長 鎖 D N A 断 片 化 装 置 メガ ラプ タ ー M e g ar u p t o r ® 第3世代シーケンサーのライブラリー作製に最適 2 kb 75 kb Megaruptor®とは? Megaruptor®(メガラプター)は、Diagenode社が開発したDNA断片化装置であり、PacBio®などのロングリードの シークエンサーに最適な長鎖DNAを調製することができます。専用ソフトウェアで目的DNAサイズなどのパラメー ターを選択するだけで、自動で断片化処理を行うことができます。 Megaruptor®の特長 断片化デバイス『ハイドロポア』 2 kb - 75 kb のDNAフラグメントを調製可能 - 断片化サイズ: 2種の断片化デバイス、ポンプ速度、サイクル数によって制御 - 長鎖DNAの調製 : PacBio®などのロングリードのシークエンサーに最適 - サンプル量 : 50 - 400μlまで対応(推奨200 μl) - 自動洗浄:自動バルブ制御により断片化および洗浄工程を自動化 クロスコンタミ、微細孔の目詰まりを防止 - クロスコンタミ防止: 使い捨ての断片化デバイスを採用 - 目詰まり防止: ハイドロポア内に複数の孔を持つ微細孔シートを採用 ハイドロポア ( Long / Short ) 微細孔シートの電子顕微鏡写真 ハイドロポア内の微細孔シート Megaruptor® は、 『ハイドロポア』 と呼ばれる使い 捨ての断片化デバイスを採用しています。ハイドロ ポア内には微細孔シートがあり、複数の孔を持つ 構造により目詰まりを防いでいます。 DNA溶液は、PCで制御されたポンプによって加圧 され、微細孔シートを通過する際に切断されます。 ハイドロポアは目的の断片化サイズによってLong (10-75 kb)及びShort(2-9 kb)を使い分けます。 APPLICATION NOTE DNAの断片化(2 - 6 kb) 100000 - 20000 - 7000 - 5000 - 10000 - 3000 4000 - 2000 - 1500 - 1 kb + ladder 1000 - 6 kb 5 700 - 4 kb 4 500 - 3 kb 3 8 kb 400 - 2 5 kb 1- 2 kb 3 kb 300 - 標的サイズ 1 2 kb 200 - B 75 - A レーン Size (bp) 図A. λファージゲノムDNAを断片化したアガロースゲル電気泳動図 図B. ヒトゲノムDNAを断片化したFragment Analyzerによる泳動図 λファージゲノムDNA (20 ng/μl; 150 μl/sample) を異なる サイズ設定で剪断し、1% アガロースゲルで分析した。 ヒトゲノムDNA(25 ng/μl; 200 μl/sample)のFragment Analyzerのプロファイルは 2 kb, 3 kb, 5 kb, 8 kbの異なるサイズ設定で剪断した。 (フラグメントサイズ決定のため にStandard Sensitivity Large Fragment Analysis Kit*1を使用した。) *1 DNAの断片化(15 - 75 kb) C * 15 kb DNF-492; Advanced Analytical Technologies社 75 kb 図C. ヒトゲノムDNAを断片化したパルスフィールドゲル電気泳動図 左の画像は、Hydoropore-long(10 - 75 kb 断片化用)で剪断されたヒトゲノムDNA(25ng/μl; 150 μl/sample)の DNAサイズ分布を示している。DNAは1% アガロースゲルでパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)によって分析した。 *: 断片化していないDNA ■ 装置仕様 ■ Megaruptor®および消耗品 Megaruptor® Code No. 製品名 包装単位 希望納入価格(税別) 備考 DNA断片化範囲 2 kb - 75 kb 313-08281 Megaruptor® 1式 4,200,000 円 *2 サンプル容量 最小:50 μl, 最大:400 μl(推奨:200 μl) 310-08311 Hydropore long for Megaruptor® 10 個 42,000 円 *3 サンプル濃度 0 - 50 ng/μl (推奨:25 ng/μl) 313-08301 Hydropore short for Megaruptor® 10 個 42,000円 *4 処理サンプル数 2サンプル連続処理 310-08291 Hydro Tubes for Megaruptor® 50 本 25,000 円 *5 電源 24 V, 3A (内蔵) メインユニット寸法 67(W)×218(D)×255(H)mm *3 設置スペース寸法 125(W)×185(D)×12(H)mm *5 メインユニット重量 8 kg 装置制御用PC ノートパソコン付属 (専用ソフトウェア インストール済) 輸入元 〒930-0834 富山県富山市問屋町1-8-7 TEL:076-451-6548 FAX:076-451-6547 E-mail:[email protected] URL:http://www.nippongene.com 販売元 *2 *4 Megaruptor®装置本体および制御用ノートパソコンを含む 10 - 75 kbの断片化用の断片化処理デバイス 2 - 9 kbの断片化用の断片化処理デバイス 断片化処理用専用チューブ Hydropore お取扱い代理店 Hydro Tube
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