INSEGNAMENTO: Metodologie diagnostiche di Biochimica e di Biologia molecolare MODULO: METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE Obiettivi formativi Scopo del corso è di introdurre gli studenti ai principi ed alle tecnologie di base ed avanzate della biologia molecolare clinica, di illustrarne le modalità di applicazione nella diagnosi, nella predizione, nella prognosi e nel supporto terapeutico delle principali patologie umane. Programma Programma in forma sintetica Definizione e scopi della Biologia molecolare clinica; principali tecniche impiegate: la reazione polimerasica ed i metodi di ibridazione; principali applicazioni a differenti alterazioni congenite ed acquisite, comprese le neoplasie; prelievo, estrazione e conservazione dei materiali;espressione proteica e metodi proteomici; tecnologie high-throughput, gene arrays, principi di pattern recognition. Programma in forma estesa: Parte generale La rivoluzione della Biologia Molecolare e il suo impatto sulla pratica della medicina. La mappatura del genoma umano nel Progetto Genoma Umano. Potenzialità della Biologia Molecolare clinica nella predizione di malattie, nella diagnosi, nella prognosi e nel guidare la terapia Visione generale sulle tecniche ad alta sensibilità basate sui metodi di amplificazione, quali reazione polimerasica (PCR), branched-DNA (BDNA), ibridazione in situ fluorescente (FISH) e spettroscopia di massa Principi basici del meccanismo genico DNA e RNA, struttura e stabilità. - Principali caratteristiche differenziali di DNA e RNA. - Melting e annealing. Organizzazione in vivo delle molecole di DNA e di RNA Principali enzimi la cui funzione è associata agli acidi nucleici: - Polimerasi - Trascrittasi inversa - DNA ligasi - Desossi- e ribonucleasi - Endo ed exo-nucleasi - Endonucleasi di restrizione Replicazione del DNA trascrizione del DNA a RNA e modificazioni post-trascrizionali Traslazione di RNA a proteine, controllo trascrizionale Regolazione genica, sRNA, meccanismi epigenetici Meccanismi di riparazione del DNA Mutazioni del DNA Principali tecniche di studio Estrazione degli acidi nucleici Separazione Elettroforetica Ibridazione degli acidi nucleici Componenti di base Sonde, cDNA, RNA Condizioni di ibridazione Metodi di rivelazione dell’avvenuta ibridazione, formati di ibridazione, fasi di ibridazione - ibridazione su supporto solido, - ibridazione dot/blot e reverse dot/blot, - tecniche di ibridazione Southern e northern, - ibridazione su microarrays, - ibridazione in situ, FISH Metodi di amplificazione, Rivelazione dei polimorfismi, Sequenziamento del DNA Reazione polimerasica a catena – PCR e Real-time PCR (varie tecniche) Principali metodi impiegati in proteo mica (tipi di elettroforesi, cromatografia, spettrometria) Elementi di bioinformatica
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