次世代シーケンスにおける「第3のブランド」 クロンテック社が今オススメする NGS関連製品のご紹介 米国NGSマーケットにおけるブランディング調査で、2大装置メーカーに次いで3位に選ばれたクロンテック。 そのクロンテックが持つ数あるNGS製品の中から、特におススメする製品をピックアップしてご紹介します。 ■ RNA-Seq関連キット 超微量RNAからでも高品質なcDNAを調製可能 SMARTer® Ultra™ Low Input 超微量サンプル total RNA 10 pg or 1細胞 RNA Kit for Sequencing - v3 高品質 cDNAが完成! <解析プラットフォーム> ・イルミナ社NGS装置 ・IonTorrent 品質の良いRNA、悪いRNAとも使用可能。リボゾームRNA除去からライブラリー調製までが約5時間で完了 SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian RIN値 3~10 の total RNA 100 ng 方向性情報をもった ライブラリーが完成! リボゾーム RNA除去 <解析プラットフォーム> ・イルミナ社NGS装置 ※RIN=RNA Integrity Number ■ イルミナ社NGS装置用 ライブラリー定量キット 高性能PCR酵素を使用したリアルタイムPCRによる定量キット。高いコストパフォーマンスも魅力! Library Quantification Kit Terra qPCR Direct SYBR Premix 他社同タイプキットのSYBR qPCR試薬 MightyAmp®テクノロジーを詰め込んだPCR 酵素「Terra™」の採用で、他社キットと比べて バイアスの少ない増幅が可能 →→ ■ リボゾームRNA除去キット 高いrRNA除去率と優れた操作性を兼ね備えたキット RiboGone™- Mammalian リボゾームRNAの除去に、DNA-RNAハイブリダイゼーション&RNase Hテクノロジーを採用。 だから、高効率で使い勝手も抜群です! 各製品の詳細は本パンフレットの内面をご覧ください ウェブサイト http://www.takara-bio.co.jp 超微量RNAにも対応可能なcDNA調製キット SMARTer® Ultra™ Low Input RNA Kit for Sequencing - v3 NGS解析プラットフォーム: イルミナ社NGS装置 Ion Torrent 超微量RNA RNA-Seq トランスクリプトーム解析 【スタートサンプル】 total RNA 10 pg (1細胞)~10 ng 【逆転写プライマー】 SMART CDS Primer (改変型Oligo dT) ✔ 1 細胞またはtotal RNA 10 pgなどの超微量サンプルからもcDNA調製が可能 ✔ 簡単、シンプルな1チューブプロトコール ✔ GCリッチに強い高性能PCR酵素「SeqAmp™ DNA Polymerase」入り 製 品 名 SMARTer® Ultra™ Low Input RNA Kit for Sequencing - v3 容 量 製品コード 価格(税別) 12回 634848 ¥260,000 24回 634849 ¥480,000 48回 634850 ¥780,000 96回 634851 ¥1,200,000 192回 634852 ¥2,000,000 480回 634853 ¥4,780,000 ※別途ライブラリー調製キットが必要です。 イルミナ社NGS装置の場合はクロンテック社 Low Input Library Prep Kit (製品コード 634947) を推奨します。 Ion Torrentの場合は Ion Xpress Plus Fragment Library Kit(Life Technologies)を使用してください。 total RNAから、わずか5時間で方向性情報をもったライブラリー調製が可能 SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian 方向性情報をもつライブラリー作製 RNA-Seq NGS解析プラットフォーム: イルミナ社NGS装置 全トランスクリプトーム解析 【スタートサンプル】 total RNA 100 ng~1 μg 【逆転写プライマー】 SMART Stranded N6 Primer (改変型N6 Random) ✔ リボゾームRNA除去からライブラリー調製まで、シームレスで簡便な操作ステップ ✔ 品質の良いRNA、悪いRNAとも対応可能でサンプルを選ばない ✔ 対象生物種はヒト、マウス、ラット 製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別) 12回 634873 ¥280,000 24回 634874 ¥480,000 48回 634875 ¥820,000 96回 634876 ¥1,400,000 192回 634877 ¥2,300,000 480回 634878 ¥4,600,000 ® SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian - 2 - クロンテック社おすすめのNGS関連製品 イルミナ社NGS装置用ライブラリー定量キット Library Quantification Kit ★ リアルタイムPCRベースの他社同タイプキットと比べて・・・ ⇒ 高性能qPCR試薬 Terra™ qPCR Direct SYBR® Premix により、バイアスの少ない定量が可能です! 【実施例】 各キットに含まれているスタンダードDNAのqPCR効率を100%として、様々なGC含量および鎖長を持つDNAを (クロンテック社取得データ) ターゲットとした測定で効率を比較した。 ・・・Terra™ qPCR Direct SYBR® Premix ・・・他社同タイプキットのSYBR® qPCR試薬 ― 様々な鎖長における反応効率 ― Normalized qPCR Efficiency Normalized qPCR Efficiency ― 様々なGC含量(%)における反応効率 ― 100% Kit Standard 100% 100% T. thermophilus (69.5%) 99% 100% E. coli (50.8%) 98% 96% S. cerevisiae (38.1%) 98% 93% 100% Kit Standard 254 bp 413 bp 590 bp 773 bp 100% 100% 101% 100% 100% 98% 99% 90% 98% 71% GC含量の変動や鎖長に関わらず、Terra™ qPCR試薬の効率はほぼ一定であり、ターゲットの種類による qPCR のバイアスが少ないことが示されました。 製 品 名 Library Quantification Kit 容 量 製品コード 価格(税別) 500回 638324 ¥98,000 わずか10 ngのtotal RNAからでもリボゾームRNA除去が可能なキット RiboGone™- Mammalian ✔ 微量total RNA(10~100 ng)からrRNAを効率的に除去(除去率95%以上) ✔ ヒト、マウス、ラットtotal RNAからのリボゾームRNAやミトコンドリアRNAの除去に → 本キットは5S、5.8S、18S、28SのリボゾームRNAと、12SミトコンドリアRNAを除去します。 ✔ FFPEサンプルなど分解RNAにも使用可能 ✔ Random primerを用いたcDNA調製キットとの組み合わせを推奨 製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別) 6回 634846 ¥80,000 24回 634847 ¥280,000 RiboGone™- Mammalian クロンテック社おすすめのNGS関連製品 - 3 - ■ その他のクロンテック社NGS関連製品のご紹介 製 品 名 概 要 容 量 製品コード 価格(税別) 2 chips 634832 ¥180,000 10 chips 634833 ¥610,000 ・イルミナ社NGS装置、Ion Torrentのいずれにも使用 可能 10回 634938 ¥228,000 ・RiboGone-Mammalianと 組み合わせての使用を推奨 25回 634940 ¥456,000 10回 634945 ¥380,000 25回 634946 ¥760,000 12回 634947 ¥230,000 12回 634865 ¥110,000 48回 634866 ¥380,000 48回 634867 ¥380,000 フリューダイム社C1 System専用cDNA調製キット SMARTer® Ultra™ Low RNA Kit for the Fluidigm C1™ System, 2 IFCs SMARTer® Ultra™ Low RNA Kit for the Fluidigm C1™ System, 10 IFCs その微量性能の高さから、 シングルセル自動解析システ ムC1で採用されました。 Random PrimerベースのcDNA調製キット ® SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing ライブラリー調製キットを含むSMARTer® Universalキット ® SMARTer Universal Low Input RNA Library Prep Kit ・イルミナ社NGS装置用 ・RiboGone-Mammalianと 組み合わせての使用を推奨 イルミナ社NGS装置用ライブラリー調製キット Low Input Library Prep Kit ・わずか50 pgのds cDNAか らライブラリー調製が可能 ・SMARTer v3と組み合わせ ての使用を推奨 イルミナ社NGS装置用ChIP解析ライブラリー調製キット DNA SMART™ ChIP-Seq Kit - 12 DNA SMART™ ChIP-Seq Kit - 48 A ・わずか100 pgの微量ChIP (クロマチン免疫沈降)サンプ ルからでもライブラリー調製 が可能 ・ライゲーション反応に依らず にアダプターを付加。操作時 間は他社キットの半分程度 DNA SMART™ ChIP-Seq Kit - 48 B ・本パンフレットで紹介した製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、 家庭用品等として使用しないでください。 ・タカラバイオの承認を得ずに製品の再販・譲渡、再販・譲渡のための改変、商用製品の製造に使用することは禁止されています。 ・本パンフレットに記載された社名および製品名は、特に記載がなくても各社の商標または登録商標です。 ・ライセンス情報については弊社ウェブサイトにてご確認ください。 ・本パンフレット記載の価格は2015年1月5日現在の希望小売価格です。価格に消費税は含まれておりません。 2015年1月作成G 取扱店 東京支店 TEL 03-3271-8553 FAX 03-3271-7282 関西支店 TEL 077-565-6969 FAX 077-565-6995 TaKaRaテクニカルサポートライン TEL 077-543-6116 FAX 077-543-1977 Website http://www.takara-bio.co.jp Facebook http://www.facebook.com/takarabio.jp
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