Diffusion in einem Kraftfeld: Ultrazentrifuge Kraft auf Molekül: Fm r m2 r Energiedifferenz zwischen Molekül bei r0 und bei r r r 1 U dr Fm r FH2O r M H2O vm 2 r 2 r02 2N A r0 Kraft dU F dr Potential PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Diffusion in einem Kraftfeld: Ultrazentrifuge dU F dr 1 U M H2O vm 2 r 2 r02 2N A im Gleichgewicht: U r U r0 cst r cst r0 exp k T B djr c Diffusionsgleichung: div j t dr c jr D ? F Flußdichte: r im Gleichgewicht: cst 0 D ? F r PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Diffusion in einem Kraftfeld: Ultrazentrifuge U r U r0 cst r cst r0 exp k T B dU F dr 0 Flußdichte im Kraftfeld: Driftgeschwindigkeit: Dcst r dU kBT dr ? dcst 0 D ? F dr dU dr c c Dc c dU jr D F D r kBT r k T dr B vdrift D D dU F kBT k B T dr jdrift cvdrift PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Fokker-Planck-Gleichung djr c div j t dr c c dU jr D r k T dr B c c c dU D t r r kBT dr Verallgemeinerung für beliebiges Potential in drei Dimensionen c c Ddiv grad c grad U t k BT PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Svedberg-Gleichung 1 U M H2O vm 2 r 2 r02 2N A The Svedberg 1884 – 1971 c c c dU D t r r kBT dr D dU vdrift k B T dr vdrif r D M H2O vm 2 r s2 r RT Sedimentationskoeffizient Einheit Svedberg PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Elektrophorese: Nernst-Planck-Gleichung U q c c czF d D t r r RT dr vdrift DzF d Dq d RT dr k B T dr elektrophoretischer Mobilitätskoeffizient (in Lösung) Dq q q k B T 6r PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Elektrische Leitfähigkeit L Mobilität eines Ions: Dq q q k B T 6r Leitfähigkeit: I U 1 U Nq A L A L Stromdichte Nq cFz V el. Feld Fläche A Molare Leitfähigkeit: Fz c PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik Übergangszustand Ratenkonstante Transition-State-Theory: G k ~ k0T exp RT Arrhenius freie Enthalpie G Reaktionsrate: ka A A aB B G G Reaktionskoordinate PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik: Reaktion 1. Ordnung k B A k kinetische Reaktionsgleichungen dcA k cA k cB dt dcB k cA k cB dt Stofferhaltung cA cB const. Anfangsbedingungen: cB ,0 0 cB c A,0 c A dcA k cA k cA,0 cA dt PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik: Reaktion 1. Ordnung k B A k dcA k k cA k cA,0 dt exp k k t e t d t d e dt dt d c A exp k k t k c A,0 dt t c A exp k k t c A,0 dtk c A,0 exp k k t 0 k cA,0 k k exp k k t 1 PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik: Reaktion 1. Ordnung k B A k cA k cA,0 k k k cA,0 k k exp k k t stationäre Bedingungen 0 k c A k c A,0 c A Spezialfall k 0 cA cA,0 exp k t PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik: Reaktion 2. Ordnung k C A B k kinetische Reaktionsgleichungen dcA dcB k cA cB k cC dt dt dcC k cA cB k cC dt Anfangsbedingungen: cC ,0 0 Stofferhaltung cA cC const. cB cC const. cC c A,0 c A cB ,0 cB cB cB ,0 c A,0 c A dcA k cA cB,0 cA,0 cA k cA,0 cA dt PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik: Reaktion 2. Ordnung dcA k cA cB,0 cA,0 cA k cA,0 cA dt dcA k cA2 k cB,0 cA,0 k cA k cA,0 dt dc A k dt cA 1 cA 2 1, 2 sind Wurzeln der charakteristischen Gleichung cA 1 cA 2 cA2 1 2 cA 1 2 c 2 A k cB ,0 c A,0 k k k c A c A,0 0 k PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik: Reaktion 2. Ordnung cA 1 cA 2 c 2 A k cB ,0 cA,0 k k k cA cA,0 0 k Lösung der charakteristischen Gleichung 2 1,2 1 1 1 1 c A,0 c0 c0 2 K 4 K K Trennung der Partialbrüche dcA 1 cA 1 cA 2 1 2 c0 cB ,0 c A,0 K k k dcA dcA c c 1 A 2 A PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik: Reaktion 2. Ordnung 1 1 2 1 1 2 dc A dc A c cA 1 cA 2 A ,0 cA c A 1 c A.0 1 ln ln c A,0 2 cA 2 k t c A 1 c A,0 1 exp 1 2 k t F t c A 2 c A,0 2 cA t 1 2 F t 1 F t PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik: Reaktion 2. Ordnung c A,0 1M cB ,0 2 M cC ,0 0 k 1M s -1 k 0.1M s -1 Konzentration (M) Beispiel: cB(t) cC(t) cA(t) Zeit (s) PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik: Reaktion 2. Ordnung k 0 2 c0 1 0 cA t Konzentration (M) Spezialfall keine Rückreaktion c A,0 c0 cB ,0 exp k c0 t c A,0 cB(t) cC(t) cA(t) Zeit (s) PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik: Reaktion 2. Ordnung Spezialfall c0 cB ,0 c A,0 0 k 0 c A,0 cB ,0 c A,0 c0 c A t lim c0 0 c A,0 c0 cB ,0 exp k c0 t c A,0 cB ,0 exp k c0 t c A,0 c A,0 c0 cB ,0 1 k c0 t c A,0 cA t c A,0 1 c A,0 k t c A,0 1 c A,0 k t PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktionskinetik: Reaktion 2. Ordnung k 0 c A,0 cB ,0 k 2 A C Konzentration (M) Spezialfall cC(t) cA t c A,0 1 c A,0 k t cA(t) Zeit (s) PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de Reaktion 2. Ordnung, Vergleich cB ,0 2 M cC ,0 0 k 1M s -1 k 0.1M s -1 Konzentration cA(t) (M) c A,0 1M c A,0 cB ,0 1M k = 0 allg. Fall Zeit (s) PC II für Biochemiker Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Institut für Physikalische und Theoretische Chemie, Prof. Dr. J. Enderlein, http://www.joerg-enderlein.de
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