アプリケーションノート Attune NxT Acoustic Focusing Cytometer 大腸菌の生死判定 はじめに フローサイトメトリーとは、細胞や粒子などを 1 つ 1 つ流路へ流し、それぞれの細胞の特徴を解析する手法です。 一般的に血液や動物細胞などで広く利用されていますが、フローサイトメーターで解析するためのサンプル条件は非常 にシンプルです。 散乱光では微生物(細胞)と ノイズの区別が難しい 核酸を検出する 蛍光色素でラベルする 1. 細胞が凝集せず、単細胞(single cell)の 状態で分散していること 2. 水溶液に溶解・懸濁していること 3. 大きさが 1 ∼ 40 µm 程度 = 微生物(細胞) 蛍光を発しない = 夾雑物(非細胞) 今回は、Invitrogen™ LIVE/DEAD™ BacLight™ Bacterial Viability and Counting Kit と Invitrogen™ Attune™ Acoustic Focusing Cytometer を用いて、 大腸菌の生死の判定測定を行いました。 蛍光を発する = 核酸を持つ生物 (微生物、細胞)として、 ノイズと区別し検出可能 サンプルの準備 サンプルに含まれる大腸菌は 106 cells/mL 以下になるように適切なバッファーで希釈します。 希釈済み大腸菌液 997 µL ※ 培養液で希釈するとバックグラウンドが高くなる可能性があります。 ※ 濃度が分からない場合は、段階希釈して測定してください。 +SYTO 9(3.34 mM)1.5 µL +Propidium iodide(PI:30 mM)1.5 µL 室温 , 15min , 遮光でインキュベーション Attune NxT Acoustic Focusing Cytometer にて測定 蛍光を発している ポピュレーションをゲート (赤) データ例:E. coli. (緑) 蛍光を発する Attune NxT Acoustic Focusing Cytometer では、サンプルの濃度(event/µL)を自動で出すことができます。 (A) サンプルを段階希釈したデータ 100 倍 SYTO 9+ Live Dead 164.79 104.38 39.29 1000 倍 10000 倍 19.18 13.63 2.59 4.7 1.87 0.97 (event / µL) (B) 同じサンプルを 3 回測定したデータ 1 回目 SYTO 9+ Live Dead 2 回目 3 回目(1 時間後に測定) 19.34 12.83 2.93 19.18 13.63 2.59 19.95 11.54 5.17 (event / µL) 測定のコツ 検体を希釈するバッファー(生理食塩水)などは予め 0.22 µm のフィルターでろ過します。 微生物は、前方散乱光によるサイズ解析ではノイズと区別するのが難しいため、まずバッファーのみでノイズ (バックグラウンド)の位置を確認します。 次に BL1 に Threshold(閾値)を設定して、蛍光を発しているポピュレーションのみを解析します。 Ordering information 製品名 LIVE/DEAD BacLight Bacterial Viability and Counting Kit サイズ 製品番号 価格 * 100 test L34856 ¥95,600 * 記載の価格は 2015 年 10 月現在の価格です。消費税は含まれておりません。価格は予告なしに変更する場合がありますので、予めご了承ください。 キットについて 核酸に結合することで蛍光を発する試薬の SYTO 9 とP Iが含まれているキットです。Invitrogen™ SYTO™ 9 は、細胞膜透過性のため全菌の判定に使 用します。 P Iは細胞膜への透過性が無いため、生細胞は染色されず、細胞膜の傷ついた細胞や死細胞を染色します。したがって SYTO 9 とP Iを組み 合わせることで、サンプル中に含まれる菌の生死の判定を簡便に行うことができます。 研究用にのみ使用できます。診断目的およびその手続上での使用はできません。 記載の社名および製品名は、弊社または各社の商標または登録商標です。 標準販売条件はこちらをご覧ください。www.thermofisher.com/TC For Research Use only.Not for use in diagnostic procedures. © 2015 Thermo Fisher Scientific Inc. All rights reserved. All trademarks are the property of Thermo Fisher Scientific and its subsidiaries unless otherwise specified. Printed in Japan.FPL009-B1510IH サーモフィッシャーサイエンティフィック ライフテクノロジーズジャパン株式会社 本社:〒108-0023 東京都港区芝浦 4-2-8 [email protected] 0120-477-392 テクニカルサポート オーダーサポート TEL:03-6832-6980 FAX:03-6832-9584 TEL:03-6832-9300 FAX:03-6832-9580 営 業 部 facebook.com/ThermoFisherJapan www.thermofisher.com @ThermoFisherJP 販売店
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