ClearSeq カタログはこちら - アジレント・テクノロジー株式会社

疾患リサーチ向け NGS ターゲットエンリッチメントパネル
ClearSeq 疾患リサーチ用 NGS ターゲットエンリッチメントパネル
ClearSeq シリーズは、疾患リサーチ用の NGS ターゲットエンリッチメントパネルです。アジレントの定評ある 3 つのターゲッ
トエンリッチメントシステムをベースに製品を展開しています。
HaloPlex HS をベースとした
ClearSeq HaloHS パネル
HaloPlex をベースとした
ClearSeq Halo パネル
SureSelect をベースとした
ClearSeq SS キャプチャライブラリ
がん研究、体質性疾患研究に向けたリサーチパネルを、各研究分野の第一人者とのコラボレーションで開発し、カタロ
グ製品および受注生産製品として提供しています。各疾患に関連したターゲットに絞り込んだ解析を効率よく行うこと
が可能です。
ClearSeq のベースとなる 3 つのターゲットエンリッチメントシステム
HaloPlex HS ターゲットエンリッチ
メントシステムは、DNA 1 分子に
1 種類の分子バーコードを付加す
ることで、異なる DNA 分 子由来
のリードと、PCR duplicate 由来のリードを識別することができる、画期的なシステムで
す。ランダムエラーを排除してより高い正確性が得られ、また存在頻度の低い変異
(0.5%
まで)を検出することができるようになりました。制限酵素による断片化とハイブリダ
イゼーション、PCR を組み合わせた独自の方式により、非常に特異性高くキャプチャす
ることが可能で、より小さなサイズのターゲットキャプチャ(500 kb 以下)での Deep
sequencing に強みを発揮します。また、スタート DNA 量は 58 ng と微量なので、サンプ
ル量が限られる場合にも適しています。
HaloPlex HS
HaloPlex HS
変異
TARGET
!
HaloPlex
SureSelect
ラリとして使 用し、ハイブリダイ
ゼーションによりゲノム DNA または cDNA からターゲット領域をキャプチャするテクノ
ロジーです。ゲノム DNA サンプルは、ClearSeq SS キャプチャライブラリと試薬キット
(SureSelect XT, SureSelect QXT, 他社ライブラリ調製試薬との組み合わせ用)を選択して
使用します。RNA サンプルは、ClearSeq SS キャプチャライブラリと SureSelect XT RNA
Reagents を組み合わせて使用します。
DNA キャプチャ用試薬キットの特長
SureSelect XT:もっとも高いキャプチャ性能をもつ試薬キット。がんに代表される、
サンプルの複雑性を維持してライブラリ調製をする必要がある場合に適しています。
gDNA 3 µ g でスタートするプロトコルと、200 ng でスタートするプロトコルがあります。
SureSelect QXT:トランスポゼースを使用して DNA の断片化とタグ付加を同時に行う
試薬キット。50 ng の微量 DNA からスタートしてトータル 7 時間でライブラリが完成
エラーは
除去された
ターゲット領域を複数のアンプリコンでカバー。各アン
プリコンは分子バーコードを利用したコンセンサス配列
を使用して PCR Duplication とランダムエラーを除去
● 変異検出の信頼性が飛躍的に向上
HaloPlex タ ー ゲ ット エ ン リッ チ
メントシステムは、HaloPlex HS の
ベースとなるテクノロジーで す。
ターゲット領域を複数のアンプリ
コンでカバーする独自のデザインにより、信頼性高く変異を同定することができます。
HaloPlex HS と同様にキャプチャの特異性が高いため、より小さいサイズのターゲット
キャプチャに適しています。スタート DNA 量は 225 ng です。Deep sequencing を必要と
せず、germ line 変異を検出する場合などに適しています。
SureSelect ター ゲットエンリッチ
メントシステムは、120 mer のビ
オチン化 RNA をキャプチャライブ
変異
HaloPlex
変異
変異
TARGET
?
これは
マイナーな
変異 ? エラー ?
ターゲット領域を複数のアンプリコンでカバー
● 変異検出の信頼性が向上
● ただし、ひとつのアンプリコンのみで検出された 変
異については、PCR Duplication か頻 度の 低い 変 異か
区別できない
SureSelect
gDNA もしくは
mRNA を目的
サイズに断片化
ライブラリ調製
+
+
ビオチン化 RNA
プローブライブラリ
アダプタ付き
DNA 断片
溶液中で 16 時間( XT )
もしくは1.5 時間(QXT )
ハイブリダイゼーション
ストレプトアビジン
磁性ビーズ
+
します。速さと簡便さが求められる場合に適しています。
他社ライブラリ調製試薬との組み合わせ用:KAPA 社のライブラリ調製試薬と組み合
わせることで、品質の高い DNA であれば 10 ng という超微量からターゲットエンリッ
チメントを行うことができます。また、FFPE 由来の DNA でも 50 – 200 ng のスタート
量で良好な結果が得られます。サンプル量が非常に少ない場合や、FFPE サンプルの
2
量が限られる場合に適しています。
キャプチャされた DNA を
オンビーズ PCR 増幅
サイズ確認と定量後
シーケンシングへ
ClearSeq 製品一覧
ClearSeq Halo HS
●
製品名
ターゲットサイズ
ClearSeq Halo HS Cancer リサーチパネル
10 kb
ClearSeq Halo HS 心筋症リサーチパネル
208.4 kb
ClearSeq Halo HS 遺伝性結合組織病リサーチパネル *
143 kb
ClearSeq Halo HS 遺伝性不整脈関連疾患リサーチパネル *
83 kb
ClearSeq Halo HS ヌーナン症候群リサーチパネル *
Ion PGM
463 kb
ClearSeq Halo HS X 染色体パネル *
3.2 Mb
ClearSeq Halo
Ion PGM
イルミナ(NSQ 除く)
イルミナ(NSQ 除く)
Ion PGM
イルミナ(NSQ 除く)
Ion PGM
イルミナ(NSQ 除く)
Ion PGM
イルミナ(NSQ 除く)
ターゲットサイズ
ClearSeq Halo Cancer リサーチパネル
10 kb
ClearSeq Halo AML リサーチパネル
23.7 kb
ClearSeq Halo 心筋症リサーチパネル
208.4 kb
ClearSeq Halo 遺伝性結合組織病リサーチパネル *
143 kb
ClearSeq Halo 遺伝性不整脈関連疾患リサーチパネル *
83 kb
ClearSeq Halo ヌーナン症候群リサーチパネル *
ClearSeq Halo ICCG パネル *
463 kb
ClearSeq Halo X 染色体パネル *
3.2 Mb
型番 48 反応
対応シーケンサ
イルミナ
型番 16 反応
G9903A
G9904A
G9913A
G9914A
G9908A
G9909A
イルミナ
Ion PGM
イルミナ
Ion PGM
イルミナ
型番 48 反応
製品名
イルミナ
Ion PGM
イルミナ
Ion PGM
イルミナ
Ion PGM
イルミナ
ターゲットサイズ
0.79 Mb
10.5 Mb
ClearSeq SS DNA Kinome キャプチャライブラリ
3.2 Mb
ClearSeq SS RNA Kinome キャプチャライブラリ
3.2 Mb
G9933B
G9934B
G9943B
G9944B
G9954B#008
G9954B#001
G9954B#005
G9954B#003
G9954B#009
G9954B#002
G9954B#006
G9954B#004
G9954B#007
対応シーケンサ
イルミナ
イルミナ
イルミナ
型番 16 反応
Ion Proton
イルミナ
型番 96 反応
G9953C#008
G9953C#001
G9953C#005
G9953C#003
G9953C#009
G9953C#002
G9953C#006
G9953C#004
G9953C#007
Ion PGM
ClearSeq SS ターゲットキャプチャライブラリ ClearSeq SS 用の試薬キットと組み合わせて使用します。
ClearSeq SS Comprehensive Cancer キャプチャライブラリ
ClearSeq SS 遺伝性疾患リサーチ キャプチャライブラリ
型番 96 反応
品名に * がつくものは受注製造品です。48 反応、96 反応キットは自動化にも対応。
Ion PGM
41 kb
品名に * がつくものは受注製造品です。
G9954C#008
G9954C#001
G9954C#005
G9954C#003
G9954C#009
G9954C#002
G9954C#006
G9954C#004
G9954C#007
Ion PGM
●
製品名
G9934A
G9943A
G9944A
イルミナ(NSQ 除く)
41 kb
ClearSeq Halo HS ICCG パネル *
対応シーケンサ
型番 16 反応
イルミナ(NSQ 除く)
G9933A
G9903B
G9904B
G9913B
G9914B
G9908B
G9909B
G9953B#008
G9953B#001
G9953B#005
G9953B#003
G9953B#009
G9953B#002
G9953B#006
G9953B#004
G9953B#007
型番 48 反応
型番 96 反応
5190-4646
5190-4647
5190-4648
5190-4801
5190-4802
5190-8011
5190-7518
5190-8012
5190-7519
5190-8013
5190-7520
ClearSeq SS 用の試薬キット
SureSelect XT DNA キャプチャ試薬キット
製品名
SureSelect XT Reagents
SureSelect Target Enrichment Reagents
対応シーケンサ
型番 16 反応
イルミナ HiSeq, NextSeq
G9611A
イルミナ MiSeq
G9612A
ABI 5500 SOLiD
G9615A
G9611B
G9612B
G9615B
LT Ion Proton
G9605A
G9605B
対応シーケンサ
イルミナ HiSeq, MiSeq
型番 16 反応
型番 96 反応
イルミナ NextSeq
G9683A
SureSelect QXT DNA キャプチャ試薬キット
製品名
SureSelect QXT Reagents
型番 96 反応
G9681A
G9681B
G9683B
他社ライブラリ調製試薬(KAPA 等)との組み合わせ用 試薬キット
製品名
SureSelect TE plus Adapter TPFD-KB(KAPA 等)
対応シーケンサ
イルミナ
SureSelect XT RNA キャプチャ試薬キット
製品名
SureSelect XT RNA Reagents
対応シーケンサ
イルミナ
型番 96 反応自動化用
G9641B
G9642B
型番 96 反応自動化用
お問い合わせください
型番 96 反応自動化用
型番 16 反応
型番 96 反応
型番 96 反応自動化用
G9692B
備考
お問い合わせください
型番 96 反応
G9692A
ライブラリ調製試薬を
含む
ライブラリ調製試薬を
含まない
型番 16 反応
931171
備考
NextSeq 500 v1 キット
対応
931182
お問い合わせください
3
ClearSeq がん研究用パネル
ClearSeq Halo HS/Halo Cancer リサーチパネル
ClearSeq HaloHS/Halo Cancer リサーチパネルは既知のがんホット
スポットにおける遺伝子変異を網羅的に検出するためにデザ
インされたパネルです。これまでの研究により各種がんとの関
連性や、薬剤ターゲットとの関連性が報告されている 47 遺伝
子のホットスポットをターゲットとしています。デザインのプロ
セスで主な参照データベースとして COSMIC を用いています。
ClearSeq HaloHS/Halo Cancer リサーチパネルは、ホルマリン固
定 / パラフィン包埋(FFPE)組織として保存されているサンプ
ル由来の DNA を使用しても高いカバレッジが得られるように
設計されています。
●
●
100 bp 以下の短い DNA 断片もキャプチャできるデザインにする
ことで、FFPE サンプルのような断片化した DNA を使用しても高
いカバレッジが得られます。
DNA の両鎖をキャプチャするデザインなので、ホルマリン固定に
よるシトシンからチミンへの置換と、検体由来の変異を区別する
ことが可能です。
●
ClearSeq HaloHS / Halo Cancer リサーチパネル遺伝子リスト
固形腫瘍、血液がん、アクショナブルな変異がターゲット
ABL1
AKT1
ALK
AR
ATM
BRAF
CDKN2A
CSF1R
CTNNB1
EGFR
ERBB2
ERBB4
FANCA
FANCC
FANCF
FANCG
FGFR1
FGFR2
FGFR3
FLT3
HRAS
IDH1
IDH2
JAK2
JAK3
KIT
KRAS
MAP2K1
MAP2K2
MAP2K4
MET
NOTCH1
NPM1
NRAS
PDGFRA
PIK3CA
PIK3R1
PTEN
RET
RUNX1
SMAD4
SMO
SRC
STK11
TP53
VHL
WT1
HaloPlex HS、HaloPlex 対応
ClearSeq Halo AML リサーチパネル
ClearSeq Halo AML リサーチパネルはスタンフォード大学の Dr.
Robert Ohgami と Dr. Daniel Arber とのコラボレーションにより開
発されたパネルで、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症
候群(MDS)、骨髄増殖性腫瘍(MPN)で高頻度に変異がみつ
かる 20 遺伝子の該当するエクソンを対象としています。
ClearSeq Halo AML リサーチパネルは、重要な変異を見逃さな
いようにターゲット領域の 90% 以上が 20x 以上の depth でカ
バーされるようにデザインされています。また、HaloPlex の特
長である、ターゲット領域を複数のアンプリコンでカバーする
ClearSeq Halo AML リサーチパネルの
ターゲットエクソン
ASXL1
CSF3R
CBL
CEBPA
DNMT3A
EZH2
FLT3
IDH1
IDH2
JAK2
12
14, 17
8, 9
1
4, 8, 13, 15, 16, 18
19, 20, 22, 23
8, 17, 18
14, 20
4
4
12, 14
MPL
NPM1
NRAS
RUNX1
SETBP1
10
11
2, 3
3, 4, 8
3
SF3B1
SRSF2
TET2
TP53
U2AF1
13–15, 17
1
3, 9, 10, 11
5–8
2, 6
ことにより、ほかの PCR ベースの方法と比較して感度、正確性
が高く、偽陽性を除外することができます。
FFPE サンプルには対応していません。
●
HaloPlex 対応
ClearSeq Halo Cancer リサーチパネルの
パフォーマンス
ClearSeq Halo AML リサーチパネルの
パフォーマンス
ClearSeq Halo Cancer リサーチパネル
4
イルミナ MiSeq 分析結果。
Uniformity は平均カバレッジの 10% にあたるカバレッジとなる塩基として計算。
イルミナ MiSeq 分析結果。
高い Specificity, Coverage を達成
ClearSeq SS Comprehensive Cancer キャプチャライブラリ
ワシントン大学セントルイス校との共同開発製品。幅広いがん種(乳がん、肺がん、大腸癌、AML)に関連する 151 の重要ながん
関連遺伝子を網羅しています。キャプチャの均質性が高く、深いカバレッジのシーケンスで信頼性の高い変異検出を行うこと
ができます。
●
●
●
パネルサイズ 0.79 Mb
コーディングエクソンおよびエクソン・イン
トロン境界から最大 200 bp までの部位
一部のイントロン * は CNV と構造変化の
検出が可能なデザイン
●
主に固形がんに関連するターゲット
●
FFPE サンプル対応
●
SureSelect 対応
●
試薬キットは SureSelect XT もしくは KAPA
Hyper Prep との組み合わせ用を推奨
ClearSeq SS Comprehensive Cancer キャプチャライブラリのターゲット遺伝子
ABL1
BRCA1
EGFR
JAK2
MYC
PIK3CA
RUNX1
AKT1
BRCA2
ESR1
KRAS
MYD88
PTCH1
SMO
ALK *
CDKN2A
FGFR2
KIT
NF1
PTEN
STK11
APC
CEBPA
FLT3
MAP2K2
NOTCH1
PTPN11
TET2
ASXL1
CTNNB1
HRAS
MET
NPM1
NRAS
TP53
ATM
DNMT3A
IDH1
MPL
MTOR
RB1
VHL
BRAF
ERBB2
IDH2
IL2RB
PDGFRA
RET
WT1
ABCB1
CYP19A1
FBXW7
IL2RG
MLH1
ROS1
SMARCB1
ABCC2
CYP2A6
FGFR1
INPP4B
MST1R
RPS6KB1
SNCAIP
ABL2
CYP2B6
FGFR3
JAK1
NELL2
RXRA
SOS1
AKT2
CYP2C19
FGFR4
JAK3
PDGFRB
RXRB
SPRED1
AKT3
CYP2C9
FLT1
KDM6A
PHF6
RXRG
SRC
ATRX
CYP2D6
FLT4
KDR
PIK3R1
SHH
SUFU
CBL
DDR1
FSTL5
KMT2A *
PSMB1
SHOC2
TAS2R38
CDA
DDR2
GNA11
LAMA2
PSMB2
SLC22A1
TRRAP
CDH1
DDX3X
GNAQ
LCK
PSMB5
SLC22A2
TYK2
CDKN2B
DPYD
GNAS
LTK
PSMD1
SLC31A1
UGT1A1
CHD7
ERBB3
GSTP1
MAP2K1
PSMD2
SLC34A2
YES1
CHIC2
ERBB4
H3F3A
MAP2K4
RAF1
SLC45A3
ZMYM3
CREBBP
ERG
HNF1A
MAP3K1
RARA
SLCO1B1
CRLF2
ESR2
IKZF1
MAPK1
RARB
SMAD4
CSF1R
EZH2
IL2RA
MED13
RARG
SMARCA4
ClearSeq SS DNA Kinome キャプチャライブラリ
612 のキナーゼ遺伝子とがん関連遺伝子のコーディングエクソンと UTR
領域をターゲットにしたデザインです。キナーゼ遺伝子の変異と疾患の
関連の探索に威力を発揮します。
●
SureSelect 対応
ClearSeq SS RNA Kinome キャプチャライブラリ
ClearSeq SS DNA/RNA Kinome のコンテンツ
カテゴリー
Protein Kinases
PI3K domain proteins
Diglyceride kinases
PI3K regulatory components
Inositol polyphosphate kinases
PIP4/PIP5 kinases
Cancer genes
遺伝子数
517
12
13
6
9
9
46
ClearSeq SS DNA Kinome と同じ遺伝子のコーディングエクソンと UTR 領
域をターゲットにし、RNA を解析対象とするキャプチャライブラリです。
発現しているキナーゼ遺伝子の変異解析や、融合遺伝子の探索に適して
います。
●
SureSelect 対応
ClearSeq SS Comprehensive Cancer FFPE
サンプルへの適用例
乳がんおよび肺がんの新鮮凍結 (FF) 検体とホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE)
検体を、ClearSeq SS Comprehensive Cancer リサーチパネルと SureSelect XT 試薬を
用いて解析した結果です。
1 検体あたりのシーケンス量は 240 Mb です。
それぞ れの 検 体 の DNA の 分 解 度 は、2200 TapeStation で 測 定した DNA Integrity
Number (DIN)で示されています。分解のある程度進んだ FFPE 検体においても良
好なカバレッジが得られています。
% On-Target ± 100bp
10X Coverage
50X Coverage
% Duplicates
20X Coverage
5
ClearSeq 体質性疾患 研究用パネル
ClearSeq Halo HS/Halo 心筋症リサーチパネル
ClearSeq Halo HS/Halo 心筋症リサーチパネルは、遺伝性心筋症
の研究のために設計されたパネルです。心筋症に関する文献や、
NIH のオンラインリソースである GeneReview の情報の詳細な
検討に基づき、肥大型心筋症、拡張型心筋症、不整脈原性右
室心筋症に関連することが知られる 34 遺伝子のコーディング
エクソンが含まれています。
●
HaloPlex HS, HaloPlex 対応
ClearSeq Halo HS/Halo 心筋症
リサーチパネル遺伝子リスト
TTR
MYL2
MYL3
MYOZ2
NEXN
MYH6
MYH7
MYBPC3
TNNT2
ACTC1
TNNI3
TPM1
TTN
ACTN2
CSRP3
PLN
TNNC1
TCAP
DES
LMNA
SGCD
VCL
LDB3
ABCC9
SCN5A
TAZ
RBM20
TGFB3
DSP
PKP2
DSG2
DSC2
TMEM43
JUP
ClearSeq Halo HS/Halo 遺伝性不整脈関連心疾患リサーチパネル
ClearSeq Halo HS/Halo 遺伝性不整脈関連心疾患リサーチパネル
は、4 種類の遺伝性不整脈心疾患に関連することが知られる
遺伝子をターゲットとするパネルです。パネルの開発にあたっ
ては、不整脈に関する文献や NIH リソースである GeneReviews
の情報を詳細に検討し、QT 延長症候群、QT 短縮症候群、ブル
ガダ症候群、カテコールアミン誘発性多形性心室性頻拍との
関連性が知られている 19 遺伝子のコーディングエクソンを選
択しています。
ClearSeq Halo HS/Halo 遺伝性不整脈関連心疾患
リサーチパネル遺伝子リスト
KCNQ1
KCNH2
KCNJ2
ANK2
KCNE1
KCNE2
CACNA1C
CAV3
SCN4B
AKAP9
SNTA1
SCN5A
GPD1L
CACNB2
SCN1B
KCNE3
SNC3B
RYR2
CASQ2
各種の不整脈に関連する遺伝子は重複しているケースもあり、
ClearSeq 遺伝性不整脈関連心疾 患リサーチパネルを使うこと
で、臨床研究サンプルについて関連する遺伝子の網羅的な変
異プロファイルを得ることができます。
●
HaloPlex HS, HaloPlex 対応
●
受注製造品
ClearSeq Halo HS/Halo ヌーナン症候群リサーチパネル
ClearSeq Halo HS/Halo ヌーナン症候群リサーチパネルは、公開
されている文献や NIH リソースである GeneReviews の情報に基
づいて設計されたパネルです。ヌーナン症候群、LEOPARD 症
候群、CFC 症候群、コステロ症候群に関連することが知られる
遺伝子のコーディングエクソンを対象にしたデザインです。
6
●
HaloPlex HS, HaloPlex 対応
●
受注製造品
ClearSeq Halo HS/Halo ヌーナン症候群
リサーチパネル遺伝子リスト
BRAF
CBL
HRAS
MAP2K1
SPRED1
MAP2K2
NRAS
PTPN11
KRAS
RAF1
SHOC2
SOS1
NF1
ClearSeq Halo HS/Halo 遺伝性結合組織病リサーチパネル
ClearSeq Halo HS/Halo 遺伝性結合組織病リサーチパネルは、マ
ルファン症候群、エーラース・ダンロス症候群、ロイスディー
ツ症候群、胸部大動脈瘤および解離(TAAD)、スティックラー
症候群、骨形成不全症、その他の関連疾患に関連する 40 遺伝
子のコーディングエクソンをターゲットとしています。
●
HaloPlex HS, HaloPlex 対応
●
受注製造品
ClearSeq Halo HS/Halo ICCG パネル
ICCG(International Collaboration for Clinical Genomics)は、以前は
ISCA(International Standards for Cytogenomic Arrays)と呼ばれて
いた組織です。ClearSeq Halo HS/Halo ICCG パネルでは、ICCG の
定義する 178 の遺伝子のコーディングエクソンがターゲットと
なっています。デザインや解像度に関する ICCG 推奨事項にも
ClearSeq Halo HS/Halo 遺伝性結合組織病
リサーチパネル遺伝子リスト
AMPD1
LMNA
SEPN1
TPM3
ACTA1
POMGNT1
AN05
PYGM
TNNI2
CAPN3
CAV3
CHKB
LARGE
COL6A1
COL6A2
DES
DYSF
COL6A3
EMD
DMD
FHL1
ITGA7
ISPD
SGCE
LAMA2
POMT2
SGCA
TCAP
SGCB
TPM2
FKTN
POMT1
TRIM32
FKRP
TNNT1
MYOT
SGCD
SIL1
PLEC
SGCG
ClearSeq Halo 体質性疾患リサーチパネルの
パフォーマンス
準拠しています。
●
HHaloPlex HS, HaloPlex 対応
●
受注製造品
ClearSeq Halo HS/Halo X 染色体パネル
ClearSeq Halo HS/Halo X 染色体パネルは、X 染色体上の遺伝子
のコーディングエクソンと UTR 領域をターゲットとしています。
X 染色体に連鎖する、様々な遺伝性疾患の解析に対応したデザ
インです。
●
HaloPlex HS, HaloPlex 対応
●
受注製造品
ClearSeq Halo 遺伝性不整脈関連心疾患
ClearSeq Halo ICCG パネル
リサーチパネル
ClearSeq Halo ヌーナン症候群
ClearSeq Halo X 染色体パネル
リサーチパネル
ClearSeq Halo 遺伝性結合組織病
リサーチパネル
イルミナ MiSeq 分析結果。
Uniformity は平均カバレッジの 10% にあたるカバレッジとなる塩基として計算。
ClearSeq SS 遺伝性疾患リサーチキャプチャライブラリ
既 知 の 約 4000 の 遺伝 性 疾 患に関 連 する遺伝 子 2742 のコー
ディングエクソンをターゲットとしたデザインです。
ClearSeq SS 遺伝性疾患リサーチの
パフォーマンス
シャリテ・ベルリン医科大学との共同開発です。このキャプチャ
ライブラリを用いることで、Exome よりも少ないデータ量で、
効率よく遺伝性疾患の原因遺伝子を同定できることが報告さ
れています。
Effective diagnosis of genetic disease by computational phenotype
analysis of the disease-associated genome Science Translational
Medicine, 6, 242ra123(2014)
●
パネルサイズ 10.5 Mb
●
1 サンプルあたり 1 Gb のシーケンス量で、88% の領域で x20 以
上のカバレッジ
●
MiSeq 1 ランで Trio 解析が可能
●
コーディングエクソン領域をターゲット
●
SureSelect 対応
8
10
NA
31
5
18
NA
1X
07
8
3
1
7
6
5
15
15
87
99
89
95
12
12
12
12
18
18
NA
NA
NA
NA
NA
NA
10X
20X
SureSelect XT 試薬キットを使用。
1 サンプルあたり 1 Gb のシーケンス量を取得した場合のカバレッジ。
7
販売店
[ お問い合わせ窓口 ]
アジレント・テクノロジー株式会社
本社 / 〒 192-8510 東京都八王子市高倉町 9-1
●カストマコンタクトセンタ 0120-477-111
mail:email_ [email protected]
※仕様は予告なく変更する場合があります。
※本資料掲載の製品は全て研究用です。
その他の用途にご利用いただくことはできません。
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Printed in Japan, May. 25, 2015
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