Audrey Boutron (Paris)

Déficits du complexe
de la pyruvate déshydrogénase (PDHc)
ENCEPHALOPATHIES PROGRESSIVES
Avec
HYPERLACTATEMIE
Audrey Boutron
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
Laboratoire de biochimie Hôpital de Bicêtre
PDHc : Enzyme clé de l’état nourri
(+)
Insuline,
PDH-phosphatase
(-)
ATP, PDH kinase
-
( )
DCA
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
Décarboxylation oxydative du pyruvate
TPP
↓
E3BP=X
Xp22.1-22.2
→
1 x 106 Da
inn mt membrane
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
x20-30
x60
x6
Dosage du complexe PDHc
Pre-traitement :
Dichloro acetate (inhibiteur PDH-kinase)
Mg++
(activateur PDH phosphatase)
activité
(1-14C) Pyruvate + NAD + CoA → AcétylCoA +14CCO2 +NADH
↓
+ L-Carnitine
Ratio PDHc/citrate synthase
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
PDHc
maximale
Difficultés du dosage
Majorité des anomalies sur la sous unité E1alpha
(PDHA1 gène : Xp21.2)
Variabilité Tissulaire de l’ activité de la PDHc:
Normale dans un tissu (lymphocytes)
Anormale dans un autre (fibroblastes, cerveau)
Biais d’inactivation du X fréquent chez les filles
Mosaicisme somatique possible chez les garçons
expression tissulaire différentes de certaines mutations
Mutations Cryptiques
Mutations de splice
Silencieuse
Intronique lointaine
Délétions hétérozygotes de grande taille
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
PAULINE grossesse, accouchement normaux
Microcéphalie
Difficultés alimentaires ± hypotonie
J14 hospitalisation pour hypothermie, apnées ;
Transfert en réanimation : Intubation/ventilation ; décès à J21
ETF agénésie du CC, dilatation ventriculaire D
mmol/l
Lactate
N <1.9
sang
sang
LCR
7
5
7
Pyruvate N <0.17
L/P
0.700
7-15
10
pmol/min/
mg prot
%N
m
range
PDHC
Lymphocytes
2.31
N
2.7
1.8-3.7
PDHC
fibroblastes
0.52
24
2.2
1.4-3.1
Biais d’inactivation de l’X
Ce biais est différent dans les fibroblastes et les lymphocytes
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
PDHA1 : dupAAGAGT (exon 10)
hétérozygote
ANTHONY, 1er enfant de parents non consanguins
A 21 mois, bilan pour microcéphalie, légère dysmorphie et syndrome pyramidal
IRM : atrophie corticale et dilatation ventriculaire
sang
PP
LCR
mmol/l
sang
AJ
Lactate N<1.9
2.00
3.7
4.99
Pyruvate N <0.17
0.211
0.314
0.434
10
12
11.5
L/P
7-15
pmol/min/
mg prot
%N
m
range
PDHC
Lymphocytes 1.75
65
2.7
1.8-3.7
PDHC
fibroblastes
1.2
55
2.2
1.4-3.1
PDHC
MUSCLE
1.0
18
2.7-8.2
Pas d’anomalies des complexes de la chaine respiratoire sur muscle
meetochondrie 0505-07mai
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Séquençage PDHA1 (Patient Garçon)
1- ADNg : taux de mutation variable selon les tissus
ADNg : c.787C>T
R263X
exon 8
lymphocytes
fibroblastes
2- ADNc : discordance entre ADNg et ADNc
ADNc : pas de mutation
dans les Fibroblastes
meetochondrie 0505-07mai
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muscle
1- pourquoi cette discordance entre les tissus ?
activité PDHc variable, taux de mutation variable de PDHA1
mosaicisme somatique ?
Immuno-cytochimie
Anti PDHA1 rouge
Anti PDHE2 vert
cellules N : orange
meetochondrie 0505-07mai
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Analyse cheveu par cheveu
Digestion ENZYMATIQUE
DdeI
2 – pourquoi cette discordance :ADNg et ADNc ?
Mutation c.787C>T soit p.Arg263*
Risque de dégradation des ARNm non sens (Nonsense mRNA Mediated Decay:
NMD)
Ce NMD peut être prévenu grâce à l’utilisation d’inhibiteur de la traduction
Séquençage de l’ADNc
G C G T C C GA C
T
+ fibroblastes
pré-incubés
avec émétine
- émétine
meetochondrie 0505-07mai
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DdeI digestion
- émétine +émétine
LYA Début en anténatal
•Présence de kystes para ventriculaires bilatéraux avec une hypoplasie
partielle du corps calleux
•Convulsions néonatales Hypotonie axiale
•Hypoglycémie et RCIU
mmol/l
Sang AJ
Sang PP
LCR
5.20
3.40
3.50
Pyruvate N <0.17
0.44
0.27
0.30
L/P
11.8
12.8
11.5
Lactate
PDHC
N <1.9
7-15
Lymphocytes
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
pmol/min/
mg prot
%N
m
range
3.160
N
2.7
1.8-3.7
Étude moléculaire de PDHA1
ADN g
Long range PCR : promoteur(1000kb) → exon 11
Bande Normale : absence de délétion intra génique
Séquençage
Aucune anomalie
ADN c
Pas d’anomalie d’épissage
Déficit en PDHc ?
pmol/min/
mg prot
%N
m
Valeurs
usuelles
PDHC
Lymphocytes
3.160
N
2.7
1.8-3.7
PDHC
Fibroblastes
0.317
25%
2.13
1.37-3.10
Délétion hétérozygote qui emporte la totalité du gène PDHA1 ?
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
Dosage génique
aux 2 extrémités du gène
Quantification relative
Dosage
génique
Dosage génique patient
Dosage génique témoin
LYA
Témoin
Fille
Témoin
Garçon
5’UTR
1.04
0.814-1.219
2.02
2.004-2.356
1.11
0.958-1.186
3’UTR
0.98
0.907-1.254
1.84
1.916-2.370
1.04
0.923-1.084
Délétion hétérozygote qui emporte la totalité du gène
PDHA1 + ?
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
Délétion Xp22.12p22.2 (2.14 Mb ;15 gènes)
puce 244K Agilent
CXorf15
RBBP7
REPS2
NHS
SCML1
RAI2
CXorf20
SCML2
CDKL5
RS1
PPEF1
PHKA2
GPR64
PDHA1
MAP3K15
SH3KBP1
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
Déficits en PDHc sans anomalies de PDHA1
PDHA1
PDHX
PDHB (E1β)
DLAT (E2)
DLD (E3)
: 85 cas (>70% De Novo)
: 11 cas
: 8 cas (1 mutation fréquente )
: 0 cas
: 3 cas
acidurie organique , anomalies
sd de Reye
PPM2C (PDH pase)
CAA,
: 0 cas
Absence de spécificité des signes cliniques, biologiques et
radiologiques
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
Déficits en PDHc sans anomalies
moléculaires
Faux positifs
1 cas de déficit secondaire à un déficit de la chaîne
respiratoire (complexe I)
1 déficit aigu en thiamine
Vrais positifs ???
Anomalies mixtes :MMDS
PDH + KGDHc +BCKDHc
et GCS
+chaine respiratoire
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
E1
E2
E3
Liam
Hypotonie de l’axe non étiquetée dès 4 mois de vie
A 18 mois suite à une GEA :
décompensation neurologique avec régression
psychomotrice et altération de la conscience
Lactates augmentés sang et LCR (rapport L/P bas)
CAO dérivés du cycle de krebs : αcetoglutarate +++
CAA: alanine, glutamine et glycine
IRM normale
Suspicion de déficit en E3
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
PDHc
Lc
PDHc
fibro
KGDH
Fibro
E3 / DLD
fibro
0.98
0.08
1.00
45
1.82-3.68
1.37-3.10
7-8
42-81
•Hypothèse : Anomalie de lipoylation de la sous-unité E2 ?
•Etude en WB / anticorps anti acide lipoique :
T
1
2
3
1 Liam
4
70 kDa - PDH E2 subunit = DLAT
< 55 kDa - BCKDH E2 subunit = DBT
≈ 48 kDa - α-KGDH E2 subunit = DLST
2 N
3 Lya PDHA1
4 Marion NFU1
HSP70 (70 kDa)
•Etude moléculaire gènes NFU1/ BolA3/ LIAS puis exome
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
ISCU / NFU1
IBA57
BOLA3
GLRX5
E1
cluster
4Fe-4S
LIAS
Lipoyl-E2
E3
Octanoyl-E2
Apo-E2
LIPT1 ApoGMP-lipoate
mt lipoate
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian
Apo-E2
LIPT2
Octanoyl-mtACP
mt FAS II
MERCI !!!!!!!!!!!!!!
À Michèle Brivet
À tous les cliniciens
B.Chabrol, A.Cano, A.Goldenberg
P.De Lonlay, I.Desguerre, V.Desportes
B.Heron, D.Lamireau, P. Landrieu, C.Mignot
H.Ogier de Baulny, M.Rio, A.Roubertie,
F.Rivier, F.Sedel, C.Sevin, G.Touati ……
Aux technicien(ne)s, particulièrement à V.TAMI
pour les dosages enzymatiques et les cultures de fibroblastes
et I. Correia et C. Oliveira pour la biologie moléculaire
meetochondrie 0505-07mai
2014 Evian