授業科目名 科目区分 生命情報解析学（講義） 講義題目 単位数 選択科目 開講時期等 時間割 4 授業コード 982101 関連授業課目 生命情報解析学（演習） 担当教員名 履修推奨科目 竹崎 直子（総合生命科学研究センター） 岩間 久和（総合生命科学研究センター） 授業の概要 現在ゲノムデータをはじめとして、大量の生命情報データが入手可能となっている。このなかでも特に DNA の塩基配列や アミノ酸配列データや多型データまたそれに関連したデータの解析方法について学習する。これらのデータのパブリックデータ ベースからの検索、収集方法や配列データ、多型データについての比較解析方法について紹介する。配列データ、多型デー タの性質および一般的に用いられる解析方法の理論的基礎の学習を行いながら、これらの方法を実際のデータに対して用い てみる。この授業は演習とともに行う形式をとる。 授業の目的・達成目標 (1)配列データのデータベースからの検索、収集について紹介するが、演習において実際にデータ検索、収集を行っ てみること。(2)配列データや多型データの性質、一般的に用いられる解析方法について理論的基礎について理解する こと。そして、演習において配列データや多型データの比較解析をソフトウェアを用いて実際に行ってみること。 授業及び学習の方法 データの検索、収集、解析についての解説の後、演習においてコンピューターを用いて個々に実際に行う。データ 解析方法については、講義あるいは教科書または関連文献の輪読を行う。 成績評価の方法と基準 データ検索、収集、解析のそれぞれの段階で、演習と連動した assignment に対するレポートの提出、講義への出 席を評価の基準とする 授業計画 第１回―第３回 第４回―第９回 第１０回―第２０回 第２１回―第３０回 ゲノムデータ、配列データ、多型データの紹介 データベースの利用方法、データの検索、収集 データ解析方法の理論的基礎 データ解析方法の活用 教科書 「バイオインフォマティクス第２版ゲノム配列から機能解析へ」著者：デービッドW．マウント著／岡崎 康司監訳／ 坊農 秀雅監訳／香月 祥太郎〔ほか〕訳、税込価格：￥１１，５５０、出版：メディカル・サイエンス・インター ナショナル、ISBN：４８９５９２４２６２生協の書籍部にて購入 参考書 「分子進化と分子系統学」根井 正利監訳 大田 竜也・竹崎 ISBN４－５６３－０７８０１－８ 生協の書籍部にて購入 直子共訳 税込価格：￥７，３５０ 出版：培風館 オフィスアワー 随時、アポイントメントにより、質問などの話し合いの時間を設ける。 履修上の注意 assignment はコンピューターを用いて行うので、受講者が用いることのできるコンピューター環境が必要である。 URL : E-Mail：
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