大阪大学核物理研究センター 汎用計算機システム 紹介 http://www.rcnp.osaka-u.ac.jp/Divisions/CN/computer/ibm/index.html システム全体構成図 I/Oステーション Internet HEPNET ODINS リング棟2F AVF3F 本館3F 本館6F Firewall 計算サーバー データ処理サーバー 外向けメールサーバ 外向けwwwサーバ オンラインステーション1,2(kasuga1,2) アプリケーション・サーバ群 printer mail news web dns ntp ・・・ 核理1ネットワーク プリンター用ネットワーク ポスタープリンター(1台) 高速プリンター(3台) カラープリンター(13台) 高速モノクロプリンター(1台) 汎用計算機システムについて • 大規模実験データを高速処理可能な サーバー(RS/6000 SP) • 大容量で高速なストレージ サーバー(RS/6000-SP)の性能 • 4cpu(1ノード) ・875 SPECint_rate95 ・1382 SPECfp_rate95 • メモリ ・3.5 GB(データ処理サーバー) ・7.0 GB(計算サーバー) ディスク装置 • SSAによる大容量(37.59TB)のディスクシ ステムを構築。 • 8同時I/O処理と最大320MB/sの転送速度 という高パフォーマンスの実現。 • RAID-5による構成により1ドライブに障害 が発生しても、連続稼動が可能。 (※SSA:Serial Storage Architecture) 計算サーバー/データ処理サーバー バッチノード インタラクティブノード • バッチ ノード 計算ノード #3 senri 4CPU Memory:7GB 計算ノード #2 サブミット 4CPU Memory:7GB ログイ ン 4CPU Memory:7GB 計算ノード #1 saho 4CPU Memory:7GB 4CPU Memory:7GB ログイン データ処理ノード #8 4CPU Memory:3.5GB データ処理ノード #7 4CPU Memory:3.5GB ログイ ン ・計算ノード ・データ処理ノード hozumi SPスイッチ 4CPU Memory:3.5GB データ処理ノード #6 4CPU Memory:3.5GB データ処理ノード #5 • インタラクティブ ノード 4CPU Memory:3.5GB データ処理ノード #4 4CPU Memory:3.5GB • 大容量ディスク 装置 データ処理ノード #3 4CPU Memory:3.5GB データ処理ノード #2 4CPU Memory:3.5GB データ処理ノード #1 4CPU Memory:3.5GB 大容量ディスク 計算ノード • 4CPUが3ノードで合計12CPUあります。 • 大規模計算(主として理論)用のCPUです。 • 処理の為のバッチキューは 長時間 中時間 短時間 の3種類用意されてます。 データ処理ノード • 4CPUが8ノードで合計32CPUあります。 • CPUは核理1A、1B、1C各グループにそれぞれ 15,11,6に分配してます。 • 処理の為のバッチキューは、各核理共に 長時間 中時間 短時間 の3種類用意されてます。 バッチジョブのクラス設定 グループ クラス名 説明 CPU使用時間 キュープライオリティ 最大同時実行数 核理1A (sahoから実行可能) AL 核理1A長時間 30日 3 8 AM 核理1A中時間 6時間 2 14 AS 核理1A短時間 1時間 1 8 BL 核理1B長時間 30日 3 8 BM 核理1B中時間 6時間 2 10 BS 核理1B短時間 2時間 1 4 CL 核理1C長時間 30日 3 4 CM 核理1C中時間 1時間 2 4 CS 核理1C短時間 3分 1 4 DL 理論長時間 30日 3 6 DM 理論中時間 1時間 2 6 DS 理論短時間 3分 1 12 ML Mathemathica長時間 30日 3 2 MM Mathemathica中時間 1時間 2 2 MS Mathemathica短時間 3分 1 2 核理1B (sahoから実行可能) 核理1C (sahoから実行可能) 理論 (senriから実行可能) Mathemathica (senriから実行可能) インタラクティブノード • Senri ・一般ユーザー向けのノード ・計算ノードへのバッチジョブの投入口 • saho ・データ解析ユーザー向けのノード ・データ処理ノードへのバッチジョブの投入口 • hozumi ・データ解析ユーザー向けのノード ・インタラクティブで大きなジョブを実行する為のノード ・このノードはsahoに入ってから利用可能 導入ソフトウエア 【導入ソフトウェア一覧】 項目 名称 機能 システムソフトウェア AIX v4.3.3 Parallel System Support Program V3.1 Performance Tool Box V2.2 General Parallel File System v1.2 Parallel Environment V2.4 IBM LoadLeveler V2.1 Tivoli Storage Manger/Tivoli Space Manager 3.7 オペレーティングシステム 並列サーバ用管理プログラム パフォーマンス管理ツール パラレルファイルシステム 並列環境(並列化ライブラリ等) ジョブコントローラ アーカイブ管理 言語 XL Fortran for AIX v7.1 ANSI X3.9-1978 (Full ANSI FORTRAN 77)、 Fortran 90 (ISO/IEC 1539-1991 (E) and ANSI X3.198-1992)準拠 ANSI X3.159-1989準拠 C for AIX v5.0 VisualAge C++ Professional for AIX v5.0 gcc-2.95.2.0 gcc.g++-2.95.2.0 gcc.info-2.95.2.0 エディタ関連 GNU Emacs-20.7(mule) ispell-3.1.20 エディタ emacs使用時のスペルチェッカー かな漢字変換 Wnn6 egg4 かな漢字変換 かな漢字変換 数式処理 Mathematica 数式処理 mail,news,www関連 pine 4.05 Netscape 4.7(navigator,messanger,composer) mnews Mime対応メールユーティリティ Webブラウザ,メールリーダ,ニュースリーダ ニュースリーダ,メールリーダ セキュリティ関連 OpenSSL 0.95a SSLプログラム SSHプログラム OpenSSH 2.2.0p1 【導入ソフトウェア一覧】(続き) 項目 名称 機能 ライブラリ関連 cernライブラリ IMSL F90 MP Linbrary IMSL C Library Cernの提供するライブラリ IMSL FORTRANライブラリ IMSL Cライブラリ tex関連 tex v3.14159 ptex v2.1.8 latex v9906 platex v19990809e dvips v5.78+patch v1.4 xdvi v22.15+patch v03 VFlib2-config v2.25.1 mendex v2.4f tex 日本語版(ASCII版) texマクロ ptexマクロ PSファイル変換 dviファイルビューワ 日本語を統一的に扱うためのライブラリ 索引整形ツール その他ツール等 gzip-1.2.4.1 GNU patch-2.5.4 GNU make-3.79.1.0 GNU tar-1.1.3 gnuplot-3.7 tcsh-6.09 kterm-6.2.0 Ghostscript ghostview-3.5.8 tcl-7.6.0.0, tcl-8.2.3.0 圧縮ツール GNU版patch GNU版make GNU版tar 対話的な関数描画プログラム cshの上位版 日本語対応端末 ポストスクリプトインタプリタ PostScriptビューア 言語処理ソフト tclの拡張ライブラリセット 画像ビューア システム資源監視ツール グラフの表示・編集ツール リモートクライアント PDFファイルビューア Zip圧縮用汎用ライブラリ テキストビューア tk-4.2.0.0, tk-8.2.3.0 xv-3.10a monitor v2.1.7+patch pre7 xmgr v3.1.7 xon-6.5.1 Acrobat Reader 4.05 zlib-1.1.3 jless-3.3.2 ネットワーク • • • • 対外接続 内部ネットワーク 建物間接続 情報コンセント(network socket) ネットワーク • 対外接続 Internet HEPNET ODINS Firewall 緩衝セグメント(DMZ) 対外接続セグメント ファイアーウォール Firewall • 許可されたトラフィックだけを通過させます。 • ネットワーク構成やIPアドレスを外部のネット ワークから隠します。 • ネットワークの不正のチェックや障害チェック のため、ファイアウォールを通過するトラ フィックはログに記録されます。 ネットワーク • 内部接続 対外接続セグメント senri saho hozumi 核理1セグメント 加速器セグメント 汎用セグメント 各種サーバー 大塔セグメント ネットワーク • 建物間接続 ネットワーク集線装置 リング棟地階 ネットワーク集線装置 リング棟2階 2GigaBit Ethernet ネットワーク集線装置 本館4階 ネットワーク集線装置 AVF棟3階 ネットワーク • 情報コンセント ネ ッ ト ワ ー ク 集 線 装 置 情 報 コ ン セ ン ト ハブ PC等 オンラインステーション • リングサイクロトンにおけるデータ収集システム からのデータ転送を受け、データ処理サーバー へ転送する為のシステムです。 • 2台を設置し、1台に障害が発生しても他の1台 が利用できる構成です。 • 大量のデータ転送を可能にする為、ギガビット イーサネットで接続されてます。 CPU:POWER3-Ⅱ 375MHz 2cpu 437 SPECint_rate95 (2CPU) メモリ: 2 GB I/O ステーション • I/Oステーションはテープ装置を中心とするリ ムーバブルメディアを管理するシステムです。 • 4台をリング棟2F、AVF棟3F、本館3階、6階 に設置してます。 • I/Oステーションの利用は各ステーションにロ グインする事で利用できます。 I/Oステーションと接続機器 DLT テープライブラリー装置 8mm テープ装置 8 m m DLT テープ装置 テ ー プ ラ イ ブ ラ リ ー 装 置 DAT テープ装置 Solaris システム CD-R装置 3.5FD装置 3.5MO装置 DVD‐RAM装置 アプリケーションサーバー • • • • • • • プリンターサーバー メールサーバー wwwサーバー newsサーバー dnsサーバー ntpサーバー pppサーバー アプリケーションサーバー プリンターサーバー Windows95,98 WindowsNT プリンタサーバa LPR対応計算機 MacOS プリンタサーバb 出力履歴収集処理 履歴集計処理 メール通知機能 カラープリン ター ×13 高速プリンター ×3 高速モノクロプリンター ×1 ポスタープリンター ×1 • プリントサーバーを同時2台 稼動 • 1台のサーバーに障害が発 生した場合、クライアントより 他のサーバへ切替えることで 同一プリンターが使用出来る。 • 各々のプリントサーバー上の 履歴情報を集計し、ユーザー 別・機器別の情報をレポート する。 アプリケーションサーバー メールサーバー • メールサーバーは受 信専用と送信用の2 台に分けて運用 • メールサーバーは架 空のサイト名を送信 元とするようなメール の拒否など、ファイア ウォールとの組み合 わせでセキュリティー を確保しています。 アプリケーションサーバー wwwサーバー •wwwサーバーは、公開用外向けとWebページ登録・編集等を行う内向け の2種類有ります。 【ブラウザ環 境】 【ホームページ公 開】 Internet HEPNET Firewall Internet ODINS HEPNET 外向けwwwサーバ(公開) www-rcnp 汎用ネットワーク ODINS Firewall 汎用ネットワーク 内向けwwwサーバ www-in (プロキシ) nfs 登録・編集 •外部のwwwサーバーへのアクセスに はプロキシの設定が必須です。 内向けwwwサーバ www-in (プロキシ) login Senri ユーザー (webブラウザ) 外向けwwwサーバ(公開) www-rcnp www管理者 登録・編集 一般ユーザー •Webの公式ページはセンター内の限られ たコンテンツ管理者のみが編集可能。 •一般ユーザーの個人/グループのページ はsenri上のページの更新で公開サーバー へ反映されます。 アプリケーションサーバー newsサーバー • newsサーバーを使用できるのは内部 ユーザに限られてます。 • newsサーバーの推奨リーダーはmnews です。 • システムの運用情報が rcnp.announce で提供されます。 アプリケーションサーバー dns • dnsは内向け2台、外向け1台で サービスを行ってます。 • 内向けサーバーを2台設定する 事で、1台に障害が発生してもも う1台でサービスの提供を受けら れます。 • センター内からセンター内の計算 機の名前は引けますが、外部の ネットワークよりセンター内の名 前の参照は特定のサーバー以外 は出来ません。 アプリケーションサーバー ntpサーバー • ntpサーバーは各計算機の時計を正確 にあわせる為に時刻情報を提供する。 • 現在2台のサーバーで運用をおこなって ます。 アプリケーションサーバー pppサーバー • pppサーバーは電話回線からダイアル・ インにより、senri/saho にアクセスを可能 にするシステムです。 • pppサーバーを利用されたい方はシス テム管理者に確認のうえ、指示された電 話番号を適宜入力し設定して下さい。
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