo sapiens
Homo sapiens
0
0
Homo sapiens
NM_006894|
NM_001002294
AAGCCTAACGTGAAGGAATTCACAG[A/G]
GACCTCGGCCATTTTGAGGATGGG
144193147
35
1q,1q23,1q2
1
0.15
0.01
0.23
0.19
Homo sapiens
N-acetyltransferase 1 (arylamine N-acetyltransferase)
NM_000662
TTTTGATCAAGTTGTGAGAAGAAAT[C/T]
GGGGTGGATGGTGTCTCCAGGTCAA
17045677
3
nuclear receptor subfamily 1,
group I, member 2
NM_022002|NM_0
03889|NM_033013
GGACACAGAGTCTGTTCCTGGAAAG[C/T]
CCAGTGTCAACGCAGATGAGGAAGT
117935283
35
hCV27529541
Mis-sense
Mutation
hCV25599886
Mis-sense
Mutation
35
10q24,10q,10q2
10
0.17
0.02
0
0
Homo sapiens
表2
5
8p22,8p2,8p
8
0
0
0
0
Homo sapiens
3q13.1,3q13,3q
1,3q
3
0
0.08
0
0
Homo sapiens
DMEコレクションに含まれるアッセイとそれに付随する情報の例。アレル名とrs#については存在するもののみ記載。dme.appliedbiosystems.comより、ファイルをダウンロードすることが可能です。
• NAT1とNAT2（N-アセチルトラ
1. アッセイコンポーネントとDNAテンプレート
ンスフェラーゼ）: この遺伝子から
Forward primer
できる酵素は、最も重要な結核の薬
F
Q
5'
ガン性物質を代謝します。
MGB
Probe
Q
Reverse primer
A
G
であるイソニアジドやさまざまな発
• MDR1（ABCB1, P-糖タンパク質
V
MGB
Probe
[C/T]
3'
5'
LEGEND
Reverse primer
V
薬物輸送に関わる遺伝子の代表で
MGB
Probe
F
Q
MGB
Probe
Q
A
G
Forward primer
す。これらの遺伝子は細胞膜を介し
た代謝産物の輸送に関わっています。
[C/T]
3'
ここに挙げたもの以外の遺伝子の例に
全なリストは dme.appliedbiosys-
F
Forward primer
実験が可能であり、アッセイのパフォー
す。
マンスを各々に最適化する必要はありま
Q
G
MGB
Q
C
Match
のを一部改良し、90秒のエクステンショ
ンタイム、50サイクルで反応します。その
他すべての装置条件は、アプライドバイ
FAM™ dye
高い再現性と容易な操作性を兼ね備え
オシステムズのTaqMan® Genotyping
Quencher
たTaqMan
® によるアレル識別技術を
Minor Groove
Binder
採用しています。それぞれのアッセイ
す。反応手順の統一と簡便化するため
AmpliTaq Gold®
DNA Polymerase
には、多型を検出するための2種類の
に、全てのTaqMan® Genotyping Assays
アレル特異的なプローブと一対のプラ
にDrug Metabolism Assayと共通のサー
Probe
Primer
イマーが含まれています。プローブと
マルサイクリング条件を用いることも可能
Template
プライマーはともにゲノム中で特有の
です。
VIC® dye
F
Q
MGB
Probe
TaqMan® Genotyping Assay
Technologyの採用
A
V
Extended Primer
tems.comで入手可能です。
多型の同定とマッピング
ル名やdbSNPのrs＃が記載されていま
TaqMan® Genotyping Assaysでは、
V
MGB
5'
3. シグナルの発生
ついては表 2に示しています。また完
全アッセイは、すべて同じ反応条件での
せん。アッセイの反応条件は、従来のも
2. 熱変性したDNAテンプレートとアニールするアッセイコンポーネント
1）: 多剤耐性遺伝子の一つであり、
DME Assay Index ファイルには、アレ
3'
[G/A]
DNA template
図 1 1. TaqMan® Genotyping Assay の4つのコンポーネントとターゲットDNAテンプレート（SNP
を括弧内に示しています）。2. 熱変性したDNAテンプレートとアニールする各コンポーネント。3. シグナ
ルの発生によるアレルの検出。
これらのDMEコレクションの多型には
一塩基多型（ S N P s ）、挿入や欠失
Assaysで採用されているものと同じで
® ケミストリーを用いた
検証済みの優れたパフォーマンス
ジェノタイピング技術の高い特異性を
各々のアッセイについて、まずAfrican
実現します。そしてその特異性の高さ
American
が、偽遺伝子を含む非常に相同性の高
DNAサンプル（3 ng）
を使用し、2反復
45人、Caucasian45人の
（ i n / d e l s ）、複数塩基にわたる多型
報、更にはアプライドバイオシステムズ
連部位に存在する多型のみをセットとし
い遺伝子ファミリー中に存在するター
のテストを行います。ここで良好な結果
（MNPs）があります。そのデータソース
独自のSNPデータベースが含まれます。
て選出しました。allele nomenclature
ゲットにおいても特異的に検出できま
が得られたアッセイは、さらに各45人ず
は３種類で、dbSNP、HGMD、allele
まず初めに220遺伝子の全ての多型を
サイトは、DMEにある多型と、一般的
す。すべてのアッセイデザインにおい
つのChineseおよびJapaneseのDNAサ
nomenclatureサイト等のデータベース、
抽出し、その中から調節因子やコー
なアレル名と整合性をとるために利用
て、BLASTプログラムによるゲノム
ンプルを用いたテストを行っています。
しました。無料でダウンロード可能な
全体との相同性チェックが行われ、ゲ
すべてのテストにおいて再現性、シグナ
ノム中で特有のデザインであることを
ル強度、確実なジェノタイプの判定がで
医薬品業界における共同研究による情
ディング領域、もしくはスプライシング関
確認しています。
www.appliedbiosystems.co.jp
www.appliedbiosystems.co.jp
きるかどうか評価しています。
製品としての柔軟性
各アッセイは１本単位、もしくはセッ
にこのシステムは次世代のソフトウェ
プローブ（ VIC もしくは 6-
ア技術を採用することにより、高い利
FAMTMでラベル）、2種類の遺伝子特異
便性を実現します。もちろん、このリ
的なプライマーを含むシングルチュー
アルタイム PCR システムは、パフォー
ブで供給されます。各アッセイは20×
マンス、品質、信頼性を兼ね備えた、
濃度に調整されており、5-µLの反応系
アプライドバイオシステムズの実績に
で750反応が可能です（表 3）
。
支えられた製品です。
®
遺伝子リスト（サンプル）
Official Gene
Symbol
Alias
Entrez Gene ID
Gene Description
ABCB1
ABC20; CD243; CLCS; GP170; MDR1; P-gp; PGY1
5243
ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
ABCC1
ABC29; ABCC; GS-X; MRP; MRP1
4363
ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 1
ABCC2
ABC30; CMOAT; DJS; MRP2; cMRP
1244
ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 2
ADH1A
ADH1
124
alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide
ADH5
ADH-3; ADHX; FDH
128
alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide
1312
catechol-O-methyltransferase
COMT
CYP1A1
AHH; AHRR; CP11; CYP1; P1-450; P450-C; P450DX
1543
cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 1
CYP1A2
CP12; P3-450; P450(PA)
1544
cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 2
全てのアッセイでも、研究に合わせて
CYP1B1
CP1B; GLC3A
1545
cytochrome P450, family 1, subfamily B, polypeptide 1
選択することができます。各アッセイ
CYP2A6
CPA6; CYP2A; CYP2A3; P450C2A; P450PB
1548
cytochrome P450, family 2, subfamily A, polypeptide 6
はアプライドバイオシステムズのウェ
CYP2B6
CPB6; CYP2B; CYPIIB6; IIB1; P450
1555
cytochrome P450, family 2, subfamily B, polypeptide 6
ブサイト、dme.appliedbiosys-
CYP2C19
CPCJ; CYP 2C; CYP2C; P450C2C; P450IIC19
1557
cytochrome P450, family 2, subfamily C, polypeptide 19
tems.com のページからmyScienceSM
CYP2C9
CPC9; CYP2C; CYP2C10; P450 MP-4; P450 PB-1; P450IIC9
1559
cytochrome P450, family 2, subfamily C, polypeptide 9
CYP2D6
CPD6; CYP2D; CYP2D@; CYP2DL1; P450-DB1; P450C2D
1565
cytochrome P450, family 2, subfamily D, polypeptide 6
DPYD
DHP; DPD
1806
dihydropyrimidine dehydrogenase
FMO3
FMOII; MGC34400; dJ127D3.1
2328
flavin containing monooxygenase 3
2952
glutathione S-transferase theta 1
トで注文することができます。1遺伝
子上の１アッセイでも、複数遺伝子の
を通じて注文できます。
DME Assay Indexファイル
配列を持つようにデザインされてお
り、TaqMan
り使いやすいものにしています。さら
MGB
Homo sapiens
0
mono-
のTaqMan SNP Genotyping Asays同
様、2種類のアレル特異的なTaqMan
®
0
flavin containing
oxygenase 3
ションであり、リアルタイムPCRをよ
0
7
Mis-sense
Mutation
なニーズに対応できる強力なソリュー
います。アプライドバイオシステムズ
2
7q22,7q2,7q
hCV2220257
注後速やかに発送できる体制を整えて
Species
ウンロードでき、製品に添付されるCDの
35
cytochrome P450, family 3,
subfamily A, polypeptide 4
タイムPCRシステムは、研究者の多様
Chromosome
94109937
Mis-sense
Mutation
アプライドバイオシステムズのリアル
アッセイは、製造後ストックされ、受
Minor Allele
Frequency
Chinese
ACATTCCATGTCAAACATACAAAAG[C/T]
CCTGGGAGGAGAAACAAAATAATAT
hCV30634213
製品を迅速に供給するためにすべての
dme.appliedbiosystems.comからダ
Minor Allele
Frequency
Japanese
NM_017460
NM_000771
強力なリアルタイムPCR システム
Minor Allele
Frequency
African
American
90442165
cytochrome P450, family 2,
subfamily C, polypeptide 9
迅速なデリバリーと使いやすいフォーマット
バイオシステムズのウェブサイトの
Minor Allele
Frequency
Caucasian
GATGGGGAAGAGGAGCATTGAGGAC[C/T]
GTGTTCAAGAGGAAGCCCGCTGCCT
Mis-sense
Mutation
hCV25625805
Location on
NCBI Assembly
NCBI
Assembly
Build
DME Assay Index ファイルはアプライド
全てのアッセイの詳細情報は、DME
GSTT1
Assay Index ファイルに入っています。
NAT1
AAC1
9
N-acetyltransferase 1 (arylamine N-acetyltransferase)
クスト配列（多型および前後 2 5 b p ）、
NAT2
AAC2
10
N-acetyltransferase 2 (arylamine N-acetyltransferase)
NCBIアセンブリ上の位置、dbSNP rs
SLC15A2
PEPT2
6565
solute carrier family 15 (H+/peptide transporter), member 2
#や、また存在する一般的なアレル名が
UGT1A1
GNT1; HUG-BR1; UDPGT; UGT1; UGT1*1; UGT1A
54658
UDP glycosyltransferase 1 family, polypeptide A1
リストアップされています。さらに、遺
UGT1A6
GNT1; HLUGP; HLUGP1; MGC29860; UDPGT; UGT1; UGT1*6; UGT1F
54578
UDP glycosyltransferase 1 family, polypeptide A6
このファイルには、各アッセイのコンテ
伝子名（およびaliases）、SNPタイプ、ア
ミノ酸置換、ウェットバリデーションより
こちらには220種の薬物代謝酵素および薬物輸送タンパク質遺伝子のうちの一部を示しています。完全なリストは dme.appliedbiosystems.comにアクセスし
てご覧ください。
得られた4人種各45人でのマイナーアレ
ル頻度の情報も記載されています。
www.appliedbiosystems.co.jp
ABS-2746_Mailer_v4.qxd 05.9.26 3:33 PM ページ2
表1
DME Assay Index
Assay ID
Gene
Symbol
C____559715_20
UGT1A4
C___2307598_20
C__30634116_20
C__27861809_10
C__25625805_10
UGT1A1
Gene Symbol Alias
Allele Nomenclature
Polymorphism
UDPGT|UGT1D|UGT1*
4|HUG-BR2
UGT1A1*6,c.211G>A
A/G
GNT1|UGT1|UDPGT|UGT1
A|UGT1*1|HUG-BR1
UGT1A1*27,c.686C>A
CYP2C19
CYP2C9
MIM:191740
T154A
A/G
CYP2C19*3,c.636G>A
Phenotype
Q229P
T/C
CPCJ|CYP2C|CYP
2C|P450C2C|P450IIC19
NCBI SNP
Reference
MIM:606429
A/C
TPMT
Amino Acid
Change
*212W
rs1800460
PharmGKB:PA124
|MIM:124020
R144C
CPC9|CYP2C|CYP2C10|P450I
IC9|P450 MP-4|P450 PB-1
CYP2C9*2A,c.430C>T|CYP2C9*2A,g.
3608C>T|CYP2C9*2B,c.430C>T|CYP
2C9*2B,g.3608C>T|CYP2C9*2C,c.43
0C>T|CYP2C9*2C,g.3608C>T
C/T
CYP3A4*7,c.167
g.6004G>A
C/T
D56G
PharmGKB:PA130
|MIM:124010
A/G
E308G|E308G
MIM:136132
C__30634213_10
CYP3A4
HLP|CP34|CYP3A|NF25|CYP3
A3|P450C3|P450PCN1|CP33
C___2220257_30
FMO3
FMOII|MGC34400|dJ127D3.1
C__27529541_20
N A T 1
A
C__25599886_40
NR1I2
ARq|PAR2|BXR|PAR|PRR|PXR|
SAR|SXR|ONR1|PAR1
A
C
1
G>A|CYP3A4*7,
NAT1*17,g.190C>T
C
/
C/T
T
hCV
SNP Type
Gene Name
hCV559715
Intron
UDP
glycosyltransferase
1 family, polypeptide A4
NM_007120
Mis-sense
Mutation
UDP
glycosyltransferase
1 family, polypeptide A1
NM_000463
Mis-sense
Mutation
thiopurine
transferase
NM_000367
Nonsense
Mutation
cytochrome P450, family 2,
subfamily C, polypeptide 19
hCV2307598
MIM:187680
rs4986893
MIM:601130|Phar
mGKB:PA126
rs1799853
rs16947
R 6 4 W
MIM:108345
P66S|P27S|P2
7S
PharmGKB:PA378
|MIM:603065
NCBI Gene
Reference
hCV30634116
hCV27861809
S-methyl-
Cytogenetic
Band
TGACGCCTCGTTGTACATCAGAGAC[A/G]
GAGCATTTTACACCTTGAAGACGTA
228389777
35
2q,2q37,2q3
TTTCTGTGCGACGTGGTTTATTCCC[A/C]
GTATGCAACCCTTGCCTCAGAATTC
228390252
TCACCTGGATTAATGGCAACTAATG[T/C]
TCCTCTATCCCAAATCATGTCAAAT
19377237
ACATCAGGATTGTAAGCACCCCCTG[A/G]
ATCCAGGTAAGGCCAAGTTTTTTGC
90280519
Context Sequence
NM_000769
0
0.2
0.11
Homo sapiens
中にも含まれています。
35
2q,2q37,2q3
35
6p22,6p2,6p
35
10q24,10q,10q2
2
6
10
0
0.03
0
0
0
0.01
0
0.14
0
0.03
0
0.03
Homo sapiens
Homo sapiens
0
0
Homo sapiens
NM_006894|
NM_001002294
AAGCCTAACGTGAAGGAATTCACAG[A/G]
GACCTCGGCCATTTTGAGGATGGG
144193147
35
1q,1q23,1q2
1
0.15
0.01
0.23
0.19
Homo sapiens
N-acetyltransferase 1 (arylamine N-acetyltransferase)
NM_000662
TTTTGATCAAGTTGTGAGAAGAAAT[C/T]
GGGGTGGATGGTGTCTCCAGGTCAA
17045677
3
nuclear receptor subfamily 1,
group I, member 2
NM_022002|NM_0
03889|NM_033013
GGACACAGAGTCTGTTCCTGGAAAG[C/T]
CCAGTGTCAACGCAGATGAGGAAGT
117935283
35
hCV27529541
Mis-sense
Mutation
hCV25599886
Mis-sense
Mutation
35
10q24,10q,10q2
10
0.17
0.02
0
0
Homo sapiens
表2
5
8p22,8p2,8p
8
0
0
0
0
Homo sapiens
3q13.1,3q13,3q
1,3q
3
0
0.08
0
0
Homo sapiens
DMEコレクションに含まれるアッセイとそれに付随する情報の例。アレル名とrs#については存在するもののみ記載。dme.appliedbiosystems.comより、ファイルをダウンロードすることが可能です。
• NAT1とNAT2（N-アセチルトラ
1. アッセイコンポーネントとDNAテンプレート
ンスフェラーゼ）: この遺伝子から
Forward primer
できる酵素は、最も重要な結核の薬
F
Q
5'
ガン性物質を代謝します。
MGB
Probe
Q
Reverse primer
A
G
であるイソニアジドやさまざまな発
• MDR1（ABCB1, P-糖タンパク質
V
MGB
Probe
[C/T]
3'
5'
LEGEND
Reverse primer
V
薬物輸送に関わる遺伝子の代表で
MGB
Probe
F
Q
MGB
Probe
Q
A
G
Forward primer
す。これらの遺伝子は細胞膜を介し
た代謝産物の輸送に関わっています。
[C/T]
3'
ここに挙げたもの以外の遺伝子の例に
全なリストは dme.appliedbiosys-
F
Forward primer
実験が可能であり、アッセイのパフォー
す。
マンスを各々に最適化する必要はありま
Q
G
MGB
Q
C
Match
のを一部改良し、90秒のエクステンショ
ンタイム、50サイクルで反応します。その
他すべての装置条件は、アプライドバイ
FAM™ dye
高い再現性と容易な操作性を兼ね備え
オシステムズのTaqMan® Genotyping
Quencher
たTaqMan
® によるアレル識別技術を
Minor Groove
Binder
採用しています。それぞれのアッセイ
す。反応手順の統一と簡便化するため
AmpliTaq Gold®
DNA Polymerase
には、多型を検出するための2種類の
に、全てのTaqMan® Genotyping Assays
アレル特異的なプローブと一対のプラ
にDrug Metabolism Assayと共通のサー
Probe
Primer
イマーが含まれています。プローブと
マルサイクリング条件を用いることも可能
Template
プライマーはともにゲノム中で特有の
です。
VIC® dye
F
Q
MGB
Probe
TaqMan® Genotyping Assay
Technologyの採用
A
V
Extended Primer
tems.comで入手可能です。
多型の同定とマッピング
ル名やdbSNPのrs＃が記載されていま
TaqMan® Genotyping Assaysでは、
V
MGB
5'
3. シグナルの発生
ついては表 2に示しています。また完
全アッセイは、すべて同じ反応条件での
せん。アッセイの反応条件は、従来のも
2. 熱変性したDNAテンプレートとアニールするアッセイコンポーネント
1）: 多剤耐性遺伝子の一つであり、
DME Assay Index ファイルには、アレ
3'
[G/A]
DNA template
図 1 1. TaqMan® Genotyping Assay の4つのコンポーネントとターゲットDNAテンプレート（SNP
を括弧内に示しています）。2. 熱変性したDNAテンプレートとアニールする各コンポーネント。3. シグナ
ルの発生によるアレルの検出。
これらのDMEコレクションの多型には
一塩基多型（ S N P s ）、挿入や欠失
Assaysで採用されているものと同じで
® ケミストリーを用いた
検証済みの優れたパフォーマンス
ジェノタイピング技術の高い特異性を
各々のアッセイについて、まずAfrican
実現します。そしてその特異性の高さ
American
が、偽遺伝子を含む非常に相同性の高
DNAサンプル（3 ng）
を使用し、2反復
45人、Caucasian45人の
（ i n / d e l s ）、複数塩基にわたる多型
報、更にはアプライドバイオシステムズ
連部位に存在する多型のみをセットとし
い遺伝子ファミリー中に存在するター
のテストを行います。ここで良好な結果
（MNPs）があります。そのデータソース
独自のSNPデータベースが含まれます。
て選出しました。allele nomenclature
ゲットにおいても特異的に検出できま
が得られたアッセイは、さらに各45人ず
は３種類で、dbSNP、HGMD、allele
まず初めに220遺伝子の全ての多型を
サイトは、DMEにある多型と、一般的
す。すべてのアッセイデザインにおい
つのChineseおよびJapaneseのDNAサ
nomenclatureサイト等のデータベース、
抽出し、その中から調節因子やコー
なアレル名と整合性をとるために利用
て、BLASTプログラムによるゲノム
ンプルを用いたテストを行っています。
しました。無料でダウンロード可能な
全体との相同性チェックが行われ、ゲ
すべてのテストにおいて再現性、シグナ
ノム中で特有のデザインであることを
ル強度、確実なジェノタイプの判定がで
医薬品業界における共同研究による情
ディング領域、もしくはスプライシング関
確認しています。
www.appliedbiosystems.co.jp
www.appliedbiosystems.co.jp
きるかどうか評価しています。
製品としての柔軟性
各アッセイは１本単位、もしくはセッ
にこのシステムは次世代のソフトウェ
プローブ（ VIC もしくは 6-
ア技術を採用することにより、高い利
FAMTMでラベル）、2種類の遺伝子特異
便性を実現します。もちろん、このリ
的なプライマーを含むシングルチュー
アルタイム PCR システムは、パフォー
ブで供給されます。各アッセイは20×
マンス、品質、信頼性を兼ね備えた、
濃度に調整されており、5-µLの反応系
アプライドバイオシステムズの実績に
で750反応が可能です（表 3）
。
支えられた製品です。
®
遺伝子リスト（サンプル）
Official Gene
Symbol
Alias
Entrez Gene ID
Gene Description
ABCB1
ABC20; CD243; CLCS; GP170; MDR1; P-gp; PGY1
5243
ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
ABCC1
ABC29; ABCC; GS-X; MRP; MRP1
4363
ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 1
ABCC2
ABC30; CMOAT; DJS; MRP2; cMRP
1244
ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 2
ADH1A
ADH1
124
alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide
ADH5
ADH-3; ADHX; FDH
128
alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide
1312
catechol-O-methyltransferase
COMT
CYP1A1
AHH; AHRR; CP11; CYP1; P1-450; P450-C; P450DX
1543
cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 1
CYP1A2
CP12; P3-450; P450(PA)
1544
cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 2
全てのアッセイでも、研究に合わせて
CYP1B1
CP1B; GLC3A
1545
cytochrome P450, family 1, subfamily B, polypeptide 1
選択することができます。各アッセイ
CYP2A6
CPA6; CYP2A; CYP2A3; P450C2A; P450PB
1548
cytochrome P450, family 2, subfamily A, polypeptide 6
はアプライドバイオシステムズのウェ
CYP2B6
CPB6; CYP2B; CYPIIB6; IIB1; P450
1555
cytochrome P450, family 2, subfamily B, polypeptide 6
ブサイト、dme.appliedbiosys-
CYP2C19
CPCJ; CYP 2C; CYP2C; P450C2C; P450IIC19
1557
cytochrome P450, family 2, subfamily C, polypeptide 19
tems.com のページからmyScienceSM
CYP2C9
CPC9; CYP2C; CYP2C10; P450 MP-4; P450 PB-1; P450IIC9
1559
cytochrome P450, family 2, subfamily C, polypeptide 9
CYP2D6
CPD6; CYP2D; CYP2D@; CYP2DL1; P450-DB1; P450C2D
1565
cytochrome P450, family 2, subfamily D, polypeptide 6
DPYD
DHP; DPD
1806
dihydropyrimidine dehydrogenase
FMO3
FMOII; MGC34400; dJ127D3.1
2328
flavin containing monooxygenase 3
2952
glutathione S-transferase theta 1
トで注文することができます。1遺伝
子上の１アッセイでも、複数遺伝子の
を通じて注文できます。
DME Assay Indexファイル
配列を持つようにデザインされてお
り、TaqMan
り使いやすいものにしています。さら
MGB
Homo sapiens
0
mono-
のTaqMan SNP Genotyping Asays同
様、2種類のアレル特異的なTaqMan
®
0
flavin containing
oxygenase 3
ションであり、リアルタイムPCRをよ
0
7
Mis-sense
Mutation
なニーズに対応できる強力なソリュー
います。アプライドバイオシステムズ
2
7q22,7q2,7q
hCV2220257
注後速やかに発送できる体制を整えて
Species
ウンロードでき、製品に添付されるCDの
35
cytochrome P450, family 3,
subfamily A, polypeptide 4
タイムPCRシステムは、研究者の多様
Chromosome
94109937
Mis-sense
Mutation
アプライドバイオシステムズのリアル
アッセイは、製造後ストックされ、受
Minor Allele
Frequency
Chinese
ACATTCCATGTCAAACATACAAAAG[C/T]
CCTGGGAGGAGAAACAAAATAATAT
hCV30634213
製品を迅速に供給するためにすべての
dme.appliedbiosystems.comからダ
Minor Allele
Frequency
Japanese
NM_017460
NM_000771
強力なリアルタイムPCR システム
Minor Allele
Frequency
African
American
90442165
cytochrome P450, family 2,
subfamily C, polypeptide 9
迅速なデリバリーと使いやすいフォーマット
バイオシステムズのウェブサイトの
Minor Allele
Frequency
Caucasian
GATGGGGAAGAGGAGCATTGAGGAC[C/T]
GTGTTCAAGAGGAAGCCCGCTGCCT
Mis-sense
Mutation
hCV25625805
Location on
NCBI Assembly
NCBI
Assembly
Build
DME Assay Index ファイルはアプライド
全てのアッセイの詳細情報は、DME
GSTT1
Assay Index ファイルに入っています。
NAT1
AAC1
9
N-acetyltransferase 1 (arylamine N-acetyltransferase)
クスト配列（多型および前後 2 5 b p ）、
NAT2
AAC2
10
N-acetyltransferase 2 (arylamine N-acetyltransferase)
NCBIアセンブリ上の位置、dbSNP rs
SLC15A2
PEPT2
6565
solute carrier family 15 (H+/peptide transporter), member 2
#や、また存在する一般的なアレル名が
UGT1A1
GNT1; HUG-BR1; UDPGT; UGT1; UGT1*1; UGT1A
54658
UDP glycosyltransferase 1 family, polypeptide A1
リストアップされています。さらに、遺
UGT1A6
GNT1; HLUGP; HLUGP1; MGC29860; UDPGT; UGT1; UGT1*6; UGT1F
54578
UDP glycosyltransferase 1 family, polypeptide A6
このファイルには、各アッセイのコンテ
伝子名（およびaliases）、SNPタイプ、ア
ミノ酸置換、ウェットバリデーションより
こちらには220種の薬物代謝酵素および薬物輸送タンパク質遺伝子のうちの一部を示しています。完全なリストは dme.appliedbiosystems.comにアクセスし
てご覧ください。
得られた4人種各45人でのマイナーアレ
ル頻度の情報も記載されています。
www.appliedbiosystems.co.jp
Product Bulletin TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assays
表3
製品規格
P/N
Size
Status
Concentration
Volume Delivered
Reaction Size*
Reactions
4362691
Small
Inventoried
20X
187.5 µL
5 µL
25 µL
750
150
*反応ボリュームは、使用する反応ブロックにより異なります。384-ウェルブロックでは5 µl、96-ウェルブロックでは25 µlで反応を行います。
表4
他のTaqMan®
Assay Type
SNP Genotyping
AssaysとTaqMan®
Drug Metabolism Genotyping Assaysとの比較
Status
Size
Number of 5-µL Reactions*
Performance Validated with 180 DNA Samples
Number of Assays
Drug Metabolism
Inventoried
Small
750
Yes
>2,000
Validated
Inventoried
Small
750
Yes
~160,000
Coding
Inventoried
Small
750
No
~30,000
Made-to-order
Small
750
No
>2 million
Pre-Designed
Custom
Made-to-order
Small
Medium
Large
Applied Biosystems 7900HT Fast
Applied Biosystems 7500 リアルタイ
Applied Biosystems 7300 リアルタイ
リアルタイムPCRシステム − 究極の
ムPCR システム − 拡張性必要とす
ム PCR システム − 基礎分野の研究
パフォーマンスと柔軟性
るユーザーのための多機能モデル
者のための経済性に優れたスタンダー
• ユーザーご自身で交換できるサンプ
• 先進的な5色対応の光学検出系の採
ドモデル
ルブロックには、384-ウェル、96-ウェ
用により、広範囲の色素に対応でき、
• 4色対応の検出系で、主要なすべて
ル、TaqMan® Low Density Array、
また励起波長はフィルター毎に変更
のアプリケーションに対応します。
Fast 96-ウェルの4種があります（オプ
されており、長波長（赤色）色素に
ション）
。
対する感度を改善しています。
• 寿命の長い488 nmアルゴンイオン
• Relative Quantitation Softwareの機
レーザーと、500 - 660nm波長域の全
能により、最大10枚のプレートの遺
波長での検出を組み合わせることで、
伝子発現データを、1度に解析する
優れた色素識別能を発揮します。
ことが可能です。
No
がシンプルでわかりやすく、多機能
ソフトウェアを採用しています。
• 精密な光学系とCCDカメラにより、
精度、再現性、信頼性ともに高い結
極めて簡単な設定で自動化を実現し
コードしています。
ロールシステムにより、優れた再現
性と一貫した高品質のデータを提供
エンタープライズ版ソフトウェアにより数
• SNPs、insertion/deletion、複数塩
基におよぶ多型（MNPs）など幅広
します。
い変異が検出可能です。
百から数千のプレートを同時に解析す
ることが可能です。
（21 CFR part 11に
• 常時在庫しているinventoried assay
準拠。オプション。
）
特長と優位性
• ターゲットとなる多型が存在する
遺伝子は220種以上におよび、薬物
果を提供します。
• 特許取得済みのサンプル温度コント
N/A
*384-ウェルサンプルブロック使用
• 実験のセットアップ、データの処理
代謝酵素や薬物輸送タンパク質を
• オートメーションアクセサリーにより、
ます。
1,000
3,000
12,000
基礎研究および臨床研究のためのTaqMan®
Drug Metabolism Genotyping Assays
で、パフォーマンスは検証済みで
す。
特長
優位性
Ordering Information
220種以上の薬物代謝遺伝子の調節因子やコーディング領域の
内部に存在する有用な多型2,000以上がターゲットです。※注1
特定薬物の代謝速度に関係する多型や、これまでタイピングが困
難とされていた多型の研究が可能。
商品名
各アッセイは任意に選択して、注文することができます。
研究の目的に応じて自由にアッセイを選択することができ、
アッセイを制限されることはありません。
TaqMan Drug Metabolism Genotyping Assays
®
TaqMan®ケミストリにより、1つのプラットフォームで、
SNPs、in/dels、MNPsなど各種多型に対応可能です。
各アッセイは、dme.appliedbiosystems.comから注文できます。
アッセイコレクションは既存のリアルタイムPCRプラットフォーム
を用いて検出できるよう開発が行われています。
新規のアッセイもこれまでと全く同じ実験条件で（90秒のエク
ステンションタイムと50回のサイクル数が必要となりますが、
他の条件は全て同じです。）シームレスな統合が可能です。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
必要なアッセイを選択するための時間とエネルギーは必要ありま
せん。
配列相同性による問題の克服および特異的な多型検出のために、
高度なバイオインフォマティクス技術が用いられています。
厳密なWet Validationにより、信頼性の高いターゲットSNPs
のデータを提供します。
Applera シーケンシングプロジェクトで得られた新規の
SNPターゲット変異が含まれています。
他の手法では入手が困難な情報が簡単にアクセスでき、研究に重
要なSNPsをいち早く調査することが可能です。
※注1 2005年8月末現在、1,560Assays。順次追加する予定です
商品番号
small scale
4362691
本製品には、プロトコル、Assey Information File (AIF)、DME Assay Index、トラブルシューティングガイドの入ったCDが付属されています。
各種多型が検出可能です。
個々の多型と一般的なアレル名との関連づけ、またゲノム上の
物理的な位置を得るため、高度なバイオインフォマティクス技術が
用いられています。
サイズ
• 4人種で合計180人のDNAサンプル
についてデータを検証済みです。
• 公開されているallele nomenclatureサイトを参照しています。
イントロダクション
NOTICE TO PURCHASER: LIMITED LICENSE:
The purchase price of TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assays, P/N 4362691 includes a limited, non-transferable license under U.S. Patents Nos. 5,538,848, 5,876,930, 6,030,787
and 6,258,569, and corresponding claims in patents outside the U.S., owned by the Applera Corporation (“Applera”), and U.S. Patent No. 5,804,375 (claims 1-12 only), owned by Roche
Molecular Systems, Inc. and corresponding claims outside the U.S. owned by F. Hoffmann-La Roche Ltd. (collectively, “Roche”), to use only this portion of probe solely to perform the
purchaser’s own internal research and development activities. This product may also be used to perform 5' nuclease assays under service licenses from Applera. No rights are granted
under any other patent or patent claim, expressly, by implication, or by estoppel, including U.S. Patents Nos. 5,210,015 or 5,487,972, covering the 5' nuclease process, owned by Roche,
or corresponding claims in patents outside the United States. Further information on purchasing licenses for these patented processes may be obtained by contacting the Director of
Licensing, Applied Biosystems, 850 Lincoln Centre Drive, Foster City, California 94404, USA.
Notice to Purchaser:
TaqMan® probes are covered by U.S. Patent 5,723,591, and foreign counterparts and patents pending owned by Applera Corporation, and are covered by U.S. Patents 5,801,155 and
6,084,102 and foreign counterparts licensed to Applied Biosystems.
2 2 0 種を超す薬物代謝酵素遺伝子
（DMEs）および薬物輸送タンパク質遺
伝子上に存在する、2000種以上
（※注1）
のユニークな多型を検出するTaqMan®
Drug Metabolism Genotyping Assays
が発売になりました。これらの遺伝子
多型は、患者体内の薬物代謝速度に
関係することがあり、薬効や副作用
研究用にのみ使用できます。診断目的およびその手続き上での使用は出来ません。
Applied Biosystems is a registered trademark and AB (Design), Applera and myScience are trademarks of Applera Corporation or its subsidiaries in the US and/or certain other countries.
の発生に影響を与える可能性があり
ます。これまで、こうした遺伝子多
TaqMan is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc.
記載の社名および製品名は、弊社または各社の商標または登録商標です。
型を効果的に同定するための技術や
© 2005 Applied Biosystems Japan Ltd,. All Rights reserved.
製品が少なかったため、遺伝子の複
Printed in JAPAN, GTA001-A0509OB
雑な性質についての研究には制限が
お問い合せ先
本社：
アプライドバイオシステムズジャパン株式会社
〒104-0032 東京都中央区八丁堀4-5-4
セイは、全て表現型に現れる可能性
がある多型、すなわち調節領域や
FAX. 03（5566）6501
コーディング領域、スプライシング
大阪：
に関連した部位の多型のみをター
TEL. 06（6389）1201 FAX. 06（6389）1206
www.appliedbiosystems.co.jp
ありました。本製品に含まれるアッ
TEL. 03（5566）6100 〒564-0052 大阪府吹田市広芝町10-28
www.appliedbiosystems.co.jp
取扱店：
TaqMan® Drug Metabolism Genotyping
薬物代謝に関わる遺伝子
Assaysの開発には、高度なバイオイ
薬物代謝酵素をコードする遺伝子は、
ンフォマティクス技術、厳密な
医薬品（もしくは化学物質）に対す
ウェットバリデーションの手法が用
る反応性に影響を与えるため、医薬
いられています。アッセイはallele
品開発や臨床研究において重要な
nomenclatureサイトを含む、幾つか
ターゲットとなります。主要な遺伝
のパブリックSNPデータベースをも
子は以下の通りです。
とに設計されており、4人種から得ら
れた180人のDNAサンプルからパ
フォーマンスを確認してます。またこ
れらのTaqMan® DME (drug metabolism enzyme) assaysは、アプライドバイオ
システムズのTaqMan® SNP Genotyping
Assaysやリアルタイム PCR システムと共
• CYP2D6: 57種あるチトクローム
P450ファミリーの遺伝子の1つであ
り、抗不整脈剤、抗うつ剤、抗精
神病薬、ßブロッカーや鎮痛剤など
の20-25%がこの酵素により代謝さ
れるとされています。
に使用することが可能です。
ゲットにしています。
※注１ 9月12日現在、1560アッセイ。順次追加予定です。
www.appliedbiosystems.co.jp
ABS-2746_Mailer_v4.qxd 05.9.26 3:33 PM ページ1
Product Bulletin TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assays
表3
製品規格
P/N
Size
Status
Concentration
Volume Delivered
Reaction Size*
Reactions
4362691
Small
Inventoried
20X
187.5 µL
5 µL
25 µL
750
150
*反応ボリュームは、使用する反応ブロックにより異なります。384-ウェルブロックでは5 µl、96-ウェルブロックでは25 µlで反応を行います。
表4
他のTaqMan®
Assay Type
SNP Genotyping
AssaysとTaqMan®
Drug Metabolism Genotyping Assaysとの比較
Status
Size
Number of 5-µL Reactions*
Performance Validated with 180 DNA Samples
Number of Assays
Drug Metabolism
Inventoried
Small
750
Yes
>2,000
Validated
Inventoried
Small
750
Yes
~160,000
Coding
Inventoried
Small
750
No
~30,000
Made-to-order
Small
750
No
>2 million
Pre-Designed
Custom
Made-to-order
Small
Medium
Large
Applied Biosystems 7900HT Fast
Applied Biosystems 7500 リアルタイ
Applied Biosystems 7300 リアルタイ
リアルタイムPCRシステム − 究極の
ムPCR システム − 拡張性必要とす
ム PCR システム − 基礎分野の研究
パフォーマンスと柔軟性
るユーザーのための多機能モデル
者のための経済性に優れたスタンダー
• ユーザーご自身で交換できるサンプ
• 先進的な5色対応の光学検出系の採
ドモデル
ルブロックには、384-ウェル、96-ウェ
用により、広範囲の色素に対応でき、
• 4色対応の検出系で、主要なすべて
ル、TaqMan® Low Density Array、
また励起波長はフィルター毎に変更
のアプリケーションに対応します。
Fast 96-ウェルの4種があります（オプ
されており、長波長（赤色）色素に
ション）
。
対する感度を改善しています。
• 寿命の長い488 nmアルゴンイオン
• Relative Quantitation Softwareの機
レーザーと、500 - 660nm波長域の全
能により、最大10枚のプレートの遺
波長での検出を組み合わせることで、
伝子発現データを、1度に解析する
優れた色素識別能を発揮します。
ことが可能です。
No
がシンプルでわかりやすく、多機能
ソフトウェアを採用しています。
• 精密な光学系とCCDカメラにより、
精度、再現性、信頼性ともに高い結
極めて簡単な設定で自動化を実現し
コードしています。
ロールシステムにより、優れた再現
性と一貫した高品質のデータを提供
エンタープライズ版ソフトウェアにより数
• SNPs、insertion/deletion、複数塩
基におよぶ多型（MNPs）など幅広
します。
い変異が検出可能です。
百から数千のプレートを同時に解析す
ることが可能です。
（21 CFR part 11に
• 常時在庫しているinventoried assay
準拠。オプション。
）
特長と優位性
• ターゲットとなる多型が存在する
遺伝子は220種以上におよび、薬物
果を提供します。
• 特許取得済みのサンプル温度コント
N/A
*384-ウェルサンプルブロック使用
• 実験のセットアップ、データの処理
代謝酵素や薬物輸送タンパク質を
• オートメーションアクセサリーにより、
ます。
1,000
3,000
12,000
基礎研究および臨床研究のためのTaqMan®
Drug Metabolism Genotyping Assays
で、パフォーマンスは検証済みで
す。
特長
優位性
Ordering Information
220種以上の薬物代謝遺伝子の調節因子やコーディング領域の
内部に存在する有用な多型2,000以上がターゲットです。※注1
特定薬物の代謝速度に関係する多型や、これまでタイピングが困
難とされていた多型の研究が可能。
商品名
各アッセイは任意に選択して、注文することができます。
研究の目的に応じて自由にアッセイを選択することができ、
アッセイを制限されることはありません。
TaqMan Drug Metabolism Genotyping Assays
®
TaqMan®ケミストリにより、1つのプラットフォームで、
SNPs、in/dels、MNPsなど各種多型に対応可能です。
各アッセイは、dme.appliedbiosystems.comから注文できます。
アッセイコレクションは既存のリアルタイムPCRプラットフォーム
を用いて検出できるよう開発が行われています。
新規のアッセイもこれまでと全く同じ実験条件で（90秒のエク
ステンションタイムと50回のサイクル数が必要となりますが、
他の条件は全て同じです。）シームレスな統合が可能です。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
必要なアッセイを選択するための時間とエネルギーは必要ありま
せん。
配列相同性による問題の克服および特異的な多型検出のために、
高度なバイオインフォマティクス技術が用いられています。
厳密なWet Validationにより、信頼性の高いターゲットSNPs
のデータを提供します。
Applera シーケンシングプロジェクトで得られた新規の
SNPターゲット変異が含まれています。
他の手法では入手が困難な情報が簡単にアクセスでき、研究に重
要なSNPsをいち早く調査することが可能です。
※注1 2005年8月末現在、1,560Assays。順次追加する予定です
商品番号
small scale
4362691
本製品には、プロトコル、Assey Information File (AIF)、DME Assay Index、トラブルシューティングガイドの入ったCDが付属されています。
各種多型が検出可能です。
個々の多型と一般的なアレル名との関連づけ、またゲノム上の
物理的な位置を得るため、高度なバイオインフォマティクス技術が
用いられています。
サイズ
• 4人種で合計180人のDNAサンプル
についてデータを検証済みです。
• 公開されているallele nomenclatureサイトを参照しています。
イントロダクション
NOTICE TO PURCHASER: LIMITED LICENSE:
The purchase price of TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assays, P/N 4362691 includes a limited, non-transferable license under U.S. Patents Nos. 5,538,848, 5,876,930, 6,030,787
and 6,258,569, and corresponding claims in patents outside the U.S., owned by the Applera Corporation (“Applera”), and U.S. Patent No. 5,804,375 (claims 1-12 only), owned by Roche
Molecular Systems, Inc. and corresponding claims outside the U.S. owned by F. Hoffmann-La Roche Ltd. (collectively, “Roche”), to use only this portion of probe solely to perform the
purchaser’s own internal research and development activities. This product may also be used to perform 5' nuclease assays under service licenses from Applera. No rights are granted
under any other patent or patent claim, expressly, by implication, or by estoppel, including U.S. Patents Nos. 5,210,015 or 5,487,972, covering the 5' nuclease process, owned by Roche,
or corresponding claims in patents outside the United States. Further information on purchasing licenses for these patented processes may be obtained by contacting the Director of
Licensing, Applied Biosystems, 850 Lincoln Centre Drive, Foster City, California 94404, USA.
Notice to Purchaser:
TaqMan® probes are covered by U.S. Patent 5,723,591, and foreign counterparts and patents pending owned by Applera Corporation, and are covered by U.S. Patents 5,801,155 and
6,084,102 and foreign counterparts licensed to Applied Biosystems.
2 2 0 種を超す薬物代謝酵素遺伝子
（DMEs）および薬物輸送タンパク質遺
伝子上に存在する、2000種以上
（※注1）
のユニークな多型を検出するTaqMan®
Drug Metabolism Genotyping Assays
が発売になりました。これらの遺伝子
多型は、患者体内の薬物代謝速度に
関係することがあり、薬効や副作用
研究用にのみ使用できます。診断目的およびその手続き上での使用は出来ません。
Applied Biosystems is a registered trademark and AB (Design), Applera and myScience are trademarks of Applera Corporation or its subsidiaries in the US and/or certain other countries.
の発生に影響を与える可能性があり
ます。これまで、こうした遺伝子多
TaqMan is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc.
記載の社名および製品名は、弊社または各社の商標または登録商標です。
型を効果的に同定するための技術や
© 2005 Applied Biosystems Japan Ltd,. All Rights reserved.
製品が少なかったため、遺伝子の複
Printed in JAPAN, GTA001-A0509OB
雑な性質についての研究には制限が
お問い合せ先
本社：
アプライドバイオシステムズジャパン株式会社
〒104-0032 東京都中央区八丁堀4-5-4
セイは、全て表現型に現れる可能性
がある多型、すなわち調節領域や
FAX. 03（5566）6501
コーディング領域、スプライシング
大阪：
に関連した部位の多型のみをター
TEL. 06（6389）1201 FAX. 06（6389）1206
www.appliedbiosystems.co.jp
ありました。本製品に含まれるアッ
TEL. 03（5566）6100 〒564-0052 大阪府吹田市広芝町10-28
www.appliedbiosystems.co.jp
取扱店：
TaqMan® Drug Metabolism Genotyping
薬物代謝に関わる遺伝子
Assaysの開発には、高度なバイオイ
薬物代謝酵素をコードする遺伝子は、
ンフォマティクス技術、厳密な
医薬品（もしくは化学物質）に対す
ウェットバリデーションの手法が用
る反応性に影響を与えるため、医薬
いられています。アッセイはallele
品開発や臨床研究において重要な
nomenclatureサイトを含む、幾つか
ターゲットとなります。主要な遺伝
のパブリックSNPデータベースをも
子は以下の通りです。
とに設計されており、4人種から得ら
れた180人のDNAサンプルからパ
フォーマンスを確認してます。またこ
れらのTaqMan® DME (drug metabolism enzyme) assaysは、アプライドバイオ
システムズのTaqMan® SNP Genotyping
Assaysやリアルタイム PCR システムと共
• CYP2D6: 57種あるチトクローム
P450ファミリーの遺伝子の1つであ
り、抗不整脈剤、抗うつ剤、抗精
神病薬、ßブロッカーや鎮痛剤など
の20-25%がこの酵素により代謝さ
れるとされています。
に使用することが可能です。
ゲットにしています。
※注１ 9月12日現在、1560アッセイ。順次追加予定です。
www.appliedbiosystems.co.jp

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