プール型レンチウイルス shRNA ライブラリー ＆ 受託解析サービス 次世代シークエンス技術を用いた次世代 shRNA ライブラリー登場！ 記事 ID 検索 8048 本製品は、レンチウイルスベクターシステムと次世代シークエンスの技術を合わせた、画期的なハイスループット RNAi 遺伝子スクリーニン グツールです。各 shRNA コンストラクトにあらかじめ導入したバーコード配列を次世代シークエンサーで検出することにより、プール型ライ ブラリーの課題であった「表現系選抜後の主要調節因子の特定」の正確性が、従来のレンチウイルスライブラリーと比較して飛躍的に向上して います。ウイルスの自己複製能を欠損させた安全なシステムです。また、ご希望の遺伝子群を標的としたカスタム shRNA ライブラリーを作製 （有償）することも可能です。 Cellecta, Inc. メーカー略号：CLT ご利用可能なライブラリー製品概要 ライブラリー Human Genome-Wide shRNA DECIPHER Custom 適用生物種 カバーしている 遺伝子数 モジュール RNAs/ 標的 ヒト 19,276 3 8 shRNA ヒト 15,000 3 5+ shRNA バーコードは重複の可能性があり マウス 10,000 2 5+ shRNA モジュールを合わせられない。 ご相談 ご相談 ご相談 ご相談 ご相談 注意事項 非重複バーコードにより、３つのモジュールを 合わせることによりゲノムワイドな実験が可能。 プール型レンチウイルス shRNA ライブラリー実験概要 プール型レンチウイルス shRNA ライブラリー＆受託解析サービス 特長 プール型レンチウイルス shRNA ライブラリー：低コストかつ少人数でのゲノムワイド遺伝子探索実験を実現 検証済み shRNA データベースを整備：機能的 shRNA を独自の in silico プログラムで予測、shRNA コンストラクトを構築し、 一部（50 ∼ 100 コンストラクト）を実験的に検証してアルゴリズムを評価済み shRNA 構造最適化済み：ノックダウン効果の向上、偽陽性候補の低減 shRNA 配列決定が簡便化：各 shRNA に特異的な bar-code をシークエンスすることにより目的の表現型に関与する shRNA をハイスループットかつ効率的に同定 レンチウイルスシステムの利用：コンプレキシティ（shRNA コンストラクトの密度）の高いプール型ライブラリーを効率よく、 かつ広範囲な細胞種に導入可能、宿主ゲノムへ組み込まれるので長期安定発現が期待でき、細胞分裂の活発な細胞、非分化 細胞のいずれにも導入可能 ヒトゲノムワイド shRNA ライブラリー レンチウイルスベースのヒトゲノムワイド shRNA ライブラリープール品をお届けします。本ライブラリーはヒトゲノムの全ての遺伝子をカバー し、各遺伝子は 8 種の shRNA によりターゲッティングされています。特定の shRNA を含む特定の細胞の成長、分化、移動等を追跡するために、 各 shRNA には重複しないバーコード配列が付属しております。 ヒトゲノムワイド shRNA ライブラリーの特徴 ライブラリー 標的遺伝子 標的遺伝子数 shRNA 数 hGW Module 1 シグナル伝達遺伝子 hGW Module 2 疾患関連遺伝子及び薬剤標的遺伝子 6,500 55,000 hGW Module 3 hGW Modules 1, 2, 3 Pool 細胞表面マーカー、細胞外基質遺伝子、DNA 結合遺伝子 上記のプール 19,276 165,000 ヒトゲノムワイド shRNA ライブラリーの製品仕様 商品形態 プラスミド パッケージ済ウイルス 品番 品名 包装 HGW-M1-P2 hGW Module 1 HGW-M2-P2 hGW Module 2 HGW-M3-P2 hGW Module 3 HGW-P2 hGW Modules 1,2,3 Pool HGW-M1-V8 hGW Module 1 HGW-M2-V8 hGW Module 2 HGW-M3-V8 hGW Module 3 HGW-V8 hGW Modules 1,2,3 Pool HGW-M1-V9 hGW Module 1 HGW-M2-V9 hGW Module 2 HGW-M3-V9 hGW Module 3 HGW-V9 hGW Modules 1,2,3 Pool 希望販売価格 200 µg 2 x 108 TU 納期目安 2 週間 ご照会 4 週間 1 x 109 TU DECIPHER shRNA ライブラリー 本ライブラリー商品はヒト及びマウスの特定の遺伝子群に対してデザインされております。各標的遺伝子に対し 5-6 種の shRNA が含まれ、約 65% の標的遺伝子に対して最低 70% のノックダウン効率を誇ります。 DECIPHER DECIPHER shRNA shRNA Library Library Design Design ライブラリー 標的遺伝子 標的遺伝子数 Human Module 1 シグナル伝達 5,043 Human Module 2 疾患関連 5,412 Human Module 3 細胞表面、DNA 結合 4,922 Mouse Module 1 シグナル伝達 4,625 Mouse Module 2 疾患関連 4,520 shRNA 数 27,500 ユニークなshRNA特異的bar-code U6 Gex1 T6 shRNA: 最適化配列デザイン UbiC Gex2 RFP 2A Puro 3’∆LTR 図1 左：pRSI レンチウイルス shRNA 発現ベクターマップ 実験系に合わせてライブラリーに使用するベクターをカスタマイズが可能です。 ＊ DECIPHER shRNA ライブラリーは選択マーカーの変更ができません （薬剤マーカー：Puro、蛍光マーカー：RFP） 右：shRNA 特異的 bar-code ユニークな shRNA 特異的 bar-code で主要調節因子 （効果のあった shRNA）を特定する。 DECIPHER shRNA ライブラリー製品使仕様 商品形態 プラスミド パッケージ済ウイルス 品番 DHPAC-M1-P DHDAC-M2-P DHCSC-M3-P DMPAC-M1V2-P DMDAC-M2V2-P DHPAC-M1-V8 DHDAC-M2-V8 DHCSC-M3-V8 DMPAC-M1V2-V8 DMDAC-M2V2-V8 DHPAC-M1-V9 DHDAC-M2-V9 DHCSC-M3-V9 DMPAC-M1V2-V9 DMDAC-M2V2-V9 品名 DECIPHER Human Module 1 DECIPHER Human Module 2 DECIPHER Human Module 3 DECIPHER Mouse Module 1 DECIPHER Mouse Module 2 DECIPHER Human Module 1 DECIPHER Human Module 2 DECIPHER Human Module 3 DECIPHER Mouse Module 1 DECIPHER Mouse Module 2 DECIPHER Human Module 1 DECIPHER Human Module 2 DECIPHER Human Module 3 DECIPHER Mouse Module 1 DECIPHER Mouse Module 2 包装 希望販売価格 200 µg ￥250,000 ( 非営利団体 ) ￥947,000 ( 営利団体 ) 2 x 108 TU ご照会 1 x 109 TU ご照会 カスタム shRNA ライブラリー お客様より標的遺伝子のリストをご提供いただき、セレクタ社にて shRNA を設計致します。 通常 1 つの標的遺伝子に対して少なくとも 5-6 種類の shRNA を設計することで、平均して 65% 以上のノックダウン効率を得ることができます。 まず初めに設計した shRNA 配列をオリゴプールで合成を行い、その後セレクタ社の shRNA 発現レンチウイルスベクターへクローニングを行い ます。作製したライブラリーはハイスループットシーケンシングにより品質を確認致します。オリゴプールでの shRNA 合成を行うため、 ライブラリーサイズは 6,500 種類より承ります。 ● 標的遺伝子数 500 1,000：6,500 shRNA ● 標的遺伝子数 1,000 2,500：13,000 shRNA ● 標的遺伝子数 2,500 5,000：27,000 shRNA ● 標的遺伝子数 5,000 10,000：55,000 shRNA セレクタ社スタンダードライブラリーベクター は、U6 プロモーターにより shRNA を発現し、 セレクションマーカーとして Puroｍycin、RFP が含まれます。ご要望に応じて図に示されてい るプロモーター、蛍光マーカー、抗生物質耐性 遺伝子のカスタマイズが可能です。 関連製品 パッケージング 品名 293LTV Cell Line Ready-to-Use Packaging Plasmid Mix (250 µg) CBL：Cell Biolabs, Inc. CLT：Cellecta, Inc. メーカー略号 CBL CLT 品番 LTV-100 CPCP-K2A 包装 1 vial 1 each 希望販売価格 ￥81,000 ￥68,000 プール型レンチウイルス shRNA ライブラリー＆受託解析サービス 受託解析サービス概要 記事 ID 検索 6364 本サービスはセレクタ社のデザイン＆検証済みまたは非検証のカスタムプール型レンチウイルス bar-code 化 shRNA ライブラリーを用いた ハイスループット RNAi 遺伝子スクリーニングサービスです。お客様のニーズに合わせて、実験ステップの一部 ( オプション A)、もしくは全て の作業を実施いたします ( オプション B)。 オプション A オプション B ゲノム DNA をご提供いただく 作業内容： プール型バーコード化 shRNA ライブラリーを 使用したスクリーニングの全作業を実施 または セレクタ社ライブラリーを使用して 調製した各サンプルの 凍結ペレット（細胞・組織）を使用 ※ 必要な作業のみを受託することも可能ですので お問合せください。 提供物： 報告書（電子データ） 作業内容： DNA 抽出・増幅 次世代シークエンシングデータ取得・解析 提供物： shRNA 配列のリスト（電子データ） 詳細は、コスモ・バイオの Web サイトをご覧ください。上記「記事 ID 検索」のアイコンに示された数字を使うと簡単にご希望のサイトに行くことができます。 コスモ・バイオの受託サービスは、Web サイトに より詳細な情報を掲載しています。 お見積りやお問い合わせもこちらから行えます！ http://www.cosmobio.co.jp/ 詳細情報へは、記事 ID 検索コードを使うと便利です。 1 コスモ・バイオのホームページへ 記事 ID 検索 このアイコンの数字を入力 0000 3 お目当ての「記事 ID」を入力し、 検索をクリック！ まとめて検索 商品検索 カテゴリ検索 品番検索 SDS 検索 メーカー情報 検索 記事 ID 検索 0000 2 トップページの 「記事 ID 検索」を クリック！ ● 希望販売価格 ･･･「希望販売価格」は参考であり、販売店様からの販売価格ではございません。 記載の希望販売価格は２０１5 年 5 月１日現在の希望販売価格です。 予告なしに改定される場合がありますので、ご注文の際にご確認下さい。消費税は含まれておりません。 ● 使 用 範 囲 ･･･ 記載の商品は全て、「研究用試薬」です。 人や動物の医療用・臨床診断用・食品用等としては使用しないよう、十分ご注意ください。 (12252)
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