Recombinant DNA-technologie

Studiefiche
Vanaf academiejaar 2014-2015
Recombinant DNA-technologie (I630008)
Cursusomvang
(nominale waarden; effectieve waarden kunnen verschillen per opleiding)
Studiepunten 6.0
Studietijd 180.0 u
Contacturen
60.0 u
Aanbodsessies en werkvormen in academiejaar 2014-2015
A (semester 2)
practicum
hoorcollege
Lesgevers in academiejaar 2014-2015
Wille, Christophe
Van de Vel, Elien
36.0 u
24.0 u
LA16
LA16
Aangeboden in onderstaande opleidingen in 2014-2015
Bachelor of Science in de industriële wetenschappen: chemie
Schakelprogramma tot Master of Science in de industriële
wetenschappen: biochemie
Verantwoordelijk lesgever
Medewerker
stptn
6
6
aanbodsessie
A
A
Onderwijstalen
Nederlands
Trefwoorden
Recombinant DNA technologie, PCR, hybridisatie
Situering
In het opleidingsonderdeel recombinant DNA technologie wordt dieper ingegaan op de
moleculaire biologie. Vooral het complexe evenwicht die elke cel moet vinden om met
informatie (DNA) te gebruiken komt aan bod. In het laboratorium zal gebruik gemaakt
worden van restrictie-enzymen om gewenste stukken DNA (antibiotica-resistentie) in te
brengen in kleine circulaire DNA fragmenten gesplitst met hetzelfde enzym. DNA ligase
(een ander enzym) assembleert vervolgens het stukje DNA met de vector (plasmide).
Vervolgens wordt het plasmide getransformeerd in een bacteriecel (E.coli) en wordt tot
expressie gebracht. Ook PCR-technieken (vermenigvuldigen van DNA) komen aan bod
en wordt hun toepassing geïllustreerd met behulp van DNA uit speekselcellen.
Inhoud
Recombinant DNA-technologie Theorie
Moleculaire genetische technieken
Trancriptiecontrole van de genexpressie.
Post-transcriptie gen controle en nucleair transport
Signaal controle
Recombinant DNA-technologie Labo
- Introductie
- Zuivering en identificatie van plasmide DNA: Plasmide minipreparatie (via kit) en
restrictieanalyse van het gezuiverde plasmide
- Recombinantie van (antibiotica-resistente) genen (met restrictiefragmenten van
lambda (bacteriofaag))
- restrictie en ligatie (ev. + zuivering uit gel en ev. cippen van 5’fosfaatgroepen vector)
- Transformatie van E. coli (competente cellen) met recombinant DNA
- Zuivering en identificatie van het recombinant plasmide DNA
- Detectie van een Alu insertie polymorfism met PCR
- ev. PCR amplificatie van lambda DNA fragment, GMO detectie
- ev. Southern hybridisatie van lambda DNA: restrictie en elektroforese van lambda
DNA, southern transfer van lambda restrictiefragmenten, hybridisatie van lambda probe
(Goedgekeurd)
1
en niet-radioactieve probe detectie.
Begincompetenties
De student moet volgende OLOD's gevolgd hebben:
Biologie van de micro-organismen
Biomoleculen
Biochemie
Moleculaire celbiologie
Eindcompetenties
In staat zijn om blijvend kritisch, creatief en wetenschappelijk te denken en te
redeneren
In staat zijn om relevante wetenschappelijke en technische informatie adequaat te
verzamelen en te verwerken
In staat zijn om informatie, ideeën, problemen en oplossingen adequaat te
communiceren en te rapporteren zowel aan leken als aan specialisten
In staat zijn om problemen in teamverband adequaat te bespreken en op te lossen
In staat zijn om milieu-, kwaliteits- en veiligheidsbewust te handelen
In staat zijn om wetenschappelijk-disciplinaire inzichten zelfstandig en in teamverband
toe te passen op wetenschappelijke en/of ingenieurstechnische problemen
Kan in functie van de onderzoeksvraag relevante technische en wetenschappelijke
informatie opzoeken en verwerken
De student beschikt over een grondige kennis moleculaire biologie
De student kent enkele basisontwerptechnieken voor algoritmen
De student kan de waarde van een algoritme inschatten.
De student kent enkele standaard datastructuren die in de bio-informatica gebruikt
worden.
Creditcontractvoorwaarde
Toelating tot dit opleidingsonderdeel via creditcontract is mogelijk mits gunstige beoordeling
van de competenties
Examencontractvoorwaarde
Dit opleidingsonderdeel kan niet via examencontract gevolgd worden
Didactische werkvormen
Hoorcollege, practicum
Toelichtingen bij de didactische werkvormen
Theorie: hoorcollege 24 u
Het labo wordt tweewekelijks (6 uur) aangeboden en loopt over het volledige semester.
In groepjes van 2 wordt het practicum uitgevoerd.
Leermateriaal
Theorie: Molecular Cell Biology, Lodish (ISBN-13:978-1-4641-0981-2)
Practicum: Bloom, M.V., Freyer, G.A., Micklos, D.A., Laboratory DNA Science,
Benjamin Cummings, p. 371 (ISBN13: 9780805330403) Geraamde kostprijs: 73.09
euro.
Referenties
Theorie: zie referenties in de cursus
Vakinhoudelijke studiebegeleiding
De lesgever van de theorie is beschikbaar na de les en op afspraak op andere
momenten.
De lesgever van het lab is beschikbaar gedurende de labsessie, na de les en op
afspraak op andere momenten.
Evaluatiemomenten
periodegebonden en niet-periodegebonden evaluatie
Evaluatievormen bij periodegebonden evaluatie in de eerste examenperiode
Schriftelijk examen, mondeling examen
Evaluatievormen bij periodegebonden evaluatie in de tweede examenperiode
Schriftelijk examen, mondeling examen
Evaluatievormen bij niet-periodegebonden evaluatie
(Goedgekeurd)
2
Participatie, gedragsevaluatie op de werkvloer, verslag
Tweede examenkans in geval van niet-periodegebonden evaluatie
Examen in de tweede examenperiode is mogelijk
Toelichtingen bij de evaluatievormen
PE1 en PE2 bestaat uit een aantal vragen die kunnen worden schriftelijk voorbereid.
Gedurende het mondeling examen worden de antwoorden gecontroleerd en kunnen
bijkomend evragen worden gesteld.
Voor het laboratorium wordt verwacht dat er aan het labo wordt deelgenomen. Het
correct hanteren van de aangeleerde technieken wordt continu geëvalueerd. Er wordt
verwacht te kunnen werken in teamverband. Hetgeen in het labo aangeleerd werd,
moet worden verwerkt in een standaard operatie procedure, alsook de technieken
moeten worden gekaderd en de resultaten moeten worden verwerkt en verklaard met
behulp van beschikbare literatuur in de bibliotheek als op het internet.
Eindscoreberekening
Eindscore (op 20) = C1xP1 + C2xP2
Waarbij C1 en C2 de wegingcoëfficiënten zijn en P1 en P2 de punten (op 20) zijn van
respectievelijk PGE theorie, NPGE labo.
C1 = 0,6
C2 = 0,4
Algemeen geldt: Indien een student 3 maal onwettig afwezig is tijdens een labo, dan
krijgt hij een score AFW op het volledige opleidingsonderdeel.
Om te kunnen slagen voor het opleidingsonderdeel moet minstens 8/20 behaald
worden voor zowel PGE theorie als NPGE labo.
Is aan deze voorwaarde niet voldaan dan wordt er afgeweken van het berekende cijfer
indien dit 10 of meer is:
- Behaalt de student niet minder dan 7/20 voor zowel PGE theorie als NPGE labo, dan
wordt de eindscore 9/20.
- Behaalt de student minder dan 7/20 voor ofwel PGE theorie of NPGE labo., dan wordt
de eindscore het laagste cijfer van PGE of NPGE.
Tweede examenkans:
NPGE labo tweede examenkans = 60 % punten NPGE labo eerste examenkans + 40
% punten tweede examenkans. Die 40% wordt beoordeeld door een opdracht die
bestaat uit de verwerking en interpretatie van een geziene labo oefening.
Ook bij de tweede examenkans geldt:
Om te kunnen slagen voor het opleidingsonderdeel moet minstens 8/20 behaald
worden voor zowel PGE theorie als NPGE labo.
Is aan deze voorwaarde niet voldaan dan wordt er afgeweken van het berekende cijfer
indien dit 10 of meer is:
- Behaalt de student niet minder dan 7/20 voor zowel PGE theorie als NPGE labo, dan
wordt de eindscore 9/20.
- Behaalt de student minder dan 7/20 voor ofwel PGE theorie of NPGE labo., dan wordt
de eindscore het laagste cijfer van PGE of NPGE.
(Goedgekeurd)
3

Download Report