arg tesi sperim Pession_2014

Alma Mater Studiorum – Università di Bologna
DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT
Laboratorio di Biologia Molecolare
Anatomia Patologica, Ospedale Bellaria
Michela Visani
Tutor Prof.ssa Annalisa Pession
Bologna, 30 Maggio 2014
DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT
Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Diagnostica Molecolare
Di cosa ci occupiamo?
Caratterizzazione molecolare di neoplasie solide
Da cosa partiamo?
Analizziamo il DNA da:
- tessuti freschi (resezioni chirurgiche/biopsie)
- tessuti FFPE (resezioni chirurgiche/biopsie)
- campioni citologici (diretti/strisci su vetrino)
Cosa analizziamo?
Markers molecolari
Diagnostici
Prognostici
Predittivi
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Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Principali indagini di diagnostica molecolare
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Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Progetti di ricerca - 1
Tumori Cerebrali
Analisi degli effetti del trattamento con TMZ e XAV939 su
una linea cellulare di Glioblastoma: analisi miRNOMA
Tumori tiroidei
Caratterizzazione molecolare, analisi mutazionale di
potenziali marker molecolari
Sclerosi laterale amiotrofica
Isolamento, caratterizzazione e analisi miRNOMA delle
cellule satellite di pazienti SLA
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Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Progetti di ricerca - 2
Tumori Pancreatici
Profilo molecolare di carcinomi pancreatici lungo
sopravviventi
Epilessia
Studi di espressione genica e di silenziamento
epigenetico relativi all’immunoproteasoma
Tumori ipofisari
Ricerca di markers molecolari per diagnostica
differenziale
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Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Tecniche - 1
Tecniche mutazione-specifiche
Es. Allele-specific PCR per le
mutazioni più frequenti di KRAS,
BRAF e IDH1
Real-Time ABI7000
High Resolution Melting (HRM)
Es. Screening mutato/non mutato
per KRAS e EGFR
Es. analisi miRNOMA con
piattaforma da 384 pozzetti
Es. Campione KRAS G12D
Light Cycler 480
(Roche)
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Tecniche - 2
Sequenziamento Sanger
- si analizza tutta la regione di
interesse
- sensibilità 20%
Next Generation sequencing
- si analizza tutta la regione di
interesse
- sensibilità 1%
- sequenziamento parallelo
- alta processività
CEQ2000 XL
(Beckman Coulter)
Es. Campione KRAS G12D
454-GS Junior
(Roche)
Es. Campione KRAS G12D
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Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria
Staff & Info
Chi siamo:
Dove siamo:
Laboratorio di Biologia Molecolare
Anatomia Patologica, Ospedale Bellaria
Via Altura 3, Bologna