Stefan Rensing (VIT): Impact van Genomics in Duitsland

Genomics in Duitsland
IT-Solutions for
Animal Production
 Genomische fokwaarden (GFw) zijn voor 3 rassen beschikbaar:
Holstein
Fleckvieh
Brown Swiss
Impact van Genomics
in Duitsland
Sinds:
Aug. 2010
Dr. Stefan Rensing, Erik Pasman
Vereinigte Informationssysteme Tierhaltung w.V. (vit), Verden/Germany
Referentie populaties:
EuroGenomics
27.000 stieren
(10.000 binnenlands)
GES dag, Apeldoorn, 5 november 2014
6. November 2014
Melkvee in Duitsland
Melkvee in Duitsland
 4.267.000 melkkoeien
 4.267.000 melkkoeien




Aug. 2011
DEU/AUT/CZE
8.600 stieren
(8.600 binnenlands)
Brown Swiss
 Rassen:
 65% Holstein
 25% Fleckvieh
 5% Brown Swiss
 5% rest (incl. 1,5% kruisingen)
Page 4
Ontwikkeling genotypering in Duitse Holsteins
Genomics en KI-fokprogramma‘s
Aantal nieuwe genom KI-stieren per jaar van inzet
Vrl. genotypeerd
2012
2013
(2014 onvolledig)
geboortejaar
 Aantal getypeerde mnl. kandidaten (door KI-stations) stabiliseert bij 12.000/jaar
Vaders geteste
stierkalfjes geb. 2014
Vader
sire
Balisto
Boss
Shotglass
Galaxy
Chevrolet
Aikman
Big Point
Kanu P
Alpine
Sargeant
Mnl. genotypeerd
2011
(2.600 binnenlands)
Page 2
 organisatie structuur:
 regionale organisaties (melkcontrole,
stamboek, KI)
 Stamboek en KI meestal samen
 data verwerking overwegend centraal
Page 3
2010
Intergenomics
4,600 stieren
 rassen:
 65% Holstein
 25% Fleckvieh
 5% Brown Swiss
 5% rest (incl. 1,5% kruisingen)
in 79.500 bedrijven ( 53 koeien/bedrijf)
88% under melkcontrole
66% stamboek
90% KI (4.2 Mio. 1e inseminaties)
2009
Dec. 2011
522
396
235
209
183
177
171
169
156
155
 Aantal nieuwe jonge KI-stieren bij invoering van genomics snel gehalveerd
(tegenover proefstieren daarvoor)

Sindsdien nauwelijks verdere reducering
 Aantal getypeerde vrouwlijke dieren neemt toe, maar is nog relatief laag tegenover bijv.
USA
  ca. 75% slechts „proefstieren“ (geen brede inzet/sperma verkoop)
6. November 2014
6. November 2014
 Ondertussen praktisch 100% genomische stiervaders

Seite 5
N
n zonen
sons
Bijna alleen uit DEU en USA/CAN
Page 6
1
Ontwikkeling gebruik jonge genomische stieren
Genomische stieren versus dochter-geteste stieren
Inseminaties met Holstein stieren Januari – April 2014:
HOLSTEIN
Do. getest
N insem.
birth year
Suran
(Super x Mr.Burns)
29,510 1e inseminaties 2013
Nr. 4 van alle HOL stieren
genomisch
373731
2005.9
RZM (prod. index)
RZE (exterieur)
RZS (celgetal)
RZN (levensduur)
RZR (do. vruchtbaarheid)
RZKm (do. afkalving)
RZG (totaal index)
757770
2011.5
115.7
117.9
109.0
113.3
105.8
103.3
125.2
128.3
127.2
115.2
125.0
108.6
108.6
144.1
verschil
5.6
12.6
9.3
6.2
11.7
2.8
5.3
18.9
*) FW: relative schaal met  100 en s=12
 In 1e jaar na introductie van genomics geen toename in gebruik
van jonge stieren (ca. 20% zoals daarvoor bij proefstieren)
 Daarna tot nu toe regelmatige toename tot bijna 70%

met regionale verschillen van 40% tot >90%
6. November 2014
Ellmau
(Elburn x Carmano)
5,898 1e inseminaties 2013
Nr. 5 van alle Red HOL stieren
Page 7
RZG 158
RZM 137 RZE 129
RZS 118 RZN 131
 Gebruikte genomische jonge stieren zijn 1,5 genetic st. dev. beter dan gebruikte
dochter-geteste stieren in dezelfde periode
 Vergelijkbare selektie strategie in beide stiergroepen
 Selectie gericht op totaal index (RZG), productie, exterieur en levensduur
6. November 2014
Genetische vooruitgang door genomic selection
Lexington
(Lexor x Time) geb. 2013
Page 8
In discussie (I)
 Vervullen GFw de verwachtingen?
 Fokwaarden gebruikte Holstein stieren per jaar (alle ins.):
Genomics
Schaal:
Relative FW
 = 100
s = ±12
Relative schaal met
 100 en s=12
 Genomic selection verdubbelt genetische vooruitgang
 RZG 1995-2008 =  +2.1 per jaar ( 0.2 s)
 RZG 2010-2013 =  +5.1 per jaar ( 0.4 s)
 …en nog geen einde in zicht (2013 ‘pas’ 55% genomische stieren)
6. November 2014
Page 9
 Ja, dat doen ze!
 Niet alleen in doorsnee, maar ook voor ‘hoge’ genomische stieren
 Van 70% betr. tot 90% verwachte gemiddelde afwijking van ±7 punten (0,6 st. dev.)
 sommige stieren veranderen ≥ ±21 punten
 FW van dochter-geteste stieren veranderden vroeger ook (bijv. van 1e to 2e inzet)

En niet altijd ongericht voor topstieren
Page 10
In discussie (II)
In discussie (III)
 KI-organisaties willen genomics voor mannelijke dieren exclusief voor zich
 Holstein = gesloten systemen in DEU en NLD, maar …
 In DEU und NLD om dezelfde redenen
 Maar verschillende systemen/antwoorden (binnen DEU en DEU<>NLD)
 Fleckvieh/Brownswiss:
 Holstein:
 ♂ open voor fokkers
 Voor dezelfde prijs als ♀
 ♂ alleen door KI-organisatie
en met koopoptie
  Fokker ondertekent
verdrag zonder GFw te
kennen
  KI-stations kopen stieren
van fokkers in vrije
concurrentie
6. November 2014
Page 11
 ♂ Holstein Duitsland:
 ♂ Holstein Nederland:
 Stamboekorganisties
verantwoordelijk voor GFwschatting
  Eigenaren van alle
getypeerde dieren ontvangen
GFw
 Omdat alle GFw wettelijk
deel van het stamboek zijn
6. November 2014
 CRV als KI-organisatie
controlleert GFw-schatting
 Levert niet alle dieren/GFw
aan „derden“ (ook niet aan
AEU/GES)
Page 12
2
In discussie (IV)
In discussie (V)
 Nationale GFw voor buitenlandse KI stieren
 Brede genotypering vrouwelijke dieren
 Belangrijk voor effectieve stiervader-selektie
  KI-organisaties genotyperen potentiele buitenlandse stiervaders
  Wie ontvangt de nationale GFw?
EU-verordening 2006/427/EG (bijlage 1, III., 1.):
 Fokwaardeschatting tenminste vor KI-stieren en
minimaal voor melkproductiekenmerken
 Deze en alle andere beschikbare FW moeten
gepubliceerd worden
 DEU: Importeur/alle, wegens publicatie

Fokwaardeschatting en genomics in handen van stamboeken (HOL) / staat (Fleckvieh)
 NLD: voor buitenlandse stieren alleen KI intern

Fokwaardeschatting=AEU/GES; genomics ‚prive‘ (K.I.)
 Typering van de complete top van de vrouwelijke populatie biedt extra kansen voor
stierselectie
 Typering van gehele (commerciele) bedrijven lijkt cruciaal voor de toekomst van
genomics (koe referentie populatie)
 Hoe veehouders annmoedigen om vrouwlijke dieren te laten typeren?
 Noordamerika: gestimuleerd vanuit de markt
 En typering is goedkoper als in DEU/NLD
 In Europa: ‘hulp’ van de organisatie nodig
 Bijv. NLD: ‘data+’ programma van CRV
 In DEU gebeurt nog wenig
 Duitsland:
 Hoe importeuren aan de kosten voor GFw van hun stieren laten meebetalen?
 Importeur is niet opdrachtgever
 En verplichte publicatie GMACE fokwaarden
6. November 2014
Page 13
6. November 2014
Page 14
IT-Solutions for Animal Production
Perspectieven
 Hogere betrouwbaarheden van GFw?
 Met de huidige methoden eerder niet
 Nieuwe kenmerken?
 Nog niet duidelijk of en hoe goed koe referentie populaties werken
 Toegevoegde voordelen uit genomics





Ontdekkking en rekening houden kunnen met genetische defekten (Haplotypen)
Rekening houden met verschillende variate in dochtergroepen
Betere inteelt controle (daadwerkelijke i.p.v. theoretische inteelt)
Betere voorspelling van de daadwerkelijke produktiewaarde van een dier
…
 …
Hartelijk bedankt voor de aandacht !
Nog vragen?
6. November 2014
Page 15
6. November 2014
Seite 16
3