Cytochrome b遺伝子の塩基配列の比較

Cytochrome b遺伝子の塩基配列の比較�
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
---ATGACTAACATTCGAAAGTCCCACCCACTAATAAAAATTGTAAACAATGCATTCATC!
---ATGACCAACATCCGAAAATCACACCCACTAATAAAAATTATCAACAACGCATTCATT!
ATGGCACCCAACATTCGAAAATCCCACCCCCTACTAAAAATAATTAACAACTCCCTAATC!
* ***** ***** ** ***** *** ******* * ***** * * ** !
GACCTTCCAGCCCCATCAAACATTTCATCATGATGAAATTTCGGTTCCCTCCTGGGAATC!
GACCTCCCAGCCCCCTCAAACATCTCATCATGATGAAACTTCGGTTCCCTCTTAGGCATC!
GACCTCCCAGCCCCATCCAACATCTCTGCTTGATGAAATTTCGGCTCCCTATTAGCAGTC!
***** ******** ** ***** ** * ******** ***** ***** * *
**!
TGCCTAATCCTACAAATCCTCACAGGCCTATTCCTAGCAATACACTACACATCCGACACA!
TGCCTAATCTTGCAAATCCTAACAGGCCTGTTCTTAGCAATACATTACACATCAGACACA!
TGCCTCATGACCCAAATCCTCACCGGCCTACTACTAGCCATGCACTACACAGCAGACACA!
***** **
******** ** ***** * **** ** ** ****** * ******!
ACAACAGCATTCTCCTCTGTTACCCATATCTGCCGAGACGTGAACTACGGCTGAATCATC!
ACAACAGCTTTCTCATCAGTTACACACATTTGTCGAGACGTAAATTACGGATGAGTTATT!
TCCCTAGCCTTCTCCTCCGTAGCCCACACTTGCCGGAACGTACAATACGGCTGACTCATC!
*
*** ***** ** ** * ** * ** ** **** * ***** *** * ** !
CGATACATACACGCAAACGGAGCTTCAATGTTTTTTATCTGCTTATATATGCACGTAGGA!
CGCTATCTACATGCAAACGGAGCATCCATATTCTTTATTTGCCTATTCATCCACGTAGGC!
CGGAATCTCCACGCAAACGGCGCCTCATTCTTCTTCATCTGTATCTTCCTTCACATCGGA!
** * * ** ******** ** ** * ** ** ** ** * *
* *** * ** !
CGAGGCTTATATTACGGGTCTTACACTTTTCTAGAAACATGAAATATTGGAGTAATCCTT!
CGAGGTCTATACTACGGATCCTATATATTCCTAGAAACATGAAACATTGGAGTAGTCCTA!
CGAGGCCTATACTACGGCTCCTACCTCTACAAGGAAACCTGAAACACAGGAGTAATCCTC!
***** **** ***** ** **
*
***** ***** * ****** **** !
CTGCTCACAGTAATAGCCACAGCATTTATAGGATACGTCCTACCATGAGGACAAATATCA!
CTATTTACCGTTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTACGTCCTGCCCTGAGGACAAATATCA!
CTCCTCACACTCATAGCCACCGCCTTTGTGGGCTATGTTCTCCCATGGGGCCAAATATCA!
** * ** * ***** ** ** ** * ** ** ** ** ** ** ** *********!
TTCTGAGGAGCAACAGTCATCACCAACCTCTTATCAGCAATCCCATACATCGGCACAAAT!
TTCTGAGGAGCTACGGTCATCACAAATCTACTATCAGCTATCCCTTATATCGGAACAGAC!
TTCTGAGGGGCCACCGTTATCACAAACCTATTCTCAGCAATTCCCTACATTGGACACACC!
******** ** ** ** ***** ** ** * ***** ** ** ** ** **
!
TTAGTCGAATGAATCTGAGGCGGATTCTCAGTAGACAAAGCAACCCTTACCCGATTCTTC!
CTCGTAGAATGAATCTGAGGGGGCTTTTCCGTCGACAAAGCAACCCTCACACGATTCTTC!
CTAGTAGAGTGAGCCTGAGGGGGATTTTCAGTCGACAACCCAACCCTTACCCGATTCTTC!
* ** ** *** ****** ** ** ** ** ***** ******* ** *********!
GCTTTCCATTTTATCCTTCCATTTATCATCATAGCAATTGCCATAGTCCACCTACTATTC!
GCCTTCCACTTTATCCTGCCATTCATCATTACCGCCCTCGCAGCCGTACATCTCCTATTC!
GCTTTACACTTCCTCCTCCCCTTTGCAATCGCAGGTATTACTATCATCCACCTCACCTTC!
** ** ** ** **** ** **
**
*
* *
* ** **
***!
CTCCACGAAACAGGCTCCAACAACCCAACAGGAATTTCCTCAGACGTAGACAAAATCCCA!
CTGCACGAAACCGGATCCAACAACCCTACCGGAATCTCATCAGACATAGACAAAATTCCA!
CTACACGAATCAGGCTCAAACAACCCCCTAGGCATCTCATCCGACTCTGACAAAATTCCA!
** ****** * ** ** ********
** ** ** ** ***
******** ***!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
!
Bovine
Pig
Chicken
TTCCACCCCTACTATACCATTAAGGACATCTTAGGGGCCCTCTTACTAATTCTAGCTCTA!
TTTCACCCATACTACACTATTAAAGACATTCTAGGAGCCTTATTTATAATACTAATCCTA!
TTTCACCCATACTACTCCTTCAAAGACATTCTGGG---CTTAACTCTCATACTCACCCCA!
** ***** ***** * * ** ***** * **
* *
* ** **
* *!
---ATACTACTAGTACTATTCGCACCCGACCTCCTCGGAGACCCAGATAACTACACCCCA!
---CTAATCCTTGTACTATTCTCACCAGACCTACTAGGAGACCCAGACAACTACACCCCA!
TTCCTAACACTAGCCCTATTCTCCCCCAACCTCCTAGGAGACCCAGAAAACTTCACCCCA!
**
** * ****** * ** **** ** *********** **** *******!
GCCAATCCACTCAACACACCCCCTCACATCAAACCCGAGTGATACTTCTTATTTGCATAC!
GCAAACCCACTAAACACCCCACCCCATATTAAACCAGAATGATATTTCTTATTCGCCTAC!
GCAAACCCACTAGTAACCCCCCCACATATCAAACCAGAATGATATTTTCTATTCGCCTAT!
** ** *****
** ** ** ** ** ***** ** ***** ** **** ** ** !
GCAATCTTACGATCAATCCCCAACAAACTAGGAGGAGTACTAGCCCTAGCCTTCTCTATC!
GCTATTCTACGTTCAATTCCTAATAAACTAGGTGGAGTGTTGGCCCTAGTAGCCTCCATC!
GCCATCCTACGCTCCATCCCCAACAAACTTGGAGGTGTACTAGCCCTAGCAGCCTCAGTC!
** ** **** ** ** ** ** ***** ** ** ** * *******
*** **!
CTAATTCTTGCTCTAATCCCCCTACTACACACCTCCAAACAACGAAGCATAATATTCCGA!
CTAATCCTAATTTTAATGCCCATACTACACACATCCAAACAACGAAGCATAATATTTCGA!
CTCATCCTCTTCCTAATCCCCTTCCTCCACAAATCTAAACAACGAACAATAACCTTCCGA!
** ** **
**** *** * ** **** ** ********** **** ** ***!
CCACTCAGCCAATGCCTATTCTGAGCCCTAGTAGCAGACCTATTGACACTCACATGAATT!
CCACTAAGTCAATGCCTATTCTGAATACTAGTAGCAGACCTCATTACACTAACATGAATT!
CCACTCTCCCAAACCCTATTCTGACTTCTAGTAGCCAACCTTCTTATCCTAACCTGAATC!
*****
*** **********
******** **** * * ** ** ***** !
GGAGGACAACCAGTCGAACACCCATATATCACCATCGGACAACTAGCATCTGTCCTATAC!
GGAGGACAACCCGTAGAACACCCGTTCATCATCATCGGCCAACTAGCCTCCATCTTATAC!
GGAAGCCAACCAGTAGAACACCCCTTCATCATCATTGGCCAAATAGCATCCCTCTCTTAC!
*** * ***** ** ******** * **** *** ** *** **** ** **
***!
TTTCTCCTCATCCTAGTGCTAATACCAACGGCCGGCACAATCGAAAACAAATTACTAAAA!
TTCCTAATCATTCTAGTATTGATACCAATCACTAGCATCATCGAAAACAACCTATTAAAA!
TTCACCATCCTACTTATCCTCTTCCCCACAATCGGAACACTAGAAAACAAAATACTCAAC!
**
** * ** * * * ** *
* *
* ******** ** * ** !
TGAAGA!
TGAAGA!
TACTAA!
*
*!
3種の動物のcytochrome b遺伝子の塩基配列を並べて示しています。
3種とも同じ塩基のところには * 印がついています。2種だけが同じ
という塩基はもっとあります。色付きの塩基配列がプライマーと同じ
配列のところです。ウシ・ブタ・トリのプライマーがそれぞれウシ・
ブタ・トリの遺伝子しか増幅しない理由が説明できるでしょうか。
食肉検査に、cytochrome b のようなミトコンドリアの遺伝子を用いる
のはどのような利点があるからでしょうか。