CLC Microbial Genomics Module

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CLC Genome Finishing Module+
CLC Microbial Genomics Module+
MetaGeneMark
★2016年6月28日(火)ご注文分まで★
アカデミック固定ライセンス
コマーシャル固定ライセンス
840,488円(税別)
1,680,968円(税別)
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*CLC Genomics Finishing Module, CLC Microbial Genomics Moduleは永久ライセンスとなり、購入後1年間のサポート&アップグレードが含まれております。
2年目以降のサポート&アップグレードは別途有償となります。
*MetaGeneMarkは年間ライセンスとなります。
スモールサイズゲノムにおけるGenome Finishingプラグイン
CLC Genome Finishing Module
・コンティグ配列における、リファレンス配列またはコンティグ配列へのアラインメント
・コンティグ配列同士の結合
・PCRプライマーの自動設計
・PacBioロングリード配列データのエラー補正およびアセンブル(ベータ版)
・PacBio De Novoアセンブル用の解析パイプライン(ベータ版)
微生物ゲノム解析用プラグイン
CLC Microbial Genomics Module
・OTU Clustering
菌種組成解析、α多様性/β多様性の計算、Greengenes/SILVA/UNITEからのリファレンスデータのダウンロード。
・Typing and Epidemiology(ベータ版)
病原菌のタイピング解析、K-mer Treeによる配列類似度の比較、SNP Treeによる分子系統樹の作成
・Whole Metagenome Analysi(ベータ版)
メタゲノムシークエンスデータのDe Novoアセンブル、BLAST/Pfamドメイン検索によるアノテーション付け
*Whole Metagenome Analysisを使用する場合、別途有償プラグイン「MetaGeneMark」が必要です。
メタゲノム遺伝子予測プラグイン
MetaGeneMark
MetaGeneMarkは、微生物のメタゲノム配列データに対して、遺伝子とCDS領域の検出を行うプラグインです。ブートストラップ類似
のアルゴリズムを用いて、外部データリソースや細かいパラメータの設定なしに、高感度な予測が可能です。
CLC bio( QIAGEN社 )日本正規販売代理店
フィルジェン 株式会社
【お問い合わせ】 バイオサイエンス部
〒459-8011 愛知県名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
TEL : (052)624-4388
FAX : (052)624-4389
E-mail : [email protected] URL : http://www.filgen.jp/