Megaruptor® パンフレット(PDF 1.4MB)

長 鎖 D N A 断 片 化 装 置 メガ ラプ タ ー
M e g ar u p t o r ®
第3世代シーケンサーのライブラリー作製に最適
2 kb
75 kb
Megaruptor®とは?
Megaruptor®(メガラプター)は、Diagenode社が開発したDNA断片化装置であり、PacBio®などのロングリードの
シークエンサーに最適な長鎖DNAを調製することができます。専用ソフトウェアで目的DNAサイズなどのパラメー
ターを選択するだけで、自動で断片化処理を行うことができます。
Megaruptor®の特長
断片化デバイス『ハイドロポア』
2 kb - 75 kb のDNAフラグメントを調製可能
- 断片化サイズ: 2種の断片化デバイス、ポンプ速度、サイクル数によって制御
- 長鎖DNAの調製 : PacBio®などのロングリードのシークエンサーに最適
- サンプル量 : 50 - 400μlまで対応(推奨200 μl)
- 自動洗浄:自動バルブ制御により断片化および洗浄工程を自動化
クロスコンタミ、微細孔の目詰まりを防止
- クロスコンタミ防止: 使い捨ての断片化デバイスを採用
- 目詰まり防止: ハイドロポア内に複数の孔を持つ微細孔シートを採用
ハイドロポア
( Long / Short )
微細孔シートの電子顕微鏡写真
ハイドロポア内の微細孔シート
Megaruptor® は、
『ハイドロポア』
と呼ばれる使い
捨ての断片化デバイスを採用しています。ハイドロ
ポア内には微細孔シートがあり、複数の孔を持つ
構造により目詰まりを防いでいます。
DNA溶液は、PCで制御されたポンプによって加圧
され、微細孔シートを通過する際に切断されます。
ハイドロポアは目的の断片化サイズによってLong
(10-75 kb)及びShort(2-9 kb)を使い分けます。
APPLICATION NOTE
DNAの断片化(2 - 6 kb)
100000 -
20000 -
7000 -
5000 -
10000 -
3000 4000 -
2000 -
1500 -
1 kb + ladder
1000 -
6 kb
5
700 -
4 kb
4
500 -
3 kb
3
8 kb
400 -
2
5 kb
1-
2 kb
3 kb
300 -
標的サイズ
1
2 kb
200 -
B
75 -
A レーン
Size (bp)
図A. λファージゲノムDNAを断片化したアガロースゲル電気泳動図
図B. ヒトゲノムDNAを断片化したFragment Analyzerによる泳動図
λファージゲノムDNA (20 ng/μl; 150 μl/sample) を異なる
サイズ設定で剪断し、1% アガロースゲルで分析した。
ヒトゲノムDNA(25 ng/μl; 200 μl/sample)のFragment Analyzerのプロファイルは
2 kb, 3 kb, 5 kb, 8 kbの異なるサイズ設定で剪断した。
(フラグメントサイズ決定のため
にStandard Sensitivity Large Fragment Analysis Kit*1を使用した。)
*1
DNAの断片化(15 - 75 kb)
C
* 15 kb
DNF-492; Advanced Analytical Technologies社
75 kb
図C. ヒトゲノムDNAを断片化したパルスフィールドゲル電気泳動図
左の画像は、Hydoropore-long(10 - 75 kb 断片化用)で剪断されたヒトゲノムDNA(25ng/μl; 150 μl/sample)の
DNAサイズ分布を示している。DNAは1% アガロースゲルでパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)によって分析した。
*: 断片化していないDNA
■ 装置仕様
■ Megaruptor®および消耗品
Megaruptor®
Code No.
製品名
包装単位 希望納入価格(税別) 備考
DNA断片化範囲
2 kb - 75 kb
313-08281
Megaruptor®
1式
4,200,000 円
*2
サンプル容量
最小:50 μl, 最大:400 μl(推奨:200 μl)
310-08311
Hydropore long for Megaruptor®
10 個
42,000 円
*3
サンプル濃度
0 - 50 ng/μl (推奨:25 ng/μl)
313-08301
Hydropore short for Megaruptor®
10 個
42,000円
*4
処理サンプル数
2サンプル連続処理
310-08291
Hydro Tubes for Megaruptor®
50 本
25,000 円
*5
電源
24 V, 3A (内蔵)
メインユニット寸法
67(W)×218(D)×255(H)mm
*3
設置スペース寸法
125(W)×185(D)×12(H)mm
*5
メインユニット重量
8 kg
装置制御用PC
ノートパソコン付属
(専用ソフトウェア インストール済)
輸入元
〒930-0834 富山県富山市問屋町1-8-7
TEL:076-451-6548
FAX:076-451-6547
E-mail:[email protected]
URL:http://www.nippongene.com
販売元
*2
*4
Megaruptor®装置本体および制御用ノートパソコンを含む
10 - 75 kbの断片化用の断片化処理デバイス
2 - 9 kbの断片化用の断片化処理デバイス
断片化処理用専用チューブ
Hydropore
お取扱い代理店
Hydro Tube