iGEM Team: TU Delft Leiden 2014 Some teams also make their own

iGEM
TU Delft
Leiden
2014
1
iGEM Team:
Bronze, silver and gold medals can be earned in every
iGEM competition. A list of requirements need to be
met in order to earn each medal. On top of this there are
TU Delft Leiden 2014
2008
Prize: Best wiki page
Temperature sensing
E. Coli.
also prizes for the three best projects overall. In 2013
only 40 % earned a gold medal. The TU Delft iGEM team
won gold medals in 2008, 2009, 2010, 2012 and 2013.
2009
Prize: Best
information project
A cell-to-cell
communication
2012
2010
FINALIST
Prize: Best presentation
Cleaning oil spills with
system.
WHAT IS IGEM?
bacteria
Prize: Best debata
A modular system
for detecting volatile
compounds.
2013
Antimicrobial peptides
to kill antibiotic
resistant MRSA.
Some teams also make their own gadget based on their synthetically enhanced
organism.
The International Genetically Engineered Machine competition (iGEM) is the
premiere undergraduate synthetic biology competition. iGEM started in 2003
In the first week of November, multi-disciplinary teams from around the world
with a month-long course during MIT’s Independent Activities Period; the first
will meet in Boston to compete in the Jamboree. Their work will be presented
year’s students designed biological systems to make cells blink.
to a large scientific community at the Hynes Convention Center.
This design course grew 5 teams in 2003 to 244 teams in 2014. The teams consist
This year, a team of 13 enthusiastic students, with diverse backgrounds, from
entirely of students and are guided by supervisors of different backgrounds.
TU Delft, Leiden University and Rotterdam University is aiming to bring biology
Working at their universities over the summer, teams design synthetically
and electronics closer together, resulting in a cool and necessary application.
enhanced organisms. Each iGEM team must also make its own wiki page and
We will design and produce an Escherichia coli strain that can transport
work on fundraising, budget, public relations and human practice.
electrons and detect landmines as a final application.
1
E ectrace
Demining:
a global issue
The
detection
of
landmines
is
Our project is called ELECTRACE,
important, because they need to
which
stands
be removed where possible. This
TRAnsport deviCE.
for
ELECtron
removal is essential, as landmines
are always a danger, not only in time
We
are
going
to
design
an
of war, but also in time of peace.
Escherichia coli strain that can detect
the chemicals that are secreted by
Landmines have been used during
landmines (which are primarily TNT,
war in many different countries over
DNT and DNB) and initiate a current
the past decades as a strategic
by using electron transport, resulting
military weapon, but when the war
in the visualisation of landmines in
is over and the danger seems past,
the ground.
these landmines are still active and
can be triggered easily.
This can be done by using the
relation between the concentration
Civilians that are passing by can
of the detected chemicals and the
trigger the landmine, causing a
distance to the landmine.
devastating explosion that causes
imminent death in many cases. Most
Eventually,
victims are children, as they are
incorporate this into a ready-to-use
smaller in general and sometimes
device. This device will be easily
see modern colourful mines as toys.
usable
for
we
would
everyone,
like
to
including
children, all over the world.
Annually there are 15,000 to 20,000
deaths caused by landmines, not
even counting the injuries. These
numbers are a reason for us to
participate in iGEM with the project
we chose.
2
Media attention
iGEM: a TU Delft Dream Team
The last couple of years the TU Delft iGEM teams have made an appearance
iGEM is a part of the large TU Delft Dream Team family! Dream Teams are
in newspapers, on websites and even on TV. The team of 2013 had an article
teams that pursue different goals in many different categories of science. Boats
on the websites Ad.nl, Telegraaf.nl, kennislink.nl and many more.
or racing cars that use solar energy, cars that travel a very large distance
using only one litre of fuel, racing bikes that break the world’s speed record
for human powered bikes and many others.
The team of 2012 made one of the biggest newspapers in the Netherlands,
the NRC Handelsblad, with a two-page article. This year we even want more
publicity, as we want to give people the chance to learn about synthetic biology.
NRC Handelsblad Dinsdag 7 augustus
NRC Handelsblad Dinsdag 7 augustus
18 Mens&
Zomertweets
alexander kraai @alexscooter
weekdag:
Eerste werkdag: #vertraging :( Tweede
Het #gaatgoed,
#verslapen + nat van de regen :(
:)
maar niet heus!! #bijnaweekend
& Woensdag 8 augustus 2012
19
& Woensdag 8 augustus 2012
Erna Temming @ErnaTemming
Oisterwijk bij
Supergezellig optreden gedaan in
feest hier,
#vakantiepark De Boskant, wat een
GEZ ELLIG #ikhebjelief
Tjebbo @TjebboGerritsma
rs die maar door
Ik word gek van al die interviewe
wel een feestje
blijven zaniken of ‘Kromowidjojo
gaat vieren’. Kuikens zijn het!! #goud
Sara Kroos @ KroosSara
koeien en schapen.
Soms vind ik het echt zielig voor
ik bespeur
Al zegt iedereen dat ze ertegen kunnen,
toch soms een sippe blik. #regen
Lisa de Jong @Just_LisadeJong
crackhok,
#Chambre d’hote was een of ander
ander Novotel.
dus nu zijn we gestrand in een of
kamer... =)
Heerlijk met zijn 4’en in een 2-pers.
eur
De vakantie van een fietstaxichauff
‘Een gratis sportschool is
dit – en ik verdien eraan’
ben moe als ik thuiskom.
Even naar de kroeg voor
een koud biertje en dan
duik ik m’n bed in. Dat
het veel energie kost, laat
ik overdag niet merken.
Werkt: bij de FietstaxiAls ik met stevige menRotterdam
in
centrale
sen achterin de Erasmusbrug op fiets, is het niet
„Over de Maasboulevard
leuk als ze zien dat ik affietsen met leuke menzie. Dan denken ze dat ze
op
Uitzicht
sen achterin.
te zwaar zijn en stappen
Rotterdam en de rivier.
ze misschien uit. Gewoon
Zonnetje erbij. Vakantie
blijven lachen dus.”
in eigen stad, dat is de
„Na een heel drukke
vakantieperiode
De
van
g
omschrijvin
beste
dag neem ik weleens een
brengt topdrukte in de
mijn zomerbaan.”
rustdag. Dat wil zeggen:
toerismesector. Mensen
„Ik ben nu een kleine
dan fiets ik iets minder,
reshotels,
in
werken
die
maand fietstaxichaufneem wat vaker pauze,
taurants, langs stranden,
feur. Dat doe ik in de vapak eens een terrasje. Ik
als gids in steden of nakantie van mijn werk als
maak het zo zwaar en
tuurgebieden – wanneer
sporthalbeheerder en
leuk als ik zelf wil. Het
gaan ze zelf met vakantie
sportinstructeur. Buiten
liefst rij ik natuurlijk met
en waarheen?
mijn werk ben ik als mapassagiers: dat is gezellig
Deel 6 van een serie.
rathonloper ook bezig
en dan verdien ik ook
met bewegen. Omdat ik
nog wat. Want het geld
jaar
van sport hou en dit
dat ik vang, mag ik houden. De fietstaxi
ufniet op vakantie ga, leek fietstaxicha
huur ik.”
princifeur mij een leuke zomerbaan. In
markante dingen mee.
ook
maak
„Ik
ik
pe is dit een gratis sportschool. En dat
zat er een schreeuwende vrouw
Laatst
denk
Ik
aan.
eens
verdien er ook nog
met kinderen achterin. Ze ging tekeer
man
ik het na mijn vakantie in de weekenden
tegen haar kinderen, terwijl haar
blijf doen. Het is heerlijk.”
sjokte met een blikje
aan
taxi
de
achter
uitge„Fietstaxichauffeur is een bijzonder
bier in z’n hand. Dat moet er raar
om,
beroep. Mensen op straat kijken
zien hebben.
ik
vraag
ritje
sommigen zwaaien zelfs. Bij andere dat
ieder
van
„Aan het eind
ze tebaantjes heb je dat niet snel. Ik denk
mensen wat ze er van vonden. Zijn
van
stapik passagiers meer dan een taxiritje
vreden, dan ben ik dat ook. Vaak
nog
meestal
hebben
Ze
Mijn
a naar b bezorg.
pen mensen uit met een glimlach.
ik
keer
paar
een
nooit in een fietstaxi gezeten. En
heeft
Ze
ook.
dochtertje
mooie
ik
breng ze naar leuke plekjes, neem
achterin gezeten. Dan voelt het alsof
twee
routes. Zo bracht ik vanochtend
toch nog op vakantie ben.”
Eurovrouwen naar een terrasje bij de
ik net.”
mast. Ze zitten er nog steeds, zag
Tekst & foto Tom Vennink
Ik
„Anderzijds is het een zware baan.
Naam: Adriaan van der
Pol (41)
Is: fietstaxichauffeur
In de race voor het
wereldkampioenschap
Studenten in de ‘life sciences’
·(biologie
en verwante wetenschap-
ale
pen) doen mee aan een internation e
onderzoekswedstrijd in synthetisch
het
biologie. Synthetische biologie,
(al
bouwen en verbouwen van cellen
dan niet met behulp van genetische
biode
van
onderdeel
is
),
modificatie
technologie.
De naam van de wedstrijd luidt
·iGEM
(International Genetically Engi-
neered Machine). Wereldwijd doen
waarbijna tweehonderd teams mee,
onder vijf uit Nederland.
bedoeling van de wedstrijd is dat
·deDeteams
met behulp van gestandaar-
s’), die
diseerde DNA-stukjes (‘biobrick
le
worden geleverd door commercië
bedrijven, een eigenschap toevoegen
een
aan een micro-organisme, zoals
zovirus,
een
gistcel, een bacterie, of
dat er een maatschappelijk nuttige
toepassing ontstaat.
De studententeams bedenken hun
zijn
eigen project. De iGEM-projecten
grotendeels afhankelijk van sponsors.
De teams zijn zelf verantwoordelijk
voor fondsenwerving.
·
De Delftse studenten (aangevuld
·met
twee studenten uit Leiden) ge-
bruiken als biobrick een standaard-geurdetector die op de aanwerezigheid van tuberculosebacterieën
De uitageert door groen op te lichten.
daging is deze detector in te bouwen
in gistcellen, zodat met een eenvoudituge blaastest goedkoop en effectief
.
berculose kan worden opgespoord
All these projects are very progressive and many of these projects are well
known to people all over the world. iGEM has been part of the Dream Team
family since 2011 and is proud to be part of this family.
Straatbeeld
5 tot 7 oktober vindt aan de VU
·inVan
Amsterdam de Europese voorronde
besplaats. Er doen 52 teams mee. De
de
te achttien teams mogen door naar
het
finale, van 2 tot 5 november aan
MIT in Boston.
TU
In 2010 eindigde een team van de
·Delft
met een olie-afbrekende bacterie
bij de beste zes van de wereld.
en student Menno Witteveen. Foto
NRC Handelsblad, Rien Zilvold
t lab
Fijne vakantie, gewoon thuis, in he
Van links af: student Lizah van der
Aart, begeleider Esengül Yildirim
: doorwerken,
Ook een manier van vakantie nemen
de wereld te worden.
aan een wedstrijd, om de beste van
orium van
laborat
een
t
Brigit Kooijman bezoch
van warm weer; ik
biotechnologen in Delft. „Ik hou niet
t.”
aanstaa
airco
de
waar
ben liever in het lab
‘het
ls studente Lizah van der Aart (20) ze
leven is echt supermooi’ zegt, heeft
liggen
het niet over op het gras in de zon
op de vraag
met een ijsje. Het is haar antwoord de biolovakgebied,
haar
wat haar zo boeit aan
hoe alles met
gie. „Het is fantastisch om te zien
en dieren,
elkaar in verband staat. Hoe planten
zijn
bacteriën en alle organismen opgebouwd lete kunnen
en van elkaar afhankelijk zijn om
in ons lab een
ven. Hoe die kleine gistcelletjes
cascade aan enzymen in zich hebben.”
in
We zitten op een klein terras, verscholen
In het gede Hortus Botanicus van de TU Delft. met tien
bouw achter ons werkt Lizah, samende hele zoandere studenten en zes begeleiders,
A
promer aan een biotechnologisch onderzoeks
ale wedject in het kader van een internationtijdens de
team
strijd, iGEM. Ze hoopt met haar
de scoren,
Europese voorronde in oktober goed
aan het beBoston
in
later
maand
een
ze
zodat
of Technology
faamde Massachusetts Institute
roem.
(MIT) kan meedingen naar eeuwige
Lizahs favoIn de zon liggen is sowieso niet
warm weer, ik
riete bezigheid. „Ik hou niet van
aanstaat. Al
ben liever in het lab waar de airco in de horhier
vind ik het wel fijn om elke dag
lab hebhet
In
lunchen.
te
tus, onze achtertuin,
voor mij is dit
ben we het gezellig met zijn allen,
tie.”
een prima besteding van de zomervakankrijgen,
Lizah kan er studiepunten voor
haar
heeft
ze
want
nodig,
maar die heeft ze niet
te leren – uit
‘bachelor’ al. „Ik doe mee om ervan
Mijn medepure nieuwsgierigheid eigenlijk.
heel normaal,
studenten bij biologie vinden het
werken.
te
hard
om
gewend
daar is iedereen
besteden, is
Veertig uur per week aan je studie
bent geweest,
standaard; als je een week ziek
in te halen wat
moet je alle zeilen bijzetten om
reniging is
je gemist hebt. Bij mijn studentenve veel waarwel
dat anders, daar hechten mensen
waarom
de aan hun zomervakantie. Ze vroegenals ik erMaar
ik dit in gódsnaam ging doen.
supertof.”
allemaal
het
ze
vinden
over vertel,
Glazen trofee
van de bloeOok Esengül Yildirim (37) geniet
zij het voornamen en de planten in de hortus,
laboratorimelijk van achter het raam van haar ze de hewerkt
um. Net als haar studententeam
dagen. ,,Heel
le zomer door, en maakt lange
vrienden in
soms, als ik vakantiefoto’s zie van
denk ik: ‘ooo,
de bergen of bij een waterval,
verder
Maar
zijn’.
willen
wel
daar had ik nu ook
alleen toevalniet. Ik reis de hele wereld rond,
lig niet in de zomer.”
omdat
De ‘iG EM-mama’ wordt ze genoemd, jaar de
elk
ze al vanaf de eerste keer, in 2008, in praktistudenten begeleidt bij hun labwerk:
zin. Wie te
sche, maar ook in psychologische
op
hooi
te veel
weinig doet, spoort ze aan, wie
laat een glazen
zijn vork neemt, remt ze af. Ze
2010’.
trofee zien met de tekst ‘Beste begeleider
gekregen.”
Liefdevol: „Van mijn studentjes
molein
erd
Yildirim is analist, gespecialise
jaar aan de
culaire genetica. Ze werkt al vijftien
ze veel plezier
TU Delft. De laatste jaren heeft
; ooit liet
gekregen in educatie en voorlichting oplosze een groep scholieren een moordzaak
Maar ook
es.
DNA-proefj
van
behulp
sen met
in het laborahet biotechnologische handwerk
„Het is net
torium vindt ze nog steeds prachtig.
wat je
als met kunst. Je hebt iets in gedachteniets wat
wilt maken. Iets nieuws, iets origineels,als in de
net
nog nooit eerder gedaan is. En
kunst laat je je inspireren door anderen.”
van een
Op haar bureau ligt een proefschrift ontworheeft
vriendin, waarvoor ze het omslag
in de traditie
pen. Eiwitmoleculen, gemaakt
geboorteland,
van de marmerkunst uit haar
Turkije.
de weer met
In het lab is Lizah intussen in
buisje. Ze
een
in
een snotachtige substantie
de celwand van
heeft zojuist met een soort zeep
de cel het
een gistcel afgebroken, om binnenin Het uitDNA-materiaal te kunnen wijzigen.
ct is
iGEM-proje
Delftse
eindelijke doel van het
dat
gistcellen zodanig genetisch te modificeren
De gistcellen
ze tuberculose kunnen opsporen.
r, die in
worden uitgerust met een geurdetecto
‘ruiken’.
te
bacterie
staat is een tuberculose
van het
Net als Esengül Yildirim houdt Lizah is een
„Het
‘knippen en plakken’ in het lab.
ook, en
soort creatiedrang. Ik teken en schilder
ik hou van koken.”
(24), stuHaar teamgenoot Menno Witteveen hij als
dat
dent chemische technologie, vertelt maken.
kind altijd al bezig was met dingen
karrevrachten
„Hutten bouwen, en lego. Ik had
vol lego.”
vooral een
Voor Menno is het iGEM-project
„te werken
unieke kans om, zoals hij het zegt,
van de
aan mijn eigen toekomst en de toekomst bedrijf
een
wereld”. Hij wil na zijn afstuderen
medipatiënten
opzetten dat voor individuele
behulp van
cijnen op maat ontwikkelt met
mij de geleDNA-onderzoek. „Dit project geeft
en contacten te
genheid de sector te verkennen
leggen.”
opofferen,
Dat hij zijn zomer eraan moet
ik echt mis, is
neemt hij voor lief. „Het enige wat
Zij zitde jaarlijkse vakantie met mijn vrienden.
in Twente, en
ten nu met zijn allen in een huisje
het moment
ik ben er niet bij. Terwijl dat nu juist hebt.”
is waarop je nog eens een goed gesprekgek bezig
ik
„Sommige vrienden vinden dat
te vinden”,
ben door mijn werk zo belangrijk kinderen
vertelt Esengül Yildirim. „Zij hebben uit. Bij
naar
en daar gaat hun grootste aandacht in oktober
ik
mij is het anders gelopen. Maar als
zie
studenten
mijn
voorfinale
bij de Europese
voor doe.”
schitteren, weet ik waar het allemaal
en om
Oproep. Wie besteedt ook vakantiedag
een
aan
niet
dan
al
werken’,
te
’gewoon door
rc.nl.
bijzonder project? Mail naar mensen@nop
lezen
De reacties zijn volgende week te
www.nrc.nl/mensen.
te wachten, zag ik
ik voor een brug in Groningen stond
Jeanet Alice Klinkert: „Laatst, toen
te doen.”
was gestapt en gymoefeningen begon
deze man, met hond, die uit zijn auto
in de publieke ruimte zichtbaar
mens
de
van
sporen
waarop
In deze rubriek staan foto’s
foto plus toelichting
en kunstzinnige uitingen. Stuur uw
teksten
,
afbeeldingen
in
gemaakt
zijn
naar [email protected]
niet als bijlage,
de zomermaanden juli en augustus
Het katern Mens& verschijnt in
katern van de krant.
maar in verkorte vorm in het eerste
3
Benefits
BENEFITS PACKAGE:
Interaction with top students
Contact
Bronze
BRONZE
Silver
SILVER
Gold
GOLD
If you still have questions, do not hesitate to contact us!
from TU Delft, Leiden, and
Rotterdam Universities
Investing in Sustainability
iGEM office
Named Partner
Room 0.620 Biotechnology building TU Delft
Named Investor
Julianalaan 67
Logo on the iGEM wiki page
Logo on the Facebook page
CVs of team members
2628 BC Delft
The Netherlands
+3115 2783394
[email protected]
Featured post on Facebook
page
Featured post on Twitter
Logo on the iGEM poster in
Boston
Logo at the end of
presentation
Logo on every presentation
slide
Logo on the lab coats
Logo on iGEM team clothing
Participation to the in-house
day
Distribution of promotional
Fundraising responsible
Janna Bogers
[email protected]
+316 16502602
Dutch and English
Team leader
Anamaria Buda
[email protected]
+316 19139547
English only
materials
4