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次世代シーケンサ用ソリューション
エクソーム・ヒト疾患関連遺伝子のシーケンスに
目的に合わせて選択できる
SureSelect
Human All Exon V5
Clinical
Research Exome
Focused
Exome
遺伝性疾患リサーチ
キャプチャライブラリ
エクソームの
ゴールデンスタンダード
クリニカルリサーチ向け
エクソーム
疾患関連遺伝子
フォーカスエクソーム
遺伝性疾患研究に最適
カバレッジ
50 Mb
54 Mb
全エクソン
全エクソン
V5 の疾患関連領域強化
+
疾患関連 SNPs
16 Mb
約 5,700
10.5 Mb
2,741
遺伝子
遺伝子
体質性疾患関連遺伝子
遺伝性疾患 約 4,000 に
関連する既知の遺伝子
HGMD, OMIM,
ClinVar
適したシーケンサ
High Througput シーケンサ
High Througput シーケンサ
デスクトップ型
デスクトップ型
シーケンサ
シーケンサ
High Througput シーケンサ
High Througput シーケンサ
Ordering Information
16 反応:5190-6208
16 反応:5190-7338
16 反応:5190-7787
16 反応:5190-7518
96 反応:5190-6209
5190-6210
96 反応:5190-7339
5190-7344
96 反応:5190-7788
5190-7789
96 反応:5190-7519
5190-7520
(自動化)
(自動化)
(自動化)
(自動化)
より少ないシーケンス量
SureSelect で信頼性の
Human All Exon V5
SureSelect V5(4 Gb)
100%
A 社エクソーム(4 Gb)
90%
エクソームのゴールデンスタンダード
80%
SureSelect 発売以来、改良を重ねた 5 代目の製品
です。より少ないシーケンス量で高い On Target %
70%
とカバレッジを実現。最も数多く使用されている
エクソーム解析のスタンダード製品です。
B 社エクソーム(4 Gb)
60%
50%
40%
30%
Clinical Research Exome
% bases >10x cov.
% bases >20x cov.
All regions
100%
Disease-Associated Regions
90%
クリニカルリサーチ向けエクソーム
Emory University と The Children's Hospital of Philadelphia
との共同開発製品。
V5 のコンテンツのうち、疾 患に関 連した 4,704
遺 伝 子 の 7.5 Mb の 領 域 の カバレッジ を 強 化。
さらに疾患関連 SNPs を中心に 4 Mb の領域を追加。
V5 と同等のシーケンス量で、7.5 Mb の疾患関連
遺伝子領域のカバレッジが向上しています。希少
疾患に関連する遺伝子の探索に最適なデザイン
です。
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%
1x
5x
10x
20x
30x
40x
50x
% Bases Covered
8 HapMaps,
XT, ILM, 4 Gb 2x100 bp
2
Next Generation Sequencing
で、より高いカバレッジ
高い変異解析を実現 Focused Exome
100%
1X
99%
20X
98%
97%
疾患関連遺伝子フォーカスエクソーム
96%
95%
デスクトップ型のシーケンサでも、疾患関
連遺伝子を網羅的に、かつ高いカバレッジ
で解析したいというご要望にお応えする製
品です。HGMD, OMIM, ClinVar のターゲット
にフォーカスし、約 5,700 の体質性疾患関
連遺伝子を均一性の高いカバレッジで解
析します。
94%
93%
92%
91%
90%
NA10831N A18507 NA12155N A12156 NA18997N A12891 NA18953N A12878
3 Gb のシーケンス量で平均 200 x のカバレッジ。
ターゲットの 98 % は 20 x 以上のカバレッジでの解析を実現。
100%
400x (6.0 Gb)
95%
200x (3.0 Gb)
90%
100x (1.5 Gb)
80x (1.3 Gb)
85%
62.5x (1.0 Gb)
80%
75%
70%
65%
60%
遺伝性疾患リサーチ
キャプチャライブラリ
1X
20X
カバレッジの均一性が高いので
シーケンス量に比例してカバレッジ
が向上しています。
Performance at 1Gb
3Gb
100%
100%
90%
90%
80%
80%
70%
70%
Medical Genetics, Charite Berlin との 共 同 開
発製品。既知の約 4,000 の遺伝性疾患に
関連する遺伝子 2,741 をターゲット。MiSeq
60%
60%
50%
50%
40%
40%
でトリオ解析が可能です。
30%
30%
20%
20%
10%
10%
遺伝性疾患研究に最適
0%
NA10830 NA10831 NA12878 NA12891 NA18507 NA18953 NA18956 NA18997
% on-target ±100 bp
% bases at 1x
% bases at 20x
% bases at 30x
0%
Ave for 8 HapMaps
% duplicates
1 Gb のシーケンス量で、平均 100 x のカバレッジを実現。
ターゲットの 85% 以上が 200 x の高いカバレッジで解析できます。
1 Gb(100x)2x100 bp
本パネルを用いた研究とデータ解析ツールについての参考文献
Effective diagnosis of genetic disease by computational phenotype analysis of the disease-associated genome
Science Translational Medicine, 6, 242ra123 (2014)
3
Enabling Your Success
SureSelect QXT
“ライブラリ調製1日”の高速化を実現
SureSelect QXT Reagents キット
• トランスポゼースを使い、断片化からアダプタ付加までが 1
• ハイブリダイゼーションは従来の 16 時間から 90
分に
step
• 必要な gDNA 量は 50 ng
SureSelect QXT で圧倒的な省力化・時間短縮
ライブラリ調製
従来の
SureSelect QXT
End
Repair
断片化
SureSelect XT
Transposase による
断片化とアダプタ付加
dA
Tailing
ハイブリダイゼーション
Ligation
16 hr
PCR
:AMPure
ビーズ精製
その日のうち に
PCR
2 hr
より確かな
研究成果へ
5 hr
ターゲットエンリッチメントが
90 min
完了!
サンプル QC からデータ解析までトータルソリューションをご提供
疾患リサーチ向けコンテンツ
サンプル QC・
ライブラリ QC
• Human All Exon V5
• Clinical Research Exome
• Focused Exome
• 遺伝性疾患リサーチ
SureSelect/
HaloPlex
データ解析
ソリューション
• SureCall( 無償)
2200 TapeStation
簡単な操作で
ハイスループット
SureDesign(無償)
(カスタムプローブ設計用 Web ツール)
簡単・迅速なプロトコル
(SureSelect/HaloPlex 専用
データ解析ソフトウエア、
Human のみ))
• シーケンスデータを自動解析
カスタムコンテンツ
販売店
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本社 / 〒 192-8510 東京都八王子市高倉町 9-1
●カストマコンタクトセンタ 0120-477-111
mail:email_ [email protected]
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※本資料掲載の製品は全て研究用です。
その他の用途にご利用いただくことはできません。
AgilentGenomics.jp
© Agilent Technologies, Inc. 2014
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改変、翻訳することは、著作権法で認められている場合を除き、
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Printed in Japan, Nov. 14, 2014
5991-5331JAJP