Amira for Life Sciences

Amira for Life Sciences
3D 可視化・解析ソフトウェア
Amira® は、コンピュータトモグラフィや顕微鏡の結果、MRI などの幅広い 3D
データを、可視化、加工、評価をするための多角的かつ高性能な 3D ソフトウェ
アプラットフォームです。Amira のスピードと柔軟性は分子・細胞生物学から
神経科学や生物工学までの、幅広い専門家たち向けの 3D 画像処理ワークフ
ローをサポートします。
 拡散テンソルイメージング（DTI）による人間の脳の可視化
画像提供：Prof. A. Brawanski, University Hospital of Regensburg
主な機能
入出力形式
· · Bio -Formats の導入によって 140 以上のファイル形
式に対応
·· ビットマップ形式：
TIFF、BMP、JPEG、PNG、SGI
·· 顕微鏡用規格：
FEI、Leica*、Zeiss*、Bio-Rad*、Olympus*、MRC
·· 医用画像規格：
DICOM、Analyze
·· 神経科学用規格：
Nifti、Hoc、SWC
·· 分子生物学用規格：
PDB など多数
·· 有限要素モデリング用規格：
FIDAP*、I-DEAS、Fluent、Abaqus
·· DTI に基づくファイバトラッキング
·· 強力なスクリプトインターフェース
·· 多数のマルチコア対応モジュール
可視化機能
·· インタラクティブな高品質ボリューム可視化
·· 直角や斜面などによる断面表示
·· 同値線と同値面レンダリング
·· マルチチャンネル画像
·· イメージ合成
·· ベクトルとテンソルの可視化
·· 任意の構造によるグリッドに対応
·· 分子の可視化
·· 形状モデリングと CAD 用規格：
DXF、STL、VRML、Open Inventor
·· 柔軟な Raw データの読み込み
·· ・大規模データ対応
* 読み込みのみ
 最大値投影処理と境界面再構築によるネズミの胸部画像
画像提供：Dr. E. Stepina and Dr. P. Hauff, Bayer Healthcare.
解析と計測
·· 体積、面積および距離の測定
 脊髄を抽出したボリュームレンダリング
画像提供：A. Ertürk, Max Planck Institute of Neurobiology.
処理機能
·· 2D・3D 画像フィルタ
· · デコンボリューション、 Z- d r o p 補正（ Z 軸に基づく
輝度補正）
·· 手動／自動スライス整列
·· 濃度測定（輝度の統計情報による）
·· フィラメントネットワークの統計情報
·· 共局在解析
·· 要素分割、数え上げ、形状解析
·· 画像、ベクトル場、非構造グリッドでの数値演算
·· MATLAB® 計算エンジンとの一体化
プレゼンテーション作成
·· 動画作成
·· 画像重ね合わせとモーフィング
·· キーフレーム・オブジェクトによるアニメーション
·· スケルトン化や微小管、導管、神経ネットワークのトラッキ
ング
·· 単体およびタイル状配置スクリーンへの表示
·· 手動／自動による分割
·· 手動での分割用、フィラメントトラッキング用、3D イメー
ジ合成と位置調整用の各専用作業ウィンドウ
·· サーフェス生成
·· FEM グリッド生成
·· テンソル計算
2 FEI Explore. Discover. Resolve.
·· 能動型／受動型立体画像
·· 没入型環境への対応
Raw 画像
データ取得
コンピュータトモグラフィ
（CT）
磁気共鳴トモグラフィ
（MRI）
3D 顕微鏡＆トモグラフィ
その他形式
画像フィルタ
＆前処理
Amira
3D 診断
分割
" イメージから理解へ
Amira の基本パッケージは、再構築さ
れた形状あるいは時系列データを含
む 3D データへの幅広い可視化と加工
機能を提供します。3D での様々な後
処理機能を用いた、高性能で柔軟性
に富む 3D 可視化とシミュレーションの
プラットフォームを提供します。
測定＆解析
境界面再構築
コミュニケーション
Explore. Discover. Resolve. FEI 3
 ヘモクロビンの可視化画像提供：S. De Carlo (FEI Company) / NeCEN, Gorlaeus Labs, Leiden University.
Amira の基本パッケージは多彩な機能を取り揃えてい
ます。さらに、様々な分野における特定のニーズに向
けた拡張パッケージも用意しています。
XBioFormats は生命科学で使われるオリジナルファイ
ルフォーマットをサポートするパッケージです。140 を
超えるファイルフォーマットから 3D や 4D 以上のデー
タを読み込み（Glencoe Software との提携により BioFormats が機能提供）。これにより、最新の顕微鏡に
使われる専用ファイルフォーマットからデータを直接読
み込むことができます。
XImagePAQ は物体、細胞、組織状物に対する画像強
調処理機能、使いやすく自動化にも対応した分割機能、
さらに様々な測定および数量化機能を提供します。
XNeuro はテンソル可視化、方向性によるカラーマッピ
ング（DEC）、ファイバトラッキングを含む拡散テンソル
イメージング（DTI）向けの機能を提供します。さらに
この拡張機能は、MR や CT による灌流画像の時系列
データ解析にも使用できます。
XMolecular を用いることによって、Amira は完全な分
子可視化ツールとなります。他の分子関連ソフトウェ
アと比べて、Amira と XMolecular の組み合わせは、
Amira に備わる最先端の分子の可視化と編集機能にボ
クセル表示とデータ処理の可能性をよりシームレスに
統合します。
XMesh は 3D 画像を有限要素法（FE）のための 3D
四面体モデルに変換するために使われます。同様に、
XMesh による結果表示では高性能なスカラー、ベク
トルおよびテンソル場の表示機能モジュールを提供し
ます。
XWind は生体力学などのための有限要素解析（FEA）
や数値流体力学（CFD）シミュレーションによる数値解
の解析および可視化が可能です。また、XWind は一
般的なサードパーティソルバとのデータの入出力を実現
し、Amira XMesh の機能を補強でき、またシミュレー
ション結果により高度な後処理を施すこともできます。
XL Volume はアウトオブコアによるデータ管理を効果
的に用いることにより、メモリ容量を超える画像の大規
模データの可視化をサポートします。この機能によって、
直角や斜面による断面表示やボリュームレンダリング、
同値面生成などの主な基本モジュールが引き続き大規
模データで利用できます。
XPand は C++ を利用した独自の可視化、データ処理
やファイル入出力のプログラムモジュールを作成できま
す。この機能には手軽に使える入門用のウィザードも
含まれています。
XScreen はタイル状配置された大型ディスプレイや没
入型仮想現実環境での高機能な可視化に必要な拡張
機能です。この機能は 3D ナビゲーションデバイスやマ
ルチスレッド処理、分散レンダリングをサポートします。
AmiraはWindows®、Mac OS®、Linuxでご利用いただけます。
本社（米国）
電話 +1 503 726 7500
Visualization Sciences Group（日本オフィス）
電話 03-3740-0970
©2016　当社は常に製品の改良に努めており、仕様は予告なく変更されることがあります。
FEI および FEI のロゴ、Amira、Avizo、Open Inventor Avizo は、FEI カンパニーおよび関連会社の登録商標です。
その他の商標については、各所有者に帰属します BR0059-JA-05-2016
より詳しくはAvizo3D.com へ
[email protected]

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