NeoPrep™用 TruSeq® Stranded mRNA

Data Sheet: RNA Sequencing
NeoPrep ™用 TruSeq® Stranded mRNA
ライブラリー調製キット
簡単なワークフロー、少ない必要インプット量、優れた再現性で、トランスクリプトームを完全解析
特長
• シンプル、シームレスなワークフロー
NeoPrep のワークフローには、装置内での定量および
ノーマライゼーションが含まれ、すぐにシーケンスできる
ライブラリーを調製
• 比類の無いパフォーマンスと再現性
TruSeq Stranded mRNA キットと同じカバレッジおよび
品質を持つライブラリーを最小限のハンズオン時間で作
製、ユーザー間のばらつきも低減
• 少ない必要インプット量
最少 25ng のトータル RNA からライブラリーを調製
デジタルマイクロフルイディクス技術は、厳重にコントロールさ
れた環境下で液滴を正確に制御し、定量およびノーマライゼー
ションを含めたライブラリー調製の全ワークフローを実行します
（図 1）。
少量のインプットから高品質なライブラリー
NeoPrep システムは、わずか 25ng のトータル RNA から、マニュ
アルの TruSeq Stranded mRNA と同じ信頼性およびパフォー
マンスのライブラリーを調製します。必要インプット量が少なく
なったことで、TruSeq 品質のデータをこれまでよりも幅広い
アプリケーションおよび実験デザインにご利用いただけるようにな
りました（図 2）。
表 1：作業効率比較
TruSeq Stranded mRNA と同品質の
ライブラリー調製が簡単に
TruSeq Stranded mRNA ライブラリー調製キットは、業界をリード
する、実績豊富なライブラリー調製法であり、明瞭かつ網羅的に
コーディングトランスクリプトーム像を捉えます。その TruSeq
Stranded mRNA ケミストリーが、NeoPrep ライブラリー調製
システムで使用できるようになりました。 NeoPrep システムは、
イルミナの全てのシーケンサープラットフォームに対応したライブ
ラリー調製のためのソリューションであり、ライブラリー調製がこ
れまでよりもはるかに容易になります。 NeoPrep システムではマ
ニュアル操作がほとんどなく、ハンズオン時間は 4.5 時間から
30 分に短縮されており、1 ランにつき定量およびノーマライゼー
ション済みですぐにシーケンスできる 16 サンプルのライブラリー
を調製します（表 1）。
マニュアル
NeoPrep
試薬キット
TruSeq Stranded
mRNA Library Prep
Kit
TruSeq Stranded
mRNA Library Prep
Kit for NeoPrep
インプット量
100~1000ng
25~100ng
ライブラリー調製アッセイ
時間 a
約 9 時間
約 8 時間
ハンズオン時間 b
約 4.5 時間
30 分
ライブラリー定量用の
機器
Qubit
必要なし
a. トータル RNA からスタートして増幅までのライブラリー調製時間です。定量および
ノーマライゼーションを含めると、
NeoPrep のアッセイ時間は約 10.5 時間になります。
b. 16 ライブラリーの調製からノーマライゼーションまでを行う場合のハンズオン時間
です。
完結した、シームレスなワークフロー
NeoPrep の優れた再現性と正確性で
RNA シーケンスの性能を向上
デジタルマイクロフルイディクス技術の採用により、NeoPrep シス
テムは TruSeq Stranded mRNA のパフォーマンスを向上させ、
複数のユーザーが使用した場合でも高い一貫性が得られます。
NeoPrep システムは、トータル RNA から始めてデータを得るま
での完全なワークフローソリューションの一部です。クリックする
だけの BaseSpace コアアプリによるデータ解析と共に、NeoPrep によるライブラリー調製は、完全な RNA シーケンスソリュー
ションの一翼を担い、次世代シーケンスの経験の多少に関わらず
あらゆるお客様の研究にお役立ていただけます。
ハンズオン
時間合計
マニュアル
cDNA 合成
A テール
ライゲーション
増幅
定量
ノーマライゼーション
NeoPrep
NeoPrep
システムへの
ローディング
NeoPrep システムによる処理
すぐに
シーケンスできる
ライブラリーの回収
すぐに
シーケンスできる
ライブラリーの回収
約
4.5 時間
30 分
図 1：TruSeq Stranded mRNA のマニュアル操作および NeoPrep によるライブラリー調製ワークフローマニュアルおよび NeoPrep によるワークフローはトータル
RNA からスタートします。約 4.5 時間のハンズオン時間が NeoPrep システムでは 30 分へと大幅に短縮されています。
Data Sheet: RNA Sequencing
まとめ
詳しい情報
NeoPrep 用の TruSeq Stranded mRNA ライブラリー調製キット
は、実績ある TruSeq ケミストリーの性能と、一体型で安定性の
高い NeoPrep ライブラリー調製システムがひとつになった製品
です。 NeoPrep システムを使用して調製したライブラリーは、
イルミナの全ての次世代シーケンサーでシーケンス可能であり、
RNA 用の BaseSpace コアアプリと合わせて、シームレスなワー
クフローを実現します。業界をリードするイルミナのサービスチー
ムが全ステップでサポートいたします。低価格な NeoPrep シス
テムおよびキットにより、つきっきりでいる必要なく、ライブラリー
NeoPrep システムの詳細については
www.illuminakk.co.jp/neoprep をご覧ください。
表 2：製品情報
キット
TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit for NeoPrep
（16 Samples, 24 Indexes）
調製が可能になります。
NeoPrep Library Prep System（設置を含む）
B
25
25ng
ng--NeoPrep
NeoPrep
25ng - NeoPrep
25
25ng
ng--NeoPrep
NeoPrep
100
100ng
ng--Manual
Manual
100
100ng
ng--Manual
Manual
100ng - マニュアル
2
2
R
R
R2 =
= 0.98
0.98
R2 =
= 0.98
0.98
25
25
25 ng
ng -- NeoPrep
NeoPrep
25 ng
ng -- NeoPrep
NeoPrep
100
ng
Manual
ng
-- Manual
100100ng
ng --100
100
Manual
ng
Manual
- マニュアル
25ng - NeoPrep
1
1
0.8
0.8
0.6
0.6
0.4
0.4
0.2
0.2
0
0
2
2
R
R
= 0.998
0.998
= 0.998
0.998
R2 =
R2 =
1
1
0.8
0.8
Manual
Manual
ng)
(100
ng)
マニュアル（
100ng
Manual (100
(100
Manual
ng)
(100）
ng)
0.6
0.6
NeoPrep
25
25
（ng)
NeoPrep
25ng((）
NeoPrep (( NeoPrep
NeoPrep
25
ng)
25 ng)
ng)
0.4
0.4
0.2
0.2
0
0
0
0
0
20
020
20
40
2040
40
60
4060
60
80
6080
80
100
80
100
25
25ng
ng--Replicate
Replicate11
1.2
1.2
25ng - 反復 1
1.2
1.2
Across
Transcripts
Transcripts
Across Across
Across
Transcripts
Transcripts
Gene
Gene
Measurement
Measurement
Across
Gene Abundance
Abundance
Gene Abundance
Abundance
Measurement
Measurement
Across Across
Across
Technical
Technical
Replicates
Replicates
(FPKM) (FPKM)
Technical
Technical
Replicates
Replicates
(FPKM) (FPKM) FPKM）
技術的反復試験における発現量測定値（
25
25ng
ng--Replicate
Replicate11
1.4
1.4
Coverage
Coverage(Normalized)
(Normalized)
カバレッジ
（ノーマライゼーション後）
Coverage
Coverage(Normalized)
(Normalized)
D
Uniformity
Uniformity
of
of
Uniformity
Uniformity
of Coverage
Coverage
of Coverage
Coverage
転写産物におけるカバレッジ均一性
1.4
1.4
SE-601-1001
Differentially
Differentially
Expressed
Expressed
Genes Detected
Detected
Genes Detected
Detected
発現に差があった遺伝子
Differentially
Differentially
Expressed
Expressed
Genes
Genes
2
R22 =
R
R
R2 =
= 0.97
0.97
= 0.97
0.97
C
NP-202-1001
システム
Concordance
Concordance
in
in
Measurements
(FPKM)
Concordance
Concordance
in Abundance
Abundance
in Abundance
Abundance
Measurements
Measurements
(FPKM) (FPKM)
(FPKM)
発現量測定値の一致（
）
FPKMMeasurements
A
カタログ番号
100
100
25
25
1
1
25 ng
ng -- Replicate
Replicate
25 ng
ng -- Replicate
Replicate
1
1
Normalized
Normalized
Position
Along
Along
(5'
Normalized
Normalized
PositionPosition
Position
Along Transcript
Transcript
Along Transcript
Transcript
(5' to
to 3')
3')(5'
(5' to
to 3')
3')
25ng - NeoPrep 転写産物長に合わせて
ノーマライズした塩基位置（5′
側から 3′
側）
25ng - 反復 1
図 2：NeoPrep およびマニュアルによるライブラリー調製法 NeoPrep 用 TruSeq Stranded mRNA キットは、マニュアルキットと同等のパフォーマンスを示します。
A）NeoPrep mRNA（25ng）とマニュアル（100ng）の比較、UHRR サンプル、15986 遺伝子；R2 = 0.97
B）NeoPrep（25ng）およびマニュアル（100ng）における、UHRR/脳組織の Log2 倍率変化、UHRR サンプルと脳組織の比較、15765 遺伝子；R2 = 0.98
C）転写産物全体におけるカバレッジ均一性 - NeoPrep mRNA（25ng）、マニュアル（100ng）
D）NeoPrep mRNA（25ng）における技術的反復試験の相関 - UHRR サンプル、16092 遺伝子；R2 = 0.998001
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Pub. No. 770-2014-J020 01MAY2015

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