Alma Mater Studiorum – Università di Bologna DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio di Biologia Molecolare Anatomia Patologica, Ospedale Bellaria Michela Visani Tutor Prof.ssa Annalisa Pession Bologna, 30 Maggio 2014 DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria Diagnostica Molecolare Di cosa ci occupiamo? Caratterizzazione molecolare di neoplasie solide Da cosa partiamo? Analizziamo il DNA da: - tessuti freschi (resezioni chirurgiche/biopsie) - tessuti FFPE (resezioni chirurgiche/biopsie) - campioni citologici (diretti/strisci su vetrino) Cosa analizziamo? Markers molecolari Diagnostici Prognostici Predittivi DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria Principali indagini di diagnostica molecolare DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria Progetti di ricerca - 1 Tumori Cerebrali Analisi degli effetti del trattamento con TMZ e XAV939 su una linea cellulare di Glioblastoma: analisi miRNOMA Tumori tiroidei Caratterizzazione molecolare, analisi mutazionale di potenziali marker molecolari Sclerosi laterale amiotrofica Isolamento, caratterizzazione e analisi miRNOMA delle cellule satellite di pazienti SLA DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria Progetti di ricerca - 2 Tumori Pancreatici Profilo molecolare di carcinomi pancreatici lungo sopravviventi Epilessia Studi di espressione genica e di silenziamento epigenetico relativi all’immunoproteasoma Tumori ipofisari Ricerca di markers molecolari per diagnostica differenziale DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria Tecniche - 1 Tecniche mutazione-specifiche Es. Allele-specific PCR per le mutazioni più frequenti di KRAS, BRAF e IDH1 Real-Time ABI7000 High Resolution Melting (HRM) Es. Screening mutato/non mutato per KRAS e EGFR Es. analisi miRNOMA con piattaforma da 384 pozzetti Es. Campione KRAS G12D Light Cycler 480 (Roche) DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria Tecniche - 2 Sequenziamento Sanger - si analizza tutta la regione di interesse - sensibilità 20% Next Generation sequencing - si analizza tutta la regione di interesse - sensibilità 1% - sequenziamento parallelo - alta processività CEQ2000 XL (Beckman Coulter) Es. Campione KRAS G12D 454-GS Junior (Roche) Es. Campione KRAS G12D DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria Staff & Info Chi siamo: Dove siamo: Laboratorio di Biologia Molecolare Anatomia Patologica, Ospedale Bellaria Via Altura 3, Bologna