NGS（次世代シーケンサー）解析のための ライブラリー作製キット NuGEN社NGS製品ガイド ■イルミナ社次世代シーケンサーに対応したライブラリーを作製します■ 解析目的 dsDNA （gDNA or cDNA） お勧め製品 PCR-free 発現解析／全ゲノム解析 Ovation® Rapid Library System FFPE or 微量 ChIP解析／発現解析／ 全ゲノム解析 Ovation ® Ultralow Library System V2 全ゲノム バイサルファイトシーケンス Ovation® Ultralow Methyl-Seq Library System RRBS法 バイサルファイトシーケンス 変異解析 SNP／InDel／CNV メチル化 ターゲット リシーケンス Stranded RNA-Seq ライブラリー作製 total RNA ds cDNA増幅 初発量 100 ng p.1 1 ng p.1 10 ng p.2 Ovation® RRBS Methyl-Seq System 100 ng p.2 Ovation® Target Enrichment System 10 ng p.7 ヒト全血 Ovation® Human Blood RNASeq Library System 100 ng p.3 ヒトFFPE Ovation® Human FFPE RNASeq Library System 多様な生物 Ovation® Universal RNA-Seq System 10 ng p.4 マウス、ラット、 ショウジョウバエ、 、 シロイヌナズナ Ovation® RNA-Seq System for Model Organisms 10 ng p.4 原核生物 Ovation® Complete Prokaryotic RNA-Seq Library System 100 ng p.4 高等脊椎動物 Ovation® Single Cell RNA-Seq System 10 pg 1細胞 p.6 融合遺伝子 Ovation® Fusion Panel Target Enrichment System 10 ng p.9 Random / Oligo dT Ovation® RNA-Seq System V2 100 ng p.3 （FFPE） 500 pg p.11 本パンフレットに掲載した製品はNuGEN社の製品です。 ウェブサイト http://www.takara-bio.co.jp 短時間で行うPCR-freeライブラリー作製キット Ovation Rapid Library System ® ◆2時間でdsDNAからPCR-freeライブラリーを作製可能 ◆わずか100 ngから対応可能 Ovation ® Rapid Library Systemsは、2時間でライブラリーの 作 製が可 能です。P C R 増 幅を行わないので、G C 含 量に伴う バイアスを最小限に抑えることができます。Ovation ® RNA-Seq V2（製品コード 7102-08） で増幅したcDNAからライブラリー 作製まで行う場合は、約6.5時間で完了することができます。 スタートサンプル：gDNA or ds cDNA 100∼500 ng 所要時間 ：約2時間 Workflow Sheared Genomic DNA or ds cDNA End Repair Adaptor Ligation Final Repair Library Quantitation 約2時間 製 品 名 容 量 製品コード 価格（税別） Ovation® Rapid DR Multiplex System 1-8 32回 0319-32 ¥187,000 Ovation® Rapid DR Multiplex System 9-16 32回 0320-32 ¥187,000 極めて微量なサンプルからのライブラリー作製キット Ovation Ultralow Library System V2 ® ◆わずか1 ngのdsDNAからライブラリーを作製可能 ◆ハイフィデリティーなPCR酵素によりGC含量に依存しない再現性 Ovation® Ultralow Library System V2は、 あらかじめ増幅するこ となくわずか1 ngのdsDNAからDNAライブラリーを作製可能です。 （製品コード 7102-08） で増幅したcDNA Ovation® RNA-Seq V2 から、簡便にライブラリー作製を行うこともできます。 スタートサンプル：gDNA or ds cDNA 1∼100 ng 所要時間 ：約4時間 Workflow Sheared Genomic DNA or ds cDNA End Repair Adaptor Ligation Library Quantitation PCR 約4時間 製 品 名 容 量 製品コード 価格（税別） Ovation® Ultralow Library System V2 1-16 32回 0344-32 ¥288,000 Ovation® Ultralow Library System V2 1-96 96回 0347-96 ¥820,000 Ovation® Ultralow Library System V2 1-16 32回 0344NB-32 ¥260,000 （注意）製品コード 0344NB-32には精製用ビーズが含まれていません。 1 NuGEN社NGS製品ガイド 微量なサンプルからのMethyl-Seq用ライブラリー作製キット Ovation Ultralow Methyl-Seq Library System ® ◆わずか10 ngからdirectional なMethyl-Seq用ライブラリーを作製可能 ◆全ゲノムバイサルファイトシーケンスに最適 Ovation ® Ultralow Methyl-Seq Library Systemsは、 わずか 10 ngのgenomic DNAからライブラリーを作製可能です。本製品は、 全ゲノムバイサルファイトシーケンスを目的に使 用することが できます。 スタートサンプル：gDNA 10∼300 ng 所要時間 ：約5∼9時間 Workflow Sheared Genomic DNA End Repair Adaptor Ligation Final Repair Bisulfite Conversion Library Quantitation PCR 約5∼9時間 製 品 名 容 量 製品コード 価格（税別） Ovation® Ultralow Methyl-Seq DR Multiplex System 1-8 32回 0335-32 ¥430,000 Ovation® Ultralow Methyl-Seq DR Multiplex System 9-16 32回 0336-32 ¥430,000 RRBS法を用いたMethyl-Seq用のライブラリー作製キット Ovation RRBS Methyl-Seq System ® ◆ゲル精製不要のシンプルなワークフロー ◆必要リード数は全ゲノムバイサルファイトシーケンスの1/50 ◆新たなアダプター構造によりシーケンス解析時にPhiXは不要 Ovation® RRBS Methyl-Seq Systemは、100 ngのgenomic DNAからライブラリーを作製可能です。断片化はメチル化状態に 依存しない制限酵素Msp Iを使用します。 Forward Flow Cell Forward Read Msp I Fragment Reverse Read スタートサンプル：gDNA 100 ng 所要時間 ：約6.5時間 Reverse Flow Cell （注意）本製品には、Bisulfite Conversionに用いる 試薬は含まれていません。 Barcode Forward Read N0…N3 N0…N3 Reverse Read Forward/Reverse ReadとMsp I Fragmentの 間にランダムに塩基が0∼3個挿入されます。 Workflow Genomic DNA Msp I による 断片化 Adaptor Ligation Final Repair Bisulfite Conversion Library Quantitation PCR 約6.5時間 製 品 名 Ovation RRBS Methyl-Seq System 1-16 ® 容 量 製品コード 価格（税別） 32回 0353-32 ¥530,000 NuGEN社NGS製品ガイド 2 InDA-Cを利用したRNA-Seq用ライブラリー作製 Workflow cDNA 合成 total RNA＊ 2n d strand 合成時に基質 アナログを使用 断片化 End Repair Adaptor Ligation Strand Selection 片鎖に基質 アナログを含む 基質アナログを 含む方を除 去 InDA-C PCR 増幅 約７時間 ＊rRNA除去やPolyA精製は必要ありません。 Insert Dependent Adaptor Cleavage （InDA-C） InDA-C rRNAなど不要なリードを最大限抑制するためのNuGEN社独自の技術 FWD Gene-specific primers REV Cleavage site Ribosomal RNA Gene-specific primersで特定配列を二本鎖化し、制限 酵素処理でその配列を除去する方法。rRNA由来のcDNAの次 の反応への持ち込みを大幅に抑制する。 ヒト成人全血由来total RNAからのRNA-Seq用ライブラリー作製キット Ovation Human Blood RNA-Seq Library System ® ◆ヒト全血由来のtotal RNAからdirectionalなライブラリーを作製 ◆ヒト r RNA（12S、 16S、18S、28S）とグロビン遺伝子（ HBA1、HBA2、HBB、HBD）を InDA-C技術で効率的に除去 ◆インプット量はtotal RNA 100∼500 ng 製 品 名 容 量 製品コード 価格（税別） Ovation® Human Blood RNA-Seq Multiplex System 1-8 32回 0337-32 ¥410,000 Ovation® Human Blood RNA-Seq Multiplex System 9-16 32回 0338-32 ¥410,000 ヒトFFPE由来total RNAからのRNA-Seq用ライブラリー作製キット Ovation Human FFPE RNA-Seq Library System ® ◆ヒトFFPEおよび新鮮凍結組織由来のtotal RNAからdirectionalなライブラリーを作製 ◆ヒトrRNA（12S、16S、18S、28S）をInDA-C技術で効率的に除去 ◆インプット量はtotal RNA 100∼250 ng （FFPE） 、10∼100 ng（新鮮凍結） 製 品 名 容 量 製品コード 価格（税別） Ovation Human FFPE RNA-Seq Multiplex System 1-8 32回 0340-32 ¥475,000 Ovation® Human FFPE RNA-Seq Multiplex System 9-16 32回 0341-32 ¥475,000 ® 3 NuGEN社NGS製品ガイド さまざまな生物種からのRNA-Seq用ライブラリー作製キット Ovation Universal RNA-Seq System ® ◆さまざまな生物種由来のtotal RNAからdirectionalなライブラリーを作製 ◆各生物種のrRNA以外にも特定の転写産物をInDA-C技術で効率的に除去 ◆インプット量はtotal RNA 10∼100 ng 注：対象生物および除去したい転写産物に対して、 個別にInDA-Cプライマーをご用意いただく必要がございます。 InDA-C用プライマーの設計は、 NuGEN社が無償で対応いたしますが、 プライマーの合成は別途お客様負担となります。 製 品 名 Ovation® Universal RNA-Seq System 1-16 容 量 製品コード 価格（税別） 32回 0343-32 ¥400,000 モデル生物に特化したRNA-Seq用ライブラリー作製キット Ovation RNA-Seq System for Model Organisms ® ◆モ デ ル 生 物（ マ ウス、ラット、ショウジョウバエ、シロイヌナズナ）由来のtotal RNAから directionalなライブラリーを作製 ◆各生物種のrRNA（細胞質、ミトコンドリア）をInDA-C技術で効率的に除去。シロイヌナズナは 葉緑体rRNAも除去 ◆インプット量はtotal RNA 10∼100 ng 製 品 名 容 量 製品コード 価格（税別） Ovation® Mouse RNA-Seq System 1-16 32回 0348-32 ¥440,000 Ovation® Rat RNA-Seq System 1-16 32回 0349-32 ¥440,000 Ovation® Drosophila RNA-Seq System 1-16 32回 0350-32 ¥440,000 Ovation® Arabidopsis RNA-Seq System 1-16 32回 0351-32 ¥440,000 原核生物からのdirectionalなRNA-Seq用ライブラリー作製キット Ovation Complete Prokaryotic RNA-Seq Library System ® ◆原核生物由来のtotal RNAからdirectionalなライブラリーを作製 ◆原核生物由来のrRNAをInDA-C技術で効率的に除去 ◆インプット量はtotal RNA 100∼500 ng 容 量 製品コード 価格（税別） Ovation® Complete Prokaryotic RNA-Seq DR Multiplex System 1-8 32回 0326-32 ¥457,000 Ovation® Complete Prokaryotic RNA-Seq DR Multiplex System 9-16 32回 0327-32 ¥457,000 製 品 名 NuGEN社NGS製品ガイド 4 解析例の紹介 Ovation® RNA-Seq System for Model Organism ● InDA-C技術を利用したStranded RNA-Seqライブラリーのシーケンス解析結果 InDA-C % Aligned Reads % rRNA Reads % Strand Retention (Coding) Transcripts Detected ＋ 90 8.7 99.4 18,439 － 95 80.0 99.3 15,395 ＋ 94 2.5 98.9 12,098 － 97 53.1 98.8 7,202 ＋ 86 7.6 99.1 14,684 － 96 85.7 98.8 12,003 Mouse Rat Drosophila Mouse Universal Reference、Rat Brain、Drosophila S2 RNAsのtotal RNA 10 ngからStrand Specificなライブラリーを 作製してシーケンス解析を行った。InDA-C技術を使用することでrRNAを効率的に低減することができた。 Ovation® Universal RNA-Seq System ● さまざまな不要転写物を除くInDA-Cの例 生物種 除去ターゲット Human Cardiac actin and myosin Mouse rRNA, globin Goat rRNA, Casein protein RNAs Yeast rRNA, housekeeping genes Grape rRNA, chloroplast RNA Plant fungus Top 30 expressed transcripts in host plant Tuberculosis Human host transcripts, TB rRNA Ovation® Ultralow Library System V2 ● 1 ng gDNAからNGS用ライブラリーを作製可能 R. sphaeroides（69% GC） 400,000 Theoretical 350,000 リード数 リード数 Experimental 250,000 250,000 200,000 150,000 200,000 150,000 100,000 100,000 50,000 50,000 0 Theoretical 300,000 Experimental 300,000 S. aureus（33% GC） 350,000 0 5 10 15 20 Genome Coverage 25 30 0 0 5 10 15 20 25 Genome Coverage 極端なGC含量を持つ微生物ゲノムDNAを用いて作製したライブラリーをシーケンスした結果から、1 ngから でも同程度のカバレッジを得られることが示された。 5 NuGEN社NGS製品ガイド 30 1細胞相当のtotal RNAからのRNA-Seq用ライブラリー作製キット Ovation Single Cell RNA-Seq System ® ◆約7.5時間で10 pgのtotal RNAからdirectionalなライブラリーを作製 ◆面倒なrRNAの除去、PolyA enrichment作業は不要 ◆高等脊椎動物に広く対応 スタートサンプル：total RNA 10 pg∼10 ng or 1細胞 所要時間 ：約7.5時間 Workflow 10 pg total RNA or Single Cell Lysate Selective random primerによる 1st strand cDNA合成 cDNA Processing 2nd strand primer / FWD Adaptor付加 約7.5時間 2nd strand cDNA合成/ End Repair 5’ 3’ 3’ 5’ FWD NNN 3’ FWD REV Adaptor付加 5’ NNN REV NNN Sense Library Quantitation PCR Antisense ● HEK293細胞、および超微量total RNAからのシーケンス解析結果 % Aligned Input HEK293 Human Brain (MAQC B) % of Mapped Reads % of RefSeq Mapped Reads rRNA NonrRNA Exon Intron Intergenic % Strand Retention (coding) Sample 1 89.8 4.4 95.6 49.4 29.0 21.7 99.1 Sample 2 85.5 8.1 91.9 54.0 27.8 18.2 99.5 10 pg 87 25.1 74.9 34.3 46.7 19.0 97.5 100 pg 95 29.2 70.8 36.6 47.4 15.9 96.2 本製品を用いて、HEK293細胞（1〜6細胞）およびHuman Brain（MAQC B）のtotal RNA（10、100 pg）からそれぞれRNA-Seq用 ライブラリーを作製した。イルミナ社のシーケンサーを用いて、40 bpシングルリードで解析を行った結果、アラインされたリードの 割合が高く、rRNAのリードの割合も低減された。また、coding領域での方向性は96%以上を保持していることが示された。 製 品 名 Ovation Single Cell RNA-Seq System ® 容 量 製品コード 価格（税別） 32回 0342-32 ¥658,000 NuGEN社NGS製品ガイド 6 NuGEN社独自のSPET技術を用いたターゲット領域濃縮システム Ovation Target Enrichment System ® ◆微量のゲノムDNAからNuGEN社独自の技術であるSingle Primer Enrichment Technology によりターゲットを濃縮 ◆癌関連遺伝子、ヒトミトコンドリアゲノム、カスタムターゲット遺伝子（∼10 Mb）の検出に ! ◆簡単操作で24時間のワークフロー（8時間のオプションプロトコールも用意） スタートサンプル：gDNA 10∼500 ng 所要時間 ：約8時間∼1日 Ovation® Target Enrichment Systemは、 NuGEN社独自のターゲット配列濃縮技術であるSingle Primer Enrichment Technology （SPET） を 用いて、微量のゲノムDNAからターゲット配列を濃縮してマルチプレックスライブラリーを作製するためのシステムです。8時間プロトコールと1日 プロトコールを選択することができ、 どちらのプロトコールでも、 そのままシーケンスに使用可能なインデックス付のライブラリーを作製できます。 ターゲット配列の含有比率が高く、 高いリード数も示します。 さらに、 ターゲット配列以外のリード数は低い結果を得ることができます。SPETは、 どの 様な配列のゲノムソースに対しても数 kb∼10 Mbのターゲットサイズに対応可能です。 （製品コード 9079-08、 9079-32、 9079-96） 、 およびOvation® Cancer Panel FFPE Ovation® Cancer Panel Target Enrichment System Target Enrichment System （製品コード 9099-08、9099-32、9099-96） は、新鮮組織、 あるいはFFPEサンプル用に設計されたプローブを 用いたcancer panelで、344種類の癌関連遺伝子をターゲットとしています。 （製品コード 9087-08、 9087-32、 9087-96） は、 ミ トコンドリアゲノム全体を Ovation® Human Mitochondrion Target Enrichment System カバーするようにデザインされたプローブを用いています。 （製品コード お問い合わせください） は、 0.5 Mb以下から最大10 Mbのターゲットサイズに対応 Ovation® Custom Target Enrichment System 可能なプローブをデザイン可能です。 Workflow − DNA 5’ Genomic DNA Probe Landing Zone Target region Target region 5’ Probe Landing Zone 1. 断片化 ~500 bp 3. ターゲットプローブ／リバース アダプターのアニーリング 2. フォワードアダプター結合 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 6. ライブラリー増幅 5. PCRプライマーのアニーリング FWD 4. プローブ伸長 REV FWD REV 5’ 5’ FWD 7 NuGEN社NGS製品ガイド REV FWD REV ● Ovation® Target Enrichment Systemを用いた解析例 Target Reads % Aligned % On Target % Uniformity Large Test Panel （7.1 Mb） 7.1 M 94.1 88.8 80 ABRF Test Panel （3.5 Mb） 1.0 M 87.8 97.9 69 Ovation Cancer Panel （1 Mb） 3.5 M 95.4 86.8 85 Custom （0.6 Mb） 3.2 M 95.8 84.8 91 Ovation Mitochondrial Genome Panel （16 kb） 1.3 M 99 93 99 % On Target：ターゲット領域に対してマッピングされた塩基数の割合 % Uniformity：リードカバー率が20%以上であったターゲット領域の塩基数の割合 100 ngのgDNAを用いて、 16 kb∼7.1 Mbのさまざまな大きさのターゲットパネルでライブラリーを作製して100 bpシングルリードでシーケンス解析 を行った。アラインされたリードの割合が高く、 ターゲット領域にマッピングされた割合も高かった （80%以上）。 ターゲットのカバレッジが高い （Uniformity） ため、 最少のシーケンス結果から最大の有益情報を得ることができた。 ● PCR duplicateを同定するための新しいアダプター構造 Target Probe end Random end FC Index Primer 8nt BC N6 gDNA target FWD Primer Index read sequence REV Primer FC Read 1 sequence インデックスはサンプルを区別するための8塩基 （8nt BC） とPCR duplicateを同定するために使用するランダムな6塩基 （N6） で構成されている。 製 品 名 Ovation® Cancer Panel Target Enrichment System Ovation® Cancer Panel FFPE Target Enrichment System Ovation® Human Mitochondrion Target Enrichment System Ovation® Custom Target Enrichment System 容 量 製品コード 価格（税別） 8回 9079-08 ¥150,000 32回 9079-32 ¥500,000 96回 9079-96 ¥1,420,000 8回 9099-08 ¥150,000 32回 9099-32 ¥500,000 96回 9099-96 ¥1,420,000 8回 9087-08 ¥150,000 32回 9087-32 ¥500,000 96回 9087-96 ¥1,420,000 32回 お問い合わせ ください 96回 お問い合わせ ください ◆Ovation® Custom Target Enrichment System 参考価格の一例 1 kb ‒ 0.5 Mbのターゲットサイズ 0.5 Mb ‒ 1 Mbのターゲットサイズ 32回 ⇒ ¥740,000 （税別） 96回 ⇒ ¥1,850,000 （税別） 32回 ⇒ ¥1,120,000 （税別） 96回 ⇒ ¥2,550,000 （税別） 1 Mb以上の価格はお問い合わせください。 上記価格は参考価格です。 カスタム製品は打合せ後に最終金額が確定いたします。 NuGEN社NGS製品ガイド 8 NuGEN社独自のSPET技術を用いたターゲット領域濃縮システム Ovation Fusion Panel Target Enrichment System ® ◆微量のRNAからNuGEN社独自の技術であるSingle Primer Enrichment Technologyにより ターゲット融合遺伝子を濃縮 ◆500遺伝子をターゲットとする融合遺伝子の検出に! ◆カスタムターゲット遺伝子にも対応 スタートサンプル：total RNA 10∼200 ng 所要時間 ：約10時間∼1日 Ovation ® Fusion Panel Target Enrichment System（製品 コード 9104-08、9104-32、9104-96） は、NuGEN社独自の ターゲット配列濃縮技術であるSingle Primer Enrichment Technology（ SPET） を用いて、微量RNAからターゲット配列を 濃縮してマルチプレックスライブラリーを作製するためのシステム です。 英国サンガーセンターのSomatic Mutations in Cancer （COSMIC） とChimerDB 2.0のデータベースで融合遺伝子として同定されている 500遺伝子の全エキソン領域をターゲットに含んでいます。Ovation® cDNA Module for Target Enrichment （製品コード 9103-08、 9103-32、 9103-96） により、 total RNAから二本鎖cDNAを作製し て、NuGEN社独自のターゲット配列濃縮技術であるSPETを 用いてライブラリー作製を行えます。あらかじめ決められた500 遺伝子以外にも、任意の遺伝子 （∼10 Mb） に対しても適用するこ とが可能です。 Workflow − RNA Probe Landing Zone Transcript 5’ UTR 3’ Target exon B Exon A Exon C Exon D UTR PolyA Probe Landing Zone Ovation cDNA Module for Target Enrichmentによるds cDNA作製 3. ターゲットプローブ／リバース アダプターのアニーリング 2. フォワードアダプター結合 1. ds cDNA調製、末端修復 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5. PCRプライマーのアニーリング 5’ FWD 6. ライブラリーの増幅 FWD REV REV REV NuGEN社NGS製品ガイド REV 9 FWD 5’ FWD 4. プローブ伸長 ● Ovation® Fusion Panel Target Enrichment Systemを用いた効果的なFusion Geneの検出 350 1.6 M Targeted Reads Fusion Read Count 300 125 M Untargeted Reads 250 8.7 M Targeted Reads 200 150 100 50 0 BCR-ABL NUP214-XKR3 FGF1R-WHSC1L1 MLLT10-PICALM 100 ngのUHR total RNAから、Ovation® Fusion Panel Target Enrichment SystemおよびConventionalなRNA-Seq法で ライブラリーを作製した。1ライブラリー当たり、 わずか1.6 MリードでBCR-ABLとNUP214-XKR3のfusion geneを検出することが できた。また、ConventionalなRNA-Seq法（125 M Untargeted Reads） と比較しても、同程度のFusion Read Countを得る ことができた。すなわち、本システムでは、ConventionalなRNA-Seq法と比較して少ないリード数でfusion geneを検出することができた。 FGF1R-WHSC1L1とMLLT10-PICALMのfusion geneはConventionalなRNA-Seq法では検出できなかったが、 本システムを用いると 8.7 Mリードで検出できた （FGF1R-WHSC1L1は1.6 Mリードでも検出可能） 。 なお、fusion gene検出にはSOAPFuseを使用した。 ● Ovation® Fusion Panel Target Enrichment Systemを用いた解析例 Input total RNA Reads % Aligned % On Target 1 ng 1.6 M 90 92 10 ng 5.5 M 89 93 100 ng 4.0 M 92 92 ヒト肺癌細胞由来のH2228からtotal RNAを抽出後、Ovation® Fusion Panel Target Enrichment Systemを用いてライブラリーを 作製し、75 bpペアエンドでシーケンス解析を行った。1 ng、10 ng、100 ngのいずれの量のtotal RNAを用いた場合でも、 アラインされた リードの割合が高く、 ターゲット領域にマッピングされた割合も高かった （90％以上） 。 製 品 名 Ovation® cDNA Module for Target Enrichment Ovation® Fusion Panel Target Enrichment System 容 量 製品コード 価格（税別） 8回 9103-08 ¥38,000 32回 9103-32 ¥136,000 96回 9103-96 ¥360,000 8回 9104-08 ¥150,000 32回 9104-32 ¥500,000 96回 9104-96 ¥1,420,000 必ずOvation® cDNA Module for Target Enrichmentが必要です。 【注意】Ovation® Fusion Panel Target Enrichment Systemの使用には、 NuGEN社NGS製品ガイド 10 NGS（次世代シーケンサー）解析に利用できるcDNA増幅システム Ovation RNA-Seq System V2 ® ◆わずか500 pgのtotal RNAから4.5時間以内にμgオーダーのcDNAを増幅 ◆rRNAの除去が不要 Ovation ® RNA-Seq System V2は、NGSによるトランスクリプ トームシーケンス解析に利用されるcDNAライブラリー作製に 最適なcDNA増幅システムです。わずか500 pgのtotal RNAを 4.5時間以内にμgオーダーのcDNAに増幅することができます。 Ovation® RNA-Seq V2 500 pg～100 ng total RNA サンプル cDNA増幅 スタートサンプル：total RNA 500 pg∼100 ng 所要時間 ：約4.5時間 Ovation® Rapid Library System Ovation® Ultralow Library System V2 Illumina NGS Platforms Other Commercial Library preparation systems Other NGS Platforms ライブラリー作製 ● total RNAおよびPolyA＋ RNAをインプットとして使用した場合のRNA-Seqリードカバー率の比較 脳 PolyA 5 ng 脳 PolyA 50 ng 脳 Total RNA 2 ng により増幅し、Encore® NGS Multiplex MAQCサンプル （脳） のtotal RNA（2∼50 ng） をOvation® RNA-Seq System V2（本製品） System Iを用いてライブラリー構築を行った。PolyAの結果はtotal RNAからPolyA＋ RNAを精製後、本製品を使用した。Illumina Genome Analyzer IIxによりシングルリードシーケンスを行い、 リードカバー率をプロットした結果、 いずれのRNA量 （2∼50 ng） においても、 リードカバー率は PolyA精製に関わらずほぼ同程度であった。 製 品 名 Ovation® RNA-Seq System V2 容 量 製品コード 価格（税別） 8回 7102-08 ¥234,000 32回 7102-32 ¥705,600 96回 7102-A01 ¥2,116,800 The Ovation and Applause System family of products and methods is covered by U.S. Patent Nos. 6,692,918, 6,251,639, 6,946,251 and 7,354,717, and other issued and pending patents in the U.S. and other countries. NuGEN®, Ovation®, SPIA®,Ribo-SPIA®, WT-Ovation®, Encore®, Applause®, Prelude®, and Imagine More from Less are trademarks or registered trademarks of NuGEN Technologies, Inc. ・本パンフレットで紹介した製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、家庭用品等として 使用しないでください。 ・タカラバイオの承認を得ずに製品の再販・譲渡、再販・譲渡のための改変、商用製品の製造に使用することは禁止されています。 ・本パンフレットに記載された社名および製品名は、特に記載がなくても各社の商標または登録商標です。 ・ライセンス情報については弊社ウェブサイトにてご確認ください。 ・本パンフレット記載の価格は2015年7月1日現在の希望小売価格です。価格に消費税は含まれておりません。 取扱店 東京支店 関西支店 TEL 03-3271-8553 FAX 03-3271-7282 TEL 077-565-6969 FAX 077-565-6995 TaKaRa テクニカルサポートライン TEL 077-543-6116 FAX 077-543-1977（2015年８月７日まで） TEL 077-565-6999 FAX 077-565-6995（2015年８月10日から） Website http://www.takara-bio.co.jp 2015年7月作成19.5K
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