植物生理last

イネカルスでショ糖とアブシジン酸が
協調して誘導する遺伝子群の単離
1
秋廣 高志
植木 千恵
水野幸一 4 藤村達人5
1. 筑波大・農学研究科
5. 筑波大・農林工学
2
3
Ben Mohamed Lobna
2. 筑波大・バイオシステム
3. INTA 4. 秋田県大・生物資源
SUT
Triose-P
Glucose-1-P
ATP
P
i
3PGA
LS
S L
AGPase
Sucrose
Sucrose
ADP-Glucose
starch
AGPase Large subunit isoform3
Suc
120
Starch
(mg / g)
0
0.75
1.5
3
5
10
100
AGPL3
80
60
Glc
40
0
20
AGPL3
0
0% 3% 6% 10% 3% 6% 10%
Sugar
free
Sucrose
Glucose
1.5
3
6
10
%
%
Glucose
ABA
GIN6/ABI4
ABI3,ABI5
ABF3
生理現象
AGPL3
ABA
BA
FREE
ABA1/ZEP
GIN1/ABA2/SDR1
AAO3
GIN5/ABA3
2.4-D
3% sucrose
GIN2/HXK1
SucとABAの協調的な効果
Sugar free
ABA
AGPL3
3% sucrose
0 1 10 50 100 200 0 1 10 50 100 200 (μM)
Suc
+
control ABA Suc ABA
ABA
0
1 10 50 100 200 (μM)
AGPL3
Suc+ABA処理
DAT
0
1
3
6
12 24 (hr)
AGPL3
Suc
+
control ABA Suc ABA
AGPL3
AAAAA
mRNA
cDNA-synthesis
AAAAA
TTT
ds-cDNA
Digest with TaqI and AvaII
5’end fragments
3’end fragments
inner fragments
AAAAA
TTT
Adapter ligation
No amplification
NN
No amplification
AAAAA
TTT
Selective PCR
NN
NN
NN
イネ完全長cDNAの情報に基づいたシュミレーション
cDNA数
128通りのPrimer対
28468
19724
(69.2%)
AvaII
39114(1.98)
TaqI
TaqI
AvaII
TaqI
両端にTaqI とAvaIIを持つ断片数
AvaII
TaqI
TC
AA
AT
AC
AG
GA
GT
GC
GG
bands
(Total 11099bands)
9799 (88.2%)
Suc+ABA ↑
ABA↑
63 → 53 → 43
321
510
ABA↓
189
Sugar ↑
66
Sugar-depletion ↑
213
(4.5%)
567
(5.1%)
Sugar-depletion ↓
288
ABA
Sugar
C
C
A S SA
1
2
5
6
9
15
10
22
21
23
38
24
41
28
54
29
59
32
64
47
65
56
69
67
73
79
75
80
A S SA
6個
etc
8個
etc
2個
etc
2
28個/43個
Transport Protein
hexose transporter plastid
hexose transporter plasma membrane
glucose-6-phosphate/phosphate-translocator
MRP-like ABC transporter
Carbohydrate metabolism
4-alpha-glucanotransferase D-enzyme
putative beta-glycosidase
Sugar Signaling
PRLI-interacting factor G
transcription regulation
ABI3-interacting protein 2
Fatty Acid Metabolism
omega-6 desaturase
stearoyl-ACP desaturase
phosphoethanolamine N-methyltransferase
Cellular Metabolism
glutamate-ammonia ligase
glutamate-cysteine ligase
probable hydroxymethyltransferase
phosphoenolpyruvate kinase
Protein kinase
cell division control-related protein kinase
Protein Phosphatase
protein phosphatase 2C-related / PP2C-related ABI1 ABI2
tyrosine specific protein phosphatase family protein
Membrane Protein
ERD4 protein
Phosphatidylinositol transfer-like protein III
Secondary metabolism
UVB-resistance protein UVR8
DNA
Regulator of chromosome condensation-like protein
RNA methyltransferase
FtsJ-like methyltransferase family protein
Electron Transport system
Ubiquinol-cytochrome C reductase subunit II
Vesicular Traffic
abscisic acid-responsive HVA22 family protein
まとめ
Sucrose
(glucose)
ABA
Suc+ABAによって誘導され
る遺伝子26個の単離に成功
SucとABAによって協調的に
制御されているシグナル系の
存在が示唆された。
転写因子
AGPL3
Cis配列
SUT
Glc
HXT
Glc
HXT
Glc
Glc-1-P
Glc-6-P
ATP
P P
P
P
i
GPT
Suc
Triose-P
Triose-P
i
i
L S
S L
AGPase
1,3-bisphosphoglycerate
ADP-Glc
3-phosphoglycerate
starch
D-enzyme
謝辞
筑波大学 農林工学系
太田 賢 博士
理化学研究所植物分子生物学研究室
梅澤 泰史 博士
筑波大学 農学研究科
バイオシステム研究科
Antonio Lalusin君
吉川 紗代さん
飯島 恵美 さん
西多 功一君