UNIX をサーバーとして Windows , Macintosh を クライアントとする遺伝子解析ソフトウェア シーケンスアセンブリ クライアント・サーバーソフトウェア ATGC はゲノムレベルまでの配列決定を支援するソフトウェアです。 大量のフラグメント配列の結合処理を高速かつ正確に行います。コンセンサス配列の決定は 波形の信頼度を考慮する機能など最新のテクノロジーが組み込まれ、コンティグの マップと波形データとアライメントの同時連動表示等、操作性も優れています。 ●機能一覧 ・解析処理 プロジェクト管理機能 フラグメント自動結合処理 フラグメント追加マッチング コンティグ同士の結合 結合マップ表示／出力 アライメント表示／出力 マッチング状況確認機能 マッチング位置検索機能 コンセンサス配列の多数決決定機能 バッチ処理 マルチスレッド処理 ・波形処理 波形ファイルの読み込み 波形データの一括変換処理 波形のマルチ表示 波形の信頼度算出 波形表示レベルの自動マッチング 波形表示ピッチの拡大／縮小 波形表示レベルの増幅／縮小 編集画面との連動 ・トリミング処理 ベクター配列の直接入力 ベクター、制限酵素からのベクター配列の決定 検索範囲の設定 ホモロジーパーセントの設定 除去配列長の設定 相補鎖配列の考慮 曖昧配列／部位の除去設定 配列の有効な範囲／長さの設定 トリミング処理のログ出力 ・配列編集処理 フラグメント配列の編集 コンセンサス配列の編集 フラグメント／コンセンサス配列の連係編集 配列のソート機能 結合マップ／波形画面／編集画面の連動機能 Undo/Redo 機能 コンティグの反転 コンセンサス配列の再構成 コンティグからのフラグメント除去 編集マーキング機能 トリミング部位の復活／伸長 不一致／ギャップ位置へのスキップ機能 フラグメント／コンセンサス配列の Export 機能 任意のフォーマットにExport機能 コンセンサス配列の相補鎖表示 コンセンサス配列のアミノ酸翻訳表示 ●配列エディタ ●トリミング設定 バイオデータベース クライアント・サーバーソフトウェア GENETYX-SV/DB は、大容量データベース（GenBank、EMBL 等）をサーバー上に構築し、 クライアントから高速にホモロジー検索・キーワード検索を行い、また、データベースを毎日更新 するデイリーアップデート等を行うソフトウェアです。 ●機能一覧 ・インターネット上の配列データバンク（EMBL、GenBank等）から 最新データを取得しサーバーにデータベース化 ・デイリーアップデートデータで最新データベースのサーバーでの維持 ・データベースに対するキーワード検索、ホモロジー検索機能 ・プライベートデータベースソフトウェア シーケンサーの出力等から得られた配列データを独自にクライアントにデータベース化 クライアントのデータベースに登録、更新、削除等の機能 クライアントのデータベースに対するキーワード検索、複数のキーワードによる絞り込み検索 クライアントのデータベースに対するホモロジー検索機能 FASTA、BLAST クライアントのデータベースに対するホモロジー検索のバッチ処理 ・対応データベース 核酸データベース EMBL、GenBank 蛋白質データ NBRF（PIR） 転写因子データベース TFD ●ブラウザ版メイン画面 ●データベースの登録、更新、削除画面 バイオ商品 GENETYX URL http://www.genetyx.co.jp/ 本 社 〒150-0002 東京都渋谷区渋谷3丁目8番12号 TEL 03(3406)3241(大代表) E-mail:[email protected] FAX 03(3406)4881 大阪支店 〒532-0011 大阪市淀川区西中島6丁目7番8号 TEL 06(6304)2371(大代表） E-mail:[email protected] FAX 06(6304)1086 CATALOGUE:120831
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