【MedR】第1回

東京大学医学系研究科
特任助教倉橋一成
1

修道（広島）→東大理科Ⅰ類→看護学科→
疫学・生物統計学教室大学院（大橋教室）→
企画情報運営部（大江教室）
◦ 修士1年まで生物統計学の勉強
◦ 修士2年から少しずつ働き始める
 健康診断＆レセプトデータ
 臨床試験データ
 遺伝子データ（マイクロアレイ）

R or SASで解析（今は99%R）
◦
◦
◦
◦
◦
解析実務
解析相談、アドバイザー、コンサルティング
VC++ & Rでレセプトデータの加工を行うソフト作ったり
SAS講習会の通訳補助やったり
iAnalysis（アイアナリシス）という会社で兼業中
2

S言語をオープンソースとして実装
◦ GPL
◦ S言語：ベル研究所で開発

再現可能な言語
◦ 同じプログラムを実行すれば同じ結果となる
◦ SASも再現可能
◦ SPSSは再現するためにはデータ加工やオプション設定を保存する必要がある

世界的に信頼性が高い
◦ SASと同等
 他にはMatLabなど
◦ グラフィックスに強い
◦ 論文でも多く利用されている
 NEJM、JCO、JNCIなど
◦ 方法論の教科書の著者がRパッケージを作っていることも

Rで分からないことがあったら。。
◦ Rjpwiki：http://www.okada.jp.org/RWiki/
◦ ツイッターでつぶやく
 私のID: isseing333
3

インストール
◦ http://cran.r-project.org/bin/windows/base/
◦ 特に設定変更なし

これ
を起動
この画面にプロ
グラムを書く
4

Plot(1:10)
◦ これだけでも割と綺麗

終了
「いいえ」
作業スペース：R上のオブジェクト
5

タスクビューで特に重要なパッケージを紹介
◦ http://cran.r-project.org/web/views/

パッケージのインストール
◦ インターネットが繋がっている状態
◦ Install.packages(“パッケージ名”)
◦ ミラーサーバーを選ぶと自動インストール
 日本は筑波、兵庫、（会津）
◦ library(“パッケージ名”)で使えるようになる

ヘルプ
◦ 「?関数名」と打つとヘルプが表示される
6


library(HSAUR2)
data(Forbes2000)
◦ Forbes Magazine 2004年世界の一流企業2,000









dim(Forbes2000)
ｓｔｒ（Forbes2000）
names(Forbes2000)
Forbes2000[1:10, ]
nlevels(Forbes2000$country)
a <- Forbes2000[Forbes2000$country == "Japan", ]
dim(a)
nrow(a)/nrow(Forbes2000)
length(Forbes2000[Forbes2000$country == "United States", 1])
7

Download Report