Slicer 3 チュートリアル SPLにおける腹部アトラス Ion-Florin Talos, M.D. Surgical Planning Laboratory -1- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 謝辞 NIH P41RR013218 (Neuroimage Analysis Center) NIH U54EB005149 (NA-MIC) Surgical Planning Laboratory -2- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 免責条項 • 使用者は添付ライセンス内の内容と関連法に遵守 してslicerを使用すること Surgical Planning Laboratory -3- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 使用するソフトウェア,データセット • Slicer 3(このチュートリアルではslicer3-3.0を使用) →http://www.slicer.org/pages/Special:SlicerDownloads • アトラスデータ →http://www.spl.harvard.edu/publications/item/view/1266 • CT画像 • ラベルマップ • 3Dモデル Surgical Planning Laboratory -4- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 学習目標 • アトラスデータの読み込み • 体内の独自の3Dviewの 製作と表示 Surgical Planning Laboratory -5- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital チュートリアルにおける必要条件 • Slicer Training データの読み込みと表示のチュートリアルを行うこと →http://wiki.na-mic.org/Wiki/index.php/Slicer:Workshops:User_Training_101 Surgical Planning Laboratory -6- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 要旨 • Part 1: 腹部アトラスデータの読み込み • Part 2:体内の独自の3Dviewの製作と表示 Surgical Planning Laboratory -7- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 腹部アトラスデータの読み込み • 解剖学的な濃淡値データ (CTやMRI等の画像データ) …………………. • MRMLシーン …………………………. • 3Dモデル……………………………… • ラベルマップ…………………………… Surgical Planning Laboratory -8- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital アトラスデータの読み込み Fileメニューより,Load Sceneを選択. ポップウィンドウにおいて, Abdominal_Atlas2008.mrmlを 選択し, Openをクリック. Surgical Planning Laboratory -9- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital アトラスデータの読み込み 3Dモデル ラベルマップで オーバーレイされた CT画像 Surgical Planning Laboratory -10- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 要旨 • Part 1: 腹部アトラスデータの読み込み • Part 2:体内の独自の3Dviewの製作と表示 Surgical Planning Laboratory -11- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 独自の3Dviewの製作 Modelsモジュールのvisibilityより,3D モデルが各構造毎に表示するかどう かを選択できることから,独自の体内の 3Dviewを製作することが可能. Surgical Planning Laboratory -12- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 独自の3Dview Surgical Planning Laboratory -13- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 独自の3Dviewの製作(1) Modulesより,Modelsモジュールを選択. Hierarchy & Displayタブを開く Model Display欄より,Select Model or Hierarchyにおいて,モデ ルを選択し,そのモデルを3DViewer 内で表示したいならば,Visibilityの チェック欄にチェックを入れる. (チェックを入れなければ,表示されない) Surgical Planning Laboratory -14- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 独自の3Dviewの製作(2) Modulesより,Dataモジュール を選択. Create Scene Snapshotをクリッ クし,ポップアップウィンドウにおい て,独自の3Dviewの名前を記入. (例：Portal Circulation) Surgical Planning Laboratory -15- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 独自の3Dviewの製作(3) •Scene Snapshotの右側の欄をク リックすると,これまでに作成したス ナップショットのデータファイル名も 出てくるので,そこから選ぶことも可 能である. •保存ファイル名が決定すれば ,Restoreをクリック. Surgical Planning Laboratory -16- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 補足(1) • スライド14~16に関しては,slicer3-3.0バージョンに おけるスナップショット方法である. • Slicer3-3.0以降のもの(3.2や3.4等)では上記のス ナップショット方法と異なる. • 3.2,3.4バージョンにおけるスナップショット方法を説 明する. Surgical Planning Laboratory -17- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 補足(2) Surgical Planning Laboratory -18- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 補足(3) Surgical Planning Laboratory -19- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 補足(4) Surgical Planning Laboratory -20- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital 翻訳 スライド翻訳：木西 基 ** 監守：波多 伸彦 * * Surgical Plannninng Laboratory, Harvard Medical School ** 知的画像処理研究室, 立命館大学 Surgical Planning Laboratory -21- http://www.slicer.org Brigham and Women’s Hospital
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