PML/RARA Sonde per Citogenetica Molecolare (FISH) Descrizione della sonda La sonda CGI PML/RARA è stata sviluppata per la rilevazione della traslocazione tra il gene PML sul cromosoma 15q24.1 (in precedenza era stato posizionato sulla banda 15q22) e il gene RARA sul cromosoma 17q21.1 mediante ibridazione in situ fluorescente (FISH). La trslocazione t(15;17) è il marcatore diagnostico della leucemia acuta promielocitica (LMA-M3) e risulta nella fusione dei geni PML e RARA. La presenza della fusione PML-RARA è predittiva di una risposta favorevole alla terapia di differenziazione con l’acido tutto-trans retinoico (ATRA) ed è attualmente il sottotipo di LMA più curabile. Questa traslocazione si riscontra anche in casi di leucemia mieloide cronica (LMC) con crisi mieloblastiche.bilanciate che non bilanciate come cloni separati.. Rappresentazione schematica della sonda PML/RARA PML 15q24 centromere 5’ telomere 3’ ~270kb ~350kb RARA RARA PML 17q21 15 centromere 17 5’ 3’ ~570kb telomere Le barre orizzontali rossa e verde indicano le regioni coperte dalla sonda (approssimate alla scala NCBI Build 36.1/Hg18/2006). Le marcature dirette PML (verde) e RARA (rossa) affiancano i comuni breakpoints della traslocazione (frecce). Sul gene PML, i breakpoints si raggruppano in 3 regioni: bcr1 (esoni 6-7, freccai destra; 70%), bcr2 (esoni 5-6 freccia centrale; 10%) e bcr3 (introni 3-4, freccia sinistra; 20%). Sul gene RARA i breakpoints si raggruppano attorno all’introne 2 di approssimativamente 17 kb. ~510kb Interpretazione del segnale Nella metafase normale diploide e nei nuclei in interfase, la sonda genera 2 segnali rossi e 2 verdi corrispondenti rispettivamente ai 2 cromosomi 15 e 17 normali (figura 1). Nelle cellule con la traslocazione tra PML e RARA il pattern che si osserva più comunemente è un segnale rosso e uno verde, che rappresentano i cromosomi 15 e 17 normali e due segnali di fusione (rosso/verde o giallo) che invece rappresentano i 2 cromosomi traslocati (figura 2). Sono state riportate in letteratura traslocazioni varianti, mascherate e a 3 cromosomi. Si raccomanda l’ibridazione di metafasi tumorali per confermare le varianti anormali del pattern di segnali che includono almeno un segnale di fusione. Figura 1: Metafase diploide normale e nucleo in interfase (da sangue periferico normale) con 2 segnali rossi (RARA) e due verdi (PML). Referenze 1. Kakizuka, a., et al., Cell, 1991. 66: 663-74. 2. Brockman, S. R, et al. Cancer Genet Cytogenet, 2003. 145:144-15. 3. Mistry, A.R., et al., Blood Rev., 2003. 17(2): 71-97 www.technogenetics.it Figura 2: Nucleo in interfase con 1 segnale rosso (RARA) , 1 verde (PML) e 2 segnali di fusione (rosso/verde o giallo). Filtri Microscopio a Fluorescenza Fluoroforo Eccitazione max Emissione max Verde 496 nm 520 nm Rosso 580 nm 603 nm DAPI 360 nm 460 nm 27
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