UNIVERSITE DE BORDEAUX Référence GALAXIE : 29

UNIVERSITE DE BORDEAUX
Numéro dans le SI local :
Référence GESUP :
Corps :
Article :
Chaire :
Section 1 :
Section 2 :
Section 3 :
Profil :
Job profile :
Research fields EURAXESS :
Implantation du poste :
Localisation :
Code postal de la localisation :
Etat du poste :
Adresse d'envoi du
dossier :
Contact
administratif :
N° de téléphone :
N° de Fax :
Email :
Date de prise de fonction :
Mots-clés :
Profil enseignement :
Composante ou UFR :
Référence UFR :
Profil recherche :
Laboratoire 1 :
Laboratoire 2 :
Laboratoire 3 :
Laboratoire 4 :
Laboratoire 5 :
Dossier Papier
Dossier numérique physique (CD,
DVD, clé USB)
Dossier transmis par courrier
électronique
Application spécifique
Référence GALAXIE : 29
0681
0681
Maître de conférences
26-I-1
Non
64-Biochimie et biologie moléculaire
65-Biologie cellulaire
Microbiologie et biologie de synthèse
Microbiology and synthetic biology
Biological sciences Biology
Biological sciences Biological engineering
0333298F - UNIVERSITE DE BORDEAUX
BORDEAUX/VILLENAVE D'ORNON
33076
Vacant
DEPOT DOSSIER ELECTRONIQUE
EXCLUSIVEMENT
https://www.u-bordeaux.fr/agdor
00000 - 00
SERVICE DES RECRUTEMENTS
CONCOURS ENSEIGNANTS
0540006968
0540002440
0540002444
[email protected]
01/09/2014
Unite de Formation de Biologie
UF Biologie
UMR_A1332 (201119465P) - BIOLOGIE DU FRUIT ET PATHOLOGIE
NON
NON
NON
OUI
Le profil détaillé se trouve en page 2 et suivantes
e-mail gestionnaire
URL application
https://www.u-bordeaux.fr/agdor
Université de Bordeaux
UF BIOLOGIE
Profil pédagogique :
La personne recrutée fera son enseignement en microbiologie et en biologie de synthèse. Les enseignements
concerneront des travaux dirigés et des travaux pratiques, mais aussi quelques cours magistraux. La personne
recrutée interviendra dans les enseignements de la licence de biologie (UE Unité et Diversité du Vivant en L1,
UE Microbiologie en L2, UE Génétique Eucaryote et bactérienne en L2, Génétique Moléculaire et Fonctionnelle
en L2 et UE Expression Génétique et Régulation en L3) et en master dans les UE de tronc commun (UE de
Technologies en biologie moléculaire et cellulaire appliquées aux procaryotes et aux eucaryotes) et les UE de la
spécialité Microbiologie-Immunologie (UE Interaction Hôtes Pathogènes en M1). La personne recrutée pourra
aussi intervenir dans la licence TECSAN.
A terme, la personne recrutée sera amenée à développer de nouveaux enseignements, en particulier des travaux
dirigés et pratiques de biologie de synthèse.
Les besoins d'encadrement correspondent au départ d'une collègue MCF qui effectuait un service plein. Ce
départ s'ajoute à un départ sur l'UF Sciences Médicales d'un PR, sans compensation. Deux moniteurs ont été
recrutés pour combler les déficits d'encadrement en microbiologie.
Contact : Alain Blanchard, [email protected]
Jean-Pierre Savineau, [email protected]
Profil recherche :
Intitulé du projet : Compréhension du fonctionnement de cellules minimales bactériennes par des approches de
biologie de synthèse.
Description du projet : Le projet s’inscrit dans le domaine de la Biologie de synthèse (BS) pour lequel une des
équipes de l’UMR 1332 BFP (Biologie du Fruit et Pathologie) est clairement identifiée aux niveaux nationaux et
internationaux pour le développement de nouvelles méthodes d’ingénierie génomique de cellules minimales
bactériennes. Ces approches (clonage de génomes, ingénierie génomique, transplantation de génomes, …)
doivent conduire d’une part à une meilleure connaissance du fonctionnement du vivant notamment par
l’identification d’un jeu minimal de gènes requis à la vie, mais aussi à la construction de châssis cellulaires
devant permettre différentes applications biotechnologiques. Il s’agit tout d’abord de poursuivre le
développement méthodologique pour l’utilisation de ces approches de BS à une gamme plus large de bactéries,
au sein de la classe des Mollicutes, voire à des bactéries Gram+. Les études portent en parallèle sur des
phytoplasmes, des mollicutes phytopathogènes non-cultivables. Nous cherchons à cloner le génome de ces
organismes dans la levure afin d’en faciliter l’étude. Notre laboratoire est intéressé non seulement par la diversité
génomique de ces bactéries mais aussi par l’identification des bases génétiques de leur pouvoir pathogène et de
leur interaction avec leurs hôtes (plante et insecte). Une des questions posées concerne aussi la caractérisation
des éléments génétiques présents ou manquants qui expliqueraient notre incapacité à cultiver ces bactéries dans
des conditions axéniques. Pour parvenir à cultiver ces bactéries, il est envisagé d’utiliser des approches
d’ingénierie génomique et de transplantation de génomes dans des cellules receveuses. Ces travaux s’appuieront
sur des données de modélisation métabolique obtenues en collaboration avec d’autres équipes. L’objectif est de
définir une stratégie générale qui pourrait se révéler transférable à d’autres bactéries non-cultivables.
Le (la) candidat(e) recherché(e) aura une solide formation en microbiologie et en biologie moléculaire, avec si
possible une expérience dans un laboratoire utilisant des approches de biologie de synthèse (ingénierie
génomique et/ou métabolique). Des connaissances solides dans les approches globales en biologie sont
souhaitées ainsi que de bonnes bases dans l’utilisation des outils pour l’analyse des séquences génomiques. Une
expérience en modélisation métabolique serait un plus.
Les travaux envisagés bénéficient actuellement de financements provenant de l’ANR (ANR jeune chercheur
2014-2017) et du programme BREAD de la NSF (2012-2014).
Quelques publications récentes de l’équipe en relation avec le projet :
Algire MA, Montague MG, Vashee S, Lartigue C, Merryman C. A Type III restriction-modification system in
Mycoplasma mycoides subsp. capri. Open Biol. 2012 Oct;2(10):120115.
Breton M, Tardy F, Dordet-Frisoni E, Sagne E, Mick V, Renaudin J, Sirand-Pugnet P, Citti C, Blanchard A.
Distribution and diversity of mycoplasma plasmids: lessons from cryptic genetic elements. BMC Microbiol.
2012 Nov 12;12:257.
Citti C, Blanchard A. Mycoplasmas and their host: emerging and re-emerging minimal pathogens. Trends
Microbiol. 2013 Apr;21(4):196-203.
Dupuy V, Manso-Silván L, Barbe V, Thebault P, Dordet-Frisoni E, Citti C, Poumarat F, Blanchard A, Breton M,
Sirand-Pugnet P, Thiaucourt F. Evolutionary history of contagious bovine pleuropneumonia using next
generation sequencing of Mycoplasma mycoides Subsp. mycoides "Small Colony". PLoS One.
2012;7(10):e46821.
Malembic-Maher S, Constable F, Cimerman A, Arnaud G, Carle P, Foissac X, Boudon-Padieu E. A
chromosome map of the Flavescence doree phytoplasma. Microbiology. 2008 May;154(Pt 5):1454-63.
Montague MG, Lartigue C, Vashee S. Synthetic genomics: potential and limitations. Curr Opin Biotechnol. 2012
Oct;23(5):659-65.
Thiaucourt F, Manso-Silvan L, Salah W, Barbe V, Vacherie B, Jacob D, Breton M, Dupuy V, Lomenech AM,
Blanchard A, Sirand-Pugnet P. Mycoplasma mycoides, from "mycoides Small Colony" to "capri". A
microevolutionary perspective. BMC Genomics. 2011 Feb 16;12:114.
Contact: Alain Blanchard ([email protected])
Laboratoire d’accueil :
UMR INRA 1332 Biologie du Fruit et Pathologie – Directeur : Thierry Candresse ([email protected])
Procédure de candidature :
1°) Les candidat(e)s doivent procéder à l'enregistrement de leur candidature sur le site du ministère de
l'enseignement supérieur et de la recherche via l'application GALAXIE, du 27 février 2014 à 10 heures (heure
de Paris) et jusqu’au 1er avril 2014 à 16 heures (heure de Paris) :
ENREGISTREMENT CANDIDATURE : Accès Galaxie (Accès Qualification/Recrutement)
2°) Les candidat(e)s doivent également transmettre leur dossier de candidature à l'établissement
EXCLUSIVEMENT SOUS FORMAT NUMERIQUE, au plus tard le 1 er avril 2014 à minuit (heure de
Paris), en le déposant dans l’application ouverte à cet effet :
DEPOT DOSSIER DE CANDIDATURE : https://www.u-bordeaux.fr/agdor
Les candidat(e)s doivent respecter les modalités générales de constitution des dossiers définies par l’arrêté du 7
octobre 2009.
N.B. : Les candidats non inscrits sur la liste de qualification aux fonctions de MCF devront produire une pièce
attestant de l'exercice d'une fonction d'enseignant-chercheur dans un établissement d'enseignement supérieur
étranger, d'un niveau équivalent à celui de l'emploi à pourvoir.
Tout dossier ou document déposé hors délai
Tout dossier incomplet à la date limite susmentionnée
SERA DECLARE IRRECEVABLE

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